
- •Белки, наследственность и обмен веществ
- •Фенилкетонурия
- •Для метаболизма аминокислот фенилаланина и тирозина требуется несколько ферментов.
- •Гипотеза один ген – один фермент
- •Опыты Билла и Татума с мутантами нейроспоры
- •Бидл и Татум (Nobel 1958) индуцировали ауксотрофные мутации питания в Neurospora, подвергая бесполые
- •При попытке вырастить мутанты на минимальной среде с добавлением различных органических соединений, мутации
- •Бидл и Татум смогли определить, что каждая генетическая мутация связана с потерей ферментативной
- •Гены и ферменты – биохимический анализ
- •Метаболический путь для синтеза аминокислоты аргинина в Neurospora был установлен путем предоставления смеси
- •Один ген – одна полипептидная цепь
- •Серповидноклеточная анемия
- •Коллинеарность между генами и полипептидами
- •Полинг (Nobel 1954) изолировал нормальные (HbA) и серповидные (HbS) молекулы гемоглобина человека и
- •Белок расщепляется на пептидные фрагменты протеолитическими ферментами.
- •Коллинеарность в гене trpA, который кодирует A субъединицу фермента триптофан синтетазы в E.coli
- •Структура и биологическое разнообразие белков
- •Аминокислоты содержат карбоксильную группу, амино группу и R группу, связанную с центральным углеродом
- •Ковалентная пептидная связь образуется, когда аминогруппа одной аминокислоты реагирует с карбоксильной группой другой
- •Известно 4 уровня белковой структуры. Первичная
- •Водородные связи в регулярных, повторяющихся фрагментах стабилизируют секции полипептида, образуя альфа-спиральную вторичную структуру.
- •Водородная связь может также образовать бета-складчатый лист вторичной структуры в плоскости зигзага.
- •Если вторичная структура белка описывает порядок аминокислот в определенной области полипептидной цепи, то
- •Четвертичная структура характерна только для белков, состоящих из двух и более полипептидных цепей,
- •Некоторые белки, особенно ферменты, являются олигомерами: состоят из более, чем одной полипептидной цепи.
- •Посттрансляционная модификация белков
- •Функции белков
- •Белковые домены и перетасовка экзонов
- •1985 г – мембранный рецептор липопротеинов низкой плотности LDL (в транспорте холестерола) –
- •Ген человеческого рецептора холестерина содержит 18 экзонов, кодирующих 5 доменов в белке.
- •Различные молекулы гемоглобина производится в
- •Генные мутации
- •Классификация мутаций
- •Спонтанные и индуцированные мутации
- •Спонтанные мутации происходят естественно и случайно и, как правило, связаны с нормальными биологическими
- •Герминальные и соматические мутации
- •Другие виды мутаций
- •Следующий тип мутаций касается регуляции работы генов.
- •Уровень спонтанных мутаций
- •Молекулярная основа мутаций
- •Точечные мутации являются заменами оснований, в которых одна пара нуклеотидов изменяется.
- •Таутомерные сдвиги
- •Нуклеотиды могут существовать в таутомерных формах (структурных изомеров) из-за изменения положения протона (таутомерного
- •Мутация транзиции.
- •В следующем раунде репликации, несоответствующие члены пар оснований разделяются; таутомер обычно смещается назад
- •Аналоги оснований
- •5-бромурацил (5-BU) - производное урацила и ведет себя как аналог тимина, который увеличивает
- •Алкилирующие соединения
- •Акридиновые красители и мутации сдвига рамки
- •Акридиновый красители, такие как профлавин и
- •Апуриновые сайты и дезаминирование
- •Причиной некоторых мутаций может стать дезаминирование, т.е. превращение аминогруппы в кето-.
- •Химические мутагены, такие как азотистая кислота (HNO2) может привести к
- •Ультрафиолет и жесткая радиация
- •Воздействие УФ-излучения может привести к созданию димеров тимина в ДНК. Димеры искажают конформацию
- •Ионизирующая радиация
- •Коротковолновая радиация, такая как Х-лучи, называется ионизирующей радиацией.
- •Определенные стадии клеточного цикла оказались более чувствительными к радиации. Рентгеновские лучи могут вызывать
- •Выявление мутагенности: тест Эймса
- •Тест Эймса подвергает ауксотрофные штаммы сальмонеллы (his–)
- •Исправление повреждений ДНК: системы репарации
- •Фотореактивная репарация у прокариот
- •Фотореактивная
- •Эксцизионная репарация у прокариот и эукариот
- •Известно два типа эксцизионной репарации – репарация оснований и репарация нуклеотидов.
- •Репарация оснований в E.coli.
- •Эксцизионная репарация нуклеотидов.
- •Репарация ошибок репликации
- •Но как система репарации должна узнать, какая цепь матричная, а какая вновь синтезированная
- •Пострепликативная репарация и система SOS-репарации
- •Пострепликационная репарация.
- •Пострепликационная репарация :
- •Пострепликационная репарация :
- •У E. coli обнаружена также система SOS-репарации, исправляющая повреждения ДНК другим способом. Если
- •Репарация разрывов двойной спирали у млекопитающих
- •Как и при пострепликативной репарации, при репарации двуцепочечных разрывов происходит гомологичная рекомбинация, поскольку
- •Мобильные генетические элементы
- •Встроенные последовательности
- •Анализ последовательностей большинства известных IS единиц обнаружил характерные для них структуры – инвертированные
- •Элементы бактериальной инсерционной последовательности (IS) содержат ген, который кодирует фермент, называемый транспозазой, что
- •Бактериальные транспозоны
- •Бактериальные транспозоны (Tn элементы) больше, чем IS элементы и содержат белок- кодирующие гены
- •IR сегменты могут гибридизованы после разделения первоначального дуплекса, образуя гетеродуплексные петли, которые можно
- •Система Ac-Ds у кукурузы
- •Позже такие элементы обнаружены и у других организмов. Оказалось, что IS элементы и
- •Транспозоны.
- •Транспозоны:
- •Транспозоны:
- •Сравнение структуры Ac и Ds элементов.
- •Copia и Р-элементы у дрозофилы
- •Каждый элемент copia (транскрибируется в "обильные" количества РНК) состоит из перевернутого концевого повтора
- •Другая группа мобильных элементов дрозофилы – семейство Р- элементов. Это семейство открыли при
- •Мобильные элементы у человека
- •Процессированные псевдогены
Молекулярная основа мутаций
Любое нарушение нуклеотидной последовательности – мутация.
Замещение пуринового основания пуриновым, пиримидиновое – пиримидиновым – транзиция, замена пурина на пиримидин и наоборот
– трансверсия.
Возможна инсерция (встраивание дополнительного основания) или делеция, что приводит к изменению кода и сдвигу рамки считывания

Точечные мутации являются заменами оснований, в которых одна пара нуклеотидов изменяется.
Вставки и делеции могут привести к мутациям сдвига рамки считывания, где все последующие аминокислоты изменяются.
Мутация сдвига рамки, кратная трем нуклеотидам, может восстановить начальные рамки считывания.
Таутомерные сдвиги
В 1953 г. Уотсон и Крик обнаружили, что основания в составе ДНК имеют альтернативную химическую структуру или таутомерную форму.
Предположили, что мутации в паре оснований могут быть обусловлены таутомерными сдвигами. Наиболее стабильные таутомерные формы образуют обычные водородные связи, которые удерживают две спирали ДНК. Реже встречаются таутомеры, образующие водородные связи с некомплементарными основаниями, хотя такое спаривание и происходит между пурином и пиримидином.
Во время репликации ДНК редкие таутомерные формы оснований спариваются с некомплементарными основаниями, а в процессе следующей репликации каждое из этих неправильно спаренных оснований связывается с комплементарным пурином или пиримидином, в результате – транзиция.

Нуклеотиды могут существовать в таутомерных формах (структурных изомеров) из-за изменения положения протона (таутомерного сдвига). Реже, переходные таутомеры
могут образовывать водородные связи с некомплементарными основаниями. Аномальное спаривание всегда происходит между пиримидином и пурином, как показано в T-G и C-A-парах.

Мутация транзиции.
Редкие таутомеры в матричной цепи спариваются с некомплементарными основаниями во время репликации ДНК.
В этом примере, аномальная T - A пара образует аномальную C - A пару в одной дочерней спирали.

В следующем раунде репликации, несоответствующие члены пар оснований разделяются; таутомер обычно смещается назад к своему нормальному изомеру.
Репликация 2 цепей при обычном спаривании оснований приводит к
точечной мутации, называемой
мутацией транзиции, при которой пурины заменяются пуринами, или пиримидины заменяются на пиримидины.
В этом примере, T - A пара дикого типа мутировала в C - G.
Аналоги оснований
В процессе репликации ДНК обычные пиримидиновые и пуриновые основания могут замещаться химически модифицированными аналогами. Пример – производное урацила 5-бромурацил, соединяющийся с дезоксирибозой, образуя бромдезоксиуридин. Наличие брома вместо метильной группы увеличивает вероятность таутомерного сдвига и транзиции пары А-Т в пару Г-Ц. Есть и другие – 2-аминопурин – аналог аденина, который спаривается с Т или Ц и приводит к аналогичной транзиции.
Поскольку такие аналоги индуцируют мутации типа транзиций, их используют для индукции обратных мутаций, т е реверсии к дикому типу.
Реверсии протекают и спонтанно, но с гораздо меньшей частотой

5-бромурацил (5-BU) - производное урацила и ведет себя как аналог тимина, который увеличивает вероятность таутомерного сдвига от нормальной кето формы в енольную форму, неправильно спариваясь с гуанином вместо аденина.
После одного раунда репликации результат мутации транзиции - A - T в G - C.

Алкилирующие соединения
Один из примеров – горчичные газы – серосодержащие мутагены, известные с Первой мировой войны.
Механизм – метильная или этильная группа, присоединяющаяся к амино- или кетогруппе нуклеотидов. Сейчас основной агент – этилметансульфонат, алкилирующий кетогруппы Г и Т.
Мутация также типа транзиции.
Акридиновые красители и мутации сдвига рамки
Другие химические мутагены вызывают мутации сдвига рамки считывания, обусловленные вставкой или делецией одного или нескольких нуклеотидов. Индукция таких мутаций – на примере акридиновых красителей – профлавина и акридинового оранжевого, молекулы которых близки по размерам к нуклеотидам и могут встраиваться между пуринами или пиримидинами в молекуле ДНК. Это приводит к искривлению двойной спирали и к появлению делеций или инсерций.
Предполагается, что мутации сдвига рамки появляются вследствие брешей, возникающих в молекуле ДНК во время репликации или рекомбинации, когда есть возможность смещения и неправильного спаривания нуклеотидов одной цепи с нуклеотидами другой. Считается, что встраивание молекул акридиновых красителей между неправильно спаренными основаниями стабилизирует такие измененные структуры. Если это так, то вероятность сохранения неправильно спаренной конфигурации нуклеотидов во время синтеза ДНК и воссоединения брешей довольно высока, что обусловливает инсерцию или делецию оснований на одной из цепей.