
- •Общие методы синтеза нуклеотидтрифосфатов
- •СИНТЕЗ НУКЛЕОЗИД-5’-ТРИФОСФАТОВ
- •Селективная активация концевого фосфата
- •Фосфорилирующие производные NTP
- •Общая схема синтеза динуклеотидтрифосфатов
- •Синтетические олигонуклеотиды и их аналоги: синтез и применение
- •Конструирование аффинных и антисмысловых реагентов
- •В некоторых биологических процессах принимают участие ковалентные интермедиаты ферментов с субстратом. Образование интермедиатов
- •Производные олигонуклеотидов
- •Производные олигонуклеотидов
- •СОЗДАНИЕ РНКазомиметика. Кислотно-основной катализ расщепления фосфодиэфирных
- •Catalytic centers of ribonucleases
- •The RNA cleaving groups
- •The minimal structure element of artificial ribonucleases
- •The RNA cleaving groups were conjugated to oligonucleotides by phosphamide linkage
- •CLEAVAGE OF LEISHMANIA MINI-EXON SEQUENCE BY OLIGONUCLEOTIDES CONJUGATED TO A DIIMIDAZOLE CONSTRUCT
- •Синтез модифицированных олигонуклеотидов
- ••МОДИФИКАЦИЯ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ
- •Аналоги олигонуклеотидов с модифицированным углеводным фрагментом
- •Синтез нуклеозидов, содержащих аминогруппу
- •Трансгликозилирование – перенос углеводного остатка от нуклеозида на другое гетероциклическое основание
- •ВВЕДЕНИЕ ФОТОАКТИВИРУЕМЫХ ГРУПП ПО ОСТАТКАМ САХАРА
- •Вопрос на повторение ВВЕДЕНИЕ ФОТОАКТИВИРУЕМЫХ
- •Введение по 2’-положению дисульфидного мостика
- •Нейлон-ДНК
- •2’-О-Модифицированные аналоги
- •Что необходимо знать после лекции
- •Что необходимо знать после лекции
•МОДИФИКАЦИЯ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ
•ПО УГЛЕВОДНОМУ ОСТАТКУ
•Модификация по С(2’)-атому углеводного фрагмента нуклеозидов представляется перспективной, так как при включении модифицированного таким образом звена в состав олигонуклеотида искажения в структуре НК-дуплекса оказываются минимальными. Кроме того, введение реакционноспособной группы в 2’-положение позволяет получать нуклеозиды как с С(2’)-экзо-, так и с С(2’)-эндо-конформацией углеводного остатка, а также «направлять» заместитель как в малую, так и в большую бороздку спирали НК- дуплекса.
Аналоги олигонуклеотидов с модифицированным углеводным фрагментом
[Зацепин Т.С., Романова Е.А., Орецкая Т.С. (2004) Успехи химии, 73(7), С.1-38]
•Представители этого типа:
•2’-модифицированные олигорибонуклеотиды;
•Реакционноспособная группа может быть связана с С(2’)- атомом непосредственно или через линкеры различной природы.
•Нуклеофильные группы – амино- или тиогруппы;
•Электрофильные группы – карбоксильные, альдегидные и др.)
•Конформационноограниченные аналоги олигонуклеотидов (LNA – “Locked Nucleic Acids”.

Синтез нуклеозидов, содержащих аминогруппу
[Зацепин Т.С., Романова Е.А., Орецкая Т.С. (2004) Успехи химии, 73(7), С.1-38]

Трансгликозилирование – перенос углеводного остатка от нуклеозида на другое гетероциклическое основание

ВВЕДЕНИЕ ФОТОАКТИВИРУЕМЫХ ГРУПП ПО ОСТАТКАМ САХАРА
|
|
|
O |
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
NH |
|
|
|
|
NH |
|
РНК-полимераза |
|
O |
N |
O |
|
|
O |
N |
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
ДНК |
O |
|
NH2 |
CF3 |
N |
O |
|
HN |
CF3 |
|
pppA, pppG, pppC, pppUNH |
|
|
N |
|||||||
|
SCNCH2 |
|
||||||||
2 |
|
|
|
|
|
C |
NHCH2 |
|||
|
|
|
N |
|
|
|
||||
|
РНК |
|
|
|
РНК |
|
N |
|||
|
|
|
|
|
|
S |
|

Вопрос на повторение ВВЕДЕНИЕ ФОТОАКТИВИРУЕМЫХ |
|
ГРУПП ПО ОСТАТКАМ гетероциклических оснований |
|
A |
Б |
РНК-полимераза
ДНК
pppA, pppG, pppC, pppUS
O
N3 CCH2Br
O
N3 CCH2
S |
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
NH |
|
|
HN |
|
CH2NH2 |
|
РНК-полимераза |
||
|
|
|
|
|
|
||||
N |
O |
O |
|
N |
|
|
|
|
ДНК |
|
|
|
|
|
CH2NH2 |
||||
|
|
|
|
|
|
pppA, pppG, pppC, pppU |
|||
мРНК |
|
|
|
мРНК |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
N |
CF3 |
|
O |
O |
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
CO N |
||
|
|
|
|
|
N |
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
S |
|
|
|
O |
|
|
O |
|
CF3 N |
|
|
|
|
|
|
CH2NH |
|
||
N |
|
|
HN |
|
|
C |
|
N |
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
NO O
N
мРНК |
мРНК |

Введение по 2’-положению дисульфидного мостика

Нейлон-ДНК
•Для образования регулярных амидных связей в олиготимидилат вводили 2’-S- замещенные уридиновые мономеры, содержащие линкеры с одной/двумя амино-, или одной/двумя карбоксильными группами. При последующей внутримолекулярной конденсации в водном растворе образовалась требуемая структура.


