Электронный учебно-методический комплекс по учебной дисциплине «Основы биохимии и токсикологии» для специальности 1-57 01 02 «Экологический менеджмент и аудит в промышленности»
.pdfИндуцированные мутации– вызваны мутагенами. Мутагены – факторы, вызывающие мутации.
Факторы, вызывающие мутации:
1.Физические факторы: излучение (УФ, СВЧ), радиация
2.Химические факторы:
Сильные восстановители: (гидриды металлов и др). Алкилирующие соединения (иприт и др.) Альдегиды (формальдегид)
Нитрозосоединения Некоторые антибиотики Пестициды и т. Д.
3.Биологические факторы (вирусы и бактерии)
Многие ксенобиотики вступают во взаимодействие с нукле-
иновыми кислотами, приводя к химической модификации или нарушению конформации кислот. К числу веществ, вступающих в химическое взаимодействие с нуклеиновыми кислотами, относятся нитриты, сернистый, азотистый, кислородный иприты, этиленоксид, этиленимид, гидразин и его производные, гидроксиламин, нитрозоамины, ареноксиды, полициклические углеводороды, метаболиты афлотоксинов, соединения мышьяка и многие другие вещества. Эти токсиканты образуют ковалентные связи с аминогруппами пуриновых и пиримидиновых оснований, входящих в структуру нуклеиновых кислот. Вещества с бифункциональными активными группами (иприты) могут образовывать с двунитевой молекулой ДНК перекрестные связи, при этом становится невозможным расхождение нитей двойной спирали, необходимое для обеспечения синтеза белков, клеточного деления. Токсиканты способны вступать во взаимодействие не только с пуриновыми и пиримидиновыми основаниями, но и с углеводно-фосфатной основой молекулы нуклеиновой кислоты. При этом происходит ее денатурация (например – формальдегид).
Многие ксенобиотики образуют нековалентные связи с ДНК, при этом меняется конформация макромолекул. Так, производные акридина, этидиумбромида, профлавина и др. которые, встраиваясь в молекулу ДНК между соседними парами оснований, изменяют ее структуру. Антрациклин, хлорахин, актиномицин и
некоторые другие антибиотики также изменяют конформацию нуклеиновых кислот, не образуя с ними ковалентных связей.
Основные типы генных мутаций:
•Замена нуклеотидов;
•Вставка или выпадение нуклеотидов
•Переворот нуклеотидов на 1800
Нарушение структуры ДНК под действием мутагенных факторов
1.Образование поперечных сшивок цепей ДНК (под действием алкилирующих соединений)
Рисунок 1.5.19.Алкилирование гуанина и тимина
2.Нарушение ароматичности и плоскостного строения гетероциклов азотистых оснований
Рисунок 1.5.21.Размыкание цикла гуанина 3.Нарушение комплиментарности цепей ДНК – затруднение
правильной репликации и транскрипции а) сдвиг равновесия в сторону лактимной формы
азотистого основания
Рисунок 1.5.22.Коплиментарность лактимной формы тимина гуанину
б) Дезаминирование азотистых оснований под действием азотистой кислоты и нитритов. Аденин превращается в гипоксатин,
гуанин – в ксантин, цитозин – в урацил
4. Образование оснований Шиффа (взаимодействие аминогруппы азотистых оснований с формальдегидом и другими альдегидами.
5.
Образование димеров пиримидиновых оснований (тимина и цитозина под действием УФ-излучения
РНК
Макромолекула РНК, как правило, представляет собой одну полинуклеотидную цепь, принимающую различные пространственные формы, в том числе и спиралеобразные.
Виды РНК
•транспортная РНК (т-РНК),
•информационная матричная) РНК (и-РНК),
•рибосомная РНК (р-РНК).
РНК. Строение
•Все рибонуклеиновые кислоты представляют собой полимеры рибонуклеотидов, соединенных как в молекуле ДНК фосфорнодиэфирными связями.
•В состав нуклеотидов РНК вместо дезоксирибозы входит сахар рибоза.
•Основание тимин замещено на урацил.
•Главное отличие от ДНК состоит в том, что РНК имеет лишь одну цепь. М-РНК обладают сложной вторичной структурой, тРНК имеют и компактную третичную структуру
•Химически РНК менее стабильна, чем ДНК: в водных растворах РНК быстрее подвергается расщеплению.
•РНК менее подходит для долговременного хранения информации.
•мРНК обладают сложной вторичной структурой, тРНК имеют и компактную третичную структуру.
•Содержатся в цитоплазме клеток
Функции РНК
1.Информационная, или матричная РНК (ее обозначают иРНК или мРНК) считывает и переносит генетическую информацию от ДНК, содержащейся в хромосомах, к рибосомам, где происходит синтез белка со строго определенной последовательностью аминокислот.
2.Транспортная РНК (тРНК) переносит аминокислоты к рибосомам, где они соединяются пептидными связями в определенной последовательности, которую задает мРНК.
3.Рибосамная РНК (рРНК) непосредственно участвует в синтезе белков в рибосомах. Рибосомы — это сложные надмолекулярные структуры, которые состоят из четырех рРНК и нескольких десятков белков.
Рисунок 1.5.22. Схема биосинтеза белка
Качественные реакции нуклеиновых кислот
1.Обнаружение пуриновых оснований в продуктах гидролиза нуклеотидов (серебряная проба)
Схема реакции:
Выпадет светлокоричневый осадок серебряных солей пуриновых оснований.
2.Обнаружение пентоз в нуклеотидах а) Качественная реакция на пентозу (проба Молиша) Схема реакции:
При взаимодействии концентрированной серной кислоты с пентозами происходит их деградация с образованием фурфурола, который дает с тимолом продукт конденсации красного цвета.
б)Качественная реакция на рибозу и дезоксирибозу Схема реакции:
. Дифениламин с дезоксирибозой дает синее окрашивание, а с рибозой – зеленое
3.Обнаружение фосфорной кислоты в продуктах гидролиза нуклеотидов
Схема реакции:
Выпадает кристаллический лимонно-желтый осадок фосформолибденовокислого аммония
Практическая работа № 4. Нуклеиновые кислоты.
Изучение структуры, физико-химических свойств ДНК и РНК является актуальным для понимания характера мутагенного воздействия ксенобиотиков, стабильности генома при воздействии экологически неблагоприятных факторов (токсических веществ, тяжелых металлов, радиации) внешней среды
2.1. Цель работы: изучить строение и классификацию, свойства нуклеиновых кислот
2.2. Порядок выполнения работы:
1. изучить теоретическую часть;
2.ответить на контрольные вопросы
2. выполнить практическую часть;
3. оформить отчет.
2.3 Практическая часть.
1.Написать уравнения образования нуклеозида, обозначить связь пентозы с азотистым основанием, назвать эту связь. Написать уравнения реакций кислотного гидролиза данных нуклеозидов (Таблица 4.П.1., задание1.)
2.Напишите возможные лактим-лактамные, амино-иминная, азольные таутомерные превращения. (Таблица 4.П.1., задание2)
3.Запишите уравнение реакции образования нуклеотидов, щелочного и кислотного их гидролиза. (Таблица 4.П.1., задание3)
4.Соедините сахарофосфатной связью в одну цепочку нуклеотиды, достройте ДНК по принципу комплементарности с указанием количества водородных связей между нуклеотидами разных цепей (Таблица 4.П.1., задание4)
5.Дан фрагмент одной цепи ДНК:
а) определите структуру другой цепочки ДНК, б) процентное содержание каждого вида нуклеотидов в целой
молекуле ДНК, (Таблица 4.П.1., задание5)
г) длину фрагмента, если известно, что длина одного нуклеотида
0,34 нм.,
6. Зная, молекулярную массу ДНК, массу отдельного нуклеотида (дезоксигуанозин- 5!-фосфат) , среднюю массу любого нуклеотида ДНК - 345 , длину одного нуклеотида 0,34 нм. определите:
а) число комплементарных нуклеотидов б)массовую долю дезоксигуанозиновых и комплементарных
нуклеотидов в молекуле ДНК в) длину этой молекулы ДНК. (Таблица 4.П.1., задание 6)
Таблица 4.П.1. – Варианты заданий
В- |
Задание 1 |
Задание |
Задание 3 |
Задание 4 |
Задание 5 |
Зада- |
т |
|
2 |
|
|
|
ние 6 |
1 |
Тимидин |
Урацил |
дезоксиаденозин- 5!- |
гуаниловый, |
ТА- |
79350 |
|
Дезокси- |
аденин |
фосфат |
адениловый, |
АГЦГЦТАГЦАТГЦ |
6900 |
|
аденозин |
|
|
гуаниловый, |
ТА |
|
|
|
|
|
тимидиловый |
|
|
2 |
Цитидин |
Тимин |
дезоксигуанозин- 3!- |
гуаниловый, |
АТТГГЦЦТА- |
67620 |
|
Дезокси- |
Гуанин |
фосфат |
тимидиловый |
ТАГЦТЦАА |
10350 |
|
гуанозин |
|
|
цитозиловый |
|
|
|
|
|
|
адениловый |
|
|
3 |
Аденозин |
Цитозин |
Гуанозин- 2!-фосфат |
гуаниловый, |
ГТТАААГГТТТЦ- |
99360 |
|
Дезокси- |
Аденин |
|
тимидиловый |
ЦААТТ |
10350 |
|
уридин |
|
|
гуаниловый, |
|
|
|
|
|
|
адениловый, |
|
|
4 |
Уридин |
Урацил |
Аденозин- 5!- |
адениловый, |
ТТТЦ- |
44850 |
|
Дезокси- |
гуанин |
фосфат |
гуаниловый, |
ЦААТТГЦАТГТАГ |
5175 |
|
тимидин |
|
|
тимидиловый |
|
|
|
|
|
|
цитозиловый |
|
|
5 |
Гуанозин |
Тимин |
Цитидин-3’-фосфат. |
гуаниловый, |
ГЦАТГЦГЦАТГГГ |
23460 |
|
Дезокси- |
аденин |
|
тимидиловый |
ТТТЦ |
3105 |
|
цитидин |
|
|
цитозиловый |
|
|
|
|
|
|
адениловый, |
|
|
6 |
Уридин |
Цитозин |
Тимидин-5’-фосфат. |
тимидиловый |
ТТТЦ- |
55890 |
|
Дезокси- |
Гуанин |
|
цитозиловый |
ЦААТТГЦАТГЦГА |
8265 |
|
гуанозин |
|
|
тимидиловый |
|
|
|
|
|
|
адениловый, |
|
|
7 |
Гуанозин |
Урацил |
дезоксигуанозин- 5!- |
адениловый, |
ГЦАТГГЦАТГЦГГ |
87630 |
|
дезокси- |
гуанин |
фосфат |
тимидиловый |
ТТТЦ |
8280 |
|
тимидин |
|
|
гуаниловый, |
|
|
|
|
|
|
адениловый |
|
|
8 |
Цитидин |
Цитозин |
дезоксицитидин-3’- |
тимидиловый |
ГЦАТГЦЦТАГЦАТ |
22080 |
|
Дезокси- |
Аденин |
фосфат. |
гуаниловый, |
ГЦТА |
3450 |
|
гуанозин |
|
|
адениловый |
|
|
|
|
|
|
цитозиловый |
|
|
9 |
Аденозин |
Урацил |
Аденозин- 2!- |
гуаниловый, |
АТТГГЦАТГЦА- |
44160 |
|
Дезокси- |
гуанин |
фосфат |
тимидиловый |
ГЦТЦАА |
6900 |
|
уридин |
|
|
адениловый, |
|
|
|
|
|
|
гуаниловый |
|
|
10 |
Уридин |
Тимин |
Цитидин-5’-фосфат. |
тимидиловый |
ГТТАА- |
66930 |
|
Дезокси- |
аденин |
|
цитозиловый |
АГГТТГЦАТГЦТ |
10350 |
|
аденозин |
|
|
гуаниловый, |
|
|
|
|
|
|
адениловый, |
|
|
11 |
Тимидин |
Урацил |
Гуанозин- 5!-фосфат |
адениловый, |
АГЦТАГЦАТГЦТА |
77970 |
|
Дезокси- |
аденин |
|
гуаниловый, |
АГЦТ |
11040 |
|
гуанозин |
|
|
тимидиловый, |
|
|
|
|
|
|
адениловый |
|
|
12 |
Гуанозин |
Тимин |
Дезокситимидин-5’- |
цитозиловый, |
АТГЦТА- |
869400 |
|
Дезокси- |
Гуанин |
фосфат. |
тимидиловый |
АГЦТАГЦТАГЦ |
110400 |
|
уридин |
|
|
гуаниловый, |
|
|
|
|
|
|
адениловый |
|
|
13 |
Цитидин |
Урацил |
Аденозин- 2!- |
тимидиловый |
АТТГГЦЦТА- |
23460, |
|
Дезокси- |
гуанин |
фосфат |
цитозиловый |
ТАГЦТЦАА |
3450 |
|
гуанозин |
|
|
тимидиловый |
|
|
|
|
|
|
адениловый, |
|
|
14 |
Цитидин |
Тимин |
дезоксигуанозин- 3!- |
гуаниловый, |
ГТТАААГГТТТЦ- |
55890 |
|
Дезокси- |
Гуанин |
фосфат |
тимидиловый |
ЦААТТ |
8265 |
|
гуанозин |
|
|
цитозиловый |
|
|
|
|
|
|
адениловый |
|
|
15 |
Аденозин |
Урацил |
Аденозин- 5!- |
цитозиловый, |
ГЦАТГГЦАТГЦГГ |
44160 |
|
Дезокси- |
гуанин |
фосфат |
тимидиловый |
ТТТЦ |
6900 |
|
уридин |
|
|
гуаниловый, |
|
|
|
|
|
|
адениловый |
|
|
16 |
Тимидин |
Тимин |
Цитидин-5’-фосфат. |
гуаниловый, |
ГЦАТГЦЦТАГЦАТ |
69000 |
|
Дезокси- |
аденин |
|
тимидиловый |
ГЦТА |
15525 |
|
аденозин |
|
|
цитозиловый |
|
|
|
|
|
|
адениловый |
|
|
|
Аденозин |
Урацил |
Цитидин-5’-фосфат. |
цитозиловый |
АТТГГЦАТГЦА- |
77970 |
|
Дезокси- |
гуанин |
|
тимидиловый |
ГЦТЦАА |
11040 |
|
уридин |
|
|
адениловый, |
|
|
|
|
|
|
гуаниловый |
|
|
|
Уридин |
Тимин |
Гуанозин- 5!-фосфат |
тимидиловый |
ТТТЦ- |
23460, |
|
Дезокси- |
Гуанин |
|
гуаниловый, |
ЦААТТГЦАТГТАГ |
3450 |
|
тимидин |
|
|
тимидиловый |
|
|
|
|
|
|
цитозиловый |
|
|
2.4.Контрольные вопросы
1.Состав и строение нуклеиновых кислот
2.Структура ДНК и РНК
3.Функции нуклеиновых кислот
4.Реакции с участием ДНК
5.Спонтанные и индуцированные мутации
6.Качественные реакции на структурные компоненты нуклеиновых кислот
1.6. Витамины
Определение, общая классификация витаминов. Определение понятий «авитаминоз», «гиповитаминоз», «гипервитаминоз»,
