- •ТРЕТИЧНАЯ СТРУКТУРА –
- •Max Perutz и John Kendrew –
- •Третичная структура миоглобина
- •Типы взаимодействий, стабилизирующие третичную структуру
- •Примеры нековалентных взаимодействий между аминокислотными остатками в третичной структуре
- •Гидрофобные взаимодействия
- •Ленточная модель с боковыми радикалами третичной структуры поверхностного белка вируса гепатита В (HBsAg)
- •относительная гидрофобность
- •Гидрофобный кор лизоцима
- •Водородные связи между радикалами аминокислотных остатков
- •Электростатические взаимодействия
- •ЧЕТВЕРТИЧНАЯ СТРУКТУРА –
- •Первый олигомерный
- •ЛЕНТОЧНАЯ МОДЕЛЬ ГЕМОГЛОБИНА
- •3-мерная модель гомодимера поверхностного белка вируса гепатита В (HBsAg)
- •Электростатические взаимодействия между субъединицами в гемоглобине
- •Структура гема
- •Изменение конформации гемоглобина при связывании кислорода
- •Некоторые примеры свойств мультимерных белков
- •Надмолекулярные структуры – капсиды вирусов
- •Определение пространственной структуры белков
- •Крио-электронная микроскопия
- •Атомная силовая микроскопия (AFM, SFM)
- •Спектроскопия ЯМР
- •ДЕНАТУРАЦИЯ И
- •Денатурация – нарушение нековалентных взаимодействий в белках и разрушение дисульфидных связей
- •ФАКТОРЫ ДЕНАТУРАЦИИ
- •Рибонуклеаза:
- •Денатурированное
- •Формирование третичной структуры белка
- •Самопроизвольность протекания любого процесса оценивают с помощью изменения свободной энергии Гиббса
- •«спонтанная» реакция
- •Экспериментально рассчитанное изменение свободной энергии для фолдинга 7 анкириновых повторов Notch- рецептора
- •Этапы свертывания полипептидной цепи
- •Структурные домены сворачиваются отдельно
- •Внутри домена можно выделить ядро свертывания
- •Проблемы фолдинга
- •Динамическая флуоресцентная деполяризация – метод исследования фолдинга белков
- •Котрансляционный фолдинг белков
- •УЧАСТИЕ ШАПЕРОНОВ В ФОЛДИНГЕ БЕЛКОВ
- •Участие шаперонов в фолдинге белков
- •ФОЛДИНГ БЕЛКОВ С УЧАСТИЕМ ШАПЕРОНИНОВ
- •Пространственная
- •Возможные причины нарушения процесса сворачивания (фолдинга) белка
- •НАРУШЕНИЯ ФОЛДИНГА: ПРИОННЫЕ БОЛЕЗНИ
- •Модели прионного перехода
Некоторые примеры свойств мультимерных белков
Кооперативность (связывание кислорода гемоглобином)
Комбинаторика (множественность иммуноглобулинов)
Структурная сборка (полимерный актин – компонент цитоскелета и мышц)
Регуляция (регуляторные и каталитические субъединицы протеинкиназы С)
Надмолекулярные структуры – капсиды вирусов
Определение пространственной структуры белков
Рентгено-структурный анализ
Крио-электронная микроскопия
Реконструкция 3D изображения
Атомная силовая микроскопия (AFM, SFM)
AFM-изображение вируса лейкемии мышей
Спектроскопия ЯМР
(nuclear Overhauser effect |
(total correlation spectroscopy) |
|
spectroscopy (13C 15N 1H; 3D-str) |
||
|
ДЕНАТУРАЦИЯ И
ФОЛДИНГ БЕЛКОВ
Денатурация – нарушение нековалентных взаимодействий в белках и разрушение дисульфидных связей
(нарушение всех уровней организации белка, кроме первичного)
ФАКТОРЫ ДЕНАТУРАЦИИ
•Высокая температура
•Высокие концентрации солей
•Ионные и неионные детергенты (мочевина и др.)
•Концентрированные щелочи
•Органические кислоты
• |
обратимая |
•Денатурация
• |
необратимая |
Рибонуклеаза:
Нативное состояние: каталитически активное
Добавление мочевины и β- меркаптоэтанола
Денатурированное
состояние:
каталитически
неактивное
