13 Июля 2016 года Джонсон был назначен министром иностранных дел Великобритании.

В июне 2017 года он сохранил свой пост в новом правительстве премьер-министра Терезы Мэй. 9 июля 2018 года Борис Джонсон ушел в отставку с поста главы МИД Великобритании. Его увольнение было связано с разногласиями в правительстве относительно подхода к Brexit.

В 2018 году вернулся в журналистику, начал вести рубрику в газете Daily Telegraph.

В конце мая 2019 года Тереза Мэй объявила, что покинет пост лидера Консервативной партии 7 июня и останется на посту премьера до избрания нового лидера. Джонсон выдвинул свою кандидатуру на эти должности. В конце июня по итогам голосования фракции тори в парламенте, он вышел в финал гонки за пост премьера Британии.

Борис Джонсон является автором сборника эссе Lend Me Your Ears (2003), романа Seventy-two Virgins (2004), исторического обзора о Римской империи Dream of Rome (2006), книги The Churchill Factor: How One Man Made History (2014).