- •Строение и эволюция геномов
- •Генотип – совокупность всех генов организма
- •Отличие понятий геном и генотип
- •Сегодня под геномом понимают прежде всего информационное содержание
- •Сколько генов у разных видов?
- •Первые представления о геномах – это генетические карты организмов
- •Хронология расшифровки геномов
- •Полностью расшифрованы 1154 генома:
- •Геном человека
- •Что есть в геноме?
- •50 kb генома человека
- •Современное определение гена
- •Прокариотический ген
- •Число генов – растет ли оно пропорционально уровню сложности?
- •Число генов и сложность организма
- •Возможное объяснение малой разницы в числе генов
- •Гомологичные гены
- •Мультигенные семейства
- •Как появляются новые гены?
- •Родительский ген
- •Родительский ген
- •Родительский ген
- •Всегда ли после дупликации образуется новый ген?
- •Семейство глобиновых генов человека
- •β-глобиновые гены человека
- •Выход
- •Эволюция генов β-субъединицы гемоглобина
- •Псевдогены
- •Псевдогены в геноме человека
- •Механизм образования псевдогенов через обратную транскрипцию зрелой м-РНК
- •В псевдогены превращаются гены, на которые не действует отбор
- •Цветовое зрение
- •Приматы: дупликация и дивергенция
- •Пример: гены гомеобокса (Hox) дрозофилы – один кластер
- •Позвоночные: 4 кластера генов гомеобокса (Hox)
- •Как появляются новые гены?
- •Прокариотический ген
- •Интроны
- •Интроны и экзоны в генах человека
- •Количество интронов в гене возрастает у эукариот с усложнением организации
- •Зачем нужны интроны?
- •Альтернативный сплайсинг
- •Блочный принцип строения генов: одни и те же экзоны встречаются в разных генах
- •Механизмы обмена экзонами
- •Незаконный кроссинговер
- •Некоторые гены находятся в интронах других генов
- •Гены РНК
- •Типы РНК
- •Скорость эволюции генов
- •Гены меняются с разной скоростью
- •Гомология генов человека с другими видами.
- •Итоги – механизмы эволюции генов
- •Горизонтальный перенос
- •Горизонтальный перенос
- ••Горизонтальный перенос мог быть основным
- •Сусложнением клеточной структуры прокариот и превращением генома в целостную иерархическую систему генов (рост
- •Размеры геномов
- •100 млрд
- •Примеры С-парадокса
- •Примеры С-парадокса
- •Что есть в геноме?
- •50 kb генома человека
- •Человек
- •Плотность генов
- •У высших форм меньше плотность генов
- •в1990 г Археи выделены
- •Геномы прокариот и эукариот
- •Вчем смысл избыточности ДНК?
- •Мобильные элементы (транспозоны)
- •Мобильные элементы – это особый класс ДНК
- •Строение мобильного элемента
- •Механизмы перемещения
- •Ретротранспозоны
- •Как много мобильных элементов в геноме?
- •4 класса транспозонов млекопитающих
- •Зачем нужны мобильные элементы?
- •Ретротранспозоны очень похожи на вирусы
- •Что есть в геноме?
- •Сателлитная ДНК
- •Сателлитная ДНК
- •Есть ли у сателлитной ДНК какие-либо функции?
- •Эволюционная геномика
- •Фанерозой 550
- •Применение метагеномики для построения естественной филогении
- •Молекулярная филогения прокариот
- •Выводы
- •Геномы человека и шимпанзе
- •Геном неандертальца
50 kb генома человека
|
ген |
МЭ |
|
|
LTR-элемент |
|
Микросателлит |
||||
Микросателлит |
|
||||
ГАГАГАГА… |
|
ТАТТ×n |
|
||
SINE-элементы LINE-элементы
ген
экзоны гена
МЭ |
ген |
уникальная ДНК с неизвестными функциями |
псевдоген
Современное определение гена
Ген – участок молекулы ДНК,
содержащий информацию об одной
функциональной молекуле
Белке (полипептидной цепочке)
РНК : транспортной, рибосомной или регуляторной
сприлегающими регуляторными последовательностями
Прокариотический ген
Регуляторна |
|
|
|
1 т.н.п. |
|
Средняя длина |
||
Промотор Терминатор |
кодирующей части |
|||||||
я |
~ 300 кодонов |
|||||||
часть |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Средняя длина
Эукариотический ген |
кодирующей части |
|
|
|
~ 450 кодонов |
10-30
Регуляторна |
Промотор |
|
т.н.п. |
|
|
|
Терминатор |
|||||
|
Экзон 1 Экзон 2 |
Экзон 3 |
Экзон 4 |
|
||||||||
я |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
часть |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Отличия: намного длиннее за счет регуляторной части и интронов
Число генов – растет ли оно пропорционально уровню сложности?
Число генов возрастает в ходе эволюции от простых форм к сложным.
Но это возрастание гораздо меньше, чем можно было предполагать исходя из сложности строения организмов.
Число генов и сложность организма
Человек
~ 30 000
Нематода
~ 20 000
1 мм 959 клеток
Дрожжи
~ 6 000
Arabidopsis thaliana
~ 25 000
Кукуруза
~ 50 000
Бактерии
~ 5 000
одна клетка
Возможное объяснение малой разницы в числе генов
Усложнение строения достигается за счет системы управления генами
Изменения на верхних этажах иерархии влекут сразу множество изменений в функционировании всего генома
Гомологичные гены
Гены, имеющие общее эволюционное происхождение
В одном геноме |
У разных видов |
Паралоги |
Ортологи |
Мультигенные семейства
Гены одного генома, имеющие общее происхож- дение и сходные, хотя и не одинаковые функции
ген
Хромосомы |
Похожие гены |
одного генома |
Этот тип гомологичных генов называют
паралогами
Как появляются новые гены?
Основной путь
возникновения новых генов – дупликация
Сусуми Оно Evolution by Gene Duplication
1970
Родительский ген
Другие случайные Основная функции функция
