Добавил:
Upload Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:
БИООРГАНИКА / Лекция_12_сахарофосфатный остов_модификация.ppt
Скачиваний:
38
Добавлен:
06.06.2015
Размер:
1 Mб
Скачать

МОДИФИКАЦИЯ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ

ПО УГЛЕВОДНОМУ ОСТАТКУ

Модификация по С(2’)-атому углеводного фрагмента нуклеозидов представляется перспективной, так как при включении модифицированного таким образом звена в состав олигонуклеотида искажения в структуре НК-дуплекса оказываются минимальными. Кроме того, введение реакционноспособной группы в 2’-положение позволяет получать нуклеозиды как с С(2’)-экзо-, так и с С(2’)-эндо-конформацией углеводного остатка, а также «направлять» заместитель как в малую, так и в большую бороздку спирали НК- дуплекса.

Аналоги олигонуклеотидов с модифицированным углеводным фрагментом

[Зацепин Т.С., Романова Е.А., Орецкая Т.С. (2004) Успехи химии, 73(7), С.1-38]

Представители этого типа:

2’-модифицированные олигорибонуклеотиды;

Реакционноспособная группа может быть связана с С(2’)- атомом непосредственно или через линкеры различной природы.

Нуклеофильные группы – амино- или тиогруппы;

Электрофильные группы – карбоксильные, альдегидные и др.)

Конформационноограниченные аналоги олигонуклеотидов (LNA – “Locked Nucleic Acids”.

Синтез нуклеозидов, содержащих аминогруппу

[Зацепин Т.С., Романова Е.А., Орецкая Т.С. (2004) Успехи химии, 73(7), С.1-38]

Трансгликозилирование – перенос углеводного остатка от нуклеозида на другое гетероциклическое основание

ВВЕДЕНИЕ ФОТОАКТИВИРУЕМЫХ ГРУПП ПО ОСТАТКАМ САХАРА

 

 

 

O

 

 

 

 

O

 

 

 

 

 

 

NH

 

 

 

 

NH

 

РНК-полимераза

 

O

N

O

 

 

O

N

O

 

 

 

 

 

 

 

 

 

ДНК

O

 

NH2

CF3

N

O

 

HN

CF3

 

pppA, pppG, pppC, pppUNH

 

 

N

 

SCNCH2

 

2

 

 

 

 

 

C

NHCH2

 

 

 

N

 

 

 

 

РНК

 

 

 

РНК

 

N

 

 

 

 

 

 

S

 

Вопрос на повторение ВВЕДЕНИЕ ФОТОАКТИВИРУЕМЫХ

ГРУПП ПО ОСТАТКАМ гетероциклических оснований

A

Б

РНК-полимераза

ДНК

pppA, pppG, pppC, pppUS

O

N3 CCH2Br

O

N3 CCH2

S

 

 

 

O

 

 

 

 

 

NH

 

 

HN

 

CH2NH2

 

РНК-полимераза

 

 

 

 

 

 

N

O

O

 

N

 

 

 

 

ДНК

 

 

 

 

 

CH2NH2

 

 

 

 

 

 

pppA, pppG, pppC, pppU

мРНК

 

 

 

мРНК

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

N

CF3

 

O

O

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

CO N

 

 

 

 

 

N

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

O

 

 

 

 

 

 

 

 

 

S

 

 

 

O

 

 

O

 

CF3 N

 

 

 

 

 

 

CH2NH

 

N

 

 

HN

 

 

C

 

N

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

NO ON

мРНК

мРНК

Введение по 2’-положению дисульфидного мостика

Нейлон-ДНК

Для образования регулярных амидных связей в олиготимидилат вводили 2’-S- замещенные уридиновые мономеры, содержащие линкеры с одной/двумя амино-, или одной/двумя карбоксильными группами. При последующей внутримолекулярной конденсации в водном растворе образовалась требуемая структура.