Реакция на 95 тезисов.

Альбрехта Бранденбургский, встревоженный и раздраженный, послал в декабре 1517 г. документы в Рим с просьбой ограничить Лютера в свободе действий и, одновременно с этим, объявить выговор торговцам индульгенциями за их злоупотребления. В то время конфликт представлялся многим лишь перебранкой между доминиканцами и августинцами.

Сам Лютер подготовил длинный латинский манускрипт с объяснениями своих «95 тезисов». Важной для него в это время была внутренняя духовная религия, проповедовавшаяся немецким мистиком XIV в. Иоганном Таулером и выраженная в коротком мистическом трактате XIV в. “Theologia Germanica” (“Немецкая теология”), который Лютер сам отредактировал и опубликовал в 1518 г.

Реформационное движение начинало преобретать широкие масштабы. Теолог Иоганн Экк (1486-1543) написал ряд обзоров «95 тезисов». В дальнейшем Экк станет главным официальным апонентом всех реформаторов 1-й половины 16 века. Коллега Лютера Карлштадт, озабоченный делом защиты Виттенбергской программы, ввязался в эту дискуссию со своими тезисами. Карлштадт (собственное имя Андреас Боденштейн; имя Карлштадт - по месту рождения - нижнефранконскому г. Карлштадт (родился ок. 1480,  Карлштадт – умер в 1541, Базель).

Доминиканцы продолжали давление, добиваясь отстранения Лютера и привлечения его к суду за ересь. Сам Лютер не отступил от предмета дискуссии, опубликовав проповедь относительно власти отлучения от церкви, разъяснявшую, что нет таких вопросов веры, на которые может ответить только папа с позиций неограниченной полноты власти.

Лютеру был сделан вызов Лютера на папский суд в Рим. Но в этот опасный момент в дело вмешалась политика. Город Виттенберг принадлежал Курфюрсту Фридриху Мудрому. Университет Виттенберга находился под личным покровительством Фридриха Мудрого. Он был один из семи князей-избирателей императора Священной Римской империи, поэтому был для папы важной фигурой в свете приближающегося избрания нового императора. Папа не мог себе позволить ссориться с ним. В результате этого Лютер был вызван на личное собеседование с одним из кардиналов в Аугсбург. Он прибыл туда с имперской охранной грамотой. Кардинал не предполагал, что какого-то провинциального профессора стоит воспринимать всерьёз, он провёл с Лютером профилактическую беседу отпустил, сказав, что тот должен безоговорочно отречься от своих положений.

Пока Лютер ожидал дальнейших событий, члены церковного совета в Саксонии передавали слухи о том, что он может быть схвачен и в цепях увезен в Рим. В конце концов, друзья Лютера организовали его бегство и отправили его из города по тайной дороге. Лютер написал обращение к своему князю Фридриху Мудрому с просьбой о защите.

Ещё во время приезда в  Аугсбург Лютер встретился с Иоганном Экком, который написал опровержение его «95 тезисам», и они договорились о проведении публичного диспута летом 1519 г. в Лейпциге. Основное содержание диспута составляли дебаты между Экком и Карлштадтом, хотя Лютер был основным объектом для выступлений Экка. Предметом спора между Экком и Карлштадтом была августинская доктрина о благодати и свободной воле. Карлштадт не хотел вмешиваться ни в вопрос об индульгенциях, ни в вопрос об авторитете папы. В умении поставить Лютера в затруднительное положение Экк показал весь свой опыт. Лютер совершил тактическую ошибку: он защищал некоторые утверждения Яна Гуса. Однако Саксония, где находился Лейпциг, была той частью Германии, где преобладали резко враждебные настроения по отношению к Богемии (так тогда называлась Чехия), где произошла история с Яном Гусом. Поэтому высказывания Лютера не нашли поддержки. Это дало основания Экку для хвастливых заявлений о том, что диспут стал его личным триумфом. Лютер же, ещё до начала диспута сказал, что этот дспут не начался во имя Божье и не закончатся во Его имя, то есть не признал своего поражения.

Теперь Экк имел возможность отправиться в Рим и придать остроту процессу официального осуждения Лютера. Корреспонденция Лютера в этот период показывает, что он достиг кризисной точки в своем отношении к папскому авторитету. Началась «война памфлетов» Лютер писал грубым народным языком, с нарастающей полемической мощью и неистовством. Два католических университета, носители мощных традиций - Кёльн и Лувен - осудили учение Лютера.

В этот период у Лютера появляется новый соратник, ставший позже главным продолжателем его дела - Филипп Меланхтон (1497–1560). Меланхтон – это буквальный греческий перевод его настоящей фамилии Шварцерд, буквально, «черная земля». Меланхтон доводился внучатым племянником известному гуманисту и гебраисту (специалисту по древнееврейскому языку) Иоганну Рейхлину и именно по его настоянию поступил в латинскую школу, а затем в университет.

В августе 1518 в возрасте 21 года Меланхтон приехал в Виттенберг, где с успехом преподавал и классические, и богословские дисциплины, отстаивая евангелическую истину средствами ренессансного гуманизма. Вскоре он приобрел авторитет одного из лидеров Реформации. Его труд «Основные истины теологии» (Loci communes rerum theologicarum, 1521) был первым трактатом по протестантской теологии.