Модификация гетероциклических оснований нуклеиновых кислот
Реакции по С(6)-С(5) связи
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ С НУКЛЕОФИЛЬНЫМИ РЕАГЕНТАМИ И НУКЛЕОФИЛЬНЫМИ ГРУППАМИ БЕЛКОВ
1
Реакции фторирования по С-5. Реагент Бартона.
2
РЕАКЦИИ ПИРИМИДИНОВЫХ ОСНОВАНИЙ С НУКЛЕОФИЛЬНЫМИ ГРУППАМИ БЕЛКОВ
•Вспомним биохимию. Как происходит
превращение уридина в тимидин? Отличие в СН3- группе. Переносчик одноуглеродных фрагментов
– фолиевая кислота. Источник – серин, который после реакции превращается в глицин.
•На пути превращения сталкиваемся с присоединением нуклеофильной группы белка по 6-положению гетероцикла
3
4
Отличительные особенности фторпроизводных уридина
5
6
РЕАКЦИИ ПИРИМИДИНОВЫХ ОСНОВАНИЙ С ГИДРАЗИНОМ
•В щелочных условиях реакции с гидразином приводят к расщеплению гетероциклических колец пиримидинов, практически не затрагивая пуриновых оснований.
•Для определения положения тимидина используется деградация по остаткам пиримидинов, для чего ДНК последовательно обрабатывается гидразином, а затем пиперидином.
•Расщепление по цитозину осуществляется при высокой концентрации NaCl с последующей
обработкой продуктов модификации пипердином.
ПОЧЕМУ?
7
Рисунок электрофореграммы,
полученной для олигонуклеотида d(AAGAAGGCCTCTGGAAGC)
8
РЕАКЦИИ ПИРИМИДИНОВЫХ ОСНОВАНИЙ C ГИДРАЗИНОМ (цитозин)
9
РЕАКЦИИ ПИРИМИДИНОВЫХ ОСНОВАНИЙ C ГИДРАЗИНОМ (последствия)
10