книги из ГПНТБ / Кретович В.Л. Введение в энзимологию
.pdfу пятого углеродного атома рибозы, то образуется адепозин-5 '- моиофосфат, формула которого такова:
Аденозинмоиофосфат может присоединять еще одну молекулу фосфорной кислоты, но не к гидроксилу рибозы, а к самому ос татку фосфорной кислоты. При этом мы получим производное нуклеотида, а именно адеиозиндифосфат (сокращенно АДФ). Если же присоединить еще третий остаток фосфорной кислоты, то получится аденозинтрифосфат, или, как его сокращенно называют, АТФ. Формула АТФ следующая:
Аденозинтрифосфат
Это соединение содержит так называемые макроэргическиѳ связи, т. е. связи, обладающие большим запасом энергии. Аденозиимонофосфат не содержит макроэргических связей, у пятого атома углерода рибозы связь простая, она содержит запас энергии, равный примерно 2—3 тыс. малых калорий. Вторая связь в моле куле АТФ, с помощью которой присоединен второй остаток фосфор ной кислоты, является макроэргической. Ее запас энергии равен 8 тыс. калорий, т. е. в 3—4 раза больше, чем запас энергии в про стой сложиоэфирной связи. Макроэргическая связь обозначается знаком —. Третья связь в молекуле аденозинтрифосфата также
79
является макроэргической. Обычно остаток ортофосфорной кисло ты — Н2 Р 0 3 обозначают буквой Р в кружке. Расположение макроэргических связей в молекуле АТФ будет таково:
NH,
«I мII я
I I |
/ |
|
N |
Итак, аденозиндифосфат и аденозинтрифосфат — это так на зываемые макроэргические соединения. Они играют исключитель ную роль в обмене веществ. Эти соединения являются топливом живой клетки — источником энергии, запасенной в макроэргических связях и потребляемой в процессе жизнедеятельности на различ ные нужды клетки.
Аденозинтрифосфат под действием особого фермента — аденилатциклазы образует циклический адепозинмонофосфат, который играет важнейшую роль в регуляции ферментативных процессов и в синтезе белков в организме. Это превращение происходит сле дующим образом:
NH, |
|
|
|
NH, |
|
.N |
|
|
|
|
ГН |
|
I |
II СН |
|
iN аденилаш |
„ ѵ ѵ j_ |
|
|
|
-------------^ Пирофосфат -г |
|
^ |
|
® ~® ~® -сн 2 а |
циклаза |
» * |
|
|
|
|
|
н |
|
|
|
О |
|
|
|
|
н |
|
н |
он
ох
АТФ
Циклический АМФ
Следующий нуклеотид — гуанозин-5'-монофосфат или гуаниловая кислота (обозначается ГМФ) не содержит макроэргической связи.
В результате присоединения к гуанозинмонофосфату еще одного остатка ортофосфориой кислоты образуется гуаиозинди-
80
фосфат (ГДФ), а если к этому последнему присоединяется еще один остаток ортофосфата, то получается гуанозиытрифосфат (ГТФ). Гуаыозиидифюсфат содержит одну макроэргическую связь, а гуанозинтрифосфат — две.
Цитидин, соединяясь с фосфорной кислотой, дает нуклеотид цитидип-5'-монофосфат (ЦМФ), или цитидиловую кислоту. Его
макроэргические производные — это цитидипдифосфат |
(ЦДФ) и |
|||||||||
цитидиптрифосфат (ЦТФ). |
|
|
|
|
|
|
||||
Далее следуют уридии-5'-моііофосфат (УМФ), или уридиловая |
||||||||||
кислота; |
его |
макроэргическими производными являются |
ури- |
|||||||
диндифосфат |
(УДФ) и уридинтрифосфат (УТФ). |
мы должны по |
||||||||
И наконец, |
последний |
нуклеотид, с которым |
||||||||
знакомиться, это тимидин-5'-мопофосфат (ТМФ), |
иначе |
называе |
||||||||
мый |
тимидиловой |
кислотой. |
Производные |
тимидиловой |
кисло |
|||||
ты — содержащий |
одну макроэргическую |
связь |
тимидиндифос- |
|||||||
фат |
(ТДФ) и содержащий |
две макроэргические |
связи тимидии- |
|||||||
трифосфат |
(ТТФ). |
|
|
|
|
|
|
|
||
Полные и сокращенные названия важнейших нуклеотидов и их |
||||||||||
фосфорнокислых производных |
таковы: |
|
|
|
|
|||||
Адепозннмонофосфат |
АМФ |
Цитпдпндпфосфат |
|
|
ЦДФ |
|||||
(адениловая |
кислота) |
|
|
Цптпдпнтрнфосфат |
|
ЦТФ |
||||
Аденозиндифосфат |
АДФ |
|
Урцдцнмонофосфат (уридц- |
УМФ |
||||||
Аденозинтрифосфат |
АТФ |
|
ловая кислота) |
|
|
УДФ |
||||
Гуэнозппмонофосфат |
ГМФ |
|
Урндпндпфосфат |
|
|
|||||
(гуаниловая |
кислота) |
ГДФ |
|
Урпдпнтрнфосфат |
|
|
УТФ |
|||
Гуанозиидпфосфат |
|
Тпмпдпнмонофосфат (тп- |
|
ТМФ |
||||||
Гуанозинтрифосфат |
ГТФ |
|
мидиловая кислота) |
|
|
|||||
Цитпдпнмонофосфат |
ЦМФ |
Тіімпдпндпфосфат |
|
|
ТДФ |
|||||
(цптнднловая кислота) |
|
|
Тнмпдпитрпфосфат |
|
ТТФ |
|||||
Рассмотрим ферментные системы, в состав которых входят аденозиндифосфат и аденозинтрифосфат — важнейшие макроэр гические соединения. Они являются, с одной стороны, так ска зать, источником топлива в клетке, ее энергетическим запасом, а с другой — составными частями очень многих ферментов и ко-
ферментов.
Схематически строение аденозинтрифосфата можно изоб разить следующим образом:
О |
О |
О |
I I |
I I |
I I |
А—О—Р—0 ~ Р —0 ~ Р —ОН
О(-) о(-) о(->
АМФ |
|
|
^ - |
АДФ |
^ |
— |
||
АТФ
8І
Здесь буквой А обозначен нуклеозид аденозин. Знак (—) около атомов кислорода в остатках фосфорной кислоты обозна чает, что в этих гидроксилах водороды диссоциированы и у ато мов кислорода имеется отрицательный заряд.
Еще более упрощенно строение молекулы АТФ выглядит так:
А—
Ферменты, содержащие в качестве кофермептов адеиозиитрифосфат, катализируют самые разнообразные реакции, указанные в общем виде на схеме 1 2 .
Схема 12. Участие АТФ в различных ферментативных реакциях
82
В центре схемы изображена в упрощенном виде формула аде-
нозинтрифосфата. |
на какую связь данного |
соедине |
|
Стрелками показано, |
|||
ния действует тот или иной фермент. |
Около стрелки на |
||
писано название процесса |
и изображено |
соединение, |
которое |
участвует в реакции, а также продукты реакции. |
|
||
Рассмотрим более подробно эти реакции. |
|
|
|
Во-первых, это реакции, катализируемые различными кина зами, например ферментом гексокиназой, который переносит пос ледний остаток фосфорной кислоты от молекулы АТФ на гексозы.
Остаток фосфорной кислоты присоединяется к гидроксилу гексозы. При этом образуются фосфорилироваииая гексоза и аденозиндифосфат:
Второй тип реакции — перенос пирофосфатного остатка. К мо лекуле сахара присоединяется пирофосфатный остаток, образуется соединение
R— О—( р ) ~ ( р )
и молекула аденозинмонофосфата
© - А
Следовательно, в результате такого переноса пирофосфатного остатка весь запас энергии, который имеется в макроэргической связи пирофосфата, переносится на молекулу сахара.
Третий тип реакций, катализируемых ферментами, содержа щими в качестве кофермента адепозинтрифосфат,— перенос аденозинмонофосфатного остатка на какую-то кислоту. В частности, особенно важное значение имеет перенос аденозинмонофосфатного остатка на аминокислоту. Именно в этом заключается процесс активирования аминокислот при биосинтезе белка. Остаток ами нокислоты активируется за счет переноса аденозинмонофосфата, в результате получается аминоациладенилат:
83
В этом соединении содержится макроэргическая связь; другая макроэргическая связь выделяется в виде пирофосфата
0 |
- |
0 |
Аминокислота, соединенная с аденозинмонофосфатным остатком, является активированной и легко вступает в дальнейшие превра щения, происходящие в процессе синтеза белка.
Четвертый и последний тип реакций, катализируемых фермен тами, содержащими в качестве кофермента аденозиытрифосфат, это перенос аденозильного остатка. Под влиянием особого фер мента соединение R —S—СН3, т. е. соединение типа метионина, присоединяет остаток аденозина. При этом образуется соединение такого типа:
(-)■ И—S—А,
СИз
выделяются свободная ортофосфорная кислота и пирофосфат. Этот тип реакций играет важную роль в обмене веществ при акти вировании и переносе метальных групп. Как известно, метио нин является в обмене веществ важнейшим источником металь ных групп, но для того чтобы метальные группы могли быть пере несены на то или иное соединение, они должны быть активирова ны. Активация происходит указанным выше путем, а именно при участии фермептов, содержащих в качестве кофермента адонозпнтрифосфат. При этом аденозильный остаток присоединяется к соединению, подобному метионину. В результате траты энергии одной из макроэргических связей метальный остаток активиру ется, становится более подвижным и может быть перенесен на другое соединение, которое должно подвергнуться метилиро ванию.
Таким образом, роль ферментов, содержащих аденозинтрифосфат в качестве кофермента, заключается в активировании различных соединений за счет энергии макроэргических связей.
Очень большое значение в обмене веществ имеют уридиимонофосфат, уридиидифосфат, а также различные их производные. Роль уридиновых ферментов заключается в том, что они катали зируют различные реакции переноса и превращения остатков са харов и остатков производных сахаров. Наиболее важный и из вестный тип переноса — перенос глюкозильных остатков (ос татков глюкозы).
Если написать схему реакции, катализируемой ферментом, содержащим в качестве кофермента УТФ, то она будет выглядеть следующим образом:
84
|
|
|
|
н |
|
он |
|
|
|
|
|
HOHjC |
|
|
|
сн2—о—® ~ ® |
® |
) |
1 |
он |
|
|
+ (р>-0 Х |
|
|
||
|
он НС |
|
|
|
|
|
H^No^ н |
|
|
|
|
||
ОН |
Уридинтрнфосфат |
|
|
|
|
|
I |
|
|
|
|
|
|
N^^CH |
|
Н |
|
|
|
|
о=с |
сн |
|
|
|
|
|
н |
/ОН н |
|
|
|||
N н |
к |
НОН2С |
|
|
||
|
|
СН2—о—(р) |
|
|
|
|
|
он но |
|
|
|
|
|
н |
> У н |
|
|
|
|
|
|
Уріідмндифосфатглюкоза |
|
|
|
Пирофосфат |
|
|
|
(УДФГ) |
|
|
|
|
Вданном случае молекула УТФ, входящая в состав фермента
исодержащая две макроэргические связи, реагирует с фосфорилироваиной глюкозой — глюкозо-1-фосфатом. Как видно из при веденного уравнения, в результате этой реакции выделяется
пирофосфат и образуется соединение, которое называется у р и - д и н д и ф о с ф а т г л ю к о з о й, или сокращенно УДФГ.
УДФГ является коферментом многих ферментов, катализи рующих различные синтезы углеводов, сопровождающиеся пере носом остатка глюкозы.
Какие же реакции катализируют ферменты, содержащие УДФГ в качестве кофермента?
Во-первых, это изомеризация галактозы в глюкозу, происхо дящая в соответствии с уравнением
УДФгалактоза =^=УДФглюкоза.
Эту реакцию катализирует фермент УДФглюкозо — эпимераза, особенно активный у так называемых кефирных дрожжей Saccharomyces fragilis. Как известно, обычные дрожжи не сбра живают галактозу, в то время как кефирные дрожжи способны ее сбраживать, что объясняется наличием у них УДФглюкозо — эпимеразы.
Нужно отметить, что для проявления каталитического дей ствия УДФглюкозо — эпимеразы необходимо присутствие НАД+.
85
УДФглюкоза является также коэнзимом фермента гексозо-1- фосфат — уридшшлтрансферазьт, катализирующей превращение галактозо-І-фосфата в глюкозо-1 -фосфат согласно уравнению
УДФглюкоза + a-D-галактозо-І-фосфат ^УДФгалактоза -f-
+ a-D-глюкозо-І-фосфат.
Вторая группа ферментативных реакций, в которых участвует УДФГ,— это синтез сахарозы.
Ранее предполагали, что синтез сахарозы в живой клетке про исходит благодаря обратимому действию инвертазы, т. е. этот фермент и расщепляет, и синтезирует сахарозу.
Оказалось, одиако, что гидролиз сахарозы происходит при участии ß-фруктофуранозидазы (инвертазы), а синтез идет путем переноса глюкозилыюго остатка с уридішдифосфатглюкозы на соответствующий акцептор. Известны два типа этих акцепторов.
1. В качестве акцептора выступает фруктозо-6 -фосфат. Реак цию можно изобразить следующим образом:
УДФГ -j- фруктозо-6-фосфат =^=УДФ + сахарозо-6-фосфат.
2. Реакция протекает следующим образом:
УДФГ -р фруктоза УДФ + сахароза.
Особенно важную роль в синтезе сахарозы играет первая реак ция.
Ферменты, содержащие УДФГ, катализируют также синтез трегалозы, который происходит таким путем:
УДФГ + глюкозо-6-фосфат =^=УДФ -р трогалозо-6-фосфат.
Следующий тип реакций, катализируемых ферментами, содер жащими УДФГ,— синтез различных гликозидов.
Еще в начале этого столетия французский биохимик Эмиль Буркло сумел осуществить синтезы различных гликозидов под действием гликозидаз, катализирующих гидролиз гликозидов иа сахар и агликон. Он работал с ß-глюкозидазой в среде метилового спирта, содержащего в растворе глюкозу. Оказалось, что этот фермент не теряет своей активности в почти концентрированном метиловом спирте и в данных условиях катализирует синтез ß-ме- тилглюкозида.
При этом происходит следующая реакция:
СНзОН + глюкоза ß-метіглглюкозид -)- НзО.
Реакция обратима, но в среде метилового спирта она направ лена в^сторону синтеза метилглюкозида, а в водной среде —
86
в сторону гидролиза глюкозида. Пользуясь этим методом, Буркло получал гликозиды буквально килограммами. Работы Буркло по ферментативному синтезу гликозидов имели большое принципи альное значение, так как послужили прекрасным доказательством обратимости действия ферментов. После работ Буркло возникло представление о том, что в живой клетке синтез гликозидов про исходит именно таким путем. Предполагали, что в клетке имеются особые «сухие» места, где и осуществляется этот синтез. Однако недавно было показано, что синтез гликозида может идти в ре зультате переноса глюкозильного остатка па какой-то спирт при участии фермента, содержащего УДФГ. Так, например, уста новлено, что может иметь место такая реакция:
УДФГ + гидрохинон =^=арбутин -f- УДФ.
Хотя подобные реакции синтеза гликозидов прекрасно идут, однако до сих пор неясно, в каких случаях они осуществляются по принципу обратимости действия ферментов и когда происходит синтез глюкозидов при участии УДФГ.
Следующий, пятый тип реакций, катализируемых УДФГфермеитом,— это синтез клетчатки у бактерий. Проблема биосин теза клетчатки, давно привлекает к себе внимание биохимиков. Уже сравнительно давно был выделен фермент целлюлаза, гидро лизующий клетчатку, но попытки синтезировать клетчатку под действием этого фермента оказались безрезультатными. Исходя из того, что УДФГ представляет собой источник активной глю козы, удалось осуществить ферментативный синтез клетчатки в бесклеточных экстрактах из уксуснокислых бактерий Acetobacler xylinum. Эти бактерии, развиваясь в вине, образуют плотную слизистую массу, которая состоит из чистой бактериальной клет чатки.
Было показано, что ферментативный синтез клетчатки проис ходит следующим образом:
УДФГ + (глюкозаД =?ьУДФ -j- (глюкоза)п+1.
Таким образом, для этой реакции нужна затравка в виде мо лекул так называемых целлодекстринов, представляющих собой продукты гидролиза целлюлозы. В соответствии с этой реакцией к затравке присоединяется одна молекула глюкозы за другой и синтезируется цепочка клетчатки.
Итак, реакции, катализируемые ферментами, содержащими УДФГ, очень разнообразны, но все они связаны с активированием и переносом глюкозильного остатка.
Синтез хитина также идет под действием ферментов, содер жащих производное УДФ.
Известно, что хитин — это биополимер, который содержится в кутикуле насекомых, в шляпочных и плесневых грибах, в дрож-
87
Жах и в одноклеточных зеленых водорослях. Хитин представлябі' собой полимор N-ацетилглюкозаміша;
СН„ОН |
|
|
Н |
|
|
н |
NHCOCH- |
|
. N- Ацетилглюкозамии |
|
|
Он реагирует с УДФ, образуя уридивднфосфат-Х-ацетилглю- |
||
козамин — соединение, аналогичное УДФГ. |
Активированный |
|
остаток N-ацетилгліокозамина |
переносится па |
соответствующую |
затравку с образованием хитина, аналогично тому, как при син тезе целлюлозы на целлодекстрип переносится остаток активи рованной глюкозы.
Последний тип реакций, катализируемых ферментами,содер жащими в качестве кофермента урпдиндифосфат, это перенос ос татка глюкуроновой кислоты. Как известно, глюкуроповая кисло та — производное глюкозы, у которой 6 -й углеродный атом окис лен до группы СООН. УДФглюкуроновая кислота представляет собой активированную форму глюкуроновой кислоты, готовую к тому, чтобы при участии фермента быть перенесенной иа какоето вещество.
Именно так синтезируются полиуроииды, т. е. соединения, состоящие из остатков уроновых кислот. Аналогичным образом галактуроиовая кислота, являющаяся продуктом окисления га лактозы, в виде уриднидифосфатгалактуроковой кислоты служит источником остатка галактуроновой кислоты, которая также ис пользуется на синтез полиуронидов.
Полиуроииды представляют собой высокомолекулярные соеди нения, состоящие из остатков глюкуроновой или галактуроновой кислот. Оыи очень распространены в природе и входят в со став целого ряда веществ, которые накапливаются в клеточных стенках растений и образуют так называемую срединную пла
стинку.
Кроме УДФглюкозы и УДФгалактозы в качестве коферментов выступают также гуанозипдифосфатсахара, например гуанозиндифосфатыанноза и гуанозиндифосфатглюкоза. Строение гуанозиндифосфатманнозы таково:
Гуанозин— О—(р) ~ ( р) — манноза
Как видно из формулы, это соединение содержит макроэргическую связь. Оно входит в состав некоторых ферментов, содержа
88
