- •МЕХАНИЗМ РЕАКЦИЙ СВОБОДНОРАДИКАЛЬНОГО ЗАМЕЩЕНИЯ. Получение производных тимидина через реакции метильной группы (следующий слайд,
- •Галогенирование гетероциклических оснований
- •• При таких реакциях сохраняется резонансно-
- •ЭЛЕКТРОФИЛЬНОЕ ЗАМЕЩЕНИЕ В АРОМАТИЧЕСКОМ РЯДУ
- •Галогенирование гетероциклических оснований пиримидинов
- •Галогенирование гетероциклических оснований пиримидинов
- •Галогенирование гетероциклических оснований пиримидинов
- •Галогенирование гетероциклических оснований пиримидинов
- •Галогенирование гетероциклических оснований пуринов
- •БРОМИРОВАНИЕ ПУРИНОВ
- •Галогенирование гетероциклических оснований пуринов
- •Галогенирование гетероциклических оснований мономерных компонентов нуклеиновых кислот в органических растворителях
- •Галогенирование гетероциклических оснований в полинуклеотидах
- •Галогенирование гетероциклических оснований в полинуклеотидах
- •Галогенирование гетероциклических оснований в полинуклеотидах
- •РЕАКЦИИ ЭЛЕКТРОФИЛЬНОГО ПРИСОЕДИНЕНИЯ и РЕАКЦИИ НУКЛЕОФИЛЬНОГО ПРИСОЕДИНЕНИЯ
- •МЕХАНИЗМ ГАЛОГЕНИРОВАНИЯ
- •Реакции фторирования по С-5. Реагент Бартона.
- •РЕАКЦИИ ПИРИМИДИНОВЫХ ОСНОВАНИЙ С НУКЛЕОФИЛЬНЫМИ ГРУППАМИ БЕЛКОВ
- •Тимидилат-синтаза – фермент-мишень для химиотерапии рака.
- •Реакции электрофильного присоединения с последующим элиминированием воды
- •Галогенирование пиримидиновых оснований. Бромирование. Реагенты: бромная вода, N-бромсукцинимид
- •Галогенирование гетероциклических оснований: бромирование
- •Галогенирование гетероциклических оснований (U)
- •Спектральные и кислотно-основные характеристики нуклеозидных производных урацила и его галоидзамещенных
- •Спектральные и кислотно-основные характеристики нуклеозидных производных урацила и его галоидзамещенных
- •Бромдезоксиуридин - мутаген
- •Бромдезоксиуридин - мутаген
- •Метод инкорпорации 5-бромдезоксиуридина.
- •Метод инкорпорации 5-бромдезоксиуридина. Слева - направо: Проявление с помощью анти- бромдезоксиуридиновых антител бромдезоксиуридиновой
- •Дифференциальная окраска сестринских хроматид
- •Примеры использования галогенпроизводных пиримидинов
- •Что нужно знать после лекций
БРОМИРОВАНИЕ ПУРИНОВ
11
Галогенирование гетероциклических оснований пуринов
•Тем не менее действие бромной воды в мягких условиях может быть использовано для препаративного получения производных гуанина.
•При бромировании в DMF при 0 0С аденозин не затрагивается, однако при проведении реакции при 50-60 0С в ледяной уксусной кислоте довольно легко образуется 8- бром аденозин.
•В водных растворах производные аденина под действием бромной воды не бромируются. Однако в буферных растворах с рН 3 образуются соответствующие 8-
бромпроизводные. Бромированием в буфере с рН, примерно 4, при комнатной температуре были получены с высокими выходами 2’-, 3’- и 5’-фосфаты 8-бромаденозина, а также 8-бромаденозин-5’-ди- и трифосфаты. При рН 7 в
процессе бромирования происходит деградация гетероциклического основания.
• При рН < 3 реакция замедляется. Почему?
12
Галогенирование гетероциклических оснований мономерных компонентов нуклеиновых кислот в органических растворителях
•Заканчивая рассмотрение реакций галоидирования мономерных компонентов нуклеиновых кислот, следует отметить следующие закономерности:
1.Галоидирование протекает путем первичной атаки атома галоида по атому С-5 пиримидиновых и С-8 пуриновых оснований;
2.по своей реакционной способности в этой реакции галоиды можно расположить в ряд Cl2, Br2 > ICl > I2
3.скорость реакции галоидирования сильно зависит от растворителя, а в случае N-галоидимидов карбоновых кислот – от присутствия катализатора.
13
Галогенирование гетероциклических оснований в полинуклеотидах
•Вследствие плохой растворимости полинуклеотидов в малополярных растворителях их галоидирование в среде, не содержащей воды, не получило широкого распространения. Трудностей, связанных с малой растворимостью, до некоторой степени удается избежать путем использования тетраалкиламмониевых солей полинуклеотидов, содержащих длинные алкильные радикалы, например, триметилгексадециламмониевых (цетавлоновых).
14
Галогенирование гетероциклических оснований в полинуклеотидах
•При бромировании рибонуклеиновых кислот (в течение 30 сек, 0 0С, добавлением в реакционную смесь различного количества брома) было обнаружено, что так же, как и в случае мономеров, адениновые ядра не галоидируются, тогда как урацильные, цитозиновые и гуаниновые ядра бромируются, давая соответственно 5-бромурацил-, 5- бромцитозин- и 8-бромгуанинпроизводные. Степень галоидирования возрастает с увеличением концентрации брома, причем после реакции при любых концентрациях брома содержание 8-бромгуанина (40-60%) превышает содержание 5-бромурацила (30-50%); 5-бромцитозиновые (10%) продукты образуются в наименьшем количестве (считая от исходного содержания каждого из этих оснований в реакционной смеси). Происходит частичное разрушение гуаниновых ядер. Бромирование приводит, кроме того, к нарушению вторичной структуры нуклеиновой кислоты.
15
Галогенирование гетероциклических оснований в полинуклеотидах
•Закономерность, наблюдаемая при бромировании РНК, сохраняется и при хлорировании: гуанин и урацил в составе РНК оказываются самыми реакционноспособными основаниями.
•Если при бромировании и хлорировании нуклеиновых кислот наиболее реакционноспособным основанием является гуанин, то при йодировании под действием хлористого иода более реакционноспособными оказываются пиримидиновые основания. Так, после иодирования цетавлоновой соли тРНК 0,02 М раствором ICl в растворе DMF в течение 18 ч при комнатной температуре было модифицировано 8,5% цитозиновых, 30% урацильных и 9% гуаниновых звеньев. Как при бромировании, так и при йодировании не наблюдается количественного галоидирования составляющих оснований даже при избытке иодирующего агента.
16
РЕАКЦИИ ЭЛЕКТРОФИЛЬНОГО ПРИСОЕДИНЕНИЯ и РЕАКЦИИ НУКЛЕОФИЛЬНОГО ПРИСОЕДИНЕНИЯ
•Электрофильное присоединение – присоединение, начинающееся с реакции положительно заряженной частицы с -связью.
•Нуклеофильное присоединение?
17
МЕХАНИЗМ ГАЛОГЕНИРОВАНИЯ
•1. Катион галогена реагирует с -системой, образуя неустойчивый -комплекс.
•2. -комплекс разрушается и образуется -
комплекс.
•3. Нуклеофил (анион) атакует образовавшийся карбокатион.
18
Реакции фторирования по С-5. Реагент Бартона.
19
РЕАКЦИИ ПИРИМИДИНОВЫХ ОСНОВАНИЙ С НУКЛЕОФИЛЬНЫМИ ГРУППАМИ БЕЛКОВ
•Вспомним биохимию. Как происходит
превращение уридина в тимидин? Отличие в СН3- группе. Переносчик одноуглеродных фрагментов
– фолиевая кислота. Источник – серин, который после реакции превращается в глицин.
•На пути превращения сталкиваемся с присоединением нуклеофильной группы белка по 6-положению гетероцикла
20
21
