
- •ХИМИЧЕСКАЯ И ПОСТТРАНСЛЯЦИОННАЯ
- •Модификаций много, а память и время ограничены. Продолжаем обсуждать
- •Неферментативное гликозилирование (гликирование) белков
- •НЕФЕРМЕНТАТИВНОЕ ГЛИКОЗИЛИРОВАНИЕ БЕЛКОВ
- •Коллаген – основной белковый элемент межклеточного матрикса (семейство близкородственных фибриллярных белков). Функции межклеточного
- •Коллаген – основной белок соединительной ткани
- •ГИСТОНОВЫЙ КОД
- •РЕАКЦИИ НУКЛЕОФИЛЬНОГО ЗАМЕЩЕНИЯ (по конечному результату)
- •АЛКИЛИРОВАНИЕ ФУНКЦИОНАЛЬНЫХ ГРУПП БЕЛКОВ
- ••Было показано, что в гистоне Н3 триметилированный Lys4 необходим для активации процесса транскрипции,
- •АЛКИЛИРУЮЩИЕ РЕАГЕНТЫ
- •АЛКИЛИРОВАНИЕ БЕЛКОВ (реакция по боковому радикалу остатка лизина)
- •Вспомним схему синтеза S-аденозилметионина. С вашей точки зрения по какому механизму протекает реакция
- •Вспомним, что может произойти, если будет повышаться уровень гомоцистеина. Это наблюдается при развитии,
- •N-Homocysteinylation of proteins
- •ДЕМЕТИЛИРОВАНИЕ ОСТАТКА МОДИФИЦИРОВАННОГО ЛИЗИНА
- •ДЕМЕТИЛИРОВАНИЕ ДИ- И МОНОМЕТИЛИРОВАННЫХ ОСТАТКОВ ЛИЗИНА В ГИСТОНАХ, КАТАЛИЗИРУЕМОЕ
- •ДЕМЕТИЛИРОВАНИЕ ТРИ-, ДИ- И МОНОМЕТИЛИРОВАННЫХ ОСТАТКОВ ЛИЗИНА В ГИСТОНАХ, КАТАЛИЗИРУЕМОЕ ГИСТОНДЕМИТИЛАЗОЙ, ФУНКЦИОНИРУЮЩЕЙ В
- ••Таким образом, метилирование-диметилирование наряду с ацетилированием-деацетилированием определенных аминокислотных остатков в гистонах является одним
- •N-метилирование по остаткам Lys и Arg в гистонах; введение фрагментов, содержащих изопренильные группы
- ••Изопренилированию подвергаются белки семейств Ras, Rab, Rho (продукты протоонкогенов ras, rab, rho, участвующие
- •Белок, обладая большим сродством к липидным мембранам, служит уникальным местом опознавания для определенных
- •Наблюдается дальнейший процессинг: протеолитическое удаление Суs-А-А-Х-протеазой трипептида А-А-Х с С-конца и карбоксиметилирование остатка
- •Молекулярные механизмы формирования и движения пузырьков
- •Rab-белки участвуют в транспорте пузырьков в клетке
- ••Для каждой внутриклеточной мембраны существуют специфические Rab-белки, которые обеспечивают определенное направление пузырьков. От
- •• CAAX мотив запускает три последовательных ферментативных
- •ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ С АЛКИЛИРУЮЩИМИ РЕАГЕНТАМИ
- •ХИМИОТЕРАПИЯ ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫХ ОПУХОЛЕЙ
- •Примеры наиболее распространенных повреждений ДНК
- •ADP-рибозилирование белков
- •Процесс синтеза поли(ADP-рибозы) предшествует началу репарации повреждений ДНК. Большие затраты энергии на биосинтез
- •ПОЛИ(ADP)-РИБОЗИЛИРОВАНИЕ
- •Поли(ADP-рибозил)ирование PARP1
- •ADP-рибозилирование аспарагина
- •УКАЖИТЕ ТИП МОДИФИКАЦИЙ
- •ГЛИКОЗИЛИРОВАНИЕ БЕЛКОВ
- •ГЛИКОЗИЛИРОВАНИЕ БЕЛКОВ
- •ГЛИКОЗИЛИРОВАНИЕ ОСТАТКОВ Ser и Thr
- •ГЛИКОЗИЛИРОВАНИЕ ОСТАТКОВ Ser и Thr
- •карбоний-ион изображается как резонансный гибрид двух состояний, в одном из которых (оксоний-ион)
- •N-гликозилирование белков происходит по карбоксамидному атому азота остатка аспарагина в последовательности Asn-X-Ser/Thr. Образование
- •ГЛИКОЗИЛИРОВАНИЕ БЕЛКОВ
- •МОДИФИКАЦИЯ АСПАРАГИНА
- •N-Гликозилирование белка осуществляется в процессе посттрансляционной модификации в эндоплазматическом ретикулуме с помощью трансгликозидаз,
- •Гликозидазы «подстригают» олигосахариды, отщепляя
- •ПРОЦЕССЫ ГЛИКОЗИЛИРОВАНИЯ БЕЛКОВ В КОМПЛЕКСЕ ГОЛЬДЖИ
- •ПРОЦЕССЫ ГЛИКОЗИЛИРОВАНИЯ БЕЛКОВ В КОМПЛЕКСЕ ГОЛЬДЖИ
- •ГЛИКОЗИЛИРОВАНИЕ АСПАРАГИНА БЕЛКОВ
- •Для О-гликозидов этих аминокислот имеется тенденция к -
- ••N-гликозиламидная связь относительно устойчива в мягких щелочных и кислотных условиях, но расщепляется при
- •РЕАКЦИИ ЭЛЕКТРОФИЛЬНОГО ЗАМЕЩЕНИЯ
- ••Тироглобулин – гликопротеин с молекулярной массой 660 кДа, содержит 115 остатков тирозина, синтезируется
- ••В крови йодтиронины находятся в связанной форме в комплексе с тироксинсвязывающим белком. Только
- •Тиреоглобулин с Т4
- •Окислительно-восстановительные реакции
- •ОКИСЛИТЕЛЬНО-ВОССТАНОВИТЕЛЬНЫЕ РЕАКЦИИ.
- •ГИДРОКСИЛИРОВАНИЕ ЛИЗИНА, ПРОЛИНА, АСПАРАГИНА
- •Известно два класса монооксигеназ. Ферменты, требующие присутствия косубстрата, называются внешними моноокисгеназами. Другую группу
- •Гидроксилирование остатков пролина и лизина в молекуле проколлагена катализируется в присутствии аскарбиновой кислоты
- •Механизм реакции гидроксилирования
- •МУЛЬТИМОДИФИКАЦИЯ. Синтез коллагена
- •Гликозилирование аминокислотных остатков гидроксилизина под действием гликозилтрансфераз
- •Как отмечалось выше, в фибробластах проходит посттрансляционная модификация определенных остатков пролина и лизина.
- •Превращения незрелых фибрилл в зрелые путем формирования сшивок между полипептидными цепями
- ••Возникшие альдегидные группы участвуют в образовании ковалентных связей, которые стабилизируют фибриллы коллагена.
- •Коллаген – основной белковый элемент межклеточного матрикса (семейство близкородственных фибриллярных белков). Функции межклеточного
- •Уникальные свойства коллагенов
- •Окислительно-восстановительные реакции. Детекция аминокислот
- •Детекция пролина
- •Взаимодействие нингидрина с другими аминами
- •Окислительно-восстановительные реакции
- •Химические модификации
- •Химические модификации
- •Протромбин – белок, состоящий из 582 аминокислотных остатков; его протеолитическое расщепление по связям
- •КАРБОКСИЛИРОВАНИЕ ОСТАТКА ГЛУТАМАТА
- •Механизм участия витамина К в карбоксилировании остатков глутамата
- •КАРБОКСИЛИРОВАНИЕ ОСТАТКА ГЛУТАМАТА
- •Что необходимо знать после лекции

ДЕМЕТИЛИРОВАНИЕ ДИ- И МОНОМЕТИЛИРОВАННЫХ ОСТАТКОВ ЛИЗИНА В ГИСТОНАХ, КАТАЛИЗИРУЕМОЕ
FAD-ЗАВИСИМОЙ ПОЛИАМИНООКСИДАЗОЙ
H2O2 |
O2 |
|
|
R1 |
|
|
R1 |
|
|
|
|
NH |
|
CO |
|
|
N N O |
|
N NH O |
|
|
|
CH |
||||
|
H C |
H3C |
|
|
|
|
||||||
|
3 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
NH |
CO |
|
NH |
|
|
NH |
|
|
|
|
(CH2)4 |
|
CH |
H3C |
N |
H3C |
NH |
NH |
|
CO |
|
||||
|
|
CH |
|
NHR |
|
|||||||
(CH ) |
|
FAD O |
|
|
FADH O |
|
|
|
|
|
||
2 4 |
|
|
|
2 |
|
(CH ) |
|
H2O |
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
NR |
|
|
|
|
|
|
|
2 4 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
+ |
NR |
|
|
O |
|
|
CH3 |
|
|
аминооксидаза |
|
|
|
|
|
||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||
|
|
|
|
|
|
|
|
C |
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
CH2 |
|
|
H |
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
H |

ДЕМЕТИЛИРОВАНИЕ ТРИ-, ДИ- И МОНОМЕТИЛИРОВАННЫХ ОСТАТКОВ ЛИЗИНА В ГИСТОНАХ, КАТАЛИЗИРУЕМОЕ ГИСТОНДЕМИТИЛАЗОЙ, ФУНКЦИОНИРУЮЩЕЙ В ПРИСУТСТВИИ КОФАКТОРОВ – ИОНОВ Fe2+, -КЕТОГЛУТАРАТА И АСКОРБАТА
|
|
|
|
|
|
|
NH |
CH |
CO |
|
|
|
|
|
|
|
|
||
NH |
|
CO |
Fe2+ + O2 |
Fe3+ + СO2 |
NH |
|
CO |
(CH2)4 |
|
|
CH |
|
|
|
|
CH |
|||
|
|
- OOC-C-CH2-CH2-COO- |
- OOC-CH2-CH2-COO- |
|
|
|
NR2 |
|
|
|
(CH2)4 |
|
(CH ) |
|
|||||
|
O |
|
|
+ |
2 4 |
|
|
||
|
+ |
NR2 |
|
|
NR2 |
|
|
||
|
|
|
|
|
O |
|
|||
|
|
|
|
|
|
CH2 |
|
||
|
|
CH3 |
гистондеметилаза, |
|
|
C |
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
аскорбат |
|
|
|
OH |
H |
H |
|
|
|
|
|
|
|
•Таким образом, метилирование-диметилирование наряду с ацетилированием-деацетилированием определенных аминокислотных остатков в гистонах является одним из основных факторов регуляции активации или репрессии генов.

N-метилирование по остаткам Lys и Arg в гистонах; введение фрагментов, содержащих изопренильные группы (фарнезильной (С15) и геранилгеранильной (С20)) по остаткам цистеина в GTPазы (молекулярные переключатели)
O O
O P O P O-
O- O-
•Изопренилированию подвергаются белки семейств Ras, Rab, Rho (продукты протоонкогенов ras, rab, rho, участвующие в процессах роста и дифференцировки клеток), центромерные белки,
-субъединицы гетеротримерных G-белков,
шапероны, тирозинфосфатазы.
•Белки семейства Rab участвуют во внутриклеточном везикулярном транспорте, циркулируя между мембраной клетки и цитозолем. Обратимая ассоциация белка с клеточной мембраной в строго определенном месте осуществляется как раз за счет изопренильных остатков, введенных в эти белки.



Белок, обладая большим сродством к липидным мембранам, служит уникальным местом опознавания для определенных белок-белковых взаимодействий

Наблюдается дальнейший процессинг: протеолитическое удаление Суs-А-А-Х-протеазой трипептида А-А-Х с С-конца и карбоксиметилирование остатка изопренилцистеина
|
Ras |
|
O |
1 |
|
|
|
|
O |
H2N |
Cys-AAX C O- |
|
|
H2N |
Ras |
Cys- AAX C O- |
|||
|
|
H2C |
SH |
|
|
|
|
H C |
R |
|
|
|
H3C |
|
H3C |
|
2 S |
||
|
|
|
|
PP CH2 CH C CH2 |
CH2 |
CH C CH3 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
2 |
|
|
|
|
|
|
|
R |
|
|
2 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
- AAX |
|
|
|
|
SAH |
|
SAM |
|
|
|
|
|
|
O |
|
3 |
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
H2N |
Ras |
Cys-C |
OMe |
|
H2N |
Ras |
Cys-C O- |
|
|
|
|
H2C S |
R |
|
|
|
H2C S |
R |
MeOH
