Программы для химического моделирования

КОМПЬЮТЕРНАЯ ХИМИЯ

Компьютерная химия (математическая химия) — сравнительно молодая область химии, основанная на применении компьютерных методов и дискретной математики, прежде всего, теории графов и комбинаторики, к химическим задачам фундаментального и прикладного характера.

КВАНТОВАЯ ХИМИЯ

Квантовая химия — это направление химии, рассматривающее строение и свойства химических соединений, реакционную способность, кинетику и механизм химических реакций на основе квантовой механики

ХЕМОИНФОРМАТИКА

Хемоинформатика — это часть теоретической химии, базирующаяся на своей собственной молекулярной модели; в отличие от квантовой химии, в которой молекулы представлены как ансамбли электронов и ядер, и основанного на силовых полях молекулярного моделирования, имеющего дело с классическими «атомами» и «связями», хемоинформатика рассматривает молекулы как объекты в химическом пространстве.

ХИМИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА КАК АБСТРАКЦИЯ

Ванилин

глюкоза

СОВРЕМЕННЫЕ РЕДАКТОРЫ ХИМИЧЕСКИХ СТРУКТУР (МОЛЕКУЛЯРНЫЕ РЕДАКТОРЫ)

Ascalaph

Avogadro Open Source, GPL, кросс-платформенный редактор (на базе Qt4)

ACD/ChemSketch (ACD/Labs), freeware.

HyperChem.

ChemDraw

ISIS/Draw, freeware.

Symyx Draw

BKchem: Open Source, GPL, Python.

Smormoed: Open Source, модифицированная лицензия BSD, Си. Linux, FreeBSD, Mac OS X

JChemPaint (JCP): Open Source, LGPL Java. На базе Chemistry Development Kit (CDK).

XDrawChem и WinDrawChem: Open Source, GPL, C++. На базе OpenBabel. Windows, Linux, Mac OS X

Chemistry 4-D Draw

ChemAxon’s MarvinSketch/View: химический редактор и вьюер — десктопная версия (Java Beans).

ChemAxon’s MarvinSpace (недоступная ссылка с 13-05-2013 [1334 дня] — история): макромолекулярный 3D визуализатор и редактор — десктопная версия (Java Beans).

molsKetch: Open Source, GPL, мултиплатформенный редактор (на базе Qt4)