- •Организация ДНК у различных организмов
- •Хромосомы вирусов и бактерий
- •Геном вирусов
- •Геном вирусов
- •Вирусные хромосомы могут состоять из ДНК либо РНК, и быть одно- или двуцепочечными.
- •Молекулы вирусных нуклеиновых кислот были обнаружены с помощью электронной микроскопии. Общая особенность организации
- •Бактериофаг λ (лямбда) обладает линейной двухцепочечной молекулой ДНК в белковой оболочке, которая сближается,
- •Бактериофаг Т2 имеет двухцепочечный, линейный геном ДНК.
- •Бактерии, такие как
- •Нуклеоид
- •ДНК митохондрий и хлоропластов
- •Молекулярная организация и продукты генов митохондриальной ДНК
- •Несколько характерных черт мтДНК –
- •Митохондриальная ДНК человека
- •Митохондриальная ДНК человека
- •Митохондриальная ДНК
- •Молекулярная организация и продукты генов ДНК хлоропластов
- •Некоторые гены хлоропластов кодируют продукты, необходимые для трансляции. У высших растений два набора
- •Специализированные хромосомы
- •Политенные хромосомы
- •Гигантские политенные хромосомы,
- •На вставке показан относительный размер нормальных митотических хромосом.
- •Гипотетическая модель, показывающая, как 1024 хроматиды каждой из политенных хромосом ориентированы в хромосоме,
- •Хромосомы типа ламповых щеток
- •Хромосомы типа
- •Организация эукариотического хроматина
- •Хромосомы
- •Структура хроматина и нуклеосом
- •В эукариотических хроматине ДНК ассоциирована с различными белками, в том числе гистоновыми и
- •Модель структуры хроматина была разработана в 70-х гг.
- •Повторяющиеся единицы нуклеосом напоминают
- •Сердцевина нуклеосомы или коровая частица (146 п.н.) остается после ферментативного расщепления некоторых 200
- •1.На первом уровне упаковки ДНК, 2-нм в диаметре молекула ДНК наматывается около 2
- •b.11-нм нить упакована в 30-нм соленоид, состоящий из нескольких нуклеосом, свернутых вместе.
- •Процесс формирования хроматиновых нитей – процесс образования митотических хромосом.
- •Уровни компактизации ДНК
- •Нуклеосома
- •Нуклеосомная нить
- •Нуклеомерная фибрилла
- •Метафазная хромосома
- •Уровни компактизации ДНК
- •Хроматин
- •Гетерохроматин
- •Хромосомные препараты могут быть денатурированы нагреванием и
- •Организация ДНК у эукариот
- •Повторяющиеся последовательности ДНК
- •Repetitive DNA can be grouped into many categories.
- •ДНК-повторы и сателлитная ДНК
- •Часть ДНК, ренатурирующая быстрее, – с высокой
- •Большинство эукариотических ДНК показывают равномерную плотность (что указывает на аналогичные отношения GC /
- •Сателлитная ДНК – высокоповторенная – с короткими повторами, расположенными группами в очень специфических
- •Сателлитная ДНК высокоповторенная и демонстрирует быструю кинетику реассоциации.
- •Результаты – сателлитная ДНК отличается от остальной по молекулярному составу, последовательности ее –
- •Последовательности ДНК центромерных и теломерных участков хромосом
- •centromeric DNA.
- •Теломеры обеспечивают стабильность хромосомы. Теломеры всех хромосом в организме имеют характерную нуклеотидную последовательность.
- •Теломерная ДНК на концах линейных хромосом эукариот состоит из коротких тандемных повторов: Последовательность
- •ДНК-повторы средней длины VNTR и динуклеотидные повторы
- •SINE и LINE элементы
- •L1 и Alu - два основных типа ретротранспозонов без LTR (длинные концевые повторы
- •Множественные копии генов средней длины
Нуклеоид
(прокариоты)
1.Это двухцепочечная кольцевая суперспирализованная молекула ДНК
2.Размер генома 3 - 5×106 п.н.
3.ДНК находится в комплексе с функциональными и, возможно, структурными (гистоноподобными) белками.
4.Молекула ДНК монорепликонная (1 ori-сайт).
5.В области ori-сайта нуклеоид прикреплен к цитоплазматической мембране.
6.Кодирующие последовательности ДНК составляют 70% генома, 30% - межгенные промежутки и регуляторные области.
7.Около 4 000 генов
8.Характерна оперонная структура.
9.Интроны отсутствуют.
ДНК митохондрий и хлоропластов
Митохондрии и хлоропласты содержат собственные молекулы ДНК с собственными системами, необходимыми для экспрессии генов этой ДНК. Организация ДНК органелл оказалась более схожей с организацией ДНК у бактерий и вирусов
Молекулярная организация и продукты генов митохондриальной ДНК
Митоходриальная ДНК (мтДНК) у большинства эукариот – двуцепочечная кольцевая молекула, реплицируется полуконсервативно и не связана с белками. Содержит около 16-18 т.п.н. – у дрожжей 75 т.п.н., у арабидопсиса до 360 т.п.н. В митохондриях позвоночных 5-10 молекул ДНК на органеллу, в хлоропластах растений 20-40 копий на органеллу.
Несколько характерных черт мтДНК –
убольшинства отсутствуют интроны и ДНК-повторы, генетический код отличен от стандартного,
учеловека кодирует 2 рРНК, 22 тРНК и ряд полипептидов для клеточного дыхания (другая часть этих полипептидов кодируется ядерной ДНК, т.е. наблюдается совместное кодирование).
Рибосомы в органеллах отличаются от цитоплазматических – они ближе к прокариотическим. Определенные белковые продукты ядерных генов необходимы для биологической активности митохондрий.
Митохондриальная ДНК человека
1.Кольцевая суперспирализованная двухцепочечная молекула ДНК.
2.Длина молекулы ДНК – 16 569 п.н.
3.37 генов: 2 гена рРНК, 13 генов, кодирующих белки, 22 гена тРНК.
4.Есть перекрывающиеся гены
5.1 ori-сайт (монорепликонная молекула ДНК)
6.Комплементарные цепи различаются по удельной плотности. Одна цепь – тяжелая (содержит много пуринов), другая – легкая (содержит много пиримидинов).
7.2 промотора (по одному на каждой цепи)
8.Синтезируются полицистронные РНК
Митохондриальная ДНК человека
9.Процессинг РНК:
•Разрезание полицистронной РНК
•Полиаденилирование 3’-концов мРНК
•Редактирование РНК (модификация или замена нуклеотидов)
КЭПирования нет.
Сплайсинга нет (в митохондриальных генах человека интроны отсутствуют).
10.ДНК не метилируется.
11.Митохондриальная ДНК наследуется по материнскому типу
12.Есть отклонения от универсального генетического кода:
•Кодон АУА кодирует метионин (вместо изолейцина)
•Кодон УГА кодирует триптофан (вместо стоп-кодона)
•Кодоны АГА и АГГ являются стоп-кодонами (в универсальном коде кодируют аргинин )
Митохондриальная ДНК
Цитохром b
12S рРНК
16S рРНК
Ori
Субъединицы |
|
Субъединицы |
|
|
NADH- |
||
NADH- |
тРНК |
||
дегидрогеназы |
|||
дегидрогеназы |
|
||
|
|
|
|
Субъединица |
Субъединицы |
|
цитохромоксидазы |
цитохромоксидазы |
|
АТФ-синтетаза |
|
|
Молекулярная организация и продукты генов ДНК хлоропластов
Размер ДНК хлоропластов (хлДНК) намного больше мтДНК
– 120-200 т.п.н. Сходство – кольцевая двуцепочечная ДНК, реплицируется полуконсервативно и не ассоциирована с белками.
Хламидомонада – 75 копий (каждая 195 т.п.н.) на органеллу, у высших растений - множественные копии в каждой органелле, но их размер меньше (134 т.п.н. у гороха).
