Shpargalka_po_biohimii(ceccuu.net) / T8

БИЛЕТ 8

1.Вторичная структура белка. Альфа-спираль, бетта складка и хаотический клубок. Роль водородных связей в поддержании пространственной структуры белка.

Вторичная структура. Пепт.связь «плоская»  2 степени свободы для каждого АК-остатка. Допустимые значения углов ψ и φ Ramachandran plot (карта). [Б5] •Альфа-спираль: вод.связь параллельна оси спирали, 3.6 АК-остатка на один виток (13 атомов), диаметр (без бок.цепей) ~6 Å. «Закручена» вправо. Каждая вод.связь формирует незн.диполь вся спираль =диполь («+» на N-конце) разные лиганды скапл-ся у разн.концов. Легче всего формир-ся из Ala или Leu, для Asp, Pro и нек.др – невозможна. !Есть и др.спирали: 3₁₀, 2₇ или π-спираль (4,4₁₆). •Бета-складка: [Б6] паралл. и антипаралл (менее «напряжена», см.рис). Вод.связи перпендик.длинной оси складки. •β-поворот (особ.хороши Gly и Pro); •β-buldge («клубок, выпуклость») ≈ «неправильная» бета-складка.

2.Представление о пентозофосфатном пути превращений глюкозы. Окислительные реакции (до стадии рибулозо-5-фосфата). Суммарные результаты пентозофосфатного пути: образование НАДФ*Н и получение Сахаров с разным количеством атомов углерода. Сопряжение пентозного пути с гликолизом.

[УГ5] Пентозофосфатный путь (гексозомонофосфатный шунт) – альтерн.путь оксиления глюкозы: 3 молекулы глюкозы 3СО₂ и 3 молекулы пентоз.

Функции: 1.Обр-ие NADPH (восст.синтез, i.e.синтез ЖК, стероидов); 2.Обр-ие рибозы (синтез нуклеотидов и НК). Ферменты ПФ-пути – в цитозоле, окисление – путем дегидрогенирования, но акцептор Н⁺ - не NAD, а NADP.

2 фазы: окислительная (дегидрогенирование и декарбоксилирование Г-6-Ф до рибулозо-5-фосфата) и восстановительная (рибулозо-5-фосфат Г-6-Ф за счет транскетолазы и трансальдолазы).

I фаза: 1.Г-6-Ф-дегидрогеназа (NADP-зависимое дегидрогенирование 6-Ф-глюконолактон), 2.Глюконолактонгидролаза (гидролиз 6-Ф-глюконат), 3.6-Ф-глюконатдегидрогеназа (NADP-зависимое дегидрогенирование и декарбоксилирование рибулозо-5-фосфат).

II фаза: 1.Рибулозо-5-фосфат-3-эпимераза (Р-5-Ф ксилулозо-5-фосфат) и рибозо-5-фосфаткетоизомераза (Р-5-Ф рибозо-5-фосфат). 2.Транскетолаза (кофермент – тиамин; перенос 1,2-С-участка сахара с кетозы на альдозу) обр-ие кетозы седогептулозо-7-Ф и альдозы глицеральдегид-3-Ф. 3.Трансальдолаза (переном 1,2,3-С-участка сахара с кетозы на альдозу) обр-ие кетозы фруктозо-6-Ф и альдозы эритрозо-4-фосфата. 4.Транскетолаза (перенос «активного гликоальдегида» с ксилулозо-5-Ф на эритрозо-4-Ф) обр-ие фруктозо-6-фосфата и глицеральдегид-6-фосфата.

Можно полностью окислить глюкозу, i.e. в присут. фруктозо-1,6-бисфосфатазы.

!Обр-ие рибозы: из рибозо-5-фосфата под действием PR-PP-синтетазы 5-фосфорибозил-1-пирофосфата.

3.Повреждения ДНК под действием физических и химических факторов. Прямая репарация.

3: Поскол мн-во хим и физ агентов вызыв вДНК повреж-я,во всех кл им-ся спец-ые мех-мы для исправл-я этих поврежд-ий.Основ-я вДНК могут измен-ся и теряться,фосфодиэфирн св остова могут разрыв-ся,а 2цепи могут поперечно сшив-ся др с др.Эти повреждения образ-ся под действ-м ионизирующей радиации,ультрафиолет-го облучения и различ хим в-в.Многие поврежд-я вДНК подд-ся исправл-ю,т.к.генетич инф-ция запис в обеих цепях двойн спирал.Благодаря этому инф-цию,утрачен одной из цепей,можно извл-чь из др цепи.Один из наиб хорошо изучен мех репарац-вырез-е пиримидинового димера,кот образуется при дейст наДНК ультрафиолетов света. Соседние пиримидин остатки в 1цепиДНК мог в этих усл образ-ть ковалент сшивку.Такой пиримидин димер не уклад-ся в двойную спир,так что репликац и экспрессия генов оказыв-ся блокирован до тех пор,пока повреж-е не

будет удалено.В осуществ этого проц важн роль игр 4 ферментатив актив-ти. 1-ая из них-УФ-специфичная эндонуклеаза-находит место поврежд-я и вносит одноцепоч разрыв вблизи от димера,обычно с 5'-стороны.Участок,содерж-ий димер,выпячив-ся из двойной спир,что позволДНК-полимеразе I(или др подоб полимеразе)провести репарацион синтез в направл5'—>3'.Затравк служ 3'-конец разорван цепи,а матрицей-интактная комплементар цепь.Затем обл,где располож пиримидиновый димер,вырез-ся под действ5'—>

—>3'-нуклеазной актив-тиДНК-полимер.Новосинтезирован цепь и остаток той же цепиДНКсоед-ся

ДНК-лигазой.Др путь репарации-фотохимич расщеп-е пиримидин-го димера.Почти все кл содерж фотореактивирующий ферм,кот узнает димер и расщепл его на исходн основ-я,испол-я Е поглощен-го синего света.