
- •Популяционная генетика
- •Естественный отбор как механизм адаптивной эволюции был предложен А. Уоллесом и Ч. Дарвином
- •При действии всех четырех факторов в популяции при смене поколений изменяется соотношение фенотипов,
- •Популяции и генофонд
- •По определению Н.В, Тимофеева-Ресовского, популяция - это группа особей определенного вида, которая:
- •Расчет числа аллелей
- •Делеция в гене человека CCR5 делает особь устойчивой к инфицированию HIV- 1 изменением
- •Частота (в %) аллеля
- •Закон Харди-Вайнберга
- •Для популяции размножающихся половым путем диплоидных организмов есть два шага в переносе частот
- •Для популяции в равновесии Харди-Вайнберга, частоты генотипов могут быть рассчитаны из частот аллелей
- •При равновесии Харди-Вайнберга, частоты аллелей в
- •Следствия закона Харди-Вайнберга
- •Тесты на равновесие
- •Если в популяции 283 человека, из которых 223 имеют генотип 1/1, 57 –
- •Расширение закона Харди-Вайнберга
- •Calculating Genotype Frequencies for Multiple Alleles Where
- •Применение закона Харди-Вайнберга – расчет частоты гетерозигот
- •При равновесии Харди-Вайнберга, частоты всех трех генотипов могут
- •Факторы, изменяющие частоту аллелей в популяции
- •Естественный отбор
- •Различие выживаемости и (или) репродуктивного успеха особей – естественный отбор.
- •Приспособленность и отбор
- •Как отбор действует против вредных аллелей?
- •Естественный отбор
- •При неполном доминировании у гетерозигот -промежуточная приспособленность, возможен другой вариант – вредный в
- •Вредный аллель (a)
- •Для популяции с начальной частотой аллеля Δ32 0.10, и 1%-ной смертности 1/1 (iначальная
- •Два важных вывода – за тысячи поколений даже слабый отбор может привести к
- •Отбор в природных популяциях
- •Рассмотрим, например, доминантную мутацию R (для инсектицидной устойчивости), которая появляется сначала с низкой
- •Как частоты генотипов в популяции личинок комаров A. aegypti изменяются в ответ на
- •Естественный отбор и количественные признаки
- •При направленном отборе часто отбираются признаки, представляющие крайние фенотипические варианты. Если признак полигенный,
- •Стабилизирующий отбор действует против экстремальных фенотипов, благоприятствуя средним особям.
- •Дизруптивный отбор противоположен стабилизирующему отбору из-за отбора против промежуточных типов.
- •Естественный отбор может влиять на количественные признаки тремя способами:
- •Мутации
- •Чтобы установить, являются ли мутации существенной движущей силой, изменяющей частоты аллелей, нужно измерить
- •Скорость мутагенеза – отношение числа новых мутантных аллелей к определенному числу гамет.
- •Пусть мутация возникает как доминантная у 2 из 100000 новорожденных. Родители фенотипически нормальны.
- •В популяции из 500000 человек у всех генотип dd. Первоначальная частота аллеля d
- •Мутационный процесс в популяции.
- •В общем случае, имея в поколении g два аллеля А с частотой р
- •При скорости мутации (μ) 1.0 x 10-5, требуется 70,000
- •Мутагенез создает материал для эволюции, но частота аллелей, возникших при мутации, обычно определяется
- •Миграции
- •Если в соседних популяциях частоты аллеля А различны, при миграции особей из одной
- •На континенте частота А составляет pm, на острове pi. При
- •Очевидно, что изменение частоты аллеля пропорционально разности частот в соседних популяциях и доле
- •Используя эту формулу можно оценить интенсивность миграции в популяции.
- •Миграция – движущая сила эволюции.
- •Если значение m велико или частоты в двух популяциях сильно различаются, то частота
- •Дрейф генов
- •Для популяционно-генетических исследований большое значение имеет большой объем выборки.
- •Чем меньше численность популяции, тем выше степень
- •Дрейф генов в лабораторных популяциях дрозофилы.
- •Аллели могут распространяться по всей популяции или исчезать в силу только случайных причин.
- •Избирательное скрещивание
- •Инбридинг
- •Инбридинг среди родственников снижает генетическое разнообразие за счет уменьшения частоты гетерозигот.
- •Коэффициент инбридинга (F) есть вероятность того, что два аллеля гена у индивида идентичны,
- •Генетические последствия инбридинга
- •У человека инбридинг увеличивает риск спонтанных абортов и смерти новорожденных, а также риск
Чем меньше численность популяции, тем выше степень
флуктуации популяционно-генетических параметров. Это явление – дрейф генов. В крайних случаях он приводит к
исчезновению из популяции нескольких аллелей.
Дрейф генов в лабораторных популяциях дрозофилы.
100 линий по 4 самца и 4 самки.
Начальная частота сцепленной с полом мутации и частота аллеля дикого типа 0.5.
В каждом следующем поколении брали случайных 4 самцов и 4 самок для размножения.
Через 16 поколений
в70 линиях один аллель полностью исчез:
в29 линиях остался мутантный аллель,
в41 – аллель дикого типа.
Остальные линии либо вымерли, либо сохранили оба аллеля.
Полученные результаты достоверно не различаются от 35:35 (вариант случайного исчезновения одного из аллелей)
Аллели могут распространяться по всей популяции или исчезать в силу только случайных причин.
Как возникают маленькие природные популяции? Например
– разделение большой на несколько, эпидемии, миграция части большой популяции.
Избирательное скрещивание
Пятое условие – скрещивание случайным образом. Неслучайное скрещивание не меняет непосредственно частоты аллелей, но может изменить частоты генотипов в популяции и этим косвенно повлиять на ход эволюции.
Важнейшая форма неслучайного скрещивания – инбридинг или близкородственное скрещивание.
Для некоторого аллеля инбридинг увеличивает долю гомозигот в популяции, и с течением времени в популяции останутся только гомозиготы. Самая крайняя форма инбридинга – самоопыление.
Инбридинг
Результаты самооопыления в течение 4х поколений в линии происходящей от одной гетерозиготы – к четвертому поколению остается только около 6% гетерозигот, а 94% составляют гомозиготы, при этом частоты аллелей не изменяются
Для величины инбридинга в популяции Райт ввел коэффициент инбридинга F, определяемый как вероятность
того, что гомозигота по данному гену получила обе копии аллеля от одного предка.
Если F=1, то в популяции все – гомозиготы, оба аллеля которых получены от одной предковой копии,
если F= 0, то в популяции таких гомозигот нет

Инбридинг среди родственников снижает генетическое разнообразие за счет уменьшения частоты гетерозигот.
При крайней формк инбридинга, самоопылении, для отдельных гетерозигот
по одному локусу, 94% из их потомков гомозиготны за 4 поколения.
Заметим, однако, что частоты аллелей А и а остаются неизменными на уровне 50%.

Коэффициент инбридинга (F) есть вероятность того, что два аллеля гена у индивида идентичны, потому что они происходят из того же аллеля предка.
В этом примере для женщины-потомка от двоюродных брата и сестры сначала измеряется вероятность, что она будет гомозиготна по рецессивному аллелю, унаследованному от своей прабабушки. Каждое поколение имеет вероятность 1/2 наследования аллеля а.
Вероятность того, что все шесть наследований содержат аллель а (1/2) 6 = 1/64.
Также она также может быть гомозиготой по любому из 3 других аллелей ее прабабушки и прадедушки,
F = 4 x (1/64) = 1/16.
Генетические последствия инбридинга
Инбридинг приводит к появлению рецессивных гомозигот, которые раньше были скрыты в гетерозиготах. Одно из последствий инбридинга – увеличение вероятности появления потомства, гомозиготного по вредному рецессивному аллелю Средняя приспособленность в инбредных популяциях обычно понижена
Инбредная депрессия – степень снижения приспособленности, вызванная инбридингом. Гомозиготность по многим локусам присутствует у одомашненных растений и животных. В больших популяциях со случайным скрещиванием инбридинг может приводить к сильной инбредной депрессии
При убывании численности природных популяций, находящихся под угрозой вымирания, инбридинг начинает играть большую роль
У человека инбридинг увеличивает риск спонтанных абортов и смерти новорожденных, а также риск врожденных аномалий и генетических болезней с рецессивным проявлением
Последствия инбридинга не всегда вредны для потомства, он широко используется в селекции и семеноводстве. Можно увеличить долю особей в популяции, несущих желательные для человека признаки