- ••РЕАКЦИИ ПО ГЕТЕРОЦИКЛИЧЕСКИМ ОСНОВАНИЯМ
- •АТОМ
- •РАСПРЕДЕЛЕНИЕ ЭЛЕКТРОННОЙ ПЛОТНОСТИ В АТОМЕ ВОДОРОДА
- •ДВИЖЕНИЕ ЭЛЕКТРОНА В АТОМЕ
- •КВАНТОВЫЕ ЧИСЛА И ОРБИТАЛИ
- •КВАНТОВЫЕ ЧИСЛА
- •КВАНТОВЫЕ ЧИСЛА
- •КВАНТОВЫЕ ЧИСЛА
- •ПРИНЦИПЫ ЗАПОЛНЕНИЯ АТОМНЫХ ОРБИТАЛЕЙ ЭЛЕКТРОНАМИ
- •ПРИНЦИПЫ ЗАПОЛНЕНИЯ АТОМНЫХ ОРБИТАЛЕЙ ЭЛЕКТРОНАМИ
- •Схемы, иллюстрирующие уровни (а), подуровни (б), орбитали (в) атомов элементов
- •ПРИНЦИПЫ ЗАПОЛНЕНИЯ АТОМНЫХ ОРБИТАЛЕЙ эЛЕКТРОНАМИ
- •ПРИНЦИП ЗАПОЛНЕНИЯ АТОМНЫХ ОРБИТАЛЕЙ ЭЛЕКТРОНАМИ
- •ПРИНЦИП ЗАПОЛНЕНИЯ АТОМНЫХ ОРБИТАЛЕЙ ЭЛЕКТРОНАМИ
- •ПРИНЦИП ЗАПОЛНЕНИЯ АТОМНЫХ ОРБИТАЛЕЙ ЭЛЕКТРОНАМИ
- •ПРИНЦИП ЗАПОЛНЕНИЯ АТОМНЫХ ОРБИТАЛЕЙ ЭЛЕКТРОНАМИ
- •ПРИНЦИПЫ ЗАПОЛНЕНИЯ АТОМНЫХ ОРБИТАЛЕЙ ЭЛЕКТРОНАМИ
- •ХИМИЧЕСКАЯ СВЯЗЬ
- •ХИМИЧЕСКАЯ СВЯЗЬ энергия связи
- •При сближении атомов между их внешними электронами с противоположными спинами происходит сильное обменное
- •КОВАЛЕНТНАЯ СВЯЗЬ
- •ОТНОСИТЕЛЬНАЯ
- •ОСНОВНЫЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ АТОМОВ ЭЛЕМЕНТОВ
- •ХАРАКТЕРИСТИКА АТОМА энергия ионизации
- •ОСНОВНЫЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ АТОМОВ ЭЛЕМЕНТОВ
- •ОСНОВНЫЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ АТОМОВ ЭЛЕМЕНТОВ
- •ХИМИЧЕСКАЯ СВЯЗЬ
- •ХИМИЧЕСКАЯ СВЯЗЬ
- •ХИМИЧЕСКАЯ СВЯЗЬ
- •СВОЙСТВА КОВАЛЕНТНОЙ СВЯЗИ
- •ПОЛЯРНОСТЬ КОВАЛЕНТНОЙ СВЯЗИ
- •ПОЛЯРНОСТЬ КОВАЛЕНТНОЙ СВЯЗИ
- •ПОЛЯРНОСТЬ и ПОЛЯРИЗУЕМОСТЬ СВЯЗИ
- •ХИМИЧЕСКАЯ СВЯЗЬ
- •ХИМИЧЕСКАЯ СВЯЗЬ
- •СТРУКТУРА ЛЬЮИСА И ФОРМАЛЬНЫЙ ЗАРЯД
- •СТРУКТУРА ЛЬЮИСА И ФОРМАЛЬНЫЙ ЗАРЯД
- •СТРУКТУРА ЛЬЮИСА И ФОРМАЛЬНЫЙ ЗАРЯД
- •СВОЙСТВА КОВАЛЕНТНОЙ СВЯЗИ длина связи
- •СВОЙСТВА КОВАЛЕНТНОЙ СВЯЗИ кратность связи
- •ОСОБЕННОСТИ КОВАЛЕНТНОЙ СВЯЗИ кратность связи
- •ОСОБЕННОСТИ КОВАЛЕНТНОЙ СВЯЗИ насыщаемость связи
- •ОСОБЕННОСТИ КОВАЛЕНТНОЙ СВЯЗИ насыщаемость связи
- •Начиная с третьего периода, у атомов р-элементов при возбуждении электроны внешних s- и
- •СВОЙСТВА КОВАЛЕНТНОЙ СВЯЗИ направленность
- •ГЕОМЕТРИЧЕСКОЕ СТРОЕНИЕ МОЛЕКУЛ
- •ГЕОМЕТРИЧЕСКОЕ СТРОЕНИЕ МОЛЕКУЛ
- •ГЕОМЕТРИЧЕСКОЕ СТРОЕНИЕ МОЛЕКУЛ
- •СОПРЯЖЕНИЕ КОВАЛЕНТНЫХ СВЯЗЕЙ
- •ХИМИЧЕСКИЕ РЕАКЦИИ
- •КЛАССИФИКАЦИЯ ХИМИЧЕСКИХ РЕАКЦИЙ
- •ТИПЫ РЕАКЦИООНОСПОСОБНЫХ ЧАСТИЦ
- ••Нуклеофильной будем называть реакцию, при которой биомолекула атакует электрофильный центр низкомолекулярного участника процесса
- ••Свободно-радикальные реакции сопровождаются взаимодействием свободных радикалов с молекулами с образованием новых свободных радикалов
- •Химическая модификация нуклеиновых кислот. Сайты модификации в гетероциклах
- •РЕАКЦИИ НУКЛЕОФИЛЬНОГО ЗАМЕЩЕНИЯ
- •РЕАКЦИИ НУКЛЕОФИЛЬНОГО ЗАМЕЩЕНИЯ
- •РЕАКЦИИ НУКЛЕОФИЛЬНОГО ЗАМЕЩЕНИЯ. SN1
- ••Характерный пример участия соседней группы мы находим в реакциях горчичного газа [бис-(2-хлорэтил)сульфида или
- •Химическая модификация гетероциклических оснований.
- •Природные алкилирующие реагенты (Повторите биохимию – механизмы переноса одноуглеродных
- •Азотистые аналоги иприта. Механизм SN1
- •Алкилирующие соединения латентной активности
- •Образование активной формы циклофосфана происходит в
- •Действие монозамещенных ( -хлорэтил)-аминов и ( -хлорэтил)-сульфидов
- •Взаимодействие нуклеиновых кислот и их компонентов с диметилсульфатом. Механизм SN1 или
- •Взаимодействие нуклеиновых кислот и их компонентов с диметилсульфатом
- •Метилирование ДНК
- •Разрыв молекулы ДНК (1)
- •Расщепление молекулы ДНК по АП-сайту
- •Взаимодействие с диазометаном. Зависимость от типа растворителя. Где ошибка в структуре?
- •Реакции с N-метил-N-нитрозосоединениями
- •Постсинтетическая модификация нуклеиновых кислот. Минорные основания
- •Природные алкилирующие реагенты (Повторите биохимию – механизмы переноса одноуглеродных
- •Схема синтеза S-аденозилметионина
- •S-аденозилметионин - алкилирующий реагент. SN2 механизм – нуклеофильное бимолекулярное
- •Метилирование ДНК (пострепликационная модификация)
- •Метилирование в последовательности -GC- цитозина
- •Алкилирование (метилирование) пуринов
- •Алкилирование аденозина
- •Алкилирование пиримидинов
- •Изопренилирование НК. Механизм SN1 или SN2?
- •Алкилирование аденозина
- •Минорные основания РНК. Вопрос: кислородсодержащие или серусодержащие гетероциклические основания будут проявлять большую реакционную
- •Реакции замещения у экзоциклических атомов кислорода и серы
- •Реакции замещения у экзоциклических атомов кислорода и серы
- •Реакции замещения у экзоциклического атома серы и азота в составе гетероцикла
- •Введение фотоактивируемых групп в молекулы НК с привлечением алкилирующих реагентов (А)
- •ДЛЯ ЧЕГО НУЖНЫ РЕАКЦИИ НУКЛЕОФИЛЬНОГО ЗАМЕЩЕНИЯ.
- •БИООРТОГОНАЛЬНЫЕ РЕАКЦИИ
- •БИООРТОГОНАЛЬНЫЕ РЕАКЦИИ
- •БИООРТОГОНАЛЬНЫЕ РЕАКЦИИ. УСЛОВИЯ БИООРТОГОНАЛЬНОСТИ
- •А сколько биоорганику реакций нужно?
- ••Природа собирает все из молекул, как из конструктора «Лего». Мы тоже пытаемся пользоваться
- •Асколько химику реакций нужно?
- •ПЕРСПЕКТИВЫ "CLICK"-ХИМИИ
- •РЕАКЦИИ НУКЛЕОФИЛЬНОГО ЗАМЕЩЕНИЯ. Пример для чего надо получать производные алкинов (например, для клик-
- •ПРИМЕР ИСПОЛЬЗОВАНИЯ КЛИК-ХИМИИ ДЛЯ ПОЛУЧЕНИЯ НАНОЧАСТИЦ, МОДИФИЦИРОВАННЫХ ПРОИЗВОДНЫМИ НУКЛЕОЗИД-5’-ТРИФОСФАТОВ, НЕСУЩИХ ФЛУОРЕСЦЕНТНУЮ РЕПОРТЕРНУЮ ГРУППУ
- •СХЕМА СИНЕЗА ИСХОДНОГО КОМПОНЕНТА ДЯ КЛИК-ХИМИИ
- •Пример использования наночастиц, полученных через клик-химию, для доставки нуклеотидного материала внутрь клетки
- •БИООРТОГОНАЛЬНЫЕ РЕАКЦИИ
- •БИООРТОГОНАЛЬНЫЕ РЕАКЦИИ
- •Что нужно знать после лекций
БИООРТОГОНАЛЬНЫЕ РЕАКЦИИ
Реакция Штаудингера стала первой химической реакцией, приспособленной для проведения модификации внутри клетки. Азидная группа, вступающая в данную реакцию, относится к мягким электрофилам, которые не способны реагировать с жесткими нуклеофилами, наиболее распространенными в природе. Партнером для азида стал фосфин – мягкий нуклеофил, предложенный Штаудингером в 1919 году. В 2000 году реакция Штаудингера была модифицирована Бертоцци и применена как биоортогональное лигирование по Штаудингеру для мечения широкого спектра биомолекул как в живых клетках, так и целых организмах.
В настоящее время при помощи биоортогональных реакций стало возможным изучение различных биомолекул, например, комплексов нуклеиновых кислот с белками, в режиме реального времени в живых системах при отсутствии цитотоксичности. Было разработано несколько химических реакций, отвечающих требованиям биоортогональности, среди них 1,3-диполярное циклоприсоединение азидов в циклооктинам (называемое также безмедной клик-реакцией), образование оксимов или гидразонов из карбонильных соединений и др.
112
Что нужно знать после лекций
•Реакции гетероциклических оснований в составе моно- и олигонуклеотидов.
Общие представления. Природа реакционных центров. Закономерности распределения биогенных элементов по s-, p- и d-блокам; строение атомов каждого органогена, его основные валентные состояния и характерные особенности образуемых им химических связей. Возможные электронные состояния для атомов азота и кислорода. Влияние их на основность, нуклеофильность и комплексообразующую способность биологически важных соединений. Теория резонанса. Электронные эффекты заместителей и их влияние на реакционные центры молекул. Выстраивание логической взаимосвязи между строением вещества, его свойствами и реакционной способности. Типы химических реакций. Влияние пространственной структуры НК на реакционную способность.
•Реакции алкилирования: действие азотистых ипритов. Механизм алкилирования алифатическими ипритами.
•Взаимодействие с диазометаном. Зависимость от условий проведения реакции.
•Модификация диметилсульфатом. Расщепление ДНК по гуанозиновым звеньям через модификацию диметилсульфатом. Алкилирование остатка аденозина и перегруппировка Димрота.
•Природные алкилиующие реагенты. Пострепликационная и посттранскрипционная модификация ДНК и РНК. Минорные компоненты нуклеиновых кислот как продукт модификации.
•Получение фотоактивируемых производных нуклеиновых кислот через реакцию алкилирования алкилирующими производными фотореагентов. Другие примеры.
•Биоортогональные реакции. Клик-химия.
113
