
- •Белки, наследственность и обмен веществ
- •Фенилкетонурия
- •Для метаболизма аминокислот фенилаланина и тирозина требуется несколько ферментов.
- •Гипотеза один ген – один фермент
- •Опыты Билла и Татума с мутантами нейроспоры
- •Бидл и Татум (Nobel 1958) индуцировали ауксотрофные мутации питания в Neurospora, подвергая бесполые
- •При попытке вырастить мутанты на минимальной среде с добавлением различных органических соединений, мутации
- •Бидл и Татум смогли определить, что каждая генетическая мутация связана с потерей ферментативной
- •Гены и ферменты – биохимический анализ
- •Метаболический путь для синтеза аминокислоты аргинина в Neurospora был установлен путем предоставления смеси
- •Один ген – одна полипептидная цепь
- •Серповидноклеточная анемия
- •Коллинеарность между генами и полипептидами
- •Полинг (Nobel 1954) изолировал нормальные (HbA) и серповидные (HbS) молекулы гемоглобина человека и
- •Белок расщепляется на пептидные фрагменты протеолитическими ферментами.
- •Коллинеарность в гене trpA, который кодирует A субъединицу фермента триптофан синтетазы в E.coli
- •Структура и биологическое разнообразие белков
- •Аминокислоты содержат карбоксильную группу, амино группу и R группу, связанную с центральным углеродом
- •Ковалентная пептидная связь образуется, когда аминогруппа одной аминокислоты реагирует с карбоксильной группой другой
- •Известно 4 уровня белковой структуры. Первичная
- •Водородные связи в регулярных, повторяющихся фрагментах стабилизируют секции полипептида, образуя альфа-спиральную вторичную структуру.
- •Водородная связь может также образовать бета-складчатый лист вторичной структуры в плоскости зигзага.
- •Если вторичная структура белка описывает порядок аминокислот в определенной области полипептидной цепи, то
- •Четвертичная структура характерна только для белков, состоящих из двух и более полипептидных цепей,
- •Некоторые белки, особенно ферменты, являются олигомерами: состоят из более, чем одной полипептидной цепи.
- •Посттрансляционная модификация белков
- •Функции белков
- •Белковые домены и перетасовка экзонов
- •1985 г – мембранный рецептор липопротеинов низкой плотности LDL (в транспорте холестерола) –
- •Ген человеческого рецептора холестерина содержит 18 экзонов, кодирующих 5 доменов в белке.
- •Различные молекулы гемоглобина производится в
- •Генные мутации
- •Классификация мутаций
- •Спонтанные и индуцированные мутации
- •Спонтанные мутации происходят естественно и случайно и, как правило, связаны с нормальными биологическими
- •Герминальные и соматические мутации
- •Другие виды мутаций
- •Следующий тип мутаций касается регуляции работы генов.
- •Уровень спонтанных мутаций
- •Молекулярная основа мутаций
- •Точечные мутации являются заменами оснований, в которых одна пара нуклеотидов изменяется.
- •Таутомерные сдвиги
- •Нуклеотиды могут существовать в таутомерных формах (структурных изомеров) из-за изменения положения протона (таутомерного
- •Мутация транзиции.
- •В следующем раунде репликации, несоответствующие члены пар оснований разделяются; таутомер обычно смещается назад
- •Аналоги оснований
- •5-бромурацил (5-BU) - производное урацила и ведет себя как аналог тимина, который увеличивает
- •Алкилирующие соединения
- •Акридиновые красители и мутации сдвига рамки
- •Акридиновый красители, такие как профлавин и
- •Апуриновые сайты и дезаминирование
- •Причиной некоторых мутаций может стать дезаминирование, т.е. превращение аминогруппы в кето-.
- •Химические мутагены, такие как азотистая кислота (HNO2) может привести к
- •Ультрафиолет и жесткая радиация
- •Воздействие УФ-излучения может привести к созданию димеров тимина в ДНК. Димеры искажают конформацию
- •Ионизирующая радиация
- •Коротковолновая радиация, такая как Х-лучи, называется ионизирующей радиацией.
- •Определенные стадии клеточного цикла оказались более чувствительными к радиации. Рентгеновские лучи могут вызывать
- •Выявление мутагенности: тест Эймса
- •Тест Эймса подвергает ауксотрофные штаммы сальмонеллы (his–)
- •Исправление повреждений ДНК: системы репарации
- •Фотореактивная репарация у прокариот
- •Фотореактивная
- •Эксцизионная репарация у прокариот и эукариот
- •Известно два типа эксцизионной репарации – репарация оснований и репарация нуклеотидов.
- •Репарация оснований в E.coli.
- •Эксцизионная репарация нуклеотидов.
- •Репарация ошибок репликации
- •Но как система репарации должна узнать, какая цепь матричная, а какая вновь синтезированная
- •Пострепликативная репарация и система SOS-репарации
- •Пострепликационная репарация.
- •Пострепликационная репарация :
- •Пострепликационная репарация :
- •У E. coli обнаружена также система SOS-репарации, исправляющая повреждения ДНК другим способом. Если
- •Репарация разрывов двойной спирали у млекопитающих
- •Как и при пострепликативной репарации, при репарации двуцепочечных разрывов происходит гомологичная рекомбинация, поскольку
- •Мобильные генетические элементы
- •Встроенные последовательности
- •Анализ последовательностей большинства известных IS единиц обнаружил характерные для них структуры – инвертированные
- •Элементы бактериальной инсерционной последовательности (IS) содержат ген, который кодирует фермент, называемый транспозазой, что
- •Бактериальные транспозоны
- •Бактериальные транспозоны (Tn элементы) больше, чем IS элементы и содержат белок- кодирующие гены
- •IR сегменты могут гибридизованы после разделения первоначального дуплекса, образуя гетеродуплексные петли, которые можно
- •Система Ac-Ds у кукурузы
- •Позже такие элементы обнаружены и у других организмов. Оказалось, что IS элементы и
- •Транспозоны.
- •Транспозоны:
- •Транспозоны:
- •Сравнение структуры Ac и Ds элементов.
- •Copia и Р-элементы у дрозофилы
- •Каждый элемент copia (транскрибируется в "обильные" количества РНК) состоит из перевернутого концевого повтора
- •Другая группа мобильных элементов дрозофилы – семейство Р- элементов. Это семейство открыли при
- •Мобильные элементы у человека
- •Процессированные псевдогены
Белки, наследственность и обмен веществ
Началом биохимической генетики считается обоснование В. Бэтсоном связи между генами и ферментами на основании работ А. Гаррода начала 20 века. Гаррод при изучении причин алькаптонурии выяснил, что это моногенный рецессивный признак, т. е. гены контролируют химические реакции, протекающие в организме, а наследственные заболевания являются результатом нарушения нормального обмена веществ.
Фенилкетонурия
Наследуется как аутосомно-рецессивный признак, вызывает нарушение обмена веществ, сопряженное с умственной отсталостью. У больных блокировано превращение фенилаланина в тирозин (у тирозина есть ОН-группа, у фенилаланина нет).
Активность фермента фенилаланин гидроксилазы у больных не превышает 30% от нормы. При ранней диагностике болезнь можно предотвратить строгой диетой без фенилаланина.
В медицине обнаружен целый ряд болезней, связанных с генетическими нарушениями. Сейчас известны тысячи таких болезней

Для метаболизма аминокислот фенилаланина и тирозина требуется несколько ферментов.
Различные блоки метаболизма из-за мутаций приводят к дефектных ферментам и нарушениям - фенилкетонурия, тирозинемия, альбинизм и алькаптонурия.
Гипотеза один ген – один фермент
В 1933 г. Дж. Бидл экспериментально доказал прямое участие генов в синтезе ферментов, что позже в 1940-е гг. было показано в опытах Дж. Бидла и Э. Татума с нейроспорой. Мутации генов могут быть ассоциированы с утратой функций некоторых ферментов.
Опыты Билла и Татума с мутантами нейроспоры
Облучение спор гриба Х-лучами резко увеличило число мутаций. Мутанты выращивали на полной среде, т.к. из-за нарушений метаболизма на минимальной среде они расти не могут. Выращенные культуры переносили на минимальную среду, где все мутанты прекращали рост, но на разных средах можно было отобрать мутантов с нарушениями того или иного пути метаболизма. Результат - добавленное в минимальную среду вещество, восстанавливающее рост клеток, представляет собой субстрат, не синтезирующийся в результате мутации. Тестирование более 80000 спор доказало взаимосвязь генетических и биохимических нарушений в клетке. Выводом явилась гипотеза – «один ген – один фермент».

Бидл и Татум (Nobel 1958) индуцировали ауксотрофные мутации питания в Neurospora, подвергая бесполые конидии (споры) действию радиации.

При попытке вырастить мутанты на минимальной среде с добавлением различных органических соединений, мутации питательных веществ могут быть точно определены.

Бидл и Татум смогли определить, что каждая генетическая мутация связана с потерей ферментативной активности синтезировать какой-то витамин или аминокислоту.
Это привело их к гипотезе, что один ген определяет один фермент.
(Теперь мы знаем, что не все белки - ферменты и некоторые белки состоят из более, чем одной полипептидной цепи.)
Гены и ферменты – биохимический анализ
Одним из первых исследовали метаболизм аргинина у нейроспоры. А. Серб и Н. Горовиц – 7 мутантных штаммов для роста которых требовался аргинин. Им удалось определить, какие биохимические реакции приводят к синтезу аргинина в клетках и продемонстрировать возможности генетического анализа для биохимии.
Исследовали способность каждого штамма восстанавливать рост клеток после добавления в минимальную среду цитруллина или орнитина – химически близких аминокислот. Если рост клеток восстанавливался, значит вещество вовлечено в биосинтез аргинина. Оказалось, что по меньшей мере в одном штамме эти вещества взаимозаменяемы и восстанавливают рост клеток Четыре из семи штаммов росли при добавлении орнитина, цитруллина или аргинина (arg 4-7), два (arg 2 и 3) - цитруллина и аргинина, один (arg 1) – только аргинина, Исходя из этого была предложена схема мутаций и блокировки синтеза аргинина: предшественник – орнитин – цитруллин – аргинин.

Метаболический путь для синтеза аминокислоты аргинина в Neurospora был установлен путем предоставления смеси добавок семи различных ауксотрофным по аргинину
мутантам.
•Мутанты arg 4–7 растут при добавке citrulline, ornithine, или arginine.
•Мутанты arg 2 и arg 3 растут при добавке citrulline или arginine.
•Мутант arg 1 растет, только если arginine добавлен; ни citrulline, ни ornithine не позволяет рост.