
- ••РЕАКЦИИ ПО ГЕТЕРОЦИКЛИЧЕСКИМ ОСНОВАНИЯМ
- •АТОМ
- •РАСПРЕДЕЛЕНИЕ ЭЛЕКТРОННОЙ ПЛОТНОСТИ В АТОМЕ ВОДОРОДА
- •ДВИЖЕНИЕ ЭЛЕКТРОНА В АТОМЕ
- •КВАНТОВЫЕ ЧИСЛА И ОРБИТАЛИ
- •КВАНТОВЫЕ ЧИСЛА
- •КВАНТОВЫЕ ЧИСЛА
- •КВАНТОВЫЕ ЧИСЛА
- •ПРИНЦИПЫ ЗАПОЛНЕНИЯ АТОМНЫХ ОРБИТАЛЕЙ ЭЛЕКТРОНАМИ
- •ПРИНЦИПЫ ЗАПОЛНЕНИЯ АТОМНЫХ ОРБИТАЛЕЙ ЭЛЕКТРОНАМИ
- •Схемы, иллюстрирующие уровни (а), подуровни (б), орбитали (в) атомов элементов
- •ПРИНЦИПЫ ЗАПОЛНЕНИЯ АТОМНЫХ ОРБИТАЛЕЙ эЛЕКТРОНАМИ
- •ПРИНЦИП ЗАПОЛНЕНИЯ АТОМНЫХ ОРБИТАЛЕЙ ЭЛЕКТРОНАМИ
- •ПРИНЦИП ЗАПОЛНЕНИЯ АТОМНЫХ ОРБИТАЛЕЙ ЭЛЕКТРОНАМИ
- •ПРИНЦИП ЗАПОЛНЕНИЯ АТОМНЫХ ОРБИТАЛЕЙ ЭЛЕКТРОНАМИ
- •ПРИНЦИП ЗАПОЛНЕНИЯ АТОМНЫХ ОРБИТАЛЕЙ ЭЛЕКТРОНАМИ
- •ПРИНЦИПЫ ЗАПОЛНЕНИЯ АТОМНЫХ ОРБИТАЛЕЙ ЭЛЕКТРОНАМИ
- •ХИМИЧЕСКАЯ СВЯЗЬ
- •ХИМИЧЕСКАЯ СВЯЗЬ энергия связи
- •При сближении атомов между их внешними электронами с противоположными спинами происходит сильное обменное
- •КОВАЛЕНТНАЯ СВЯЗЬ
- •ОТНОСИТЕЛЬНАЯ
- •ОСНОВНЫЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ АТОМОВ ЭЛЕМЕНТОВ
- •ХАРАКТЕРИСТИКА АТОМА энергия ионизации
- •ОСНОВНЫЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ АТОМОВ ЭЛЕМЕНТОВ
- •ОСНОВНЫЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ АТОМОВ ЭЛЕМЕНТОВ
- •ХИМИЧЕСКАЯ СВЯЗЬ
- •ХИМИЧЕСКАЯ СВЯЗЬ
- •ХИМИЧЕСКАЯ СВЯЗЬ
- •СВОЙСТВА КОВАЛЕНТНОЙ СВЯЗИ
- •ПОЛЯРНОСТЬ КОВАЛЕНТНОЙ СВЯЗИ
- •ПОЛЯРНОСТЬ КОВАЛЕНТНОЙ СВЯЗИ
- •ПОЛЯРНОСТЬ и ПОЛЯРИЗУЕМОСТЬ СВЯЗИ
- •ХИМИЧЕСКАЯ СВЯЗЬ
- •ХИМИЧЕСКАЯ СВЯЗЬ
- •СТРУКТУРА ЛЬЮИСА И ФОРМАЛЬНЫЙ ЗАРЯД
- •СТРУКТУРА ЛЬЮИСА И ФОРМАЛЬНЫЙ ЗАРЯД
- •СТРУКТУРА ЛЬЮИСА И ФОРМАЛЬНЫЙ ЗАРЯД
- •СВОЙСТВА КОВАЛЕНТНОЙ СВЯЗИ длина связи
- •СВОЙСТВА КОВАЛЕНТНОЙ СВЯЗИ кратность связи
- •ОСОБЕННОСТИ КОВАЛЕНТНОЙ СВЯЗИ кратность связи
- •ОСОБЕННОСТИ КОВАЛЕНТНОЙ СВЯЗИ насыщаемость связи
- •ОСОБЕННОСТИ КОВАЛЕНТНОЙ СВЯЗИ насыщаемость связи
- •Начиная с третьего периода, у атомов р-элементов при возбуждении электроны внешних s- и
- •СВОЙСТВА КОВАЛЕНТНОЙ СВЯЗИ направленность
- •ГЕОМЕТРИЧЕСКОЕ СТРОЕНИЕ МОЛЕКУЛ
- •ГЕОМЕТРИЧЕСКОЕ СТРОЕНИЕ МОЛЕКУЛ
- •ГЕОМЕТРИЧЕСКОЕ СТРОЕНИЕ МОЛЕКУЛ
- •СОПРЯЖЕНИЕ КОВАЛЕНТНЫХ СВЯЗЕЙ
- •ХИМИЧЕСКИЕ РЕАКЦИИ
- •КЛАССИФИКАЦИЯ ХИМИЧЕСКИХ РЕАКЦИЙ
- •ТИПЫ РЕАКЦИООНОСПОСОБНЫХ ЧАСТИЦ
- ••Нуклеофильной будем называть реакцию, при которой биомолекула атакует электрофильный центр низкомолекулярного участника процесса
- ••Свободно-радикальные реакции сопровождаются взаимодействием свободных радикалов с молекулами с образованием новых свободных радикалов
- •Химическая модификация нуклеиновых кислот. Сайты модификации в гетероциклах
- •РЕАКЦИИ НУКЛЕОФИЛЬНОГО ЗАМЕЩЕНИЯ
- •РЕАКЦИИ НУКЛЕОФИЛЬНОГО ЗАМЕЩЕНИЯ
- •РЕАКЦИИ НУКЛЕОФИЛЬНОГО ЗАМЕЩЕНИЯ. SN1
- ••Характерный пример участия соседней группы мы находим в реакциях горчичного газа [бис-(2-хлорэтил)сульфида или
- •Химическая модификация гетероциклических оснований.
- •Природные алкилирующие реагенты (Повторите биохимию – механизмы переноса одноуглеродных
- •Азотистые аналоги иприта. Механизм SN1
- •Алкилирующие соединения латентной активности
- •Образование активной формы циклофосфана происходит в
- •Действие монозамещенных ( -хлорэтил)-аминов и ( -хлорэтил)-сульфидов
- •Взаимодействие нуклеиновых кислот и их компонентов с диметилсульфатом. Механизм SN1 или
- •Взаимодействие нуклеиновых кислот и их компонентов с диметилсульфатом
- •Метилирование ДНК
- •Разрыв молекулы ДНК (1)
- •Расщепление молекулы ДНК по АП-сайту
- •Взаимодействие с диазометаном. Зависимость от типа растворителя. Где ошибка в структуре?
- •Реакции с N-метил-N-нитрозосоединениями
- •Постсинтетическая модификация нуклеиновых кислот. Минорные основания
- •Природные алкилирующие реагенты (Повторите биохимию – механизмы переноса одноуглеродных
- •Схема синтеза S-аденозилметионина
- •S-аденозилметионин - алкилирующий реагент. SN2 механизм – нуклеофильное бимолекулярное
- •Метилирование ДНК (пострепликационная модификация)
- •Метилирование в последовательности -GC- цитозина
- •Алкилирование (метилирование) пуринов
- •Алкилирование аденозина
- •Алкилирование пиримидинов
- •Изопренилирование НК. Механизм SN1 или SN2?
- •Алкилирование аденозина
- •Минорные основания РНК. Вопрос: кислородсодержащие или серусодержащие гетероциклические основания будут проявлять большую реакционную
- •Реакции замещения у экзоциклических атомов кислорода и серы
- •Реакции замещения у экзоциклических атомов кислорода и серы
- •Реакции замещения у экзоциклического атома серы и азота в составе гетероцикла
- •Введение фотоактивируемых групп в молекулы НК с привлечением алкилирующих реагентов (А)
- •ДЛЯ ЧЕГО НУЖНЫ РЕАКЦИИ НУКЛЕОФИЛЬНОГО ЗАМЕЩЕНИЯ.
- •БИООРТОГОНАЛЬНЫЕ РЕАКЦИИ
- •БИООРТОГОНАЛЬНЫЕ РЕАКЦИИ
- •БИООРТОГОНАЛЬНЫЕ РЕАКЦИИ. УСЛОВИЯ БИООРТОГОНАЛЬНОСТИ
- •А сколько биоорганику реакций нужно?
- ••Природа собирает все из молекул, как из конструктора «Лего». Мы тоже пытаемся пользоваться
- •Асколько химику реакций нужно?
- •ПЕРСПЕКТИВЫ "CLICK"-ХИМИИ
- •РЕАКЦИИ НУКЛЕОФИЛЬНОГО ЗАМЕЩЕНИЯ. Пример для чего надо получать производные алкинов (например, для клик-
- •ПРИМЕР ИСПОЛЬЗОВАНИЯ КЛИК-ХИМИИ ДЛЯ ПОЛУЧЕНИЯ НАНОЧАСТИЦ, МОДИФИЦИРОВАННЫХ ПРОИЗВОДНЫМИ НУКЛЕОЗИД-5’-ТРИФОСФАТОВ, НЕСУЩИХ ФЛУОРЕСЦЕНТНУЮ РЕПОРТЕРНУЮ ГРУППУ
- •СХЕМА СИНЕЗА ИСХОДНОГО КОМПОНЕНТА ДЯ КЛИК-ХИМИИ
- •Пример использования наночастиц, полученных через клик-химию, для доставки нуклеотидного материала внутрь клетки
- •БИООРТОГОНАЛЬНЫЕ РЕАКЦИИ
- •БИООРТОГОНАЛЬНЫЕ РЕАКЦИИ
- •Что нужно знать после лекций
РЕАКЦИИ НУКЛЕОФИЛЬНОГО ЗАМЕЩЕНИЯ
•Существует два основных механизма, по которым протекают реакции нуклеофильного замещения: SN1 и SN2.
•SN1-Реакция – мономолекулярное нуклеофильное замещение. Реакция, протекающая через карбокатион. Несогласованный двухстадийный процесс.
•SN2-Реакция – бимолекулярное нуклеофильное замещение. Согласованный процесс, т.е. одностадийная реакция, в которой исходное соединение и продукт разделяет только переходное состояние.
•Следует обратить внимание, что нуклеофильная атака метильной или другой алкильной группы протекает легко только в том случае, если атом углерода присоединен к какому-либо атому, несущему положительный заряд.
62
РЕАКЦИИ НУКЛЕОФИЛЬНОГО ЗАМЕЩЕНИЯ
•Химическая природа уходящей группы сильно влияет как на скорость реакции нуклеофильного замещения, так и на положение равновесия. Уходящая группа должна иметь пару электронов и несет отрицательный заряд. Существует обратное соотношение между основностью частицы и ее способностью быть уходящей группой. Считается, что лучшей уходящей группой при реакциях нуклеофильного замещения является анион сильной кислоты. В водной среде, например, фосфат-ион – гораздо лучшая уходящая группа, чем ОН-, а пирофосфат и триполифосфат – даже еще лучшие уходящие группы. Студенты иногда спрашивают: «Откуда я знаю, какой атом в сложной структуре будет атакован нуклеофилом?». Наиболее простой ответ звучит так: «Ищите углерод, несущий лучшую уходящую группу, потому что при прочих
равных условиях именно этот углерод наиболее легко
будет подвергаться атаке». |
63 |
РЕАКЦИИ НУКЛЕОФИЛЬНОГО ЗАМЕЩЕНИЯ. SN1
•По SN1 механизму могут протекать реакции, при которых возможно образование устойчивого карбокатиона. К этому типу реакций относятся реакции с участием соседней группы. Если в одной и той же молекуле имеется хороший нуклеофил (например, O, S или N) и уходящая группа, и они разделены двумя атомами, то может произойти внутримолекулярное замещение уходящей группы. На второй стадии внешний нуклеофил (функциональная группа нуклеиновой кислоты в нашем случае) замещает внутренний нуклеофил у того углеродного атома, с которым он связывается. Реакция соседней группы описанного типа приводит в целом к сохранению конфигурации атома углерода, связанного с уходящей группой.
64

•Характерный пример участия соседней группы мы находим в реакциях горчичного газа [бис-(2-хлорэтил)сульфида или иприта] или его азотистого аналога. Горчичный газ отличается сильным кожно-нарывным действием и является токсичным при концентрации в воздухе 1 м. д. (миллионная доля). Его высокая реакционная способность и токсичность связаны с эффектом участия соседней группы. Способность к легкому раскрытию кольца при нуклеофильной атаке делает трехчленные кольца сильнейшими алкилирующими агентами.
•
65
Химическая модификация гетероциклических оснований.
Алкилирующие реагенты
•Изучение действия алкилирующих агентов на НК привлекает большое внимание; литература, посвященная этому вопросу, весьма обильна и часто противоречива. Наиболее полно материал представлен в книге «Органическая химия нуклеиновых кислот» под редакцией Н.К. Кочеткова и Э.И. Будовского.
•С одной стороны, многие алкилирующие реагенты являются мутагенами и канцерогенами, а с другой стороны, реакции алкилирования, осуществляемые в мягких условиях, широко используются для исследования структуры и функции полинуклеотидов.
•Примеры алкилирующих реагентов
•Алкилгалогениды. Первыми алкилирующими агентами, использовавшимися в терапии злокачественных заболеваний сразу после второй мировой войны, были иприт и его азотистый аналог.
•Эфиры серной кислоты (диметилсульфат)
•N-метил-N-нитрозосоединения и диазометан
66

Природные алкилирующие реагенты (Повторите биохимию – механизмы переноса одноуглеродных
фрагментов)
OO
O P O P O-
O- O-
67

Азотистые аналоги иприта. Механизм SN1
|
Alk |
||
+H2O |
N |
|
CH2CH2OH |
|
|||
|
Ar |
Alk |
Alk |
+ |
CH2 |
|
|
|
|||
|
N CH2CH2Cl |
N |
|
|
Ar |
Ar |
Cl |
CH2 |
+Nucleophile |
|
|
|
Alk |
|
|
|
|
|
N CH2CH2 Nucleophile
Ar
68

Алкилирующие соединения латентной активности
•Алкилирующие агенты являются одной из самых
распространенных групп из всех применяемых в настоящее время противоопухолевых препаратов.
Одно из направлений создания модифицированных более селективно действующих алкилирующих препаратов, содержащих в молекуле хлорэтиламиногруппы, основано на принципе получения соединений латентной активности
NH N(CH2CH2Cl)2
P
OO
N’-бис-( -хлорэтил)-N’-О-триметиленовый эфир диамида фосфорной кислоты (циклофосфан). Является алкилирующим цитостатическим препаратом.
69

Образование активной формы циклофосфана происходит в
результате действия оксидаз микросом
70
Действие монозамещенных ( -хлорэтил)-аминов и ( -хлорэтил)-сульфидов
•Монозамещенные ( -хлорэтил)-амины и ( -хлорэтил)-
сульфиды чрезвычайно легко взаимодействуют с нуклеофильными агентами.
•Реакция протекает через промежуточное образование циклического сульфониевого или циклического иммониевого ионов. Ниже сопоставляется относительная реакционная способность нуклеозидов при их взаимодействии с диэтил-( -
хлорэтил)амином (рН 7, 40 0С)
• |
Гуанозин |
– 3000 |
• |
Аденозин |
– 850 |
• |
Дезоксицитидин – 500-600 |
|
• |
Тимидин |
- 40 |
•С одной стороны, многие алкилирующие реагенты являются мутагенами и канцерогенами, а с другой стороны, реакции алкилирования, осуществляемые в мягких условиях, широко используются для исследования структуры и функции полинуклеотидов (вспоминаем метод Максама-Гилберта).
• |
71 |