Ациклические
2. Заряженные
-Отрицательно заряженные (моноаминодикарбоновые)
Ациклические
2. Заряженные
-Положительно заряженные (диаминомонокарбоновые)
Первичная структура белка
Пептидные связи
Н |
|
|
О |
|
|
Н |
Н |
О |
|
|
|
|
|
||||
N |
С |
С |
|
|
|
N |
С |
С |
Н |
Н |
|
О |
Н |
|
Н |
|
О Н |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
К о н д е н с а ц и я |
|
Н 2 О |
|
|
||
|
Н |
|
|
О |
|
Н |
О |
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
N |
|
|
|
|
|
|
|
Н |
С |
С |
N |
С |
С |
|
|
|
|
Н |
|
Н |
|
О |
Н |
|
|
|
|
|
|
|
|
||
Д и п е п т и д
Связи, стабилизирующие белковую молекулу
|
|
|
О |
|
С Н |
Н |
|
С |
С Н |
N |
|
|||
N |
С |
С Н |
N |
С |
Н |
О |
|
Н |
О |
|
|
|
Ч а с т ь м о л е к у л ы п о л и п е п т и д а
Последовательность аминокислот для каждого белка уникальна и закреплена генетически
Первичная структура характеризует последовательность аминокислотных остатков в полипептидной цепи, связанных ковалентыми связями
H O
N — конец NH2 — CH2 — C — N — CH — C — N — CH — COOH 
C — конец
O |
СH3 |
H (CH2)4NH2 |
трипептид: глицилаланиллизин
Вторичная структура белка
α-спираль |
β-складчатая структура |
Пример бета-листа, сложенного из 4 антипараллельных нитей. Показана кристаллическая структура фермента каталаза (по файлу PDB 1GWE на разрешении 0.88Å). a) Вид сверху. Видны водородные связи (линии из точек) между группами NH и CO в аминокислотах. Стрелки показывают направление цепочки. Контурами показана плотность электронов у атомов (кроме водорода). Красные шары — кислород, синие — азот; водород не показан; у боковых цепей показан зеленым только первый атом углерода. b) Вид сбоку на центральные 2 нити. Видно правостороннее закручивание и складчатость слоя, когда боковые цепи последовательно соединенных аминокислот попеременно обращены на разные стороны листа
Связи, стабилизирующие белковую молекулу
Электроположительные водородные атомы, соединенные с кислородом или азотом в группах
– ОН или – NH, стремятся обобществить электроны с находящимся по соседству с электроотрицательным атомом кислорода, например, с кислородом группы = СО
Локализованное электростатическое притяжение
– ОН . . . . . . . . . . . ОС
Водородная связь
Характерные мотивы укладки белковой цепи в α, β, α/β, и α+β белках