
книги из ГПНТБ / Кретович В.Л. Введение в энзимологию
.pdfдетельствуют следующие данные, характеризующие действие глюкозооксидазы из Penicillium на различные субстраты:
Субстрат |
Отиоснтель- |
ная спорость |
|
|
окисления, % |
ß-D-Глюкоза |
100,00 |
2-Дезоксн-Б-глюкоза |
25,00 |
D-Манноза |
0,98 |
a-D-Гліокоза |
0,64 |
Трегалоза |
0,28 |
ОтыосытельСубстрат ная скорость
окисления, %
Мальтоза |
0,19 |
D-Галактоза |
0,14 |
L-Арабнноза, D-рибо- |
|
за, D-фруктоза, сахаро- |
|
за, лактоза, рафиноза |
0 |
Из этих данных следует, что, хотя фермент обладает очень высокой специфичностью, он все же действует не па один субстрат. Так, глюкозооксидаза довольно энергично окисляет 2-дезокси- D-глюкозу. Мы видим, что a-D-глюкоза окисляется данным фер ментом чрезвычайно медленно, хотя она отличается от ß-D-глюко- зы только положением групп Н и ОН у первого углеродного атома по отношению к плоскости кольца. Интересно, что восстанавли вающий дисахарид мальтоза, содержащая свободный глюкозидный гидроксил, окисляется глюкозооксидазой лишь с ничтожной скоростью. Таким образом, хотя глюкозооксидаза обладает до вольно высокой специфичностью, все же эта специфичность не абсолютна.
Если рассмотреть действие упоминавшейся уже нами ранее пируватдекарбоксилазы, катализирующей декарбоксилирование пировииоградной кислоты с образованием С02 и уксусного аль дегида, то можно убедиться в том, что этот фермент декарбоксилирует ие только пируват, но и другие а-кетоксилоты с более длинной углеродной цепочкой — а-кетомасляную, а-кетовалериа- новую и а-кетокапроновую. Однако по мере удлинения углерод ной цепочки скорость декарбоксилирования убывает, что ясно видно на рис. 49, а.
Число томоз Св а-кетонислоте |
Числоатомов Ов Л-аминокиспоте |
Рис. 49. Влияние длины углеродной цепи на декарбоксилирование а-кето- кислот под действием пируватдекарбоксилазы дрожжей (а) и окисление
D-аминокислот оксидазой плесневого гриба Ncurospora (б) (по М. Диксону и Э. Уэббу)
149
Следовательно, хотя фермент действует па одну и ту же груп
пу в молекуле |
любого из ука |
|||||||
занных |
субстратов, длина угле |
|||||||
родной |
цепочки |
оказывает су |
||||||
щественное влияние на действие |
||||||||
фермента. У других |
ферментов |
|||||||
это |
влияние |
не |
обязательно |
|||||
выражается в снижении |
скоро |
|||||||
сти реакции по мере |
удлинения |
|||||||
углеродной |
цепи |
|
субстрата. |
|||||
Так, |
например, |
флавиновый |
||||||
фермент оксидаза D-аминокис- |
||||||||
лот, |
катализирующий |
окисле |
||||||
ние D-ампнокислот кислородом |
||||||||
воздуха с образованием |
аммиа |
|||||||
ка и соответствующей |
кетокис |
|||||||
лоты, наиболее энергично |
окис |
|||||||
ляет |
аминокислоты, |
|
содержа |
|||||
щие |
четыре |
углеродных |
атома |
|||||
в цепочке. Уменьшение и уве |
||||||||
личение |
углеродной |
|
цепочки |
|||||
аминокислоты вызывает ослабление действия фермента |
(см. рис. |
49, 6).
Таким образом, па примере уреазы, глюкозооксидазы, пируватдекарбоксилазы и оксидазы D-амішокпслот мы убеждаемся в том, что фермент, действуя па одну и ту же группировку в моле куле различных соединений, небезразличен к составу и строению молекулы субстрата в целом.
Очень важным видом специфичности является стереохими ческая специфичность ферментов, т. е. действие фермента на оп ределенный оптический изомер одного и того же вещества.
Как известно из органической химии, Г) и L-формы различ ных соединений отличаются друг от друга расположением в пространстве группировок, находящихся у так называемого асим метрического атома углерода — атома углерода, у которого все четыре валентности заняты различными группировками.
D- и L-соедштения различаются между собой как кисти пра вой и левой руки, как предмет и его зеркальное изображение и никак не могут быть совмещены в пространстве. Это ясно видно на рис. 50, на котором изображены молекулярные модели D- и L-алапипа и D- и L-тирозииа.
Еще Луи Пастер в своих классических исследованиях пока зал, что D- и L-формы разных органических соединений, в частности винной кислоты, различаются по форме кристаллов, а также и по тому, какиа пих действуют микроорганизмы. Он выра щивал плесневый гриб РешсШіит на растворах D- или L-вишюй кислоты, Оказалось, что L-ршшая кислота прекрасно усваивается
150
!' f, |
|
■fU. |
Г : |
. .’V Я. |
|
.ГЧѵ .1 |
|
У,-.
■ а |
.Я-'% |
- ?.
Рис. 50. Молекулярные |
модели D- и L- аланина (а) и D- и Ьт тиро |
зина (б) (по Ф. |
Шорму) |
плесневым грибом, а D-випиая кислота ле усваивается. На осно вании этих опытов Пастер сделал вывод, что. живая клетка из бирательно относится к D- и L-формам различных органических соединений и сама протоплазма обладает асимметрией. Живая протоплазма прежде всего тем и отличается от мертвой, что она избирательно извлекает из среды: L-стереоизомеры различных органических соединений, оставляя D-изомеры нетронутыми.
Известно также, что стереоизомеры отличаются друг от друга по своему физиологическому действию на организм. Так, напри мер, L-аспарагин безвкусен, а его неприродный стереоизомер D- аспарагии обладает сладким вкусом.
В настоящее время целый ряд ферментов изучен в отношении их действия па стереоизомеры соответствующих субстратов. На пример, рассмотренный нами ранее фермент глготаматдегидрогеиаза, который катализирует дезаминирование глютаминовой кислоты, действует только на L-глютаминовую кислоту и не дей ствует на D-глютаминовую кислоту. Таким образом, глютаматдегидрогеназа обладает абсолютной стереоспецифичностыо по отношению к L-глютаминовой кислоте.
При гидролитическом расщеплении аспарагина образуются
аспарагиновая кислота |
н аммиак: |
HsNOC—СЛ-Ь—CM—СООН + Ні О ф СООН—СИ-.—СЫ—СООН + ГШз. |
|
N Hu |
NIL |
Как видно из уравнения, при этом происходит гидролитичес кое отщепление амидной группы. Реакция катализируется фер ментом аспарагиназой. Аспарагииаза действует только на при родный изомер аспарагина — L-аспарагин и пе действует на D- аепарагин. Если к раствору L-аспарагииа и аспарагиназы доба вить D-аспарагш-і, то этот последний будет конкурентно подавлять действие аспарагиназы на L-аспарагии. Это наблюдение свиде тельствует о том, что D-аспарагин, хотя и связывается с аспарагииазой по принципу конкурентного торможения, однако не гидро лизуется ею. Такое явление, когда D-изомер пе расщепляется ферментом, но конкурентно подавляет действие этого фермента на L-изомер, известно для ряда ферментов.
Прекрасным примером стереоспецифичности действия фермен тов является различное их действие на такие изомеры, как а- и ß-формы глюкозы.
151
Выше (см. стр. 149) уже были приведены данные, свидетель ствующие о резко различном действии глюкозооксидазы па а- н ß-D-глюкозу.
Эти соединения отличаются друг от друга только взаимным расположением Н и ОН групп по отношению к плоскости кольца у первого углеродного атома. В природе широко распространены производные а- и ß-глюкозы, у которых водород глгокозидпого гидроксила замещен каким-нибудь радикалом. Если таким ради калом; является метилыіая группа — СН3, то мы имеем а- метилглюкозид или ß-метилглюкозид. Формулы этих соединений таковы:
а Метилглюкозмд |
ß -Метилглюкозид |
Как видно из этих формул, метилглюкозиды представляют собой простые эфиры, которые могут образоваться в результате взаи модействия глюкозпдного гидроксила моносахарида с гидроксилом спирта. Эти два вещества, как и другие а- и ß-глюкозиды, раз личаются тем, что на одни из них действует фермент а-глюкози- даза, а па другие — ß-глюкозидаза. Эти ферменты строго специ фичны: ß-глюкозидаза не расщепляет сс-глгокозиды. Таким образом, а- и ß-глюкозидазы обладают абсолютной специфичностью по от ношению к а- или ß-глюкозидной связи. Важно, однако, отме тить, что скорость расщепления того или иного глюкозида очень сильно зависит от окружения, которое имеется рядом с а- или ß- глюкозидной связью. Так, при гидролизе ß-D-метилгліокозида под действием ß-глюкозидазы образуется ß-D-глюкоза и мети ловый спирт:
Природа несахарного компонента глюкозида (аглюкона) су щественно влияет на действие ß-глюкозидазы: скорость расщеп ления глюкозидиой связи очень сильно зависит от природы аглю кона.
152
Влияние природы аглюкона иа скорость гидролиза различ ных глюкозидов ß-гліокозидазой может быть продемонстрировано следующими данными:
|
|
|
|
Субстрат |
|
Относительная |
||
|
|
|
|
|
скорость |
гидролиза |
||
|
|
|
|
|
|
|||
ß-D-Метплгліокозіід |
|
|
|
0,034 |
||||
ß-D-Гліокозид, аглюконом |
|
|
|
|||||
которого является ванилип: |
|
|
||||||
О |
|
|
/ |
СИ--------СИ |
\— і |
|
13,0 |
|
\ |
П__р |
X |
|
|
||||
|
|
|
р __ |
QT-Tl |
в |
образовании |
||
|
° |
u |
/ |
( |
і |
|||
/ . |
|
\ |
|
—- |
глюиозндной |
|||
II |
|
|
|
СН.-------:---- г, |
|
*4 |
связи участвует |
|
|
|
|
|
I |
|
|
этот гидроксил |
ОСЫз
Таким образом, мы видим, что скорость расщепления глюкозида, аглгокоиом которого является ванилин, почти в 400 раз выше, чем скорость расщепления ß-метилглюкозида. Следова тельно, в данном случае более сложная структура аглюкона — ванилина способствует ускорению расщепления ß-глюкозидиой связи.
Этот пример наглядно показывает, что для действия фермента важна не только структура той группировки в молекуле субстра та, па которую он действует, не только ее стереохимическая кон фигурация, но и «окружение», имеющееся рядом с расщепляе мой связью.
Рассмотрим теперь значение цис- и траке-изомерии для дей ствия ферментов. Этот вид изомерии, т. е. расположение радика лов по отношению к двойной связи между двумя атомами углеро да, также оказывает большое влияние на действие фермента. Мы можем рассмотреть подобное влияние на примере фермента L- аспартат — аммиак-лиазы (аспартазы). Она катализирует иегидролитическое отщепление аммиака от аспарагиновой кислоты с образованием фумаровой кислоты:
СООН—СІ-І2-С Н -С О О Н ^ С О О Н -С Н = С Н -С О О Н + Ш з .
Nl-b
Формула фумаровой кислоты такова:
СООН
I
нс=сн ноосI
Следовательно, она представляет собой транс-изомер, так как в ее молекуле карбоксильные группы расположены по разные стороны от двойной связи. Ifuc-пзомером является малеиновая кислота, у которой оба карбоксила расположены рядом, по одну сторону от двойной связи, что приводит к значительным разли
153
чиям в химических свойствах этих двух соединений. Формула малеиновой кислоты такова:
С Н = С Н
I I
HOOG СООН
Малеиновая кислота ие встречается в природе, по является очень важным исходным продуктом для целого ряда синтезов в органической химии. Выяснилось, что аспартаза действует толь ко на фумаровуго кислоту, совершенно не реагируя с малеиновой кислотой. Производные малеиновой кислоты сильно угнетают раз личные процессы в растительных тканях. Поэтому некоторые про изводные малеиновой кислоты, например гидразид малеиновой кислоты, находят широкое применение в народном хозяйстве. Даже незначительного количества этого соединения достаточно для того, чтобы полностью подавить дыхание и прорастание ово щей и корней сахарной свеклы при храпении.
Наконец, известны случаи особенно топкой стереоспецифич ности ферментов, когда в совершенно симметричной молекуле субстрата фермент различает одинаковые группы, которые хи мик не может различить с помощью имеющихся в его распоряже нии средств. Так, например, если мы имеем соединение Cx'xyz, то X, х ', у и z означают четыре различные группы, связанные с уг леродным атомом. При этом, хотя две группы х и х' химически совершенно одинаковы, фермент действует лишь на одну из них, в результате чего образуется лишь один оптический изомер ве щества Cx'xyz. Пример подобного рода стереоспецифичности фермента мы имеем в случае фосфорилирования глицерина под действием глицеролкиназы — образуется лишь L-глицеро-З-фос- фат. Тот факт, что к симметричной молекуле глицерина остаток фосфорной кислоты присоединяется только лишь в третьем по ложении, был подтвержден опытами, в которых был взят глице рин, меченный радиоактивным углеродом С14 в положении 1. При этом реакция шла следующим образом (углерод С14 отмечен звездочкой):
іСІ-ЬОІ-І |
J CI-IÜOH |
|
Н О - 2 С—Н + АТФ Г ^ и н а т Л |
НО—-С—Н |
+ А Д Ф . |
зСНоОН |
зСНі-О-НгРОз |
|
Такого рода стереоспецифичиость фермента может быть на глядно показана в виде схемы 23. На этой схеме молекула субст рата изображена в виде тетраэдра, по углам которого располо жены группы X , х', у и Z . X, Y и Z в кружках представляют со бой специфические группировки в молекуле фермента, по месту которых к нему присоединяется субстрат. X в кружке с черточ ками является той группой фермента, которая активирует груп
154
пировку х в молекуле субстрата. Из схемы 23 совершенію оче видно, что, поскольку каждая группа субстрата должна связать ся с определенной группировкой в молекуле фермента — х с X, у с Y, z с Z, при любом расположении субстрата по отношению к ферменту с активирующей группировкой может связаться только лишь определенная группа, а имепно х '.
Схема 23. СтерсоспецііфпчIIость фермента по отноше нию к субстрату Cx'xyz
(по А. Огстолу)
Весьма детально разработан вопрос о специфичности протео литических ферментов (протеаз), катализирующих гидролиз бел ков и пептидов. Первоначально проблему специфичности дейст вия протеаз связывали с размером молекулы субстрата, на кото
рый действует тот или иной фермент. Однако |
Э. Фишером и |
Э. Абдергальденом, изучавшими действие |
протеолитических |
ферментов на синтетические пептиды, были получены первые данные, говорящие о том, что не все пептидные связи атакуются с одинаковой скоростью ферментами. Проблема специфичности действия протеолитических ферментов была разрешена главным образом благодаря работам М. Бергмапна, Д. Фрутона и их сот рудников. На основании огромного количества экспериментальных данных, полученных с различными синтетическими субстратами, было установлено, что каждый протеолитический фермент предъ
являет свои специфические требования к строению |
субстрата и |
к окружению расщепляемой им пептидной связи. |
н гидроли |
Так, например, образующийся в желудке п е п с и |
зует пептидные связи с участием аминной группы тирозина или фенилаланина. Типичным специфическим синтетическим субстра том для пепсина может служить карбобеизокси-Ь-глготамил-Ь- тирозин:
|
ОН |
СООН |
|
(СН-ф |
сш |
I |
NH—СН—СООН |
СоІ-І5—СНі—О—С—NН—СН—С |
оо
Пепсин
155
II
°Чс/ОН |
и |
о |
н—сII—н |
|
|
|
|
н—с—н |
|
н—с—нII |
|
н—с—н |
|
I |
Н |
N—I |
а
Схема 24. Расщеплеппе пептидных связей трипсином (а), химотрішсшюм
(б) п карбокеппептпдазой А (#)
Наличие свободной амшшой группы в непосредственной блпзостп к гидролизуемой денспном связи делает субстрат устойчи вым к действию пепсина.
Напротив, наличие карбоксильпой группы способствует уве личению скорости гидролиза. Интересно отметить, что пепсины, полученные из слизистой желудка различных теплокровных жи вотных (свиньи, быка, овцы, цыпленка), все обладают сходной специфичностью, тогда как пепсин рыб проявляет несколько от личиую специфичность действия.
Содержащийся в кишечнике х и м о т р и п с и и также гидро лизует пептидные связи, образованные с участием ароматических аминокислот, однако, в отличие от пепсина, расщепляет связи,
образованные карбоксильными группами ароматических амино кислот.
Примером типичного синтетического субстрата для химотрипсина может служить карбобензокси-Ь-тирозилглицинамид:
ОН
СНо
I t
CiiHs—СНо—О—С—NH—СН—С — Г— NН—СІ-Ь—С—NН->
II |
II |
I |
и |
Химотрипсии
^Наличие свободной карбоксильной группы в непосредствен ной близости к гидролизуемой связи (иапример, в карбобензокси-
L-тирозилглнцине) делает субстрат устойчивым к действию химотрипсииа.
Свободная аминная группа в молекуле субстрата также сни жает его атакуемость химотрипсипом. Химотрипсии расщепляет также связи, образованные карбоксильной группой лейцина, ме тионина и триптофана.
Содержащийся в кишечнике т р и и с и и специфически гидро лизует связи, образованные карбоксильпой группой аргинина или лизина.
Наличие свободной основной группы в молекуле субстрата (е-амипогруппы лизииа или б-гуанидиновой группы аргинина) является непременным условием атакуемости субстрата трипси ном. Наличие свободной а-амипиой группы снижает или полно стью подавляет гидролиз субстрата трипсином.
Как мы уже указывали ранее (см. стр. 16), карбоксипептидаза гидролизует пептидные связи, расположенные рядом с С-конце- вой аминокислотой.
Схема 24 показывает, какие пептидные связи в полипептидпой цепочке белка расщепляются трипсином, какие — химо трипсипом и какие — карбоксипептидазой А.
П а п а и н вызывает более глубокое расщепление белков, чем протеазы животного происхождения. Это соответствует меньшей специфичности действия папаина на синтетические субстраты. Так, кристаллический папаин гидролизует бензоил-Ь-аргинин- амид, типичные субстраты пепсииа (карбобензокси-І-глютамил- тирозии), карбоксипептидазы (карбобензоксиглицил-Ь-трипто- фан), химотрипсина (ацетил-Ь-тирозинамид) и пептидаз (L-лей- цилглицилглицин и L-лейцииамид). Папаин гидролизует также некоторые другие субстраты, устойчивые к действию очищенных энзимов животного происхождения.
Итак, рассмотрев влияние структуры вещества на специфич ность действия ферментов, мы можем сказать, что большинство ферментов обладает ярко выраженной специфичностью, т. е. действует только на один субстрат или на определенные хими ческие связи в различных субстратах. Однако мы уже указыва ли, что один и тот же фермент может катализировать различные реакции. Это ясно видно на примере трипсина, который гидроли-
156 |
157 |
|
зует не только пептидные, но и некоторые эфирные и амидные связи.
В качестве примера рассмотрим расщепление трипсином не которых производных бензоил-Ь-аргинина.
H ä N — C = N H
NH
(С Н а ) з
I
C J - H — С О — N H - C H — С О О П
Веікюил-Б-арглшпі
Если в карбоксильную группу бензоил-Ь-аргинина ввести амид ную группу — NH2. то мы получим беизоил-Ё-аргининамид. Ока залось, что трипсин расщепляет амидную связь в этом соедине нии даже с большей скоростью, чем пептидные связи. Если взять метиловый или этиловый эфир бензоил-Ь-аргинина, то трипсин с исключительной скоростью расщепляет имеющиеся в них эфир ные связи, образуя соответственно метиловый или этиловый спирт и беизоил-Ь-аргинпп.
N Н >
C = N H
N11
I
(СНі )з О
I ./
С И — С — О С г Ш
I Г
N H Трипсин
'|со
С 6Н 5
Этиловый эфир бензонл-Ь-аргшшна
Химотринсин энергично гидролизует этиловый эфир ацетил- L-тирозина. Таким образом, трипсин и химотринсин обладают очень высокой эстеразной активностью. Эстеразной активностью обладают также и другие протеолитические ферменты.
Эстеразная активность нашла широкое применение в лабо раторной практике при определении активности препаратов про теолитических ферментов. Это объясняется простотой определе ния эстеразной активности путем прямого титрования щелочью.
Следовательно, мы убедились в том, что трипсин имеет трой ную специфичность — он катализирует расщепление трех раз личных типов химических связей: 1) пептидных, в образовании которых участвуют карбоксильные группы аргинина или лизина, 2) амидных и 3) наиболее энергично он расщепляет сложноэфир ные связи, образуемые'карбоксилом аминокислоты и спиртом.
158