11.Рнк - полимеразы. Строение, виды, функции.

Катализирующие синтез иРНК-полимеразы обычно представляют собой сложные белки. Так, один из наиболее изученных ферментов этого типа - РНК- полимераза Е. соli - имеет Mr 480 ООО и состоит из 5 полипептидных цепей, из которых 4 (2α,β ,β' образуют стержень, или кор-фермент. Способность РНК- полимеразы распознавать начало данного гена и присоединяться к специфическому для каждого гена сайту инициации транскрипции, или промотору, определяется пятым полипептидом δ (сигма-фактор). У эукариот известно 3 типа РНК-полимераз, ответственных за синтез различных классов РНК. Наиболее активна РНК- полимераза I, обнаруженная в ядрышках. Она транскрибирует лишь гены, кодирующие рРНК (т.е. РНК, входящие в состав рибосом), что составляет 50-70 % от общего синтеза РНК. РНК-полимераза II локализована в нуклеоплазме и синтезирует 20-40 % всей клеточной РНК, в том числе РНК-предшественники иРНК в виде гетерогенной (состоящей из различных молекул) ядерной РНК. РНК- полимераза III также находится в нуклеоплазме и ответственна за синтез большей части мелких ядерных РНК и транспортных РНК.

12.Инициация транскрипции. Промотор, стартовая точка.

Инициация начинается с распознования фрагм. Гена промотера ,длина фрагмент. 41-44 нуклеотида,выделяют стартовую точку,нуклеотид лежащий слева (-) и нуклеотид лежащий справа (+). РНК полимераза садится на начало гена в промежутке -50…+20 минимальный участок связывания с РНК-полимеразой у прокариот состоит из 12 пар нуклеотидов. Во всех промоторах присутствуют одни и те же нуклеотидные последовательности, называемые консервативными. Они служат для распознования стартовой точки которая обычно начинается с пурина. Сразу же влево ог нее располагаются 6-9 п.н., известные как последовательность (или ящик) Прибнова: ТАТААТ. Центры ящика Прибнова приходятся на нуклеотиде в положении 3’ вторая последовательность находится в положении -35 и называется районами первичного распознования. Он является сайтом, к которому присоединяется 6-фактор, тем самым определяя эффективность, с которой РНК-полимераза распознает определенный промотор. Есть промоторы, с которых РНК-полимераза не может начать транскрипцию без помощи специальных белков. Одним из них служит фактор САР, или С RР. Замена δ-фактора приводит к тому что ДНК полимер аза начинает распозновать ии транскрибировать другие гены. Каждый δ-фактор распознает собственные последовательности нуклеотидов расположенные в области -10….-35 –это инициация у прокариот.

У эукариот содержатся три гомологичных участка в районах с координатами -25, -27, а также в стартовой точке. Стартовым основанием служит аденин, окруженный пиримидином. Влево на 25 нуклеотидов располагаются участки богытые А=Т парами ТАТАТАТ- ящик Хогнеса,он напоминает ящик Прибнова но распалогается на 15 нуклеотидов левее. Еще левее в положении от -70 до -80 находится последовательность ГТЦ (или Т) ЦААТЦТ, называемая также “ящик ЦААТ”. Предполагается, что последовательность ТАТА контролирует выбор стартового нуклеотида, а ЦААТ - первичное связывание РНК- полимеразы с ДНК-матрицей.