
- •Популяционная генетика
- •Естественный отбор как механизм адаптивной эволюции был предложен А. Уоллесом и Ч. Дарвином
- •При действии всех четырех факторов в популяции при смене поколений изменяется соотношение фенотипов,
- •Популяции и генофонд
- •По определению Н.В, Тимофеева-Ресовского, популяция - это группа особей определенного вида, которая:
- •Расчет числа аллелей
- •Делеция в гене человека CCR5 делает особь устойчивой к инфицированию HIV- 1 изменением
- •Частота (в %) аллеля
- •Закон Харди-Вайнберга
- •Для популяции размножающихся половым путем диплоидных организмов есть два шага в переносе частот
- •Для популяции в равновесии Харди-Вайнберга, частоты генотипов могут быть рассчитаны из частот аллелей
- •При равновесии Харди-Вайнберга, частоты аллелей в
- •Следствия закона Харди-Вайнберга
- •Тесты на равновесие
- •Если в популяции 283 человека, из которых 223 имеют генотип 1/1, 57 –
- •Расширение закона Харди-Вайнберга
- •Calculating Genotype Frequencies for Multiple Alleles Where
- •Применение закона Харди-Вайнберга – расчет частоты гетерозигот
- •При равновесии Харди-Вайнберга, частоты всех трех генотипов могут
- •Факторы, изменяющие частоту аллелей в популяции
- •Естественный отбор
- •Различие выживаемости и (или) репродуктивного успеха особей – естественный отбор.
- •Приспособленность и отбор
- •Как отбор действует против вредных аллелей?
- •Естественный отбор
- •При неполном доминировании у гетерозигот -промежуточная приспособленность, возможен другой вариант – вредный в
- •Вредный аллель (a)
- •Для популяции с начальной частотой аллеля Δ32 0.10, и 1%-ной смертности 1/1 (iначальная
- •Два важных вывода – за тысячи поколений даже слабый отбор может привести к
- •Отбор в природных популяциях
- •Рассмотрим, например, доминантную мутацию R (для инсектицидной устойчивости), которая появляется сначала с низкой
- •Как частоты генотипов в популяции личинок комаров A. aegypti изменяются в ответ на
- •Естественный отбор и количественные признаки
- •При направленном отборе часто отбираются признаки, представляющие крайние фенотипические варианты. Если признак полигенный,
- •Стабилизирующий отбор действует против экстремальных фенотипов, благоприятствуя средним особям.
- •Дизруптивный отбор противоположен стабилизирующему отбору из-за отбора против промежуточных типов.
- •Естественный отбор может влиять на количественные признаки тремя способами:
- •Мутации
- •Чтобы установить, являются ли мутации существенной движущей силой, изменяющей частоты аллелей, нужно измерить
- •Скорость мутагенеза – отношение числа новых мутантных аллелей к определенному числу гамет.
- •Пусть мутация возникает как доминантная у 2 из 100000 новорожденных. Родители фенотипически нормальны.
- •В популяции из 500000 человек у всех генотип dd. Первоначальная частота аллеля d
- •Мутационный процесс в популяции.
- •В общем случае, имея в поколении g два аллеля А с частотой р
- •При скорости мутации (μ) 1.0 x 10-5, требуется 70,000
- •Мутагенез создает материал для эволюции, но частота аллелей, возникших при мутации, обычно определяется
- •Миграции
- •Если в соседних популяциях частоты аллеля А различны, при миграции особей из одной
- •На континенте частота А составляет pm, на острове pi. При
- •Очевидно, что изменение частоты аллеля пропорционально разности частот в соседних популяциях и доле
- •Используя эту формулу можно оценить интенсивность миграции в популяции.
- •Миграция – движущая сила эволюции.
- •Если значение m велико или частоты в двух популяциях сильно различаются, то частота
- •Дрейф генов
- •Для популяционно-генетических исследований большое значение имеет большой объем выборки.
- •Чем меньше численность популяции, тем выше степень
- •Дрейф генов в лабораторных популяциях дрозофилы.
- •Аллели могут распространяться по всей популяции или исчезать в силу только случайных причин.
- •Избирательное скрещивание
- •Инбридинг
- •Инбридинг среди родственников снижает генетическое разнообразие за счет уменьшения частоты гетерозигот.
- •Коэффициент инбридинга (F) есть вероятность того, что два аллеля гена у индивида идентичны,
- •Генетические последствия инбридинга
- •У человека инбридинг увеличивает риск спонтанных абортов и смерти новорожденных, а также риск

При равновесии Харди-Вайнберга, частоты всех трех генотипов могут
быть рассчитаны только если известна частота каждого аллеля. Число гетерозигот быстро растет в популяции при движении значений
p и q от 0 или 1.
Большинство генетических заболеваний – рецессивные признаки с низкими частотами в популяции, и большинство особей с этим аллелем - гетерозиготы.
Факторы, изменяющие частоту аллелей в популяции
В реальных популяциях всегда есть факторы, мешающие популяции достичь равновесия Харди-Вайнберга или направляющие на достижение иного равновесия.
Естественный отбор
Первое условие закона Харди-Вайнберга – одинаковая выживаемость и одинаковый репродуктивный успех всех особей, если это условие не выполняется, частоты аллелей могут меняться.
Если в популяции из 100 особей частоты аллелей А и а равны, то частоты генотипов АА = 25%, Аа = 50%, аа = 25%.
Предположим различную выживаемость – для АА 100%, Аа 90%, аа 80%. Тогда для нового генофонда мы получим 180 гамет (25х2 + 45х2 + 20х2)
Какие теперь частоты аллелей?
50 гамет А от АА и 45 от Аа – частота А = (50 + 45)/180 = 0.53, 45 гамет а от Аа и 40 от аа – частота а = (45 + 40)/180 = 0.47.
Частота А выросла, а – снизилась, обе частоты отличаются от исходных.
Различие выживаемости и (или) репродуктивного успеха особей – естественный отбор.
Это главный фактор смещающий частоты аллелей в больших популяциях и одна из движущих сил эволюционных преобразований
Приспособленность и отбор
Отбор может быть сильным или слабым в зависимости от
преимуществ того или иного генотипа. Генетический вклад особи в будущие поколения – приспособленность. Ее можно
исследовать. У всех генотипов относительная приспособленность
АА – wAA, Aa - wAa, aa - waa лежит в пределах от 1 до 0. Приспособленность включает выживаемость и репродуктивный успех.
Изменения частот аллелей, вызванные отбором.
Некалиброванных частоты после отбора рассчитываются путем умножения частот зигот на значение относительной приспособленности. Частоты взрослых калибруются путем деления на сумму значений относительных приспособленностей.

Как отбор действует против вредных аллелей?
Если приспособленность гомо- и гетерозигот с доминантным аллелем равна 1, а рецессивных гомозигот равна 0 (летальность), то убывание частоты аллеля а описывается уравнением
qg = q0 / (1+gq0) ,
где qg - частота а в поколении g, q0 - исходная частота, g – число поколений.
Частота рецессивного аллеля снижается по гиперболе, но не исчезает, покуда остаются гетерозиготы.

Естественный отбор
уменьшает частоту летального рецессивного аллеля a.
Это уменьшение рассчитывается как qg = q0 /
1+gq0.
Частота a уменьшается вдвое за 2 поколения, и еще вдвое в течение 6-го поколения.
Последующие сокращения происходят медленнее из-за того, что большинство
носителей аллеля a -
гетерозиготы.
При неполном доминировании у гетерозигот -промежуточная приспособленность, возможен другой вариант – вредный в гомозиготе, полезный в гетерозиготе (серповидно-клеточная анемия).

Вредный аллель (a)
кодоминантный и
стартует с частоты 0.99. Скорость уменьшения
зависит от его
приспособленности,
измеряемой W.
Сильное давление отбора, когда 90% гетерозигот
(WAa = 0.90) и 80%
гомозигот aa (Waa = 0.80)
выживают, частота аллеля a падает с 0.99 до менее, чем 0.01 за 85 поколений.
При слабом давлении отбора, когда WAa = 0.998
и Waa = 0.996, требуется
1000 поколений для снижения частоты аллеля a до 0.93.