
Слесарев. Основы Химии живого
.pdfНАДФ(Н), где указанный фрагмент, приняв два электрона и про тон, превратился в 1,4-дигидропиридиновую группировку:
Н |
^CONH2 |
|
Н |
Н |
,CONH2 |
|
|
|
Н. V |
|
|||
■ |
I |
+ 2 р - + 2Н + |
П |
Н |
НАЛ" |
К - -0,320 В |
|
|
|
A |
VTA |
НАДФ+ |
Фо = -0,324 В |
Н N |
н |
|
Н |
N |
|
|
R |
|
|
|
R |
|
|
окисленная форма |
|
восстановленная форма |
|
|||
|НАД^или НАДФ+____________________________НАД(Н) или НАДФ(Н) f |
|
сопряженная окислительно-восстановительная пара
Все окислительно-восстановительные превращения биосубстра тов под действием никотинамиднуклеотидов являются реакция ми межмолекулярной дисмутации за счет углеродных атомов участников реакции. При переходе окисленной формы кофер ментов в восстановленную происходит накопление энергии, вы деляемой при окислении субстрата. Накопленная восстановлен ной формой энергия затем расходуется в других эндэргонических процессах с участием этих коферментов (разд. 9.3.3).
Пи ри д о кс а л ь фо с фа т и витамин Be- В пиридоксальфосфате за счет электронодефицитности пиридинового кольца у углеродного атома альдегидной группы повышается склонность к окислительно-восстановительным превращениям. Поэтому это со единение является коферментом окислительно-восстановительных реакций трансаминирования а-кетокислот а-аминокислотами и в реакциях декарбоксилирования ряда аминокислот (разд. 21.2.5).
ну ° »
h o ^ J l ^ c h 2o — р — о н
Н3с |
Д+J |
О" |
|
N |
|
|
|
|
пиридоксальфосфат |
|
|
с н 2о н |
c h 2n h 2 |
|
с" |
Н0\ Д ^ СН2°Н |
Н О ^Д .С Н гО Н |
Н 0 ^ 1 / С Н 20Н |
|
НзсХХ |
H s C ^ V |
|
НзсХХ |
^пиридоксол |
пиридоксамин |
|
пиридоксаль ^ |
витамин Be (пиридоксин)
Сочетание трех индивидуальных веществ: пиридоксола, пиридоксамина и пиридоксаля - рассматривают как витамин В$
(пиридоксин), так как в организме они все способны перейти в пиридоксальфосфат, участвующий в химических реакциях, свя занных с деятельностью данного витамина. Отсутствие в пище витамина Be сопровождается резким нарушением обмена белков
621
и липидов, что ведет к развитию атеросклероза, различных дер матитов и нарушению кроветворения.
П и р и м и д и н и его п р о и з в о д н ы е . Пиримидин со держит два атома азота в положениях 1 и 3 шестичленного цикла, имеющего ароматическую шестиэлектронную я-систему. В связи с тем, что оба атома азота находятся в sp2-II состоянии и их неподеленные электронные пары не участвуют в образовании ароматической системы, пиримидин проявляет свойства слабого основания (рЛГа(ВН+) * 1,3):
IN**4]!5 |
|
^ нй |
1 N * |
Ч г |
* р х .(в н +) = 1,з |
И |
И |
м |
Основность пиримидина резко понижена по сравнению с пири дином (pJFCa(BH+) —5,2) из-за электроноакцепторных свойств второго атома азота, находящегося в ядре. Протонизация одного атома азота настолько понижает основность другого атома азота, что дальней шее солеобразование в естественных условиях не происходит.
Большое значение в химии нуклеиновых кислот имеют сле дующие оксо- и аминопроизводные пиримидина: урацил, тимин
и цитозин:
г |
? |
- |
Т * |
Н№А т-'15 |
- у |
- V |
|
° н н |
сг'й^н |
° 8 н |
|
урацил |
тимин |
цитозин |
Для этих соединений теоретически возможна прототропная лактим-лактамная таутомерия. Соответствующие таутомеры различаются не только положением протона (у атома кислорода или у атома азота), но и электронным состоянием атома азота (sjd2-II или sp2-I):
*6
Is © и
— с —N—
|
амбидентный |
^ |
он |
анион |
|
. |
о |
|
I |
1л^ |
|
— C = N — |
г*:::::::::::*. — C-^-N— |
|
лактимный |
|
Н |
|
лактамный |
|
таутомер |
|
таутомер |
У таутомеров имеется общий амбидентный анион, отрицатель ный заряд которого делокализован между атомами, участвую щими в таутомерии. Последнее обстоятельство объясняет двойст венную реакционную способность рассмотренных соединений, т. е.
622
способность образовывать и О- и N-производные. Исследования кислотно-основных свойств и спектральных характеристик ука занных оксопиримидинов и родственных им соединений свиде тельствуют, что и в кристаллах, и в растворах для них характер на только лактамная форма, а их ионы амбидентны.
Урацил и тимин в естественных условиях являются слабы ми двухосновными кислотами, причем их моноанионы сущест вуют в виде двух таутомеров, различающихся положением ос тавшегося протона у атомов азота N-1 или N-З и распределени ем делокализованного отрицательного заряда:
R
Н
смесь таутомеров моноаниона дианион
|
pJfi |
Р*? |
урацил (R - |
H) 9,4 |
18,9 |
тимин (R - |
СНз) |
1^,9 |
Таким образом, в биологических средах с рН<7,5 урацил и тимин существуют в молекулярной форме.
Цитозин - амфолит: он протонируется по атому N-1, имеюще му свободную от участия в сопряжении электронную пару, а за счет депротонирования атома N-З проявляет слабые кислотные свойства:
(«NH2
pjre(BH+) - |
4,6 |
|
катион |
молекула |
анион |
цитозина |
цитозина |
цитозина |
В биологических средах с pH —3 -г 6 цитозин существует в виде смеси катионов и молекул, а при pH » 7 - в молекулярной форме.
Среди природных оксипиримидинов важную роль играют
оротовая и барбитуровая кислоты. Оротовая кислота (урацил- 6-карбоновая кислота) является метаболитом, участвующим в превращении аспарагиновой кислоты в пиримидиновые произ водные. В условиях организма это довольно сильная двухоснов ная кислота:
О
Н
Р*?-9,5
О я |
иООН |
О' ГЧ СОО |
оротовая кислота
623
Оротат калия - стимулятор обменных процессов в организме. Для барбитуровой кислоты характерна кето-енольная тауто
мерия с преобладанием кетотаутомера (« 98 %). Барбитуровая кислота - достаточно сильная СН-кислота. Лактимная форма для этой кислоты не обнаружена.
т У н....* |
н 1 |
|
№ |
- |
|
) S он |
Л " |
|
н |
|
|
рК1а • 4,05 , |
Т 12 |
|
Н+ |
2 % |
98 % |
барбитуровая кислота
В медицине в качестве снотворных и противосудорожных средств применяют 5,5-дизамещенные барбитуровые кислоты: бар-
битал и фенобарбиталу называемые барбитуратами. Они суще ствуют только в лактамной форме и являются слабыми NH-ки слотами:
барбитал (веронал) |
=R 2 - С2 Н5 |
фенобарбитал (люминал) |
= С2Н8; Н2 - |
Пу р и н и его |
п р о и з в о д н ы е . Пурин - ароматическое |
бициклическое гетероциклическое соединение, содержащее ядро пиримидина и имидазола. Его ароматическая я-
*N
aN
№система включает 8 я-электронов двойных связей и
Анеподеленную электронную пару одного из атомов
№азота имидазольного фрагмента. Пурин, подобно
Нимидазолу, является прототропной таутомерной
пурин |
системой за счет миграции протона между атомами |
|||
азота N-7 и N-9. Пурин - |
амфолит, так как проявляет и основ |
|||
ные (рЛГа(ВН+) —2,4), и кислотные свойства (рКа= 9,9): |
||||
NH |
N x 1----- NH |
|
|
|
Н |
н+ w |
|
N N |
|
|
|
H |
|
|
катион пурина |
таутомер N7H |
таутомер NgH |
анион пурина |
|
рЛГв(ВН+) — 2,4 |
молекула пурина |
рК а = 9,9 |
624
Оксо- и аминопроизводные пурина - аденин и гуанин вхо дят в состав нуклеиновых кислот. В молекуле аденина у трех атомов азота N-l, N-3 и N-7 неподеленные электронные пары не участвуют в сопряжении, находясь на вр2-орбиталях, у двух других атомов азота неподеленные электронные пары, находясь на р-орбиталях, активно участвуют в сопряжении. Для аденина, как и для пурина, наблюдается прототропная таутомерия за счет миграции протона между N-7 и N-9. Обычно аденин изобража ют с протоном у атома N-9, хотя в его водных растворах содер жание таутомера N7H в 2,5 раза выше. Аденин является амфолитом, способным, в зависимости от кислотности среды, или присоединять протон к пиримидиновому атому азота, образуя катион, или отщеплять протон от имидазольного атома азота с образованием аниона:
№ |
|
|
NH2 |
NH2 |
•JL |
-а! |
|
Ф |
N N |
w |
pjr.(BH+) - |
4,2 |
|
|
|
|
молекула аденина |
анион аденина |
|
катион аденина |
|
|
|
|
В биологических средах с pH » 7 аденин находится в основном
ввиде молекул, а в кислых средах (pH —3 + 6) - в виде смеси молекул и катионов. Аденин входит в состав некоторых ко ферментов, аденозинтрифосфорной кислоты (АТФ) и ее произ водных АДФ и АМФ.
Для гуанина характерна лактамная форма, поэтому неподелен ная электронная пара атома N-1 находится на р-орбитали и активно участвует в сопряжении. В соответствии с кислотно-основными свойствами гуанин, в зависимости от рН-среды, в водных растворах может находиться в форме катиона, молекулы, моноили дианиона:
HNV " |
|
н+ |
|
HN |
pic - 9,2 |
||
р * а(ВН+) - 3,2 |
1 Н+ |
||||||
H2N N |
N |
|
|
|
H2N |
л |
|
|
Н |
|
|
|
|
|
|
катион гуанина |
О |
|
|
молекула гуанина |
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
^ |
|
___ |
рК 1'- 12,4 |
|
|
|
|
N |
|
71-----N |
|
|
||
|
JkJC i |
' |
iF |
Л |
N |
||
|
H2N |
N |
N |
|
|
H2N |
|
|
|
|
Н |
|
|
|
|
|
анион гуанина |
|
|
дианион гуанина |
В биологических средах с pH = 3 -г 6 гуанин находится в виде сме си молекул и катионов, а при pH = 7 -г 9 - молекул и моноанионов.
Таким образом, из всех азотистых оснований нуклеиновых кислот наиболее сильные основные свойства проявляет аденин.
40-4723 |
625 |
В условиях организма цитозин и гуанин - слабые основания, а урацил и тимин - слабые кислоты. Для всех этих гетероцикли ческих соединений характерно образование водородных связей, при котором они выступают одновременно и как доноры, и как акцепторы протонов. Эта их способность реализуется при по строении нуклеиновых кислот (разд. 23.4).
Среди оксопроизводных пурина следует выделить кофеин и мочевую кислоту. Кофеин содержится в кофейных зернах, бо бах какао и чайных листьях. Это сильнодействующий возбуди тель центральной нервной системы и стимулятор работы серд ца. Кофеин является основанием и образует соли с кислотами.
О |
О |
кофеин |
мочевая кислота |
Мочевая кислота - продукт обмена веществ в живых организ- 'мах. В значительных количествах встречается в экскрементах птиц (« 25 %) и особенно змей (« 90 %). Мочевая кислота явля ется двухосновной NH-кислотой ( р 5,4, а р * 11,3) и об разует два ряда солей-уратов, большинство из которых, как и сама мочевая кислота, плохо растворяются в воде.
2 3 .4 . НУКЛЕОЗИДЫ , НУКЛЕОТИДЫ И НУКЛЕИНОВЫЕ КИСЛОТЫ , ИХ СТРУКТУРА И СВОЙ СТВА
Нуклеозиды и нуклеотиды являются продуктами гидролиза нуклеиновых кислот, но они присутствуют в живых организмах также в несвязанном состоянии, выполняя исключительно важную роль в обмене веществ.
Нуклеозиды - это природные гликозиды гетероциклических азотистых оснований (пиримидиновых и пуриновых), которые связаны с пентозами через атом азота. В зависимости от природы углеводного остатка (пентозы) различают рибонуклеозиды и дезоксирибонуклеозиды.
5' |
Пентоза: |
рибоза, дезоксирибоза |
|
Азотистое |
аденин, гуанин, цитозин, |
|
основание: |
тимин, урацил |
нуклеозид
Названия нуклеозидов производятся от тривиального назва ния соответствующего гетероциклического азотистого основания с суффиксами -идин у пиримидиновых и -озин у пуриновых нуклеозидов. Исключение их этого правила сделано для нук леозидов тимина.
626
Компоненты нуклеознда |
Нуклеозид |
Индекс нуклеознда |
Аденин + рибоза |
Аденозин |
А |
Аденин + дезоксирибоза |
Дезоксиаденозин |
dA |
Гуанин + рибоза |
Гуанозин |
Г |
Гуанин + дезоксирибоза |
Дезоксигуанозин |
dr |
Цитозин + рибоза |
Цитидин |
С |
Цитозин + дезоксирибоза |
Дезоксицитидин |
dC |
Урацил + рибоза |
Уридин |
U |
Урацил + дезоксирибоза |
Дезоксиуридин |
dU |
Тимин + рибоза |
Риботимидин |
Т |
Тимин + дезоксирибоза |
Тимидин |
dT |
Нуклеозиды сокращенно чаще обозначают однобуквенным ин дексом» но существует также система трехбуквенного индекса.
Нуклеозиды, являясь N-гликозидами, устойчивы к гидролизу в слабощелочной среде, но расщепляются в кислой среде. Пурино вые нуклеозиды гидролизуются легко, пиримидиновые - труднее.
Нуклеотида! являются слож |
|
|
|
ными эфирами нуклеозидов и |
но»—р—.оси- |
|
|
фосфорной кислоты, которая обыч- |
9 |
||
но этерифицирует гидроксогруп- |
он |
|
|
пы при С-5' пентозы. В связи с |
|
||
наличием в молекуле остатка |
остаток |
остаток |
|
фосфорной кислоты нуклеотиды |
|||
фосфата |
нуклеознда |
||
проявляют свойства двухоснов- |
1 |
|
|
ной кислоты с рК\ * 0,9 ^ 1,5 и |
нуклеотид |
||
рК$ - б -г- 6,5. |
|
|
Нуклеотиды называют или как соответствующие кислоты (монозамещенные производные фосфорной кислоты), или как соли (монофосфаты) с указанием в обоих случаях положения фосфат ного остатка:
|
Названия нуклеотидов |
как кислот |
как солей |
5'-Адениловая кислота 5'-Гуаниловая кислота 5'-Цитидиловая кислота 5'-Уридиловая кислота 5'-Тимидиловая кислота
Аденозин-5'-фосфат Гуанозин-5'-фосфат Цитидин-5'-фосфат Уридин-5'-фосфат Тимидин-5'-фосфат
Поскольку с учетом значений рК1а и р н у к л е о т и д ы в фи зиологических условиях находятся в ионизованном состоянии, последний способ предпочтительнее.
Большое значение в живых системах играют нуклеотиды, содержащие в своем составе ди- и трифосфатные группировки. Важнейшими среди этих про'изводных являются аденозиндифосфат (АДФ) и аденозинтрифосфат (АТФ), которые способ ны к взаимопревращениям путем наращивания или отщепле ния фосфатных групп:
40* |
627 |
NH2
„ |
О |
О О |
II |
5 |
|
|
II |
II |
|
|
|||
о —р— О— Р— О— |
|
о — СН2 |
|
|
||
|
0 “ |
0 “ |
0 “ |
V * |
|
|
|
|
|
|
он |
|
он |
|
|
аденозинтрифосфат (АТФ4 |
) |
|||
|
|
|
|
|
|
NH2 |
|
_ |
о |
о |
5' |
|
поeN N |
|
II |
II |
|
|||
|
|
о—р—о—р—о—CH2 |
0 |
|||
- |
^ |
о- |
о- |
v |
" |
+ н 2Р07 |
аденозиндифосфат (АДФ3 )
В этих соединениях фосфатные группы в физиологических условиях почти полностью ионизованы, поэтому их часто запи сывают в виде анионов АТФ4-, АДФ8~. Главная особенность этих нуклеотидов состоит в том, что их полифосфатные группы содер-
жат одну или две ангидридные группы — Р— О—Р— . При гид ролизе такой группы разрывается связь, называемая макроэргической, и выделяется около 33 кДж/моль (разд. 4.5). Именно с этим связана роль АТФ в клетке как поставщика химической энергии для биохимических и физиологических процессов.
При участии АТФ в организме также осуществляется реак ция фосфорилирования гидроксилсодержащих соединений с об разованием сложных эфиров фосфорной кислоты:
R—ОН + АТФ —► R—О—PvЬок+ АДФ ОН
При фосфорилировании карбоксилсодержащих соединений об разуются ацилфосфаты, которые содержат ангидридную группи
ровку — С— О—РСГ •
и
оо
R—С' |
в ?/он |
+ АТФ —► R—с —О—Pv + АДФ |
|
ОН |
ОН |
Фосфорилированные производные выступают активными метаболитами во многих биохимических процессах.
628
Нуклеотидами являются многие кофермеыты, например НАД- и ФАД-производные аденозинфосфата, а коэнзим А - производ ное аденозиндифосфата. Важнейшая биологическая роль нуклео тидов заключается в том, что из них построены нуклеиновые кислоты (полинуклеотиды).
Нуклеиновые кислоты в живых организмах играют глав ную роль в передаче наследственных признаков (генетической информации) и управлении процессом биосинтеза белка. Нук леиновые кислоты - высокомолекулярные соединения с моле кулярной массой от 20 тысяч до десятка миллиардов. Их поли мерные цепи построены из мономерных звеньев-нуклеотидов. Особенность нуклеотидного звена заключается в том, что оно представляет собой трехкомпонентное образование, состоящее из гетероциклического азотсодержащего основания, углеводно го компонента - пентозы - и фосфатной группы. Каркас поли мерной цепи состоит из чередующихся пентозных и фосфатных остатков, связанных сложноэфирными связями (у С-3' и С-5'), а гетероциклические основания являются «боковыми» группами, присоединенными к пентозным остаткам за счет N-гликозидной связи:
[— О — 1 Н о |
N^>CHOBairae> |
|
ДНК |
РНК |
|
Пентоза |
дезоксирибоза |
рибоза |
|||
, 0 ^ |
| |
||||
|
|
Пуриновые |
адеиин, гуанин |
аденин, гуанин |
|
|
|
Пиримидиновые |
цитозин, тимин |
цитозин, урацил |
|
|
|
основания |
|
|
П е р в и ч н а я с т р у к т у р а н у к л е и н о в ы х к и с л о т определяется природой и последовательностью нуклеотидных звеньев, связанных сложноэфирными связями между пентозами и фосфатными группами (рис. 23.2).
В т о р и ч н а я с т р у к т у р а н у к л е и н о в ы х к и с л о т . Согласно вторичной структуре полинуклеотидная цепь представ ляет собой двойную спираль, в которой пуриновые и пиримиди новые основания направлены внутрь. Между пуриновым основа нием одной цепи и пиримидиновым основанием другой цепи имеются водородные связи, стабилизирующие такую структуру. Основания, образующие пары, связанные водородными связями, называются комплементарными. В ДНК комплементарными бу дут: аденин - тимин, образующие между собой две водородные связи, и гуанин - цитозину связанные тремя водородными свя зями (рис. 23.3). Это означает, что пуриновым основаниям аденину и гуанину в одной цепи будут соответствовать пиримиди новые основания тимин и цитозин в другой цепи. Полинуклеотидные цепи, образующие двойную спираль, не идентичны, но комплементарны между собой.
629
РНК |
|
ДНК |
N H 2 |
Основания |
N H 2 |
|
|
[—о—сн2
СНз
|
0 |
ОН |
HN |
Урацил \ Тимин |
|
0 |
1 |
|
^ |
||
= р — О— СН2 |
0 О' N |
Пентозы |
|||
|
ОН |
|
|
D-рибоза \ |
2-дезокси- |
|
|
|
|
\ |
D-рибоза |
Рис. 23.2. Первичная структура участка цепи нуклеиновых кислот