Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

книги из ГПНТБ / Замятнин, А. А. Дилатометрия растворов белков

.pdf
Скачиваний:
6
Добавлен:
19.10.2023
Размер:
4.77 Mб
Скачать

П ри исследовании специфичности аргиназы из печени овцы впер­ вые были количественно связаны процессы расщепления субстрата и изменения объема [57]. G помощью указанного фермента про ­ изводили расщепление равновесового рацемата d- и Z-аргинпыа и одного из оптических изомеров. Д л я характеристики наблюдав­ шегося объемного эффекта было предложено пользоваться вели­ чиной константы сокращения (к), которая характеризует изме­ нение кажущегося мольного объема субстрата при ферментатив­

ном

гидролизе

и

определяется

уравнением:

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

(28)

где

A F — уменьшение

объема (см3 ), наблюдаемое

в дилатометре,

W — вес

субстрата,

а

М2

— его

молекулярный

вес. Д л я

раце­

мата

величина

к

оказалась

равной 2,53

см3 /моль, а для

одного

изомера — 5,02

см3 /моль, что свидетельствует о высокой специ­

фичности

фермента.

 

 

 

 

 

 

 

Целый ряд дилатометрических исследований был проведен

также и иа других

аминокислотах и пептидах при различных ви­

дах

гидролиза

[131,

132].

 

 

 

 

 

Говоря об объемных эффектах в растворах аминокислот и бел­

ков,

нельзя не

отметить работы

Роны и

Фишгольда [133—135],

а также Вебера и Нахмапзона [136, 137], которые явились пред­ посылкой для необычайно тщательных исследований объемных эффектов при протеолизе аминокислот, пептидов и белков, про ­ водившихся под руководством Лнндерштрема - Лапга . В резуль ­ тате таких исследований были получены не только новые данные о

величинах объемных

эффектов, но и дапо теоретическое описание

того, за счет к а к и х

явлений эти объемные эффекты возникают .

Линдерштрем - Лапг с сотрудниками на основании литературных данных [17, 133—139], а также базируясь на собственных результа­ тах [74, 75, 104, 140], выполненных с помощью модифицирован­ ного двухпузырькового дилатометра, рассмотрели объемные эф­ фекты реакций, в которых происходят различные превращения аминокислот и пептидов [76, 141—143]. В результате этих иссле­ дований оказалось возможным получить величины объемных эф­ фектов, вызванных электрострикцией воды вблизи ионогенных групп растворенных веществ. Средние величины объемных эф­ фектов в системах, содержащих диполярные ионы, такие как аминокислоты и пептиды [140—143], даны ниже:

Образование

нары

зарядов

Объемный эффект, см»/моль

Ашшокпслотный

диполь

(1 дин)

—13,0

Дшіептпдный

диполь (2 дпп)

—15,5

Трипептидпый

диполь

(3 дин)

—16,5

Тетрапептидный

диполь

(4 дип), а

—17,0

также диполи более высокого порядка

 

(4, . . . дип)

50

Н а основании приведенных данных можно сделать

вывод о

том, что в аминокислотах противоположно заряженные

аминиые

и карбоксильные группы так близки друг к другу, что пх ре­ зультирующее влияние на окружающие молекулы воды меньше,

чем у

более удаленных друг от друга зарядов в дипептнде, трипеп-

тиде

и т. д. П р и

этом

с возрастанием длины

пептида

величина

электрострикционного

эффекта приближается к

значению, х а р а к ­

теризующему электрострнкцию от пары ионов [144].

Поэтому

было

предложено,

что

в случае тетрапептидов

и более

длинных

пептидов далеко расположенные заряды действуют как индиви­

дуальные ионы, и,

таким

образом

 

Д ф 4 . . . . д и п = А ф п а р ы

«.нов =

- 1 7 - ° ем»/моль.

(29>

В табл. 1 даны экспериментально полученные АФ^ значения величии объемных эффектов в реакциях, сопровождающихся образованием ионов и диполяриых ионов аминокислот и пептидов, а т а к ж е величины этих эффектов АФ Т , рассчитанные из данных, приведенных на стр. 50. Заметим, что величина объемного эффек­ та при образовании любой пары аминокислотных ионов везде

берется равной АФ 0 н

= 1 7 , 0

см3 /моль,

кроме случаев обра­

зования иона аммония

( А Ф М Н +

= — 18,0

см3 /моль) и

фосфат-

 

 

4

 

 

 

ного иона

( Д Ф р - - = —13,0 см3 /моль).

 

 

Б л и з к и е

значения

экспериментальных

и расчетных

величин

изменения электрострикции в реакциях, включающих в себя аминокислоты и малые пептиды, послужили достаточным основа­ нием для экспериментального и теоретического изучения объем­ ных эффектов при гидролизе белков.

ОБЪЕМНЫЕ ЭФФЕКТЫ ПРИ ГИДРОЛИЗЕ БЕЛКОВ

Собранные нами литературные данные свидетельствуют о том, что,

по-видимому,

первые

дилатометрические

исследования

белков

были предприняты в 1911 г. Галеотти

[119]. С помощью к а п и л л я р ­

ного дилатометра им

было изучено

длительное

гидролитическое

расщепление

яичного

альбумина, а т а к ж е

белков

молока и

сыво­

ротки крови. Результаты этих первых опытов свидетельствовали о том, что гидролиз белков сопровождается уменьшением объема. О величинах ж е объемных эффектов судить было трудно, так как начальные стадии реакции из-за несовершенства техники дилато­ метрии оказались недоступными для исследования.

К настоящему времени дилатометрически исследовано доволь­ но большое число белков, подвергнутых гидролизу. П р и этом ос­ новной результат Галеотти о знаке объемного эффекта подтвер­ дился, несмотря на то что исследовавшиеся белки сильно разли ­ чались по составу и молекулярному весу.

Н а рис. 24, а показан процесс изменения объема, сопровож­ дающего протеолиз казеиногена и желатины трипсином [145],

51

-іѵ, .t/r

a

б

Врет, нин. Время, «ил.

V и с . 24. Процесс изменения объема (а) н количества амшшого азота (6) при протеолпзе казеиногена и желатины трипсином [145]

1 — 2%-ньш казеиноген; 2 — 1%-ный казеиноген;Zß '.— 2%-ная желатина; 4 — 1%-ная желатина

п рп 30° С в фосфатном

буфере,

p H 7,7

паралельно с

изменением

в системе количества

амииного

азота

(рис. 24,6).

Взаимосвязь

между изменением объема-и изменением количества аминного азо­ та представлена на рис. 25. Т а к и е ж е зависимости изображены на рис. 26 для процесса гидролиза казеиногена и желатины пепсином

[146],

проводившегося при

30° С в цитратном буфере, p H 2.2.

Из

полученных данных

следует, что в случае трипсинового

гидролиза отрицательные объемные эффекты д л я казеиногена и

желатины

составляли

соответственно

10,8

и 8,7 см3 /моль

N I i 2 ,

а прп пепсиновом гидролизе — 22,9 и

12,0

см3 /моль

N H 2 .

Р а з л и ­

чие величин объемных эффектов, а т а к ж е

характера

соответству­

ющих кривых на рис. 25 и 26 и позволили

авторам сделать

вывод

о совершенно различном типе атаки ферментом субстрата

в слу­

чае гидролиза трипсином и пепсином.

 

 

 

 

Рассмотрение величин объемных эффектов, наблюдаемых в

растворах

аминокислот

и пептидов (см. табл. 1), позволило Л и н -

дерштрему - Лангу объяснить разнообразные эффекты, характе ­ ризующие протеолиз белков. Основываясь на многих данных, он предложил считать, что при расщеплении пептидных связей в белках электрострикцин не должна превышать

^пептид = - 2 0 с м 3 / м о л ь .

(30)

Эта величина включает в себя т а к ж е небольшое дополнителное сокращение ( ~ —3 см3 /моль) за счет возможной добавочной электрострикцин, вызываемой боковыми заряженными группами аминокислотных остатков после расщепления молекулы белка.

Существенное различие в величинах объемных эффектов было обнаружено при сравнительном исследовании белков, сильно

отличающихся по

молекулярному весу

[147].

К а к следует из

рис. 27 и 28, расщепление трипсином сравните­

льно низкомолекулярного белка клупеина

(молекулярный вес 5000)

52

р и с. 25. Взаимосвязь между процессами уменьшения объема н увеличения аминного азота при протеоліізе казеиногена и желатины трипсином [145]

j — 4—то же, что на рис. 24

Р и с . 2в. Взаимосвязь между процессами уменьшения объема н увеличения амііпного азота при протеолнзе назе"ногсна п телатины пененном [140]

1 — 2.84%-ныіі казеиноген; 2 — 1.46%-ный

к^зеиногснГзА"^'з'''?Г?іая желатина; 4 — « %-ная желатина

/ООО

Р и с . 27. Уменьшение объема при протео­ лнзе трипсином ß-лактоглобу.иша н илупсина [143, 147]

Число расщепленных связей.

характеризуется отрицательным объемным эффектом, лежащим в пределах 15—20 см3 /моль. Согласно результатам, полученным при расщеплении пептидов, величины этих эффектов легко могут быть, объяснены электрострикцнонным эффектом, сопровождающим раз ­ рыв пептидных связей. Т а к и м образом, объемные эффекты, обус­ ловленные иными причинами, дл я ьлупеина составляют не­ более 2—3 см3 /моль.

В то ж е время уменьшение объема, сопровождающее расщеп ­ ление пептидных связей в более высокомолекулярном и обладаю­

щем более высокой структурной организацией

белке ß - лактогло -

булине (молекулярный

вес 38 ООО), оказалось

равным более чем

40 см3 /моль, и этот отрицательный объемный эффект, как

п о к а з а ­

но на рис. 27 и 28, сильно

меняется в ходе расщепления .

 

!50\

 

 

 

1

 

 

wo

 

 

 

 

 

 

50

 

 

 

-40'

 

 

 

 

 

 

Уменьшение

объема, со­

 

 

 

 

Р и с . 28.

Н,Е0ННЯ?г0

R,CÖ0 *

H3NR2

провождающее гидролиз

пептидно»

опции, для ß-лаьтоглобулшіа [38]

4

6

8

 

10

 

 

Vuело расщепленных

ейязей

 

 

 

В связи с тем, что дополнительное сокращение в сильной сте­ пени связано с начальными стадиями протеолиза, Линдерштрем - Ланг особенно подчеркивал важность «обнаженных» и, таким об­ разом, доступных в первые моменты протеолиза для фермента пеп­ тидных связей субстрата, после разрыва которых доступными ста­ новятся и остальные.

К а к следует из результатов, полученных при 40° С, общее из ­ менение объема ß-лактоглобулина при исчерпывающем расщеп­ лении трипсином равно —1400 см3 /моль белка, а полное число расщепляемых пептидных связей составляет 35. Тогда объемный і эффект, обусловленный появлением электрострикции за счет об­ разования ионных аминных и карбоксильных пар, согласно у р а в ­ нению (30), должен быть равен 35•(—20) = —700 см3 /моль. Ка ­ ким ж е образом объяснить то, что наблюдаемая величина на 700 см3 /моль больше?

Частично это дополнительное изменение объема пытались объяснить разрушением вторичной структуры белка [147, 148], как необходимой предпосылкой для расщепления той части пептид­ ных связей, которая недоступна ферменту при структурной ор­ ганизации субстрата в нативном состоянии. Действительно, было показано, что при денатурации яичного альбумина 6—8 M моче­ виной при 30° С происходит уменьшение объема на 300—

54

380 см3 /моль [149, 150]. Уменьшение объема

было т а к ж е обнару­

жено и при денатурации белка кислотами

[78].

В случае ß-лактоглобулпна оказалось, что денатурация его щелочью приводит к уменьшению объема на 200 см 3 /моль, а моче­

виной на 250 см3 /моль [151,

152].

К а к показал протеолиз

пепсином при 27° С предварительно

денатурированного щелочью ß - лактоглобулина [153], объемный эффект, сопровождающий расщепление белка, постоянен во вре ­ мени и дает величину —24,2 см 3 /моль разорванной пептидной связи, что значительно ближе к ожидаемой величине(—20 см3 /моль).

Однако, к а к мы видим, весь дополнительный

объемный эффект

у ß - лактоглобулииа предварительной

структурной

перестройкой

молекул белка в дентурации объяснен быть не может.

Клотц [38] заметил также, что в

то время

как

электрострик-

циоииый эффект должен вызывать уменьшение объема у сыворо­ точного альбумина человека на 1800 см3 /моль, а у яичного аль ­ бумина на 730 см3 /моль, экспериментальные величины, получае­ мые для этих белков, существенно превосходят указанные теоре­ тические.

Ыа основании этих расхождений Клотц предложил считать, что в начальных этапах атаки высокомолекулярного субстрата фер­

ментом происходит изменение не только структуры

молекулы

белка. П р и этом

(что

особенно ярко иллюстрируется

результа ­

тами расщепления

при

низких температурах) вода, первоначаль­

но структурированная

около неполяриых участков

белковой

мо­

л е к у л ы и имеющая там плотность, близкую к плотности

льда,

так­

ж е меняет свою структуру,

а именно, происходит плавление

этой

льдоподобиой воды, что должно

сопровождаться

уменьшением

.объема (см. рис. 10).

 

 

 

 

 

 

Т а к и м

образом, следует

вывод

о том, что величину

объемного

•эффекта,

наблюдаемого

при

гидролизе белков, можно

обосновать

с помощью двух явлений. Первое

из них заключается

в том,

что

в процессе расщепления пептидных связей в среде происходит образование новых з а р я ж е н н ы х аминных и карбоксильных групп. Взаимодействие этих групп с водой приводит к электрострикционному эффекту, равному около —20 см3 /моль. Кроме того, в про­ цессе гидролиза изменяется первоначальная структура белковой молекулы, образуются субъедииицы, обнажаются группы, ранее недоступные растворителю, и т. д. Поэтому вторым фактором, определяющим величину объемного эффекта при гидролизе бел­ ков, является изменение системы внутри- и межмолекулярных взаимодействий в растворе белка.

V

О Б Ъ Е М Н Ы Е Э Ф Ф Е К Т Ы , С О П Р О В О Ж Д А Ю Щ И Е К О Н Ф О Р М А Ц И О І Ш Ы Е

П Е Р Е Х О Д Ы В Б Е Л К А Х

НАБУХАНИЕ И РАСТВОРЕНИЕ

Прежде чем обратиться к рассмотрению конформационных пере ­

ходов в белках, нельзя не затронуть вопрос об измененпи

объема

белка

при переводе его из твердой

фазы в раствор. Е с л и

п р и н я т ь

точку

зрения о том, что в растворе

большинство полярных групп

белка

обращено к растворителю [44] то, по-видимому, растворе­

ние белка есть процесс наибольшего пасыщения межмолекуляр ­ ными взаимодействиями его полярных групп с диполями воды. Сле­ довательно, дилатометрические исследования растворения белков могут привести к обнаружению значительных объемных эффек­ тов, вызванных электрострикцпей воды.

Ввиду необычайной простоты выполнения, эксперименты по исследованию изменения объема при намачивании различных ве­ ществ ведутся у ж е с начала X I X века [154—161]. И в первых ж е работах было замечено, что при этом наблюдается уменьшение объема системы и выделяется тепло.

Исследование процессов набухания и растворения сыграло большую роль при изучении гидратации белков. Д л я этой цели с помощью капиллярного дилатометра изучали кинетику погло­

щения влаги при помещении в воду сухого материала.

Т а к были

исследованы шерсть

[162,

163], коллаген

[164—166],

желатина

[59, 60, 72,161, 167-

171] и

другие вещества

[159, 161,

172 - 174] .

Е щ е в 1870 г. К в и и к [159] использовал дилатометрию д л я по­ лучения количественных сведений об изменении объема при на­ бухании в воде сваренного белка куриного яйца . Найденные им. величины уменьшения объема (—1,3—5,2 • 10~2 см3 /г) очень близ­ к и к значениям объемных эффектов, полученных позднее у ж е с помощью более совершенной экспериментальной техники.

Наибольшее число работ в области дилатометрии набухания было проведепо на желатине. С изучением свойств этого белка связано т а к ж е создание многочисленных разновидностей изме­ рителей объемных эффектов.

С

помощью специально сконструированного

дилатометра

(рис.

16) Сведберг [72] наблюдал изменение объема

замкнутой

системы при переносе сухих желатиновых пластинок из керосина в воду. Им был обнаружен отрицательный объемный эффект, составлявший — 5 , 4 - Ю - 2 см/г при 35° С. Б ы л о показано, что

56

величина объемного эффекта зависит от содержания воды в жела ­ тине. П р и предварительном насыщении желатины водой до 0,4 г воды на 1 г белка объемный эффект уменьшается до—2,1 • 10~2 см3 /г. Добавление в систему сильных кислот и оснований тоже приводи­ л о к уменьшению величины объемного эффекта, однако слабые кислоты, нейтральные соли и неэлектролиты на величину объем­

ного эффекта практически

ппкакого в л и я н и я не

оказывали .

К уменьшению эффекта

приводило также увеличение температуры

•среды

в интервале

от

30

до 48° С.

 

 

П р и

дилатометрическом

исследовании

набухания

желатины

в зависимости от p H

[60] было обнаружено,

что величина предель­

ного объемного эффекта, характеризующего процесс, имеет макси­

мальное значение в

изоэлектрической

зоне,

т. е. при

p H ~

5.

Из рис. 29, где приведены

экспериментальные

точки, следует,

что

к р и в а я помимо максимума

в точке рЫ 5 имеет хорошо

выражен ­

ный

минимум вблизи

p H

2.

 

 

 

 

 

 

Однако

более поздние

исследования

того

ж е процесса, прове­

денные Фридманом и

Б р а у н о м [170], показали,

что в описанных

выше экспериментах

область

p H 4—6 не была

изучена

достаточ­

но

детально.

 

 

 

 

 

 

 

 

Прежде

всего Фридман

и

Б р а у н изучили

кинетику

процесса

изменения

объема в

системе

желатина

— вода. К а к следует

из

рис.

30, завершение процесса при 10° С

наступает через 8 часов

после введения желатины в контакт с водой. Все последующие измерения объемных эффектов проводили в течение этого времени. На рис. 30 приведена также зависимость от времени отношения величины объемного эффекта к количеству впитанной белком во­ ды. Х а р а к т е р этой зависимости указывает на то, что величина объемного эффекта пропорциональна количеству поглощенной

воды, что свидетельствует о наличии электрострикционного

эф­

фекта.

 

 

Исследование зависимости объемного эффекта от p H ,

как

вид­

но из рис. 31, в области p H 4—6 привело к результату,

противо­

положному тому, какой был известен ранее (рис. 29). Кривые на

рис.

 

31 имеют

явную

тенденцию

к минимуму в указанной зоне

p H .

Этот

минимум расположен

между двумя максимумами п р и

p H

~

3,5

и в

области

p H

6—7.

Кроме того, помимо минимума

в кислой

зоне

при p H

~ 2

(рис.

29) на рис. 31 имеется еще один

минимум

в щелочной зоне, где п р и p H 13 величина объемного эф­

фекта

падает

до н у л я .

 

 

О степени гидратации белков и о величинах электрострикции можно судить т а к ж е по разнице в величинах удельного объема сухого белка и кажущегося объема белка, находящегося в - р а с ­ творе.

Объемный эффект при полном растворении белка, по-видимо­ му, впервые достаточно корректно был исследован в 1913 г. Ч и - ком и Мартином [175]. Удельные объемы сухих препаратов казеи­ ногена, яичного альбумина, сывороточного альбумина и сыворо-

57

Р и с. 29. Зависимость отрицательного объемного аффекта при набухаіпш же­ латины от величины pH [во]

Максимум эффекта

вблизи pH 5, т. е.

в лзовлсктрпческой

аонс

Р и с .

30. Изменение

объема системы

в процессе

набухания

желатины при

І0°С

[170]

 

 

1 — изменение объема, отнесенное к і г Оухой желатины; 2 — изменение объе­ ма, отпесеиное к 1 г впитанной воды

Время, часы

Р и с . 31. Зависимость

отрицательного

объемного эффекта при

набухании же­

латины от величины

pH

[170]

В пэоэлектрической

зоне вблизи pH Ь

кривая характеризуется

минимумом

точного глобулина были рассчитаны ими из

величин

плотностей,

измеренных

в пикнометре,

когда белок

находился

в

бензоле.

К а ж у щ и е с я

ж е объемы были получены из значений

плотностей

растворов белка. Разность этих величин достигала

— 8 - Ю - 2

см3 /г.

Т а к и е ж е измерения

Гауровица [21], проведенные

на

яичном аль ­

бумине, привели к

величине

объемного эффекта

— 6 - Ю - 2

см 3 /г .

В случае миоглобина величина объемного

эффекта при

переводе

58

белка из кристаллического состояния

в раствор

оказалась

рав­

н о й — 3 , 9 - Ю - 2 см3 /г [176]. Эти и другие

[177, 178]

измерения

поз­

воляют считать, что растворение различных белков приводит к уменьшению объема на величину того же порядка, что и при набу­ хании.

Уменьшение объема, наблюдающееся при набухании и раство­ рении белков, по-видимому, в с и л ь н о й степени зависит от взаимо­ действия групп боковых радикалов аминокислотных остатков с молекулами воды. Однако если провести оцеику величины объем­

ного эффекта, исходя из электрострикции, обусловленной

парой

з а р я ж е н н ы х групп (см. разделы I I u I V ) , то оказывается,

что ве­

личина объемного эффекта, обусловленного этой причиной, для многих белков приблизительно вдвое меньше, чем наблюдают при набухании и растворении [21], несмотря на то, что по этой оценке все полярные группы должны находиться на поверхности взаимо­ действия с водой. Этот результат свидетельствует о том, что объем­ ный эффект набухания и растворения может зависеть еще п от заполнения молекулами воды свободного пространства, имевше­ гося в сухом препарате. В случае белков, образующих в сухом состоянии кристаллы, часть объемного эффекта, наблюдаемого при набухании и растворении, может быть связана с характером упа­ ковки молекул белка, имевшей место в кристаллической решетке.

ПЕРЕХОД КЛУБОК-СПИРАЛЬ В ИСКУССТВЕННЫХ ПОЛИПЕПТИДАХ

Хорошо известно, что полипептидные цепи белков бывают в зна­ чительной степени спирализованы. При этом степень спирализации существенным образом зависит от условий, в которых находит­ ся белок [3, 21, 151]. Различные физнко-хнмические реакции могут приводить к повышению или понижению числа аминокислот­ ных остатков, включенных в спираль . П р и этом большинство бел­ ков не может быть спнрализованиыми полностью.

В то ж е время различные синтетические полипептиды, состоя­ щие из одного вида аминокислотных остатков, способны образовы­ вать стопроцентные спиральные структуры. Эти полиаминокис­ лоты представляют собой удобную модель для изучения спираль - ностн белков.

П р и переходе из

одной конформации в другую в природном

белке происходит перераспределение не только

водородных свя­

зей, определяющих

спиральную структуру .

Конформационные

переходы могут сопровождаться также перераспределением внутри­ молекулярных взаимодействий между боковыми радикалами амино­ кислотных остатков. Выявлению эффекта, обусловленного только изменением процента спиральиости в белке, может способствовать

изучение процессов,

сопровождающих переход клубок - спираль

у модельных систем,

т. е. у искусственных полипептидов.

59

Соседние файлы в папке книги из ГПНТБ