Вариант 9

1. Полиморфизм белков. Протеомика.

Протеомика – методы и подходы для характеристики всех белков, их содержания и взаимодействия в живых организмах. Цель протеомики – определение и характеристика полного набора белков данного организма.

Полиморфизм белков — это существование одного и того же белка в нескольких молекулярных формах, отличающихся по первичной структуре, физико-химическим свойствам и проявлениям биологической активности. Причинами полиморфизма белков являются рекомбинации и мутации генов. Пример: лактатдегидрогеназа (ЛДГ₁, ЛДГ₂, ЛДГ₃ и т.д.)

2. Типы мутации: вставки или делеции нуклеотидов.

Мутация сдвига рамки считывания — тип мутации в последовательности ДНК, для которого характерна вставка или делеция нуклеотидов в количестве, не кратном трём. В результате происходит сдвиг рамки считывания при транскрипции мРНК. Мутации сдвига рамки считывания делятся на мишенные, немишенные, мишенные задерживающиеся и немишенные задерживающиеся. Следует различать мутацию сдвига рамки считывания, в которой происходит вставка или делеция нуклеотида, от однонуклеотидного полиморфизма, в котором происходит замена одного нуклеотида на другой.

3. Рамка считывания.

Р амка считывания — нуклеотидная последовательность гена, которая задается положением первого нуклеотида в первом инициирующем кодоне и заканчивается последним нуклеотидом терминирующего кодона. Число возможных рамок считывания с каждой цепи ДНК три, так как генетический код триплетен.

Вариант 10

1. Метод изучения полиморфизма белков.

Полиморфизм белков — это существование одного и того же белка в нескольких молекулярных формах, отличающихся по первичной структуре, физико-химическим свойствам и проявлениям биологической активности. Причинами полиморфизма белков являются рекомбинации и мутации генов. Пример: лактатдегидрогеназа (ЛДГ1, ЛДГ2, ЛДГ3 и т.д.)

Протеомика – методы и подходы для характеристики всех белков, их содержания и взаимодействия в живых организмах. Цель протеомики – определение и характеристика полного набора белков данного организма.

Основными методами изучения полиморфизма белков являются электрофорез в крахмальном геле и иммуноэлектрофорез. Аллели гемоглобинового локуса обозначаются так: HbA, HbB и т. д., а генотип – HbAHbA, HbBHbB и т. д., фенотип – HbB, HbA. Замещение аминокислот в белке может вызвать функциональные различия полиморфных форм.

2. Биохимический полиморфизм в практике.

3. Классификация плазмид.

Плазмиды – кольцевые двунитевые ДНК,способные к автономной репликации.

По способности инициировать процесс конъюгации плазмиды бывают:

• Конъюгативные (трансмиссивные)  Имеют более крупные размеры; содержат область tra-генов (tra - от TRAnsfer genes), то есть генов, белковые продукты которых обеспечивают конъюгацию. Продукты tra-генов вызывают формирование пили, образуют комплекс ферментов, изменяющих ДНК нужным образом во время переноса, а также противодействуют прикреплению пилей других бактерий к клеточной стенке данной.

• Неконъюгативные (нетрансмиссивные)  Не содержат области tra-генов, а потому не способны к самостоятельной передаче генетического материала в другие бактериальные клетки.

• Мобилизуемые  Некоторые исследователи выделяют также класс мобилизуемых плазмид, которые содержат только часть tra-генов. Они также способны передавать свой ДНК-материал в ходе конъюгации, используя белковые продукты трансмиссивных плазмид, находящихся в той же клетке.

По обычному числу копий плазмиды данного типа в клетках:

• Высококопийные

• Низкокопийные

По группам несовместимости

Совместимость — это способность двух или нескольких плазмид стабильно сосуществовать в одной клетке. Родственные плазмиды ( с одним типом контроля репликации) обычно не совместимы друг с другом, и вместе образуют одну группу несовместимости

По функции:

• Половые F-плазмиды (от англ. Fertility — способность к размножению). Содержат tra-гены, способны инициировать половой процесс у бактерий — конъюгацию.

• Плазмиды лекарственной устойчивости — R-плазмиды (от англ. Resistance — устойчивость). Кодируют белковые продукты, обеспечивающие устойчивость бактерий к антибиотикам и др.

• Col-плазмиды — содержат гены колицинов (бактериоцинов — белков, подавляющих жизнедеятельность близкородственных бактерий других разновидностей). Средство борьбы за существование. 

• Плазмиды биодеградации — плазмиды, продукты которых позволяют утилизировать необычный пищевой или энергетический субстрат (например, салициловую кислоту).

• Плазмиды патогенности кодируют факторы патогенности бактерий. Например, Ent-плазмида – синтез энтеротоксина; Hly-плазмида – синтез гемолизина