стандарты лечения / Laboratornyi-Spravochnik-2012__Synevo
.pdf
Мишень (Тarget) – в самом широком смысле – биологический объект (ткань, молекула, клетка, микроорганизм), которая интересует исследователя.
Молекулярная диагностика – выявление молекулярно2биологическими методами патогенного микроорганизма, специфического вещества или измененной нуклеотидной последовательности, ответственных за то или иное заболевание.
Молекулярные маячки [moleculаr beаcons (MBs)] – пробы из коротких гибридизованных нуклеотидов, предназначенные для обнаружения специфических нуклеиновых кислот. Они представляют собой молекулы в форме булавки с флуорофором, излучение которого в обычном состоянии погашено, но может быть восстановлено за счет связывания с целевой последовательностью нуклеотидов.
Нуклеозид (Nucleoside) – пуриновое или пиримидиновое азотистое основание, ковалентно связанное с пятиуглеродным сахаром (пентозой). Если сахаром является рибоза, то мы имеем дело с рибонуклеозидом, а если дезоксирибоза, то с дезоксирибонуклеозидом.
Нуклеотид (Nucleotide) – нуклеозид, к которому присоединена одна или более фосфатных групп; присоединение происходит по 5’2углеродному атому сахарного кольца.
Обратная транскриптаза (Reverse transcriptase) – РНК2зависимая ДНК2 полимераза, использующая молекулу РНК в качестве матрицы для синтеза комплементарной цепи ДНК.
Обратная транскрипция – полимеразная цепная реакция (Reverse tran2 scription – polymerase chain reaction). Способ получения в большом количестве кДНК, состоящий из двух этапов. Вначале in vitro синтезируют кДНК, используя обратную транскриптазу, мРНК в качестве матрицы и oligo (dT) в качестве праймера. Затем кДНК амплифицируют с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР), используя два праймера: один комплементарен участку первой цепи кДНК, а второй – другой цепи, комплементарной первой.
Олигонуклеотид – короткий сегмент одноцепочечной ДНК. Обычно получают химическим путем.
Отжиг (Annealing) – процесс образования двухцепочечных молекул (ДНК2 ДНК или ДНК2РНК) из одиночных полинуклеотидных комплементарных цепей.
Пиримидины (Pyrimidine) – один из двух типов азотистых оснований, входящих в состав нуклеиновых кислот; к пиримидинам относятся тимин, цитозин и урацил. Второй тип оснований – пурины; к ним относятся аденин и гуанин.
Плазмида (Plasmide) – внехромосомный генетический элемент, способный к длительному автономному существованию и репликации. Это двухцепочечная кольцевая ДНК длиной 12200 тыс п.о.
Полимеразная цепная реакция, ПЦР (Polymerase chain reaction) – метод амплификации специфического сегмента ДНК с помощью термостабильной ДНК2полимеразы с использованием олигонуклеотидных ДНК2зондов, комплементарных последовательностям противоположных цепей ДНК, фланкирующим амплифицируемый сегмент. Процесс состоит из серии циклически повторяющихся реакций: денатурации ДНК, отжига зондов, синтеза ДНК.
631
ЛАБОРАТОРНЫЙ СПРАВОЧНИК СИНЭВО
Полинуклеотид – линейный полимер, состоящий из 20 и более нуклеотидов, соединенных друг с другом фосфодиэфирными связями. Полинуклеотидами являются, например, молекулы ДНК и РНК.
Праймер – искусственно синтезированная последовательность олигонуклеотидов, комплементарная соответствующим участкам ДНК2 мишени, применяемая для проведения полимеразной цепной реакции.
Протеиназы, протеолитические ферменты (Protease) – ферменты, расщепляющие пептидные связи в белковых молекулах.
Процессинг (Processing) – совокупность процессов образования зрелых молекул РНК и белков в клетке. Включает ряд последовательных расщеплений молекулы2предшественника эндонуклеазой или протеиназами.
Пурины (Purine) – один из двух типов азотистых оснований, входящих в состав нуклеиновых кислот; к пуринам относятся аденин и гуанин. Второй тип оснований – пиримидины; к ним относятся тимин, урацил и цитозин.
Рекомбинантная ДНК – молекула ДНК, полученная в результате объединения in vitro чужеродных (в природе никогда вместе не существующих) фрагментов ДНК с использованием методов генной инженерии.
Репликация (Replication) – процесс самовоспроизведения (синтеза) ДНК. Рибоза (Ribose) – пятуглеродный моносахарид. Входит в состав РНК. Рибонуклеиновая кислота, РНК (Ribonucleic acid RNA) – нуклеиновая
кислота, состоящая из рибонуклеотидов, у которых сахаром является рибоза, а одним из пиримидинов – урацил (вместо тимина).
Рибосома (Ribosome) – клеточная органелла, рибонуклеопротеидная частица, при участии которой осуществляется синтез белка (трансляция). Состоит из двух субчастиц, большой и малой.
Рибосомная РНК, рРНК (Ribosomal RNA, rRNA) – РНК, входящая в состав рибосом.
Сплайсинг (Splicing) – вырезание из предшественника мРНК интронов и ковалентное соединение экзонов с образованием зрелых молекул мРНК.
Температура плавления, Тm (Melting temperature) – температура, при которой происходит разрыв половины водородных связей в полинуклеотидном дуплексе.
Тимин, Т (Thymine) – пиримидиновое основание; одно из четырех азотистых оснований, входящих в состав ДНК.
Транскрипт (Transcript) – молекула РНК, синтезированная на специфической ДНК как на матрице.
Транскрипция (Transcription) – процесс синтеза РНК, катализируемый РНК2полимеразой, в котором в качестве матрицы используется одна из цепей ДНК.
Трансляция (Translation) – синтез полипептидной цепи рибосомой с использованием в качестве матрицы мРНК.
Транспортная РНК, тРНК (Transfer RNA) – молекула РНК, выступающая в роли адаптера при специфическом переносе аминокислот к растущей полипептидной цепи в процессе трансляции.
Трансформация (Transformation). 1. Перенос генетической информации в бактериальные клетки с участием плазмид или без них, но всегда – без участия вирусов; часто приводит к изменению фенотипа реципиентной клетки. 2. Превращение нормальных клеток животных в опухолевые.
Урацил, U (Uracil) – пиримидиновое основание; одно из четырех азотистых оснований, входящих в состав РНК.
632
Фосфодиэфирная связь (Phosphodiester bond) – связь между фосфатными группами при 3’2 и 5’2углеродных атомах соседних нуклеотидов одной полинуклеотидной цепи.
Хромосома (Chromosome) – структура, основу которой составляет конденсированная молекула ДНК; носитель генетической информации. Способна к воспроизведению с сохранением структурно2функциональной индивидуальности в ряду поколений. У эукариот находится в ядре клетки, у прокариот – непосредственно в цитоплазме.
Целевой ген – ген, который используется для генно2инженерной модификации микроорганизма с целью изменения его свойств, в т.ч. нуклеотидная последовательность рекомбинантной ДНК конкретного ГММ.
Цитозин (C, Cytosine) – одно из четырех азотистых оснований, входящее
всостав ДНК и РНК.
Экзон (Exon) – участок гена, входящий в состав первичного транскрипта,
который остается в нем после процессинга (вырезания интронов). Вместе с другими экзонами образует зрелую РНК.
Элонгация (Elongation) – последовательное присоединение мономеров к полимерной цепи.
Основной задачей лабораторной диагностики при инфекционных заболеваниях является установление этиологического агента, вызвавшего воспалительный процесс. В связи с этим приоритет отдается прямым методам диагностики, направленным на выявление самого возбудителя или его структурно2функциональных элементов. Эффективность решения задач диагностики определяется различными характеристиками метода, среди которых основными являются:
Диагностическая чувствительность (ДЧ) – доля (вероятность) положительных результатов теста при обследовании инфицированных лиц.
Диагностическая специфичность (ДС) – доля (вероятность) отрицательных результатов теста при обследовании неинфицированных лиц.
Диагностические характеристики определяются на основании результатов широких клинико2эпидемиологических и лабораторных исследований. В свою очередь, ДЧ и ДС во многом определяются аналитическими характеристиками метода:
Аналитическая чувствительность – минимальное количество (концентрация) микроорганизма или его структурно2функциональных компонентов, которые воспроизводимо обнаруживаются методом.
Аналитическая специфичность – отсутствие перекрестных реакций со структурно2функциональными компонентами других микроорганизмов. Следует помнить, что поскольку нет метода, который бы однозначно устанавливал наличие или отсутствие инфекции, то и показатели ДЧ и ДС претерпевают изменения по мере появления новых более чувствительных и специфичных методов, а также знаний о патогенезе заболевания.
633
ЛАБОРАТОРНЫЙ СПРАВОЧНИК СИНЭВО
ЛИТЕРАТУРА
1.Возіанова Ж.І. Iнфекцiйнi паразитарнi хвороби: В 3 тт., – К. Здоров'я, 2000.
2.Гитун Т.В. Диагностический справочник эндокринолога. – «АСГ», 2007.
3.Голубчик А.В., Ячменников Н.Н., Панова И.В., Ланкова Е.Н. О чем говорят анализы? Справочник. – «Феникс», 2008.
4.Iнфекцiйнi хвороби в загальнiй практицi та сiмейнiй медицинi. 3а ред. М.А. Андрейчина, – Тернопiль: ТДМУ «Укрмедкнига», 2007. – 500 с.
5.Инфекционные болезни у детей. Ред. Д. Марри. – М., Практика, 2006.
6.Камышников В.С. Клинические лабораторные тесты от А до Я и их диагностические профили. – М.: МЕДпресс2информ, 2007. – 313 с.
7.Лабораторные и инструментальные исследования в диагностике. Справочник. Ред. проф. В.Н. Титова. – Москва, «Гэотар2Meд», 2004.
8.Марова Е.И., Балаболкин М.И., Дедов И.И. Болезни органов эндокринной системы. – Москва, «Медицина», 2000.
9.Маршутина Н.В. Сергеева Н.С Серологические опухолевые маркеры в первичной диагностике и мониторинге больных раком молочной железы. Российский онкологический журнал, (4):2002.
10.Окороков А.Н. Диагностика болезней внутренних органов. Руководство. – Москва, «Медицинская литература», 2005.
11.Пренатапьная диагностика наследственных и врожденных болезней (под ред. акад. РАМН, проф. Э.К. Айламазяна, чл.2корр. РАМН, проф. В.С Баранова). – СПб, МЕДпресс2информ, 2005.
12.Романовский В.Е. Популярная эндокринология: щитовидная железа, сахарный диабет, ожирение. – «Феникс», 2005.
13.Синдром Дауна. Медико2генетический и социально2психологический портрет (под ред. Ю.И. Барашнева). – Москва, «Триада2Х», 2007.
14.Тюряева И.И. Опухолевые антигены. Институт цитологии РАН. – С2Петербург, 2008.
15.Чиркин А.А. Клинический анализ лабораторных данных. – Москва, «Медицинская литература», 2005.
16.Энциклопедия клинических лабораторных тестов под ред. Н.У. Тица. Издательство «Пабмнформ» – М., 1997.
17.Calgary Laboratory Services. Laboratory medicine enhance your Health, effects of Hemolysis on Clinical Speciment, 2005.
18.Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI/NCCLS). Performance Standarts for Antimicrobial Susceptibility Testing, 2006.
19.Cunha R. A. F. et al. Ureaplasma urealyticum clastogenic effects. Bras. J. Med. Biol. Res. 30 (6) 1997).
20.Current Medical Diagnosis and Treatment, 42th Edition / Ed. By L.M. Tierney, S.J.
21.Current Medical Diagnosis and Treatment, 42th Edition / Ed. By L.M. Tierney, S.J. McPhee, M.A. Papadakis. – McGraw2Hill: Lange Med. Books, 2003.
22.H.D. Isenberg. Clinical Microbiology Procedures Handbook, 2004.
23.Harrison's principles of internal medicine. 16th edition. 1, 2 / E.Braunwald, K.J. Isselbacher, R.G. Petersdorf et al. / McGraw2Hill Book Company – (1300 c.).
24.Jacobs D. et al. Laboratory test handbook / Lexi2Comp. / 2002.
25.Karnak D., Ulubay G., Kayacan O. et al. Evaluation of Cyfra 2121: a poten2 tial tumor marker for non2small cell lung carcinomas. Lung, 2001.
634
26.Krawczynski K. et al. Hepatitis E, Infect. Dis. Clin. North. Am. 2000, v.113 (1).
27.Lucrell L. I. et al. Mycoplasma hominis septic arthritis, Clin.Infect, Dis. (1994).
28.McPhee, M.A. Papadakis. – McGraw2Hill: Lange Med. Books, 2003. – p. 1373.
29.Safi F.; Kuhns V.; Beger H.G.; Comparison of CA 7224, CA 1929 and CEA in the diagnosis and monitoring of gastric cancer. Int. J.Biol. Markers. 1995.
30.Serodiagnosis of infectious mononucleosis by using recombinant Epstein2 Barr virus antigens and enzyme2linked immunosorbent assay technology. J Clin Microbiol. 1990 October.
31.Vogl M., Muller M. Tumor Markers: Review and Clinical Application. (IFCC Series), 2002.
32.Wu A. Tietz clinical guide to laboratory tests/ 2006.
33.Клінічна лабораторна діагностика I2IV частини. – Київ, МНІАЦ медичної статистики МВЦ «Медінформ» – 2008 р.
34.К. Хиггинс. «Рас шифровка клинических лабораторних анализов» – Москва, 2010 г.
35.Д.В. Ребриков. «ПЦР в «реальном времени»» – БИНОМ, 2009 – Москва.
36.А.А. Кишкун. «Клиническая лабораторная диагностика» – Москва, 2008 г.
37.А.А. Мельник. «Референтные значения лабораторних показателей у детей и взрослых» – Киев, 2000 г.
38.В.И. Покровский, О.К. Поздиев. «Медицинская микробиология» – М., 1999 г.
39.А.М. Базарнова, В.Т. Морозова. «Руководство по клинической лабораторной диагностике». Ч.3 Клиническая биохимия. – Киев, 1990 г.
40.О.В. Калинина, С.Л. Мукомолов «Молекулярная эпидемиология гепатита С» // Вирусные гепатиты, 2000 г., № 3 – С. 9215.
41.Н.Г. Клюквина. «Антифосфолипидный синдром: клинические аспекты» // Руський медицинский журнал, 2002 г., т.10, № 22 – С.24226.
42.А.И. Денисенко, А.Н. Климов. «Сравнительная характеристика липопротеидов сосуди стой стенки и плазмы крови человека» // Кардиология, 1976, № 7 – С. 64270.
43.М.Л. Алексеева, Е.В. Гусарова, С.М. Муллабаева. «Онкомаркеры, их характеристика и некоторые аспекты клинико2диагностического использования (обзор литературы)» // Проблемы репродукции, № 3, 2005 – С. 65278.
44.А.А. Скоромец, С.А. Дамбинова, О.А. Седова и др. «Биохимические маркеры в диагностике ишемии головного мозга» // INJ, 2009 г., т.27, № 5 – С.15220.
45.Л.Е. Гуревич. «Диагностика нейроэндокринных опухолей желудочнокишечного тракта» // Практическая онкология, 2005 г., т.6, № 4 – С. 1932199.
46.И.И. Антонеева, С.Б. Петров. «Маркеры апоптоза и пролиферации опухолевых клеток в динамике прогрессирования рака яичника» // Онкология, 2008 г., т.10, № 2 – С. 2342236.
47.Л.Э. Завалишина, М.В. Батева, Г.А. Франк и др. «Сравнительное исследование HER22статуса рака молочной железы методами иммуногистохимии и in situ гибридизации» // Клиническая онкология, 2007 г., т.9, № 2 – С. 173721739.
635
СИНЭВО |
48. |
А.М. Дядык, А.Э Багрий, Е.В. Щукина. «Натрийуретические пептиды |
|
(гормоны) в современной кардиологии: от теории к практике» // Ліки |
|
|
|
|
|
|
України, 2008 г., т.121, № 5 – С. 40242. |
|
49. |
А.М. Егоров, А.П. Осипов, Е.М. Гаврилова. «Теория и практика |
|
|
иммуноферментного анализа» – Москва, 1991 г. |
|
50. |
Рахманова А.Г., Яковлев А.А., Виноградова Е.Н. Хронические |
|
|
вирусные гепатиты С. – 1997. – С. 85. |
СПРАВОЧНИК |
51. |
Шерлок Ш., Дули Д. Заболевание печени и желчных путей. – М.: Изд. |
|
дом ГЭОТАР2МЕД, 2002. – С23712376. |
|
|
|
|
|
52. |
Boucher E., Bourierme A., Adams P. et al. Liver iron concentration and dis2 |
|
|
tribution in chronic hepatitis С before and after interferon treatment. Gut, |
|
|
1997, V. 41, № 1, P. 1152120. |
|
53. |
Lau JYN, Tarn RC, Liang TJ, Hong 2.Mechanism of action of ribavirin in the |
|
|
combination treatment of chronic HCV infection. Hepatology 2002;35:100229. |
|
54. |
Sharara A.I., Hunt С.М., Hamilton J.D. Hepatitis С Ann Intern Med |
|
|
1996;125:658268. |
|
55. |
Акушерські і перинатальні проблеми TORCH2інфекції: Практичний |
|
|
посібник // За ред. З.М. Дубоссарської, А.Я. Сенчука – К.: Мета, |
|
|
2003. – 134 с. |
ЛАБОРАТОРНЫЙ |
56. |
Kong F., Ma Z., James G., Gordon S., Gilbert G.L. Species identification |
|
and subtyping of Ureaplasma parvum and Ureaplasma urealyticum using |
|
|
|
|
|
|
PCR2based assays. J Clin Microbiol. 2000; 38: 117529. |
|
57. |
К.Воронин, Л. Лобортас. Иммуноферментный анализ в клинических |
|
|
лабораториях // Практикум «Медицинская техника и оборудование» – |
|
|
С. 50252. |
636
|
|
|
|
Приложение |
Таблица данных пересчета по общему |
||||
|
тестостерону для детей, нмоль/л |
|||
Стадии по Таннеру |
Мальчики |
Девочки |
||
1 |
<0,087 нмоль/л |
0,087 |
2 0,212 нмоль/л |
|
2 |
0,087 2 14,99 нмоль/л |
0,087 |
2 0,361 нмоль/л |
|
3 |
2,25 2 |
27,0 нмоль/л |
0,087 |
2 0,822 нмоль/л |
4 |
6,25 2 |
26,48 нмоль/л |
0,087 |
2 0,930 нмоль/л |
5 |
6,52 2 |
30,61 нмоль/л |
0,160 |
2 0,930 нмоль/л |
Источник: |
|
|
|
|
Дэвид Финголд «Педиатрическая эндокринология», J. Atlas of Pediatric Physical Diagnosis, 2"е издание, Филадельфия. Издательство W.B. Saunders, 1992, 9.16"19
Колебания уровня половых гормонов, в зависимости от дня менструального цикла
Эстрадиол = на протяжении всего менструального цикла ФСГ = 3 – 8 или 19 – 21 дни менструального цикла ЛГ = 3 – 8 или 19 – 21 дни менструального цикла Прогестерон = 19 – 22 дни менструального цикла
Пролактин = фолликулярная и овуляторная фазы менструального цикла Тестостерон общий = на протяжении всего менструального цикла
637
ЛАБОРАТОРНЫЙ СПРАВОЧНИК СИНЭВО
Антибиотикограмма
Для грам( ) палочек |
Для грам(+) кокков |
Для синегнойной |
|
|
|
|
палочки и НФБ |
1 |
моксифлоксацин |
моксифлоксацин |
моксифлоксацин |
2 |
ципрофлоксацин |
офлоксацин |
ципрофлоксацин |
3 |
офлоксацин |
левофлоксацин |
офлоксацин |
4 |
левофлоксацин |
цефтриаксон |
левофлоксацин |
5 |
норфлоксацин |
цефотаксим |
норфлоксацин |
6 |
цефтриаксон |
цефазолин |
цефтриаксон |
7 |
цефтазидим |
доксициклин |
цефтазидим |
8 |
цефоперазон |
азитромицин |
цефотаксим |
9 |
цефепим |
рокситромицин |
цефоперазон |
10 |
амикацин |
кларитромицин |
цефепим |
11 |
канамицин/ |
эритромицин |
амикацин |
|
тобрамицин |
|
|
12 |
нитрофурантоин |
клиндамицин |
канамицин/ |
|
|
|
тобрамицин |
13 |
меропенем |
нитрофурантоин |
меропенем |
14 |
хлорамфеникол |
ванкомицин |
азлоциллин |
15 |
амоксициллин/ |
оксациллин |
амоксициллин/ |
|
клавулат // ампициллин/ |
|
клавулат // ампициллин/ |
|
сульбактам |
|
сульбактам |
16 |
|
ампициллин |
карбенициллин |
17 |
|
рифампицин |
|
18 |
|
хлорамфеникол |
|
Алгогритм выявления ТОRCH инфекции
638
Опухолевые маркеры
639
ЛАБОРАТОРНЫЙ СПРАВОЧНИК СИНЭВО
Динамика изменения иммунологических показателей при гепатите А
Динамика изменения иммунологических показателей при гепатите B
640
