ТЕРМИНЫ ПООБЩЕЙ МИКРОБИОЛОГИИ

Лигирование РНК - процесс "сшивания" значимых участков РНК до того, как происходит перенос РНК в цитоплазму.

Малая ядерная РНК (мяРНК) - транскрипты РНК длиной 100-300 п.о. (= пар оснований),которые, связываясь с белками, формиру­ют малые ядерные рибонуклеопротеиновые/РНП/ частицы. Участвуют в процессинге mРНК.

Мегабаза (Мб) - цепь ДНК, включающая 106 оснований.

Мегадальтон (МД) - 106 Д.

Межгенный спейсер (IGS)- некодирующая ДНК, разделяющая генные последовательности.

Метилирование- добавление метильной группы чаще к цитозину, реже к аденину ДНК, что может привести к торможению транскрип­ции.

Миссенс-мутации- мутации с изменением смысла генетической информации.

Митоген - вещество, индуцирующее митоз.

Мобильный генетический элемент (транспозон) - участок ДНК, способный перемещаться по геному из одного положения в другое.

Мутаген - вещество, вызывающее мутации.

Мутагенез- это внесение изменений в нуклеотидную последова­тельность ДНК. Мутагенез широко используют для изучения белков и улучшения их свойств. ПЦР позволяет проводить сайтнаправленный мутагенез с использованием пары праймеров, несущих мутацию, а также случайный мутагенез.

Мутация - наследуемое изменение генотипа.

Неогенез - правка генетического кода.

Нозерн-блот- метод, аналогичный Саузерн-блоттингу, но зак­лючающийся в переносе РНК изагарозного геля на мембрану до об­работки зондом.

Нокаутгенный - направленное мутирование генов животных invivo,которое приводит к их инактивации во всех клетках трансгенного организма. Технология получения гомозиготных нокаутных ("knockout")мышей с отсутствием в их геноме тех или иных генов разработана В.Н.Kollerв 1992 г.

Нокаутныеживотные - животные, у которых в результате приме­нения метода генного нокаутаген определенного белка либо делетирован [делеция - выпадение], либо несет мутацию, делающую его нефункциональным.

Нонсенс-мутации (молчащие) - бессмысленные мутации.

Нуклеаза- ферменты, разрушающие ДНК и РНК путем расщепления фосфодиэфирных связей.

Оперон- группа структурных и регуляторных генов. Управляет синтезом близких пофункции полипептидов.

Ориджин - сайт начала репликации.

Ортет - организм, из которого получен клон.

п.о. - пары оснований

Парамутации- запрограммированные и часто обратимые модифи­кации регуляторных элементов генов.

Плазмиды- кольцевые внехромосомные молекулы ДНК, способные к автономной репродукции.

Плейотропия- влияние одного гена на несколько признаков ор­ганизма.

Полигения- наличие нескольких неаллельных, обычно близкос­цепленных генов, белковыепродукты которых выполняют сходные функции.

Полиморфизм- наличие нескольких аллельных форм одного и то­го же гена (белка, признака,организма).

Праймеры- искусственно синтезируемые короткие последова­тельности нуклеотидов(однотяжевых ДНК длиной до 25 нуклеоти­дов), комплементарные определенному участку искомой ДНК, кото­рые используются в ПЦР (полимеразной цепной реакции).

Пробанд(пропозит) - лицо, с которого начинается составление родословной.

Прокариоты(доядерные) - клетки без оформленного ядра (од­ноклеточные организмы с другой организацией). Бактерии, археи.

Промотор- последовательность нуклеотидов в молекуле ДНК, ответственная за начало транскрипции.

Протеом- совокупность (коллекция) всех белков (протеинов) организма [по аналогии сгеномом].

Протеомика- наука, занимающаяся изучением совокупности бел­ков и их взаимодействием в живом организме.

Профаг- геном бактериофага, интегрированный в хромосому ли­зогенной бактериальной клетки.

Процессингпре-mРНК- сложный процесс "созревания" РНК (--6 транскрипт РНК) в период между их синтезом и началом реализации ими соответствующей функции.

Механизмыпроцессинга

-Удаление из РНК интронов (черезрасщепление)

-Лигирование (присоединение) значащих участков РНК

-Кэпирование (присоединение к 5'-концу метилгуанозина

-Нуклеотидная модификация

Псевдогены- гены, структурно сходные с обычными генами, но не способные экспрессироваться с образованием функционально ак­тивных продуктов.

ПЦР (polymerase chain reaction/PCR/)- процесс амплификации (умножения) in vitro,при котором фрагмент ДНК может быть разм­ножен до 108 раз (копий).

Регулон- группа разобщенных генов с общим контролем (общим регулятором /энхансером, сайленсером .../). Регулон определяет вид микроорганизмов; фрагмент праймера.

Рекомбинантные молекулы - молекулы, полученные в результате комбинации генов (разных организмов, клеток).

Рекомбинация - перераспределение генетического материала.

Рестриктаза- фермент, разрезающий молекулу ДНК по сайтам узнавания.

Рибозим("генные ножницы") - молекула РНК, катализирующая разрезание молекул РНК.

Рибосомы(органеллы клеток) - комплекс (самосборка) четырех основных нитей rРНК(и некоторых иных РНК) и 80-ти /?/ разных белков (соотношение РНК и белка = 1:1у эукариот; сцепление ио­нами магния). Размер от 15 до 30 нм. Состоят из большой и малой субъединицы. Рибосомы служат для синтеза белка по матрице mРНК(трансляции).

Сайленсер- ингибитор транскрипции (фрагмент ДНК, действую­щий через белки-репрессоры).

Сайленсинг гена - прекращение экспрессии гена.

Саузерн-блот- перенос фрагментов ДНК (предварительно разде­ленных гельэлектрофорезом) нанитроцеллюлозную или нейлоновую мембрану.

Секвенирование(НК /= нуклеиновых кислот/ или белков) - оп­ределение последовательности нуклеотидов (аденинового, гуанози­нового, цитозинового, тиминового,урацилового) или аминокислот (соответственно) во фрагменте НК или в белке.

Секвенирование генома ="чтение генома".

Сиблинги(или сибсы) - потомки одних родителей (братья и сестры; сибсы - все дети одной супружеской пары), но не близнецы. У животных - потомки одних и тех же родителей от разных по­метов.

Сибсы - см. сиблинги.

Сингенный - генетически идентичный.

Спейсер- фрагменты ДНК между генами (нетранскрибируемая последовательность); в белках- фрагмент цепи между доменами.

Сплайсинг- процесс точного вырезания участков первичного транскрипта и сшивания нужных экзонов (в созревании РНК).

Стартовый кодон - кодон, с которого рибосома начинает транс­ляцию (обычно AUG/метионин/). Стартовый кодон задает рамку считывания.

Стоп-кодон (нонсенс-кодон, терминатор цепи) - набор трех нуклеотидов, для которых не существует соответствующей tРНК(аминокислоты). Синтез белка завершается и пептид высвобождает­ся из рибосомы.

Известно 3 стоп-кодона: UAA(охра), UAG(амбер), UGA(опал).

Структурныйген - ген, кодирующий фермент или структурный пептид.

Сцепление- близкое соседство двух генов в одной хромосоме и их совместное наследование.

т.о. - тысяча оснований

т.п.н. - тысяча пар нуклеотидов (длядвуцепочечной ДНК)

т.п.о. - тысяча пар оснований (для двуцепочечной ДНК)

ТАТА-бокс- очень консервативная богатая аденином (А) и ти­мином (Т) последовательность ДНК рядом с точкой инициации транскрипции. Обеспечивает ориентацию РНК-полимеразы относи­тельно промотора (регулирует начало транскрипции).

Теломеры- структуры на концах эукариотических хромосом, со­держащие высоко консервативные повторяющиеся последовательности ДНК, которые необходимы для правильного завершения цикла репли­кации ДНК.

Теломераза- фермент, который поддерживает состояние тело­мер путем добавления последовательностей.

Тотипотентность- способность отдельной клетки давать начало целому организму.

Точковая мутация - изменение ДНК в пределах гена (локуса).

Трансгенез- экспериментальный перенос генов из определенно­го генома или искусственносинтезированных, в другой геном.

Трансгенные животные - животные, в геном которых включены один или несколько чужеродных генов (трансгенов).

Трансгенный - генетически модифицированный.

Трансдукция- перемещение ДНК из клетки в клетку посредством вирусного вектора.

Транскрипт - молекула РНК, синтезированная на матрице ДНК.

Транскрипционный фактор /TF/- белок, который связывается со специфической последовательностью ДНК и контролирует транскрип­цию.

Транскрипция - синтез РНК на матрице ДНК.

Транслокации (t)(изменение локализации) хромосомного участ­ка.

--Сбалансированные (без потери хромосомного материала)

--Несбалансированные (с утратой части хромосомного материала)

Трансляция- синтез пептида на рибосомах (по матрице mРНК с помощью tРНК).

Транспозоны - мобильные генетические элементы.

Трансфекция - заражение клетки вирусной ДНК.

Трансформация- включение фрагментов ДНК среды в геном без каких-либо переносчиков.

Фагмиды(фаги + плазмиды) - клонирующие векторы, содержащие одновременно компоненты фаговой и плазмидной ДНК.

Фенотип - совокупность признаков.

Фланкирующий участок - последовательности, расположенные по обе стороны от интересующей последовательности ДНК.

Фолдингбелков - укладка третичной и четвертичной структуры белка.

Фолдинг - процесс правильной нековалентной укладки полипептидов или полипептидсодержащих структур в процессе трансляции; сворачивание полипептидных цепей.

Фреймшифт-мутации - мутации со сдвигом рамки считывания.

Химерав биологии - организм, состоящий из генетически неод­нородных клеток.

Хроматин- вещество, из которого состоят хромосомы (эукари­от). Включают ДНК, гистоновые и негистоновые белки, небольшое количество РНК.

Цинковыйпалец - ДНК-связывающий белок, содержащий участок с двумя близко расположенными остатками цистеина и двумя остатка­ми цистидина, которые служат лигандами для одного иона цинка (Zn2+).При связывании иона цинка молекула изменяет конформацию; при это маминокислотная цепочка выпячивается в виде паль­ца, что позволяет белку взаимодействовать с большой бороздкой ДНК.

Чип - микроматрица.

Шапероны- консервативные белки (к их числу принадлежит и БТШ-70), участвующие в восстановлении правильной третичной структуры белков (предотвращают некорректную укладку).

Экзон - кодирующие фрагменты последовательности ДНК.

Экспрессии уровень - уровень активности гена (интенсивность транскрипции).

Электроблоттинг- электрофоретический перенос РНК, ДНК или белка из разделяющего геля на поддерживающую матрицу, такую как нитроцеллюлоза. Такая техника переноса применяется в Саузерн- и Нозернблоттинге.

Энхансер - активатор транскрипционных факторов /TF/.

Эпигенетическая изменчивость - ненаследственная обратимая изменчивость. Часто является результатом изменения экспрессии гена вследствие метилирования ДНК.

Эписома (= плазмида) - устаревший термин, замененный на термин "плазмида".

Эукариоты(ядерные) - надцарство живых организмов, клетки которых содержат ядро.

Ядрышко- содержащая РНК ядерная органелла. Представляет со­бой место скопления рибосоми их предшественников. Впоследствии рибосомы транспортируются в цитоплазму.

Down-регуляция- репрессия, супрессия, снижение степени ген­ной транскрипции.

IS-элемент- элемент инсерционной последовательности. У бак­терий 800-1400 пар нуклеотидов, способная к перемещениям в но­вые области генома.

NK-kB- ядерный фактор транскрипции (TF),регулирующий транскрипцию. Участвует в эмбриогенезе, регуляции активности лимфоцитов, иммунных и воспалительных реакций.

ORF- открытая рамка считывания

р - короткое плечо хромосомы (14р - короткое плечо 14-ой хромосомы).

q - длинное плечо хромосомы (10q- длинное плечо 10-ой хро­мосомы).

rh- сокращение "рекомбинантный человеческий"

Up-регуляция- активация, промоция; повышение степени генной транскрипции.