- •Белки, наследственность и обмен веществ
- •Фенилкетонурия
- •Для метаболизма аминокислот фенилаланина и тирозина требуется несколько ферментов.
- •Гипотеза один ген – один фермент
- •Опыты Билла и Татума с мутантами нейроспоры
- •Бидл и Татум (Nobel 1958) индуцировали ауксотрофные мутации питания в Neurospora, подвергая бесполые
- •При попытке вырастить мутанты на минимальной среде с добавлением различных органических соединений, мутации
- •Бидл и Татум смогли определить, что каждая генетическая мутация связана с потерей ферментативной
- •Гены и ферменты – биохимический анализ
- •Метаболический путь для синтеза аминокислоты аргинина в Neurospora был установлен путем предоставления смеси
- •Один ген – одна полипептидная цепь
- •Серповидноклеточная анемия
- •Коллинеарность между генами и полипептидами
- •Полинг (Nobel 1954) изолировал нормальные (HbA) и серповидные (HbS) молекулы гемоглобина человека и
- •Белок расщепляется на пептидные фрагменты протеолитическими ферментами.
- •Коллинеарность в гене trpA, который кодирует A субъединицу фермента триптофан синтетазы в E.coli
- •Структура и биологическое разнообразие белков
- •Аминокислоты содержат карбоксильную группу, амино группу и R группу, связанную с центральным углеродом
- •Ковалентная пептидная связь образуется, когда аминогруппа одной аминокислоты реагирует с карбоксильной группой другой
- •Известно 4 уровня белковой структуры. Первичная
- •Водородные связи в регулярных, повторяющихся фрагментах стабилизируют секции полипептида, образуя альфа-спиральную вторичную структуру.
- •Водородная связь может также образовать бета-складчатый лист вторичной структуры в плоскости зигзага.
- •Если вторичная структура белка описывает порядок аминокислот в определенной области полипептидной цепи, то
- •Четвертичная структура характерна только для белков, состоящих из двух и более полипептидных цепей,
- •Некоторые белки, особенно ферменты, являются олигомерами: состоят из более, чем одной полипептидной цепи.
- •Посттрансляционная модификация белков
- •Функции белков
- •Белковые домены и перетасовка экзонов
- •1985 г – мембранный рецептор липопротеинов низкой плотности LDL (в транспорте холестерола) –
- •Ген человеческого рецептора холестерина содержит 18 экзонов, кодирующих 5 доменов в белке.
- •Различные молекулы гемоглобина производится в
- •Генные мутации
- •Классификация мутаций
- •Спонтанные и индуцированные мутации
- •Спонтанные мутации происходят естественно и случайно и, как правило, связаны с нормальными биологическими
- •Герминальные и соматические мутации
- •Другие виды мутаций
- •Следующий тип мутаций касается регуляции работы генов.
- •Уровень спонтанных мутаций
- •Молекулярная основа мутаций
- •Точечные мутации являются заменами оснований, в которых одна пара нуклеотидов изменяется.
- •Таутомерные сдвиги
- •Нуклеотиды могут существовать в таутомерных формах (структурных изомеров) из-за изменения положения протона (таутомерного
- •Мутация транзиции.
- •В следующем раунде репликации, несоответствующие члены пар оснований разделяются; таутомер обычно смещается назад
- •Аналоги оснований
- •5-бромурацил (5-BU) - производное урацила и ведет себя как аналог тимина, который увеличивает
- •Алкилирующие соединения
- •Акридиновые красители и мутации сдвига рамки
- •Акридиновый красители, такие как профлавин и
- •Апуриновые сайты и дезаминирование
- •Причиной некоторых мутаций может стать дезаминирование, т.е. превращение аминогруппы в кето-.
- •Химические мутагены, такие как азотистая кислота (HNO2) может привести к
- •Ультрафиолет и жесткая радиация
- •Воздействие УФ-излучения может привести к созданию димеров тимина в ДНК. Димеры искажают конформацию
- •Ионизирующая радиация
- •Коротковолновая радиация, такая как Х-лучи, называется ионизирующей радиацией.
- •Определенные стадии клеточного цикла оказались более чувствительными к радиации. Рентгеновские лучи могут вызывать
- •Выявление мутагенности: тест Эймса
- •Тест Эймса подвергает ауксотрофные штаммы сальмонеллы (his–)
- •Исправление повреждений ДНК: системы репарации
- •Фотореактивная репарация у прокариот
- •Фотореактивная
- •Эксцизионная репарация у прокариот и эукариот
- •Известно два типа эксцизионной репарации – репарация оснований и репарация нуклеотидов.
- •Репарация оснований в E.coli.
- •Эксцизионная репарация нуклеотидов.
- •Репарация ошибок репликации
- •Но как система репарации должна узнать, какая цепь матричная, а какая вновь синтезированная
- •Пострепликативная репарация и система SOS-репарации
- •Пострепликационная репарация.
- •Пострепликационная репарация :
- •Пострепликационная репарация :
- •У E. coli обнаружена также система SOS-репарации, исправляющая повреждения ДНК другим способом. Если
- •Репарация разрывов двойной спирали у млекопитающих
- •Как и при пострепликативной репарации, при репарации двуцепочечных разрывов происходит гомологичная рекомбинация, поскольку
- •Мобильные генетические элементы
- •Встроенные последовательности
- •Анализ последовательностей большинства известных IS единиц обнаружил характерные для них структуры – инвертированные
- •Элементы бактериальной инсерционной последовательности (IS) содержат ген, который кодирует фермент, называемый транспозазой, что
- •Бактериальные транспозоны
- •Бактериальные транспозоны (Tn элементы) больше, чем IS элементы и содержат белок- кодирующие гены
- •IR сегменты могут гибридизованы после разделения первоначального дуплекса, образуя гетеродуплексные петли, которые можно
- •Система Ac-Ds у кукурузы
- •Позже такие элементы обнаружены и у других организмов. Оказалось, что IS элементы и
- •Транспозоны.
- •Транспозоны:
- •Транспозоны:
- •Сравнение структуры Ac и Ds элементов.
- •Copia и Р-элементы у дрозофилы
- •Каждый элемент copia (транскрибируется в "обильные" количества РНК) состоит из перевернутого концевого повтора
- •Другая группа мобильных элементов дрозофилы – семейство Р- элементов. Это семейство открыли при
- •Мобильные элементы у человека
- •Процессированные псевдогены
Акридиновый красители, такие как профлавин и
акридиновый оранжевый,
примерно таких же размеров, как и пары азотистых оснований и интеркалируются или вклиниваются между пуринами и пиримидинами интактной ДНК.
Интеркаляция вводит искажения в спираль ДНК и вызывает делеции и вставки, которые создают мутации сдвига рамки.
Апуриновые сайты и дезаминирование
Следующий тип мутаций – спонтанная потеря одного или нескольких оснований в двойной спирали ДНК. Наиболее часто такие делеции затрагивают гуанин и аденин и обусловлены разрывом гликозидной связи. Оказалось, что в ДНК культивируемых клеток млекопитающих такие апуриновые (иногда апиримидиновые) сайты или АП-сайты возникают с большой частотой (тысячи за сутки).
Отсутствие азотистого основания в АП-сайте приводит к изменению генетического кода, а также к ошибкам репликации, транскрипции и трансляции, однако большинство таких мутаций устраняется в ходе репарации ДНК.
Причиной некоторых мутаций может стать дезаминирование, т.е. превращение аминогруппы в кето-.
При этом цитозин превращается в урацил, аденин – в гипоксантин, что приводит к ошибкам репликации. Цитозин, обычно спаривающийся с гуанином, превращаясь в урацил, спаривается с аденином, и происходит конверсия Г-Ц в АУ, а после репликации в А-Т. При дезаминировании аденина пара А-Т превращается в Г-Ц, поскольку гипоксантин комплементарно связывается с цитозином.
В качестве дезаминирующего агента можно использовать азотистую кислоту.
Химические мутагены, такие как азотистая кислота (HNO2) может привести к
дезаминированию нуклеотидов : конверсия аминогруппы в кетогруппу.
Таким образом, при мутации транзиции: цитозин и аденин преобразуются в урацил (образующий пару оснований с аденином) и гипоксантин (спаривающийся с цитозином), соответственно.
Ультрафиолет и жесткая радиация
Более длинные волны электромагнитного спектра, включая видимую часть спектра, обладают меньшей энергией воздействия на живые организмы. Чем короче длина волны, тем жестче разрушительное действие излучения на клетки. К 1960 г.
накопилось много фактов, подтверждающих мутагенный эффект УФ in vitro.
Под действием УФ в молекуле ДНК образуются пиримидиновые димеры – обычно между остатками Т. Реже между Ц или Т и Ц.
Димеры нарушают спиральную конформацию и ингибируют нормальную репликацию ДНК, что приводит к появлению ошибок репликации. Интенсивное УФ излучение летально для микроорганизмов.
Воздействие УФ-излучения может привести к созданию димеров тимина в ДНК. Димеры искажают конформацию ДНК и приводят к более высокому проценту ошибок при репликации ДНК.
Если ошибки не исправлены, они могут привести к развитию опухолей.
Ионизирующая радиация
Рентгеновские и гамма-лучи, а также космическое излучение обладает большей энергией, чем УФ. Мутагенное действие ионизирующей радиации было открыто в 20-е годы Г. Меллером и Л. Стадлером.
Проникновение Х-лучей вызывает появление нестабильных свободных радикалов и ионов, которые прямо или косвенно затрагивают азотистые основания в ДНК и вызывают точечные мутации. Ионизирующая радиация вызывает также разрыв фосфодиэфирных связей, приводящих к появлению различных хромосомных перестроек
Существует линейная зависимость между дозой облучения и частотой
мутаций. Оказалось, что мутагенный эффект у некоторых организмов, например, дрозофилы не зависит от интенсивности дозы. Разовое
облучение дозой 100 рентген оказывает примерно тот же эффект что и суммарное облучение этой дозой за несколько экспозиций. У млекопитающих такого нет, видимо из-за особенностей репарации повреждений ДНК, которая может происходить в интервалах между облучениями
Коротковолновая радиация, такая как Х-лучи, называется ионизирующей радиацией.
Она проникают глубоко в ткани, вызывая ионизацию (потерю электронов) молекул, которые становятся реактивными свободными радикалами, что может привести к физическому повреждению ДНК.
Было показано что воздействие ионизирующего излучения непосредственно связано с индуцированием мутаций.
Определенные стадии клеточного цикла оказались более чувствительными к радиации. Рентгеновские лучи могут вызывать разрывы ДНК и хромосом, что приводит к появлению концевых и
внутренних делеций. В митозе во время максимальной спирализации хромосом воздействие Х-лучей максимально. Поэтому облучение используется при лечении опухолей – раковые клетки делятся активнее нормальных и более чувствительны к ионизирующей радиации.
Выявление мутагенности: тест Эймса
Необходимо исследовать возможное мутагенное действие различных веществ. Е. Эймс разработал тест на мутагенность.
Используется несколько штаммов бактерии сальмонеллы, чувствительных к определенным мутациям. Один из штаммов позволяет обнаружить замены оснований, три другие – мутации сдвига рамки. Ни один из мутантных штаммов не синтезирует гистидин, поэтому для их роста его добавляют в среду. Оценивают частоту обратных мутаций – реверсий к дикому типу по сравнению с частотой спонтанных мутаций в контроле.
Многие мутагены относительно безопасны, пока не будут химически активированы в клетках печени, поэтому в тесте Эймса предусмотрена предварительная инкубация с экстрактом клеток печени.
Тест Эймса используется для предварительного отбора потенциальных канцерогенов из числа новых препаратов фармакологической и химической промышленности.
