
- •Новосибирский государственный медицинский университет
- •Кафедра фармацевтической химии
- •По биохимии клетки
- •Содержание
- •1.Регуляция метаболических процессов с помощью белок-белкового взаимодействия, путем фосфорилировани-дефосфорилирования и частичным (ограниченным) протеолизом.
- •2.Цикл лимонной кислоты. Ход процесса. Значение. Регуляция.
- •3.Ингибирование ферментативной активности. Обратимое ингибирование: конкурентное и неконкурентное. Лекарственные вещества – конкурентые ингибиторы ферментативной активности.
- •1. Конкурентное ингибирование
- •Кинетические зависимости
- •2. Неконкурентное ингибирование
- •1. Специфические и неспецифические ингибиторы
- •2. Необратимые ингибиторы ферментов как лекарственные препараты
- •Список литературы
2. Неконкурентное ингибирование
Неконкурентным называют такое ингибирование ферментативной реакции, при котором ингибитор взаимодействует с ферментом в участке, отличном от активного центра (рис. 6). Неконкурентные ингибиторы не являются структурными аналогами субстрата.
Неконкурентный ингибитор может связываться либо с ферментом, либо с фермент-субстратным комплексом, образуя неактивный комплекс. Присоединение неконкурентного ингибитора вызывает изменение конформации молекулы фермента таким образом, что нарушается взаимодействие субстрата с активным центром фермента, что приводит к снижению скорости ферментативной реакции.
Кинетические зависимости
Кинетическая зависимость неконкурентного ингибирования представлена на рис. 7. Этот тип ингибирования характеризуется снижением Vmaxферментативной реакции и уменьшением сродства субстрата к ферменту, т.е. увеличением Кm.
Б. Необратимое ингибирование
Необратимое ингибирование наблюдают в случае образования ковалентных стабильных связей между молекулой ингибитора и фермента. Чаще всего модификации подвергается активный центр фермента, В результате фермент не может выполнять каталитическую функцию.
К необратимым ингибиторам относят ионы тяжёлых металлов, например ртути (Hg2+), серебра (Ag+) и мышьяка (As3+), которые в малых концентрациях блокируют сульфгидрильные группы активного центра. Субстрат при этом не может подвергаться химическому превращению (рис. 8). При наличии реактиваторов ферментативная функция восстанавливается. В больших концентрациях ионы тяжёлых металлов вызывают денатурацию белковой молекулы фермента, т.е. приводят к полной инактивации фермента.
1. Специфические и неспецифические ингибиторы
Использование необратимых ингибиторов представляет большой интерес для выяснения
Рис. 5. Схема активного центра ацетилхолинэстеразы.А - присоединение ацетилхолина в активном центре фермента. Стрелкой указано место гидролиза эфирной связи в молекуле ацетилхолина; Б - присоединение конкурентного ингибитора - прозерина в активном центре фермента. Указано место гидролиза прозерина, однако реакция идёт намного медленнее, чем с ацетилхолином; В - присоединение конкурентного ингибитора в активном центре фермента - эндрофония. Эндрофоний связывается в активном центре ацетилхолинэстеразы, препятствуя присоединению ацетилхолина.
Использование необратимых ингибиторов представляет большой интерес для выяснения механизма действия ферментов. С этой целью применяют вещества, блокирующие определённые группы активного центра ферментов. Такие ингибиторы называют специфическими. Ряд соединений легко вступает в реакции с определенными
Рис. 6. Схема неконкурентного ингибирования активности фермента.
химическими группами. Если эти группы участвуют в катализе, то происходит полная инактивация фермента.
Роль гидроксильных групп серина в механизме катализа исследуют с помощью фторфосфатов, например диизопропилфторфосфата. Дии-зопропилфторфосфат (ДФФ) специфически реагирует лишь с одним из многих остатков серина в активном центре фермента. Остаток Сер, способный реагировать с ДФФ, имеет идентичное или очень сходное аминокислотное окружение (табл. 1). Высокая реакционная способность этого остатка по сравнению с другими остатками Сер обусловлена аминокислотными остатками, также входящими в активный центр ферментов.
ДФФ относят к специфическим необратимым ингибиторам "сериновых" ферментов, так как он образует ковалентную связь с гидроксильной группой серина, находящегося в активном центре и играющего ключевую роль в процессе катализа (рис. 9).
Ацетат йода, п-хлормеркурибензоат легко вступают в реакции с SH-группами остатков цистеина белков. Эти ингибиторы не относят к специфичным, так как они
Рис. 7. Влияние неконкурентного ингибитора на скорость ферментативной реакции в зависимости от концентрации субстрата.Vmax- максимальная скорость реакции в отсутствие ингибитора; 'Vmax- максимальная скорость реакции в присутствии ингибитора; Кm- константа Михаэлиса в отсутствие ингибитора; 'Кm- константа Михаэлиса в присутствии ингибитора.
Рис. 8. Механизм действия ионов ртути как необратимого ингибитора.Ионы ртути в малых концентрациях блокируют сульфгидрильные группы активного центра, что приводит к снижению скорости ферментативной реакции.
Рис. 9. Ингибирование активности химотрипсина с помощью диизопропилфторфосфата.
Таблица 1. Исследование последовательности аминокислотных остатков вокруг реакционно-способного остатка се-рина, взаимодействующего с ДФФ
Фермент |
Функция ферментов (подкласс ферментов) |
Аминокислотные остатки, находящиеся в окружении реакционно-способного серина в активном центре |
Химотрипсин |
Протеолитические ферменты |
Асп Сер Глу |
Трипсин |
Асп Сер Глу | |
|
| |
Тромбин |
Асп Сер Глу | |
Эластаза |
Асп Сер Глу | |
Холинэстераза |
Эстеразы (гидролиз эфирной связи) |
Глу Сер Ала |
|
| |
Щелочная фосфатаза |
Глу Сер Ала |
реагируют с любыми свободными SH-группами белков и называются неспецифическими ингибиторами. Если SH-группы принимают участие непосредственно в катализе, то с помощью этих ингибиторов представляется возможным выявление роли SH-групп фермента в катализе.