- •Регуляция экспрессии генов
- •Регуляция экспрессии генов
- •Зачем нужна регуляция
- •В клетках содержатся тысячи различных белков, которые кодируются разными генами и представлены в
- •Регуляция экспрессии генов у прокариот
- •Экспрессия некоторых генов зависит от специфических ингибиторов, обычно это конечные продукты биосинтеза. Бактериальные
- •Не зависимо от системы регуляции, возможен негативный и позитивный контроль экспрессии генов.
- •Индуцибельная система метаболизма лактозы у E. coli
- •У E. coli lac оперон содержит 3 структурных гена: lacZ, lacY, и lacA,
- •Структурные гены lac оперона транскрибируются одной mRNA, которая затем транслируется в три фермента.
- •Жакоб и Моно предположили, что репрессор связывается с последовательностью ДНК оператора, ингибируя РНК-
- •Для объяснения механизмов регуляции экспрессии структурных генов оперонная модель использует взаимодействие молекул. В
- •Принцип жизни бактерии – экономия
- •Белок-репрессор Lac-оперона
- •Ген lacI оказывает отрицательный контроль над опероном, производя аллостерический репрессор, который может подавлять
- •Когда репрессор связывается с регионом оператора, он ингибирует РНК-полимеразу после того, как она
- •Когда лактоза присутствует, то она косвенно индуцирует активацию генов, связываясь с репрессором, который
- •Конститутивные мутации нарушают эти молекулярные взаимодействия, что приводит к непрерывной транскрипции структурных генов.
- •В мутанте lac I-, белок-репрессор меняется и не может связываться с оператором, поэтому
- •В мутанте lac O– нуклеотидная последовательность ДНК оператора меняется, что не позволяет связываться
- •В мутанте lac IS репрессор не может взаимодействовать с индуктором лактозой. В результате,
- •САР-белок: позитивный контроль lac-оперона
- •Механизм катаболической репрессии.
- •Глюкоза является предпочтительным источником сахара для E. сoli по сравнению с лактозой. В
- •В присутствии глюкозы уровень цАМФ снижается, CAP-AMP комплексы не образуются, и транскрипция не
- •Фермент аденилатциклаза катализирует образование цАМФ из АТФ.
- •Репрессибельная система метаболизма триптофана
- •Модель регуляции триптофанового оперона – в норме репрессор инактивирован и не может взаимодействовать
- •Структура trp-оперона включает 5 смежных генов (trp E, D, C, B, A) которые
- •В дополнение к репрессору, промотору, оператору и структурным генам триптофановый оперон (trp) содержит
- •В отсутствие триптофана, репрессор неактивен и не может связываться с оператором, что позволяет
- •Когда триптофан присутствует, то он функционирует как корепрессор путем связывания с репрессором.
- •Аттенуация
- •Регуляция транскрипции
- ••Смысл сложной регуляции у эукариот – в «точной настройке».
- •Регуляция экспрессии эукариотических генов может происходить на разных уровнях:
- •Регуляторные элементы, факторы транскрипции и эукариотические гены
- •Промоторы
- •Кроме того, для инициации транскрипции важны проксимальные элементы. Один из них – СААТ-бокс
- •Многие промоторы эукариот содержат CAAT и GC боксы.
- •Промотор содержит несколько элементов, в том числе GC, СААТ и ТАТА боксы.
- •Энхансеры
- •Как энхансеры контролируют транскрипцию, находясь на расстоянии от промотора и сайта инициации транскрипции?
- •Энхансеры расположены вдали от промоторов и состоят из доменов (кластеров аминокислот, выполняющих определенную
- •Факторы транскрипции
- •Экспрессия эукариотических генов находится под контролем регуляторных элементов, расположенных в непосредственной близости от
- •Структурные мотивы факторов транскрипции
- •Один мотив, содержащий ДНК-связывающий домен активатора белков, это спираль-виток-спираль (HTH). Три α-спирали, разделенных
- •Другой мотив, содержащий ДНК-связывающий домен активатора белков, это цинковый палец, который содержит аминокислоты
- •Лейциновая молния (лейциновые ножницы) представляет собой белок, димер, сформированный между остатками лейцина в
- •Кроме ДНК-связывающих доменов факторы транскрипции содержат домены, активирующие транскрипцию. Они состоят из 30-100
- •Сборка транскрипционного комплекса
- •В области промотора происходит сборка и других факторов транскрипции, взаимодействующих в определенном порядке.
- •На этом этапе транскрипция происходит на очень низком базальном уровне. На конечной стадии
- •TATA-box
- ••Кроме транскрипционных факторов, существуют еще регуляторные белки
- •Регуляторные Промотор участки
- •Посттранскрипционная регуляция экспрессии генов
- •Пре-мРНК, содержащие двенадцать экзонов, могут быть соединены в различных комбинациях для создания различных
- •Альтернативный сплайсинг
- •Альтернативный сплайсинг гена SLO.
- •Ген Dscam у Drosophila, участвующий в сцеплении между нейронами, содержит 4 кластера экзонов,
- •Конформация хроматина, метилирование ДНК и экспрессия генов
- •При этом специальные белки разрушают нуклеосомы, удаляя гистоны и освобождая ДНК. У дрожжей
Жакоб и Моно предположили, что репрессор связывается с последовательностью ДНК оператора, ингибируя РНК- полимеразу, что приводит к репрессии транскрипции структурных генов. Но в присутствии лактозы она связывается с репрессором и изменяет аллостерическую конформацию. В результате измененный сайт связывания с оператором не может взаимодействовать с последовательностью ДНК-оператора.
Когда взаимодействия репрессора с оператором не происходит, РНК-полимераза транскрибирует структурные гены, и синтезируются ферменты, необходимые для метаболизма лактозы. Поскольку транскрипция происходит только при
отсутствии связывания репрессора с оператором – это негативный контроль экспрессии.
Для объяснения механизмов регуляции экспрессии структурных генов оперонная модель использует взаимодействие молекул. В отсутствие лактозы соответствующие ферменты не используются клеткой, и эти структурные гены репрессированы. Лактоза опосредованно активирует экспрессию, связываясь с репрессором. Когда вся лактоза израсходована, репрессор освобождается и снова связывается с оператором, блокируя транскрипцию.
Принцип жизни бактерии – экономия
•Лактозы нет белки ее переработки клеткой не синтезируются.
•Лактозу добавили начинается синтез всех трех белков.
Существует механизм регуляции экспрессии этих генов
Белок-репрессор Lac-оперона
Имеет две аллостерических конформации –
активную и неактивную
Ген lacI оказывает отрицательный контроль над опероном, производя аллостерический репрессор, который может подавлять структурные гены, если он не связан индуктором - лактозой.
Когда репрессор связывается с регионом оператора, он ингибирует РНК-полимеразу после того, как она связывается с промотором, подавляя транскрипцию структурных генов. Оперон выключен.
Когда лактоза присутствует, то она косвенно индуцирует активацию генов, связываясь с репрессором, который становится неактивным, а оперон включается.
Конститутивные мутации нарушают эти молекулярные взаимодействия, что приводит к непрерывной транскрипции структурных генов.
В случае мутации I белок-репрессор изменен и не может связываться с оператором, при мутации О изменена нуклеотидная последовательность оператора, поэтому он не связывается с репрессором, и также происходит непрерывная транскрипция.
В мутанте lac I-, белок-репрессор меняется и не может связываться с оператором, поэтому структурные гены оперона - конститутивные (всегда включены).
В мутанте lac O– нуклеотидная последовательность ДНК оператора меняется, что не позволяет связываться с нормальным белком-репрессором, так что структурные гены всегда включены.
Добавление гена I+ в I- клетки (3-я строка сверху) при конъюгации производит частично диплоидную мерозиготу (5- я строка сверху).
Это восстанавливает индуцибельность, потому что нормальный репрессор дикого типа будет производиться вставленным геном I+.
