- •Строение и эволюция геномов
- •Генотип – совокупность всех генов организма
- •Отличие понятий геном и генотип
- •Сегодня под геномом понимают прежде всего информационное содержание
- •Сколько генов у разных видов?
- •Первые представления о геномах – это генетические карты организмов
- •Хронология расшифровки геномов
- •Полностью расшифрованы 1154 генома:
- •Геном человека
- •Что есть в геноме?
- •50 kb генома человека
- •Современное определение гена
- •Прокариотический ген
- •Число генов – растет ли оно пропорционально уровню сложности?
- •Число генов и сложность организма
- •Возможное объяснение малой разницы в числе генов
- •Гомологичные гены
- •Мультигенные семейства
- •Как появляются новые гены?
- •Родительский ген
- •Родительский ген
- •Родительский ген
- •Всегда ли после дупликации образуется новый ген?
- •Семейство глобиновых генов человека
- •β-глобиновые гены человека
- •Выход
- •Эволюция генов β-субъединицы гемоглобина
- •Псевдогены
- •Псевдогены в геноме человека
- •Механизм образования псевдогенов через обратную транскрипцию зрелой м-РНК
- •В псевдогены превращаются гены, на которые не действует отбор
- •Цветовое зрение
- •Приматы: дупликация и дивергенция
- •Пример: гены гомеобокса (Hox) дрозофилы – один кластер
- •Позвоночные: 4 кластера генов гомеобокса (Hox)
- •Как появляются новые гены?
- •Прокариотический ген
- •Интроны
- •Интроны и экзоны в генах человека
- •Количество интронов в гене возрастает у эукариот с усложнением организации
- •Зачем нужны интроны?
- •Альтернативный сплайсинг
- •Блочный принцип строения генов: одни и те же экзоны встречаются в разных генах
- •Механизмы обмена экзонами
- •Незаконный кроссинговер
- •Некоторые гены находятся в интронах других генов
- •Гены РНК
- •Типы РНК
- •Скорость эволюции генов
- •Гены меняются с разной скоростью
- •Гомология генов человека с другими видами.
- •Итоги – механизмы эволюции генов
- •Горизонтальный перенос
- •Горизонтальный перенос
- ••Горизонтальный перенос мог быть основным
- •Сусложнением клеточной структуры прокариот и превращением генома в целостную иерархическую систему генов (рост
- •Размеры геномов
- •100 млрд
- •Примеры С-парадокса
- •Примеры С-парадокса
- •Что есть в геноме?
- •50 kb генома человека
- •Человек
- •Плотность генов
- •У высших форм меньше плотность генов
- •в1990 г Археи выделены
- •Геномы прокариот и эукариот
- •Вчем смысл избыточности ДНК?
- •Мобильные элементы (транспозоны)
- •Мобильные элементы – это особый класс ДНК
- •Строение мобильного элемента
- •Механизмы перемещения
- •Ретротранспозоны
- •Как много мобильных элементов в геноме?
- •4 класса транспозонов млекопитающих
- •Зачем нужны мобильные элементы?
- •Ретротранспозоны очень похожи на вирусы
- •Что есть в геноме?
- •Сателлитная ДНК
- •Сателлитная ДНК
- •Есть ли у сателлитной ДНК какие-либо функции?
- •Эволюционная геномика
- •Фанерозой 550
- •Применение метагеномики для построения естественной филогении
- •Молекулярная филогения прокариот
- •Выводы
- •Геномы человека и шимпанзе
- •Геном неандертальца
В псевдогены превращаются гены, на которые не действует отбор
У млекопитающих ~ 1 000 генов
обонятельных рецепторов.
около 40% их стали псевдогенами в линии приматов
У человека их меньше, чем у шимпанзе и функциональными осталось только 500.
Обратные примеры – превращения псевдогена в нормальный ген – крайне редки, но известны.
Недавно обнаружен такой переход у гена рибонуклеазы коров.
Цветовое зрение
Человек – 3 пигмента, |
Общий предок всех |
|
наземных позвоночных – |
||
3-хроматическое зрение |
||
4-хроматическое |
||
|
||
|
Птицы его сохранили |
Приматы: дупликация и дивергенция
Утеря двух генов
Пример: гены гомеобокса (Hox) дрозофилы – один кластер
+
Ubx
Antp
Carroll S.B. et al. From DNA to Diversity (2001) Blackwell Science
Позвоночные: 4 кластера генов гомеобокса (Hox)
Расположение на хромосомах человека
Carroll S.B. et al. From DNA to Diversity (2001) Blackwell Science
Как появляются новые гены?
1.Дупликация
2.Комбинация частей других генов
Прокариотический ген
Регуляторна |
|
|
|
1 т.н.п. |
|
Средняя длина |
||
Промотор Терминатор |
кодирующей части |
|||||||
я |
~ 300 кодонов |
|||||||
часть |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Средняя длина
Эукариотический ген |
кодирующей части |
|
|
|
~ 450 кодонов |
10-30
Регуляторна |
Промотор |
|
т.н.п. |
|
|
|
Терминатор |
|||||
|
Экзон 1 Экзон 2 |
Экзон 3 |
Экзон 4 |
|
||||||||
я |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
часть |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Отличия: намного длиннее за счет регуляторной части и интронов
Интроны
Появление интронов связывают с появлением эукариот
У архей интроны только в генах р-РНК и т- РНК
средний ген человека содержит 8 интронов
максимальное количество – в гене титина, белка, участвующего в сокращении мышц – 177 интронов.
Сам ген кодирует 34 350 аминокислот и является самым длинным геном человека
Интроны и экзоны в генах человека
Средний ген – |
27 000 н.п. |
Средний экзон – |
150 н.п. |
Средний интрон – 3 000 н.п.
Среднее число кодируемых аминокислот – 450
