
- •Популяционная генетика
- •Естественный отбор как механизм адаптивной эволюции был предложен А. Уоллесом и Ч. Дарвином
- •При действии всех четырех факторов в популяции при смене поколений изменяется соотношение фенотипов,
- •Популяции и генофонд
- •По определению Н.В, Тимофеева-Ресовского, популяция - это группа особей определенного вида, которая:
- •Расчет числа аллелей
- •Делеция в гене человека CCR5 делает особь устойчивой к инфицированию HIV- 1 изменением
- •Частота (в %) аллеля
- •Закон Харди-Вайнберга
- •Для популяции размножающихся половым путем диплоидных организмов есть два шага в переносе частот
- •Для популяции в равновесии Харди-Вайнберга, частоты генотипов могут быть рассчитаны из частот аллелей
- •При равновесии Харди-Вайнберга, частоты аллелей в
- •Следствия закона Харди-Вайнберга
- •Тесты на равновесие
- •Если в популяции 283 человека, из которых 223 имеют генотип 1/1, 57 –
- •Расширение закона Харди-Вайнберга
- •Calculating Genotype Frequencies for Multiple Alleles Where
- •Применение закона Харди-Вайнберга – расчет частоты гетерозигот
- •При равновесии Харди-Вайнберга, частоты всех трех генотипов могут
- •Факторы, изменяющие частоту аллелей в популяции
- •Естественный отбор
- •Различие выживаемости и (или) репродуктивного успеха особей – естественный отбор.
- •Приспособленность и отбор
- •Как отбор действует против вредных аллелей?
- •Естественный отбор
- •При неполном доминировании у гетерозигот -промежуточная приспособленность, возможен другой вариант – вредный в
- •Вредный аллель (a)
- •Для популяции с начальной частотой аллеля Δ32 0.10, и 1%-ной смертности 1/1 (iначальная
- •Два важных вывода – за тысячи поколений даже слабый отбор может привести к
- •Отбор в природных популяциях
- •Рассмотрим, например, доминантную мутацию R (для инсектицидной устойчивости), которая появляется сначала с низкой
- •Как частоты генотипов в популяции личинок комаров A. aegypti изменяются в ответ на
- •Естественный отбор и количественные признаки
- •При направленном отборе часто отбираются признаки, представляющие крайние фенотипические варианты. Если признак полигенный,
- •Стабилизирующий отбор действует против экстремальных фенотипов, благоприятствуя средним особям.
- •Дизруптивный отбор противоположен стабилизирующему отбору из-за отбора против промежуточных типов.
- •Естественный отбор может влиять на количественные признаки тремя способами:
- •Мутации
- •Чтобы установить, являются ли мутации существенной движущей силой, изменяющей частоты аллелей, нужно измерить
- •Скорость мутагенеза – отношение числа новых мутантных аллелей к определенному числу гамет.
- •Пусть мутация возникает как доминантная у 2 из 100000 новорожденных. Родители фенотипически нормальны.
- •В популяции из 500000 человек у всех генотип dd. Первоначальная частота аллеля d
- •Мутационный процесс в популяции.
- •В общем случае, имея в поколении g два аллеля А с частотой р
- •При скорости мутации (μ) 1.0 x 10-5, требуется 70,000
- •Мутагенез создает материал для эволюции, но частота аллелей, возникших при мутации, обычно определяется
- •Миграции
- •Если в соседних популяциях частоты аллеля А различны, при миграции особей из одной
- •На континенте частота А составляет pm, на острове pi. При
- •Очевидно, что изменение частоты аллеля пропорционально разности частот в соседних популяциях и доле
- •Используя эту формулу можно оценить интенсивность миграции в популяции.
- •Миграция – движущая сила эволюции.
- •Если значение m велико или частоты в двух популяциях сильно различаются, то частота
- •Дрейф генов
- •Для популяционно-генетических исследований большое значение имеет большой объем выборки.
- •Чем меньше численность популяции, тем выше степень
- •Дрейф генов в лабораторных популяциях дрозофилы.
- •Аллели могут распространяться по всей популяции или исчезать в силу только случайных причин.
- •Избирательное скрещивание
- •Инбридинг
- •Инбридинг среди родственников снижает генетическое разнообразие за счет уменьшения частоты гетерозигот.
- •Коэффициент инбридинга (F) есть вероятность того, что два аллеля гена у индивида идентичны,
- •Генетические последствия инбридинга
- •У человека инбридинг увеличивает риск спонтанных абортов и смерти новорожденных, а также риск
Мутации
Новые аллели в популяции возникают только благодаря мутациям. Мутации происходят случайным образом, они не направлены на преимущества или недостатки организма.
Чтобы установить, являются ли мутации существенной движущей силой, изменяющей частоты аллелей, нужно измерить частоту возникновения мутаций.
Большинство мутаций рецессивно, поэтому для оценки частоты мутагенеза используют косвенные методы теории вероятностей и статистики или крупномасштабные исследования популяций.
Прямые методы анализа можно использовать только для достоверно доминантных мутаций.
Для точности результатов необходимо, чтобы аллель определял четко различимый фенотип, отличный от фенотипов с рецессивными аллелями, чтобы признак проявлялся полностью и чтобы была исключена возможность возникновения идентичного фенотипа за счет действия негенетических факторов.
Скорость мутагенеза – отношение числа новых мутантных аллелей к определенному числу гамет.
Зная скорость мутагенеза, можно оценить, в какой степени мутации могут привести к изменениям частот аллелей при смене поколений.
Пусть мутация возникает как доминантная у 2 из 100000 новорожденных. Родители фенотипически нормальны. Зигота имеет две копии каждого гена – значит на практике как бы изучение 200000 гамет.
Если предположить, что особи-мутанты гетерозиготны, то обнаружено два мутантных аллеля на 200000 копий гена, т.е.
скорость мутации = 2/200000 = 1х10-5.
Зная скорость мутагенеза, можно оценить в какой степени мутации могут привести к изменениям частот аллелей при смене поколений
В популяции из 500000 человек у всех генотип dd. Первоначальная частота аллеля d = 1, аллеля D = 0. Генофонд состоит из 1 млн гамет с аллелем d. При этом 1.4 на каждые 100000 аллелей мутируют с образованием аллеля D.
Теперь частота аллеля D = (1000000-14)/1000000 = 0.000014, т.е. мутациям самим по себе нужно очень много времени для заметного сдвига частот в популяции

Мутационный процесс в популяции.
Частота спонтанных мутаций низка, поэтому изменение частоты аллеля только в результате мутационного процесса происходит чрезвычайно медленно.
Обозначим частоту аллеля А в поколении t как рt и частоту мутаций А -> а за
поколение — u.
Тогда частота аллеля А в следующем t + 1 поколении будет равна
Изменение частоты аллеля за одно поколение составит
В общем случае, имея в поколении g два аллеля А с частотой р и а с частотой q и скоростью мутагенеза µ, приводящего к превращению аллеля А в аллель а, можно рассчитать частоты аллелей в следующем поколении:
pq+1 = pg - µpg qg+1 = qg + µpg
Скорость замены аллеля А на аллель а при первоначальной частоте аллеля А = 1 и скорости мутагенеза 1х10-5 упадет до 0.5 за 70000 поколений.

При скорости мутации (μ) 1.0 x 10-5, требуется 70,000
поколений для уменьшения частоты аллеля A от 1.0 до 0.5.
Таким образом, мутация сама по себе играет относительно несущественную роль в изменении частоты аллеля.
Мутагенез создает материал для эволюции, но частота аллелей, возникших при мутации, обычно определяется естественным отбором или дрейфом генов.
Частота мутантного аллеля, вызывающего муковисцидоз (рецессивно-аутосомный признак) в Европе 2%. Существует сильный отбор против рецессивных гомозигот.
Какие факторы удерживают частоту аллеля на уровне 2%?
Основная гипотеза – гипотеза превосходства гетерозигот, по которой отбор против рецессивных гомозигот уравновешивается отбором в пользу гетерозигот. Есть предположения, что гетерозиготность по этому гену повышает устойчивость к брюшному тифу

