УСР.3

УСР 3

Вычислительная биодиверсикология. Информационные индексы биологического разнообразия

Выполнила: Ничипорук Анна, 23БХ-1

• Ввела значения в таблицу

1. Индекс Чекановского-Серенсена для лягушек в восточной и южной частях России составляет 0,859. Это указывает на относительно высоку степень сходства между этими двумя сообществами лягушек. Так как значение индекса выше 0,5 означает, что биоразнообразие лягушек выше в восточной части России, чем в южной части России.

2) Для этих данных построила кривые разрежения (в программа BioDivercityPro) и кривую доминирования (в Microsoft Excel).

По графику видно, что выборка the northen лежит выше других, а значит еѐ видовое богатство, а значит и биоразнообразие, больше.

• Провела ранжировку

по графику видно, что доминирующим видом в южном является Ostromordaya, в северном – Hokkaido, в западном -

Hokkaido, в восточном- Hokkaido=>один и тот же вид в 3 частях России.

3)

Индекс Шеннона

Данный индекс показывает относительную величину биоразнообразия внутри какого-либо сообщества или местности. При его использовании вместо натурального логарифма может использоваться либо десятичный (lg), либо двоичный (log2). Если формула содержит значение натурального логарифма, то обычно индекс Шеннона обычно варьирует в пределах от 1,5 до 3,5, очень редко превышая 4,5. При использовании в качестве логарифма десятичный логарифм, то показатель обычно меньше. Чем меньше данный индекс, тем больше видового разнообразия. Чем меньше показатель выравненности Шеннона, тем меньше разнообразие в сообществе.

Вывод: Наибольшая выборка в the eastern меньшее разнообразие western.

Индекс Бергера Паркера

Увеличение величины индекса Бергера Паркера означает уменьшение разнообразия и увеличение степени доминирования определѐнного(-ых) вида(-ов). Поэтому обычно используют величину 1/d – чем она выше, тем больше разнообразие.

Вывод: d = 0,5 для eastern/western/ southen и 0,394 для northern. Индекс показывает, что northern обладает меньшим индексом, что говорит о том, что биоразнообразие там больше.

Индекс Маргалефа

Чем выше показатель Маргалефа, тем больше разнообразие.

Вывод: Показатель индекса Маргалефа выше у western, что говорит о том, что видовое разнообразие там больше.

Индекс Симпсона

По мере увеличения D разнообразие уменьшается. Чем больше D, тем меньше видовое разнообразие. Индекс Симпсона часто используют как величину 1 – D, которая называется вероятность межвидовых встреч, и варьирует от 0 до 1. Иногда используют величину 1/D – чем больше еѐ значение, тем больше разнообразие.

Вывод: видовое разнообразие больше у northen, так как индекс D у неѐ меньше (и наоборот, индекс 1/D у неѐ больше). Данный показатель также говорит о большем количестве доминирующих видов в northen.

Индекс Макинтоша

Чем больше индекс выравненности Макинтоша (Е), тем больше выравненность и биоразнообразие внутри сообщества. Чем больше индекс разнообразия Макинтоша (D), тем больше биоразнообразие внутри сообщества.

Вывод: индекс разнообразия (D) Макинтоша больше у western, чем у других. Это говорит о том, что биоразнообразие western больше.

4) Провела кластерный анализ этих данных.

Для этого выполняем команды Multivariate → Cluster Analysis и программа выводит на экран монитора дендрограмму.

Для того чтобы увидеть матрицу расстояний, по которому программа строила дендрограмму, свернѐм график и в окне Distance Matrix содержится вся необходимая информация

Результаты кластеризации показывают, что наиболее близкими между собой по параметру биоразнообразия являются northen и eastern, так как они объединены в один кластер на параметре похожести > 50. И наоборот, самым отдалѐнным является the southern. Чем меньше расстояние между выборками, тем более близкими по биоразнообразию они являются.

A= 2596 A+b+c=3446 b=253 c=601 a+b=2849 a+c=3197 I=5192/6046=0,859