
книги из ГПНТБ / Дашевский, В. Г. Конформации органических молекул
.pdfнайденного пути, а конформация с (Анет и Хак) далека от сед ловой точки.
Рассмотренный пример интересен в том отношении, что в дан ном случае вычислительная машина нашла не только количествен ное, но и качественное решение задачи. В большинстве же слу чаев роль машины сводится к уточнению некоторых величин, тогда как качественные соотношения бывают ясны из логических соображений или из анализа молекулярных моделей.
Циклогексадиен-1,4
Экспериментальные и расчетные данные по структуре циклогек садиена-1,4 весьма разноречивы. Отметим, что для этой молеку лы возможны две конформации: плоская и ванна. Расчет Гербштейна [188], основанный на рассмотрении угловых напряжений и невалентных взаимодействий Н---Н, привел к выигрышу в энергии для конформации ванны и равновесному двугранному углу 141°. Напротив, итальянские авторы [189] нашли, что пло ская форма выгоднее, чем ванна с двугранным углом 141,1°, на 2,8 ккал/моль.
Авторы электронографического исследования структуры цик логексадиена-1,4 [190] пришли к выводу, что наиболее вероятна плоская конформация; по-видимому, имеются также неплоские формы, которые трудно определить на основе экспериментальной кривой интенсивности. Анализ спектров ЯМР [191] также свиде тельствует о близкой к плоской конформации этой молекулы {двугранный угол около 172°). Наконец, при повторном электро нографическом исследовании [192] было найдено, что наилучшее согласие с экспериментальной кривой интенсивности достигается для конформации ванны с двугранным углом 159,3°.
Результаты расчета, полученные в работе [167], объясняют кажущееся противоречие экспериментальных данных. Рассчи танные валентные углы для обеих форм хорошо согласуются с данными электронографических исследований (приведены в скоб ках, по данным [192]):
в |
6 |
а |
Вместе с тем разность энергий плоской формы (а) и неплоской формы ванны (б) оказалась равной всего лишь 0,13 ккал/моль, т. е. молекула при нормальных условиях почти свободно обра щается из одной ванны в другую, проходя через плоскую форму.
191
Изменение двугранного угла до 141° должно стоить несколь ких ккал/моль. Поскольку такая конформация явно противоре чит данным электронографических исследований, то можно пола гать, что неточное предсказание, сделанное в работе [188], свя зано с несовершенством параметризации. С другой стороны, энергия неплоской формы не может быть так велика, как это было найдено в расчете [189], — при разности энергий 2,8 ккал/моль неплоская форма не могла бы наблюдаться на опыте.
Циклогексадиен-1,3
Ранее на основании анализа микроволновых спектров [193] было установлено, что молекула циклогексадиена-1,3 неплоская и имеет симметрию С2. Этот тип симметрии подтвержден электроно графическими исследованиями [192, 194], где было найдено, что двугранный угол между плоскостями С2С3С4С5 и СзС^Се состав ляет 162—163°. Расчет [167] также показал выгодность симмет рии С2 и дал двугранный угол 162°, совпадающий с опытными значениями (приведены в скобках):
Расчет (град) Опыт (град)
8=162 |
162J5; 161,7; 163,0 |
а = 122,8 |
120,2; 120,1; 121,6 |
При этом энергия плоской формы всего лишь на 0,25 ккал/моль превышает энергию формы С2. Исследование потенциальной функ ции циклогексадиена-1,3 показало, что изменение неплоских координат атомов С5 и С6 от равновесной конформации в пределах 0,1 А (имеются в виду смещения относительно средней плоскости молекулы) при соответствующем подборе других геометрических параметров незначительно меняет энергию напряжения. Поэтому при комнатной температуре следует ожидать колебаний атомов С5 и С„ относительно средней плоскости с преимущественным сохранением симметрии С2.
Заметим, что итальянские авторы 1189] в результате конформационного расчета получили аналогичный результат (двугран ный угол 163°), но разность энергий плоской и неплоской форм, по их данным, — 2 ккал/моль — значительно выше.
Циклогептатриен-1,3,5
Строение молекулы циклогептатриена исследовано методами га зовой электронографии [195] и микроволновой спектроскопии 1196]. В этих работах рассматривались три конформации
192
L X I X — LXXI, в принципе возможна также конформация кресла LXXII .
|
I |
П |
|
LXIX |
LXXI |
LXX11 |
|
LXX |
|
|
Экспериментальным данным лучше всего соответствует кон формация L X X I (ванна). Однако различия в угловых параметрах значительно превышают экспериментальные погрешности.
Минимизация потенциальной функции проводилась по 8 не зависимым параметрам из всех четырех указанных нулевых приближений. При этом L X X переходит в LXI X, a L X X I I — в LXXI , т. е. существуют лишь две оптимальные конформации — плоская и ванна. Разность энергий напряжения конформаций L X I X и L X X I составляет 6,85 ккал/моль в пользу ванны LXXI.
Рассчитанные углы конформации ванны в пределах ошибок опыта согласуются с данными Батчера [196] и расходятся с результа тами Треттеберг [195]:
Валентный или |
Расчетные |
Опытные данные |
Опытные данные |
|
данные, |
1195]. |
[196], |
||
двугранный угол |
||||
град |
град |
град |
||
ег |
||||
148,4 |
139,5±2 |
150,5 ± 4 |
||
е2 |
131,2 |
143,5±2 |
130,5±5 |
|
С2С}С4 |
125,0 |
119,8 |
124,5 |
|
QCA |
110 ,8 |
113,0 |
105,0 |
|
Интересно отметить, что большую роль в создании оптималь |
||||
ной конформации |
циклогептатриена играет составляющая |
потенциальной функции [выражение (3.8)], которая опреде ляется величиной двугранного угла в этиленовой системе С4—Сб= С в—С7. Для рассчитанной равновесной конформации этот угол равен 1°. Что же касается ванны, найденной в работе [195], то в ней этиленовая система существенно неплоская: дву
гранный угол, рассчитанный по |
геометрическим параметрам |
|
этой работы, равен 22°, и |
вклад |
деформации у двойной связи |
в потенциальную функцию |
составляет 17 ккал/моль. |
Циклооктатетраен
Конформация и рассчитанные величины углов этой молекулы показаны ниже (в скобках приведены экспериментальные зна*
13— 76 |
193 |
чения). Валентные и двугранные |
углы в точности совпадают |
с данными электронографического |
исследования [197]. |
* * *
Мы привели несколько примеров, показывающих, что механи ческая модель молекулы дает вполне удовлетворительное пред сказание структуры для таких систем, описание которых раньше было немыслимо без концепций резонанса и сопряжения. Более того, как показано в следующей главе, и термохимические свойст ва этих систем могут быть получены из величин энергий напря жения, соответствующих минимуму потенциальной функции, без введения каких-либо дополнительных предположений.
Заметим, что расчеты конформацийГциклов с одной двойной связью и числом атомов углерода от 6 до 9 проводились в работе [198] и тоже привели к удовлетворительному согласию с опытом. Энергии напряжения циклопентена, циклогексена, циклогептена, цис- и транс-циклооктенов и циклодеценов рассчитаны в работе [166]. Здесь уже не ставилась задача получить совпадающую с опытом геометрию — главной целью этих расчетов было срав нение теоретических и опытных величин энергий образования.
В последние годы были получены некоторые интересные дан ные по структурам сравнительно больших ненасыщенных угле водородных циклов, в частности изучались конформации молекул LXXI I 1 — LXXVI; надо полагать, эти данные будут полезны для теории конформационного анализа.
a m |
a m |
axv axvi
194
Некоторой неожиданностью является полное отсутствие эле ментов симметрии у молекулы циклооктадиена-1,3 (LXXI I 1). Согласно ее электронографическому исследованию [199], угол между этиленовыми плоскостями составляет 37,8°; валентные
углы |
сильно |
отличаются от идеальных (угол С ^С з |
= 129°, |
угол |
С4С5Св = |
117,2°, угол С5С6С7 = 105,9°). Трудно |
сказать, |
предскажет ли расчет меньшую энергию для несимметричной молекулы, чем для симметричной; во всяком случае итальян ские авторы [189] учитывали лишь симметричные модели. В не которых ситуациях (возможно, и для циклооктадиена-1,3) прене брежение несимметричными моделями могло привести к тому, что абсолютный минимум остался за пределами поиска.
Конформация ванны циклооктадиеиа-1,5 (L X X I V ) была пред сказана на основании измерений дипольного момента [200] и получила подтверждение в электронографическом исследовании [201]. Красивая конформация цис-цис-цис-циклононатриена-1,4,7 (LXXV) с осью симметрии третьего порядка была найдена как для чистого вещества в кристалле [202], так и в комплексе с AgN03 [203]. Для молекулы ^ис-г<«с-циклодекадиена-1,6 (L X X V I ) методом газовой электронографии [204] также была найдена сим метричная конформация.
Интересно, что |
во всех |
четырех структурах L X X I I I — |
LXXVI, включая |
и весьма |
напряженную молекулу LXXI I I , |
все двугранные углы у двойных связей почти в точности равны нулю, что несомненно указывает на большую жесткость этилено вой системы.
5. КОНФОРМАЦИИ АРОМАТИЧЕСКИХ МОЛЕКУЛ
Ароматические системы интересны тем, что пространственные затруднения в них (близкие межатомные контакты в идеальных моделях) могут привести к деформациям разных типов: измене ниям валентных углов, неплоским искажениям, а также поворо там многоатомных групп вокруг связей, соединяющих их с бен зольными ядрами. Структурный материал по перегруженным аро матическим молекулам подробно обсужден в обзоре [205].
Очевидно, что в дополнение к невалентным взаимодействиям и деформациям валентных углов в потенциальную функцию долж на быть введена энергия неплоских деформаций бензольных ядер, а также энергия выхода заместителей из их средней плоскости. На языке квантовой химии это означает уменьшение перекрыва ния р—тг-электронов соседних связей, или уменьшение энергии делокализации, явно невыгодное для ароматических систем. По этой же причине невыгоден и поворот вокруг связей, являющих ся проводниками сопряжения.
Коулсон и сотр. [206, 207] предложили методику расчета не плоских деформаций ароматических и некоторых других сопря-
13* |
195 |
женных систем. Рассмотрим фрагменты молекул, представленные ниже:
н н |
|
|
нин |
н |
н |
|
6 |
в |
Случаю а может, например, соответствовать молекула этилена, случаю б — части молекулы бензола, его производных, нафтали на и т. д.; случаю в — определенной части молекул нафталина, аценафтена, фенантрена и т. д. Если обозначить выходы атомов из плоскости через гъ ..., гв и ввести K i — спектроскопическую силовую постоянную для неплоских колебаний, К 2 — торсион ную силовую постоянную для вращения вокруг связи С—С (при этом необходимо допустить, что все типы смещений атомов могут быть описаны с помощью только этих двух постоянных), то, как было показано, энергия напряжения для случаев а, б и б без уче та отталкивания несвязанных атомов может быть выражена в следующем виде (а и Ь — длины связей).
(3.10)
(3.11)
(3.12)
Уравнения (3.10) — (3.12) легко могут быть получены, если рассматривать произвольным образом искаженную молекулу, когда все zlt ..., ze не равны нулю, и если переводить атомы в идеальное плоское положение посредством нескольких последо вательных операций. Постоянные Ki и Кг были оценены
из анализа |
спектров |
этилена и бензола: для |
этилена |
К\ = |
||
= |
0,131-10® |
дин/см, Кг = |
0,151 - 10s дин/см; для |
бензола |
К г = |
|
= |
0,1474-Ю5 дин/см, |
Кг = |
0,00553-105 дин/см. |
|
|
Определение равновесной конформации молекулы заключает ся в поиске минимума потенциальной энергии, которая дается уравнениями (3.10) — (3.12) для отдельных фрагментов моле кул. Для получения однозначных результатов необходимо ввести дополнительные предположения, поскольку в уравнения (3.10)— (3.12) не входят независимые геометрические параметры моле кулы и число уравнений, определяющих условия минимума, всегда меньше числа неизвестных.
Выходом из этого затруднения является приложение метода жестких сфер к определенным фрагментам молекулы. Если пере груженность молекулы является, главным образом, следствием взаимодействия каких-либо двух атомов, находящихся на ее пе риферии, то эти атомы, согласно указанному приближению, должны сместиться от идеального положения на расстояние, равное сумме их ван-дер-ваальсовых радиусов. Тогда располо жение всех остальных атомов может быть найдено из условия равенства нулю производных потенциальной функции по смеще ниям атомов. Метод жестких сфер имеет тот существенный недо статок, что на самом деле взаимодействие даже указанных пери ферийных атомов значительно мягче, чем взаимодействие, опи сываемое жесткими сферами. Все же остальные взаимодействия предполагаются мягкими, в чем и заключается непоследователь ность метода.
Ниже приведена рассчитанная Коулсоном и Сенентом кон формация молекулы 3,4;5,6-дибензфенантрена:
короткие контакты Н (при Q) с Н (при С14), С4 с С14 и Сх с Н (при С14). Рентгенографические исследования [208, 209] показали, что расстояние С1---С14 составляет 3,0 А. Тогда за ван-дер-вааль-
197
сов радиус «спрессованной» системы атомов углерода можно принять величину 1,5 А, и если радиус водорода равен 1,2 А, то г [С14— Н (при Cj)J равно 2,7 А. Далее нетрудно получить зна чения выхода атомов Сь С14 и водородов при них из средней пло скости молекулы (1,32 и 1,36 А соответственно). Сделав такие предположения, Коулсон и Сенент решили 32 линейных урав нения типа dUldzt = 0 относительно z* — выходов из плоскости остальных 32 атомов (всего в молекуле, включая узловые угле
родные |
атомы и атомы водорода, 36 атомов) и получили согла |
|
сующиеся с опытом координаты атомов углерода. |
|
|
Отметим также расчеты пяти полициклических конденсиро |
||
ванных |
углеводородов: 5,6;7,8-дибензперилена |
LXXVII, |
1,12;5,6;7,8-трибензперилена LXXVIII, тетрабензперопирена |
||
LXXI X, |
хризена L X X X и 20-метилхолантрена (метальная груп |
па не показана) LXXXI , — проведенные Коулсоном и Асгар Али [210, 211] тем же методом.
а
I
Для тетрабензперопирена (см. стр. 13) возможны две конфор мации: (1) по одну сторону от оси b атомы имеют положительные смещения, по другую — отрицательные; эта конформация сим метрична относительно оси а\ (2) верхняя половина молекулы по ворачивается относительно нижней вокруг оси а; такую конфор мацию можно назвать пропеллерной. Расчет показал, что кон формации (^ ’соответствует энергия напряжения 41,5 ккал/моль, а пропеллерной конформации 36,3 ккал/моль. Таким образом, следует отдать предпочтение пропеллерной конформации.
Были вычислены также энергии |
напряжения бензфенантре- |
||
на L X X X (17,9), |
дибензперилена LXXVI I (18,54), |
трибензпе- |
|
рилена LXXVI I I |
(18,60 ккал/моль). |
Естественно, |
что энергия |
198
напряжения тетрабензперопирена оказалась приблизительно вдвое большей.
В более поздней работе Коулсон и Хэй [21] развили общий анализ с использованием потенциальных кривых невалентных взаимодействий.
Допустим, что в перегруженной молекуле имеется t эквива
лентных |
взаимодействий несвязанных |
атомов, Ux — энергия де |
||||
формации валентных |
углов и |
связей, |
Uz — изменение энергии |
|||
при неплоских деформациях. |
Тогда |
энергия напряжения может |
||||
быть записана в виде |
|
|
|
|
|
|
|
|
U = If (R) + Ux + |
Uz |
(3.13) |
||
где f(R) |
— потенциал |
взаимодействия |
валентно не связанных |
|||
атомов, |
находящихся |
на расстоянии R один от другого. |
Кроме |
|||
того |
|
|
|
|
|
|
|
и х — |
-^ -х К х |
и г — -^~ гАг |
(3.14) |
||
где х — вектор, соответствующий отклонению валентных |
углов |
от 120° и изменению длин связей по сравнению с их стандартными значениями, которые были бы при отсутствии напряжения; z — вектор смещений, перпендикулярных средней плоскости; К
иА — симметричные квадратные матрицы силовых постоянных. Эффект деформации выражается в изменении расстояния
между валентно не связанными атомами по сравнению с идеаль ными расстояниями
R — Ro + Rx "Ь Rz ■+■Rxz |
(3-15) |
|
где R о — идеальное расстояние, |
Rx и |
Rz — соответственно |
«плоские» и «неплоские» смещения |
атомов, Rxz — член, учиты |
вающий взаимное влияние этих смещений (при выходе атомов из средней плоскости проекция молекулы на эту плоскость не сколько искажается). Если допустить, что выходы атомов из плоскости не зависят от деформаций в плоскости (а это допуще ние оправдывается для малых неплоских деформаций), то чле
ном Rxг можно пренебречь. |
Тогда |
из уравнений (3.14) |
и (3.15) |
могут быть получены уравнения |
вида |
|
|
Я ( R , х , г) = а ' х |
+ -? т г В г — (# — #„) = 0 |
(3.16) |
где В — симметричная квадратная матрица, а' — некоторая по стоянная. Кроме того, между углами и длинами связей имеются некоторые соотношения. В общем виде эти соотношения можно записать, введя прямоугольную (/ х т) матрицу С (I—количество условий связи, т — порядок вектора х) и вектор d:
g ( x ) = C x + d = . 0 |
(3.17) |
199
Для дальнейшего анализа воспользуемся методом неопреде ленных коэффициентов Лагранжа, введя множители р, о
W ~ U ( R , x , z ) + pH(R,x,z) + ag(x) |
(3.18) |
Теперь, если подставить вместо потенциальной энергии U(R, х, z) ее значение из (3.13), то задача сведется к поиску ми нимума функции
W ~ t f (R) + ~ Y хКх + -J - zAz + pa'x -f |
|
|
- f ~y |
pzBz — p (R — R0) -f- a (x + ad) |
(3.18a) |
по отношению к x, z |
и R. |
|
Дифференцируя (3.18a) no R, по всем x и всем z, получим урав нения в матричной форме, из которых с помощью нетривиальных операций можно вычислить значения геометрических парамет ров и выяснить смысл неопределенных множителей. Коулсон и Хэй [212] установили неравенство, которое является крите рием для выхода атомов из плоскости. Смысл его состоит в том, что если величина df/dR, т. е. сила отталкивания между валентно не связанными атомами, достаточно велика, то имеет место вы ход атомов из плоскости; если же df/dR не превосходит некото рой критической величины, то молекула сохраняет плоскую конформацию.
Приведенный анализ и, в частности, уравнение (3.13) можно обобщить на случай неэквивалентных взаимодействий, т. е. не обходимо учесть отталкивание между всеми парами несвязанных атомов. Но тогда все уравнения становятся крайне сложными, в то время как ничего принципиально нового в них не содержится.
Матрица К считается диагональной (взаимодействия между валентными углами не учитываются), и ее элементами являются спектроскопические силовые постоянные, которые согласно ра боте [213] имеют следующие значения: С—С 6,40; С—Н 5,8; угол
ССС 0,740; угол ССН 0,849 мдин/А. Элементы матрицы А анало гичны силовым постоянным Ki для неплоских смещений атомов
[см. уравнения |
(3.10) — (3.12)1 и К2 для торсионных движений. |
||
Эти силовые постоянные уточнены в работе [214]. |
|||
ли |
Основываясь на описанной методике, Коулсон и Хэй вычисли |
||
равновесные |
конформации фенантрена LXXXI I , трифениле- |
||
на |
L X X X I I I |
и |
хризена L X X X : |
200