Микробиология с основами вирусологии

ПРИНЦИПЫ КЛАССИФИКАЦИИ ПРОКАРИОТОВ

1.Положение микроорганизмов в системе живого мира

2.Классификация бактерий и архей

3.Разнообразие мира прокариотов

Таксономические категории

1948 г. – «Международный кодекс номенклатуры бактерий» ICNB

Домен Bacteria

Филум Proteobacteria Класс γ-proteobacteria

Порядок Pseudomonadales Семейство Pseudomonadaceae Род Pseudomonas

Вид P. fluorescens

Штамм – бактериальные культуры одного вида, выделенные из разных мест обитания.

Клон – культура, выделенная из одной клетки.

Типы систематики биологических объектов:

Филогенетическая – естественная, в основе лежит установление родственных связей между организмами.

Практическая – искусственная, выявляет степень сходства между организмами

для быстрой идентификации.

Практическая систематика

Основная идея классификации «по Берджи»

– легкость идентификации бактерий.

Для этого используют совокупность признаков:

морфологических,культуральных,

физиолого-биохимических.

Система классификации Берджи не учитывает эволюционные связи между прокариотами.

Система классификации определителя бактерий Берджи

Дэвид Хендрикс

Берджи (1860-1937).

www.historiadelamedicina.org

1923 - первое издание

Определителя бактерий Берджи 1994 – девятое

2001-2010 – второе издание

Филогенетическая систематика

Учитывает эволюционные связи между прокариотами.

Для установления степени родства используются:

сравнительный генетический анализ, Carl Woese

анализ строения рРНК (16S – у прокариот и 18S – у эукариот).

Преимущества рРНК как объекта для анализа:

широкая распространенность

изофункциональность консервативность первичной структуры