
- •Регуляция экспрессии генов
- •Регуляция экспрессии генов
- •Зачем нужна регуляция
- •В клетках содержатся тысячи различных белков, которые кодируются разными генами и представлены в
- •Регуляция экспрессии генов у прокариот
- •Экспрессия некоторых генов зависит от специфических ингибиторов, обычно это конечные продукты биосинтеза. Бактериальные
- •Не зависимо от системы регуляции, возможен негативный и позитивный контроль экспрессии генов.
- •Индуцибельная система метаболизма лактозы у E. coli
- •У E. coli lac оперон содержит 3 структурных гена: lacZ, lacY, и lacA,
- •Структурные гены lac оперона транскрибируются одной mRNA, которая затем транслируется в три фермента.
- •Жакоб и Моно предположили, что репрессор связывается с последовательностью ДНК оператора, ингибируя РНК-
- •Для объяснения механизмов регуляции экспрессии структурных генов оперонная модель использует взаимодействие молекул. В
- •Принцип жизни бактерии – экономия
- •Белок-репрессор Lac-оперона
- •Ген lacI оказывает отрицательный контроль над опероном, производя аллостерический репрессор, который может подавлять
- •Когда репрессор связывается с регионом оператора, он ингибирует РНК-полимеразу после того, как она
- •Когда лактоза присутствует, то она косвенно индуцирует активацию генов, связываясь с репрессором, который
- •Конститутивные мутации нарушают эти молекулярные взаимодействия, что приводит к непрерывной транскрипции структурных генов.
- •В мутанте lac I-, белок-репрессор меняется и не может связываться с оператором, поэтому
- •В мутанте lac O– нуклеотидная последовательность ДНК оператора меняется, что не позволяет связываться
- •В мутанте lac IS репрессор не может взаимодействовать с индуктором лактозой. В результате,
- •САР-белок: позитивный контроль lac-оперона
- •Механизм катаболической репрессии.
- •Глюкоза является предпочтительным источником сахара для E. сoli по сравнению с лактозой. В
- •В присутствии глюкозы уровень цАМФ снижается, CAP-AMP комплексы не образуются, и транскрипция не
- •Фермент аденилатциклаза катализирует образование цАМФ из АТФ.
- •Репрессибельная система метаболизма триптофана
- •Модель регуляции триптофанового оперона – в норме репрессор инактивирован и не может взаимодействовать
- •Структура trp-оперона включает 5 смежных генов (trp E, D, C, B, A) которые
- •В дополнение к репрессору, промотору, оператору и структурным генам триптофановый оперон (trp) содержит
- •В отсутствие триптофана, репрессор неактивен и не может связываться с оператором, что позволяет
- •Когда триптофан присутствует, то он функционирует как корепрессор путем связывания с репрессором.
- •Аттенуация
- •Регуляция транскрипции
- ••Смысл сложной регуляции у эукариот – в «точной настройке».
- •Регуляция экспрессии эукариотических генов может происходить на разных уровнях:
- •Регуляторные элементы, факторы транскрипции и эукариотические гены
- •Промоторы
- •Кроме того, для инициации транскрипции важны проксимальные элементы. Один из них – СААТ-бокс
- •Многие промоторы эукариот содержат CAAT и GC боксы.
- •Промотор содержит несколько элементов, в том числе GC, СААТ и ТАТА боксы.
- •Энхансеры
- •Как энхансеры контролируют транскрипцию, находясь на расстоянии от промотора и сайта инициации транскрипции?
- •Энхансеры расположены вдали от промоторов и состоят из доменов (кластеров аминокислот, выполняющих определенную
- •Факторы транскрипции
- •Экспрессия эукариотических генов находится под контролем регуляторных элементов, расположенных в непосредственной близости от
- •Структурные мотивы факторов транскрипции
- •Один мотив, содержащий ДНК-связывающий домен активатора белков, это спираль-виток-спираль (HTH). Три α-спирали, разделенных
- •Другой мотив, содержащий ДНК-связывающий домен активатора белков, это цинковый палец, который содержит аминокислоты
- •Лейциновая молния (лейциновые ножницы) представляет собой белок, димер, сформированный между остатками лейцина в
- •Кроме ДНК-связывающих доменов факторы транскрипции содержат домены, активирующие транскрипцию. Они состоят из 30-100
- •Сборка транскрипционного комплекса
- •В области промотора происходит сборка и других факторов транскрипции, взаимодействующих в определенном порядке.
- •На этом этапе транскрипция происходит на очень низком базальном уровне. На конечной стадии
- •TATA-box
- ••Кроме транскрипционных факторов, существуют еще регуляторные белки
- •Регуляторные Промотор участки
- •Посттранскрипционная регуляция экспрессии генов
- •Пре-мРНК, содержащие двенадцать экзонов, могут быть соединены в различных комбинациях для создания различных
- •Альтернативный сплайсинг
- •Альтернативный сплайсинг гена SLO.
- •Ген Dscam у Drosophila, участвующий в сцеплении между нейронами, содержит 4 кластера экзонов,
- •Конформация хроматина, метилирование ДНК и экспрессия генов
- •При этом специальные белки разрушают нуклеосомы, удаляя гистоны и освобождая ДНК. У дрожжей
Регуляция экспрессии генов

Регуляция экспрессии генов
Возможна на уровнях
•транскрипции
•трансляции
Зачем нужна регуляция
•Все клетки одного организма содержат
идентичный набор хромосом и ДНК –
полную наследственную информацию.
•Но клетки разные – в них синтезируются разные белки.
Вывод: не все гены читаются.
•Набор транскрибируемых генов различен
–у разных типов клеток
–в одной и той же клетке в разное время
В клетках содержатся тысячи различных белков, которые кодируются разными генами и представлены в клетках в разных количествах. Синтез этих белков сильно зависит от условий среды. Регуляция работы генов лежит в основе клеточной дифференцировки у многоклеточных эукариот.
Дифференциальная экспрессия генов определяет специализацию клеток и тканей как у растений, так и у животных.
Все недифференцированные клетки организма содержат полный набор генов, характерный для данного вида. Регуляция генов состоит не в элиминации ненужных клетке генов, но в контроле генной экспрессии.
Регуляция экспрессии генов у прокариот
Пример регуляции синтеза генных продуктов в метаболизме лактозы – дисахарида, состоящего из галактозы и глюкозы. Наличие лактозы в среде – синтез
ферментов ее метаболизма, отсутствие – отсутствует и синтез ферментов. Такие ферменты – индуцибельные.
Ферменты, синтезирующиеся в клетке постоянно, независимо от условий среды – конститутивные.
Экспрессия некоторых генов зависит от специфических ингибиторов, обычно это конечные продукты биосинтеза. Бактериальные клетки могут синтезировать аминокислоты самостоятельно, но при наличии этих аминокислот в среде они также утилизуются клетками. Поэтому синтез ферментов, участвующих в продукции аминокислот, и транскрипция
соответствующей мРНК становится неэффективным, наблюдается репрессибельная регуляция работы генов
Не зависимо от системы регуляции, возможен негативный и позитивный контроль экспрессии генов.
В первом случае экспрессия генов продолжается до тех пор, пока она не прервется регуляторными молекулами.
При позитивном контроле экспрессия генов наблюдается только в присутствии регуляторных молекул, стимулирующих транскрипцию.
Теоретически оба этих типа контроля могут быть как индуцибельными, так и репрессибельными.
Индуцибельная система метаболизма лактозы у E. coli
Модель Жакоба и Моно – lac-оперон состоит из структурных генов lacZ, lacY и lacA, а смежные с ними последовательности относятся к оператору.
Транскрипция этих структурных генов регулируется геном lacI, кодирующим аллостерический репрессор.
Молекулы этого репрессора реагируют с другими молекулами, изменяя их трехмерную структуру и химические свойства.

У E. coli lac оперон содержит 3 структурных гена: lacZ, lacY, и lacA, а также впереди регуляторную область, состоящую из оператора и промотора (участок связывания РНК-полимеразы).

Структурные гены lac оперона транскрибируются одной mRNA, которая затем транслируется в три фермента.
Ген lacZ кодирует β- galactosidase,
фермент,
расщепляющий дисахарид lactose на glucose и galactose.
Ген lacY кодирует фермент permease,
транспортный белок, обеспечивающий диффузию лактозы в клетку.
Ген lacA кодирует
фермент transacetylase.