
книги из ГПНТБ / Замятнин, А. А. Дилатометрия растворов белков
.pdfП ри исследовании специфичности аргиназы из печени овцы впер вые были количественно связаны процессы расщепления субстрата и изменения объема [57]. G помощью указанного фермента про изводили расщепление равновесового рацемата d- и Z-аргинпыа и одного из оптических изомеров. Д л я характеристики наблюдав шегося объемного эффекта было предложено пользоваться вели чиной константы сокращения (к), которая характеризует изме нение кажущегося мольного объема субстрата при ферментатив
ном |
гидролизе |
и |
определяется |
уравнением: |
|
|
|||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
(28) |
где |
A F — уменьшение |
объема (см3 ), наблюдаемое |
в дилатометре, |
||||||||
W — вес |
субстрата, |
а |
М2 |
— его |
молекулярный |
вес. Д л я |
раце |
||||
мата |
величина |
к |
оказалась |
равной 2,53 |
см3 /моль, а для |
одного |
|||||
изомера — 5,02 |
см3 /моль, что свидетельствует о высокой специ |
||||||||||
фичности |
фермента. |
|
|
|
|
|
|
|
|||
Целый ряд дилатометрических исследований был проведен |
|||||||||||
также и иа других |
аминокислотах и пептидах при различных ви |
||||||||||
дах |
гидролиза |
[131, |
132]. |
|
|
|
|
|
|||
Говоря об объемных эффектах в растворах аминокислот и бел |
|||||||||||
ков, |
нельзя не |
отметить работы |
Роны и |
Фишгольда [133—135], |
а также Вебера и Нахмапзона [136, 137], которые явились пред посылкой для необычайно тщательных исследований объемных эффектов при протеолизе аминокислот, пептидов и белков, про водившихся под руководством Лнндерштрема - Лапга . В резуль тате таких исследований были получены не только новые данные о
величинах объемных |
эффектов, но и дапо теоретическое описание |
того, за счет к а к и х |
явлений эти объемные эффекты возникают . |
Линдерштрем - Лапг с сотрудниками на основании литературных данных [17, 133—139], а также базируясь на собственных результа тах [74, 75, 104, 140], выполненных с помощью модифицирован ного двухпузырькового дилатометра, рассмотрели объемные эф фекты реакций, в которых происходят различные превращения аминокислот и пептидов [76, 141—143]. В результате этих иссле дований оказалось возможным получить величины объемных эф фектов, вызванных электрострикцией воды вблизи ионогенных групп растворенных веществ. Средние величины объемных эф фектов в системах, содержащих диполярные ионы, такие как аминокислоты и пептиды [140—143], даны ниже:
Образование |
нары |
зарядов |
Объемный эффект, см»/моль |
|||
Ашшокпслотный |
диполь |
(1 дин) |
—13,0 |
|||
Дшіептпдный |
диполь (2 дпп) |
—15,5 |
||||
Трипептидпый |
диполь |
(3 дин) |
||||
—16,5 |
||||||
Тетрапептидный |
диполь |
(4 дип), а |
||||
—17,0 |
||||||
также диполи более высокого порядка |
||||||
|
(4, . . . дип)
50
Н а основании приведенных данных можно сделать |
вывод о |
том, что в аминокислотах противоположно заряженные |
аминиые |
и карбоксильные группы так близки друг к другу, что пх ре зультирующее влияние на окружающие молекулы воды меньше,
чем у |
более удаленных друг от друга зарядов в дипептнде, трипеп- |
||||
тиде |
и т. д. П р и |
этом |
с возрастанием длины |
пептида |
величина |
электрострикционного |
эффекта приближается к |
значению, х а р а к |
|||
теризующему электрострнкцию от пары ионов [144]. |
Поэтому |
||||
было |
предложено, |
что |
в случае тетрапептидов |
и более |
длинных |
пептидов далеко расположенные заряды действуют как индиви
дуальные ионы, и, |
таким |
образом |
|
Д ф 4 . . . . д и п = А ф п а р ы |
«.нов = |
- 1 7 - ° ем»/моль. |
(29> |
В табл. 1 даны экспериментально полученные АФ^ значения величии объемных эффектов в реакциях, сопровождающихся образованием ионов и диполяриых ионов аминокислот и пептидов, а т а к ж е величины этих эффектов АФ Т , рассчитанные из данных, приведенных на стр. 50. Заметим, что величина объемного эффек та при образовании любой пары аминокислотных ионов везде
берется равной АФ „ 0 н |
= —1 7 , 0 |
см3 /моль, |
кроме случаев обра |
||
зования иона аммония |
( А Ф М Н + |
= — 18,0 |
см3 /моль) и |
фосфат- |
|
|
|
4 |
|
|
|
ного иона |
( Д Ф р - - = —13,0 см3 /моль). |
|
|
||
Б л и з к и е |
значения |
экспериментальных |
и расчетных |
величин |
изменения электрострикции в реакциях, включающих в себя аминокислоты и малые пептиды, послужили достаточным основа нием для экспериментального и теоретического изучения объем ных эффектов при гидролизе белков.
ОБЪЕМНЫЕ ЭФФЕКТЫ ПРИ ГИДРОЛИЗЕ БЕЛКОВ
Собранные нами литературные данные свидетельствуют о том, что,
по-видимому, |
первые |
дилатометрические |
исследования |
белков |
||
были предприняты в 1911 г. Галеотти |
[119]. С помощью к а п и л л я р |
|||||
ного дилатометра им |
было изучено |
длительное |
гидролитическое |
|||
расщепление |
яичного |
альбумина, а т а к ж е |
белков |
молока и |
сыво |
ротки крови. Результаты этих первых опытов свидетельствовали о том, что гидролиз белков сопровождается уменьшением объема. О величинах ж е объемных эффектов судить было трудно, так как начальные стадии реакции из-за несовершенства техники дилато метрии оказались недоступными для исследования.
К настоящему времени дилатометрически исследовано доволь но большое число белков, подвергнутых гидролизу. П р и этом ос новной результат Галеотти о знаке объемного эффекта подтвер дился, несмотря на то что исследовавшиеся белки сильно разли чались по составу и молекулярному весу.
Н а рис. 24, а показан процесс изменения объема, сопровож дающего протеолиз казеиногена и желатины трипсином [145],
51
-іѵ, .t/r |
a |
б |
Врет, нин. Время, «ил.
V и с . 24. Процесс изменения объема (а) н количества амшшого азота (6) при протеолпзе казеиногена и желатины трипсином [145]
1 — 2%-ньш казеиноген; 2 — 1%-ный казеиноген;Zß '.— 2%-ная желатина; 4 — 1%-ная желатина
п рп 30° С в фосфатном |
буфере, |
p H 7,7 |
паралельно с |
изменением |
в системе количества |
амииного |
азота |
(рис. 24,6). |
Взаимосвязь |
между изменением объема-и изменением количества аминного азо та представлена на рис. 25. Т а к и е ж е зависимости изображены на рис. 26 для процесса гидролиза казеиногена и желатины пепсином
[146], |
проводившегося при |
30° С в цитратном буфере, p H 2.2. |
Из |
полученных данных |
следует, что в случае трипсинового |
гидролиза отрицательные объемные эффекты д л я казеиногена и
желатины |
составляли |
соответственно |
10,8 |
и 8,7 см3 /моль |
N I i 2 , |
|
а прп пепсиновом гидролизе — 22,9 и |
12,0 |
см3 /моль |
N H 2 . |
Р а з л и |
||
чие величин объемных эффектов, а т а к ж е |
характера |
соответству |
||||
ющих кривых на рис. 25 и 26 и позволили |
авторам сделать |
вывод |
||||
о совершенно различном типе атаки ферментом субстрата |
в слу |
|||||
чае гидролиза трипсином и пепсином. |
|
|
|
|
||
Рассмотрение величин объемных эффектов, наблюдаемых в |
||||||
растворах |
аминокислот |
и пептидов (см. табл. 1), позволило Л и н - |
дерштрему - Лангу объяснить разнообразные эффекты, характе ризующие протеолиз белков. Основываясь на многих данных, он предложил считать, что при расщеплении пептидных связей в белках электрострикцин не должна превышать
^пептид = - 2 0 с м 3 / м о л ь . |
(30) |
Эта величина включает в себя т а к ж е небольшое дополнителное сокращение ( ~ —3 см3 /моль) за счет возможной добавочной электрострикцин, вызываемой боковыми заряженными группами аминокислотных остатков после расщепления молекулы белка.
Существенное различие в величинах объемных эффектов было обнаружено при сравнительном исследовании белков, сильно
отличающихся по |
молекулярному весу |
[147]. |
К а к следует из |
рис. 27 и 28, расщепление трипсином сравните |
|
льно низкомолекулярного белка клупеина |
(молекулярный вес 5000) |
52
р и с. 25. Взаимосвязь между процессами уменьшения объема н увеличения аминного азота при протеоліізе казеиногена и желатины трипсином [145]
j — 4—то же, что на рис. 24
Р и с . 2в. Взаимосвязь между процессами уменьшения объема н увеличения амііпного азота при протеолнзе назе"ногсна п телатины пененном [140]
1 — 2.84%-ныіі казеиноген; 2 — 1.46%-ный
к^зеиногснГзА"^'з'''?Г?іая желатина; 4 — « %-ная желатина
/ООО
Р и с . 27. Уменьшение объема при протео лнзе трипсином ß-лактоглобу.иша н илупсина [143, 147]
Число расщепленных связей.
характеризуется отрицательным объемным эффектом, лежащим в пределах 15—20 см3 /моль. Согласно результатам, полученным при расщеплении пептидов, величины этих эффектов легко могут быть, объяснены электрострикцнонным эффектом, сопровождающим раз рыв пептидных связей. Т а к и м образом, объемные эффекты, обус ловленные иными причинами, дл я ьлупеина составляют не более 2—3 см3 /моль.
В то ж е время уменьшение объема, сопровождающее расщеп ление пептидных связей в более высокомолекулярном и обладаю
щем более высокой структурной организацией |
белке ß - лактогло - |
|||||
булине (молекулярный |
вес 38 ООО), оказалось |
равным более чем |
||||
40 см3 /моль, и этот отрицательный объемный эффект, как |
п о к а з а |
|||||
но на рис. 27 и 28, сильно |
меняется в ходе расщепления . |
|
||||
!50\ |
|
|
|
1 |
|
|
wo |
|
|
|
|
|
|
50 |
|
|
|
-40' |
|
|
|
|
|
|
Уменьшение |
объема, со |
|
|
|
|
|
Р и с . 28. |
||
Н,Е0ННЯ?*Нг0 |
R,CÖ0 * |
H3NR2 |
провождающее гидролиз |
пептидно» |
||
опции, для ß-лаьтоглобулшіа [38] |
||||||
4 |
6 |
8 |
|
10 |
|
|
Vuело расщепленных |
ейязей |
|
|
|
В связи с тем, что дополнительное сокращение в сильной сте пени связано с начальными стадиями протеолиза, Линдерштрем - Ланг особенно подчеркивал важность «обнаженных» и, таким об разом, доступных в первые моменты протеолиза для фермента пеп тидных связей субстрата, после разрыва которых доступными ста новятся и остальные.
К а к следует из результатов, полученных при 40° С, общее из менение объема ß-лактоглобулина при исчерпывающем расщеп лении трипсином равно —1400 см3 /моль белка, а полное число расщепляемых пептидных связей составляет 35. Тогда объемный і эффект, обусловленный появлением электрострикции за счет об разования ионных аминных и карбоксильных пар, согласно у р а в нению (30), должен быть равен 35•(—20) = —700 см3 /моль. Ка ким ж е образом объяснить то, что наблюдаемая величина на 700 см3 /моль больше?
Частично это дополнительное изменение объема пытались объяснить разрушением вторичной структуры белка [147, 148], как необходимой предпосылкой для расщепления той части пептид ных связей, которая недоступна ферменту при структурной ор ганизации субстрата в нативном состоянии. Действительно, было показано, что при денатурации яичного альбумина 6—8 M моче виной при 30° С происходит уменьшение объема на 300—
54
380 см3 /моль [149, 150]. Уменьшение объема |
было т а к ж е обнару |
жено и при денатурации белка кислотами |
[78]. |
В случае ß-лактоглобулпна оказалось, что денатурация его щелочью приводит к уменьшению объема на 200 см 3 /моль, а моче
виной на 250 см3 /моль [151, |
152]. |
К а к показал протеолиз |
пепсином при 27° С предварительно |
денатурированного щелочью ß - лактоглобулина [153], объемный эффект, сопровождающий расщепление белка, постоянен во вре мени и дает величину —24,2 см 3 /моль разорванной пептидной связи, что значительно ближе к ожидаемой величине(—20 см3 /моль).
Однако, к а к мы видим, весь дополнительный |
объемный эффект |
||
у ß - лактоглобулииа предварительной |
структурной |
перестройкой |
|
молекул белка в дентурации объяснен быть не может. |
|||
Клотц [38] заметил также, что в |
то время |
как |
электрострик- |
циоииый эффект должен вызывать уменьшение объема у сыворо точного альбумина человека на 1800 см3 /моль, а у яичного аль бумина на 730 см3 /моль, экспериментальные величины, получае мые для этих белков, существенно превосходят указанные теоре тические.
Ыа основании этих расхождений Клотц предложил считать, что в начальных этапах атаки высокомолекулярного субстрата фер
ментом происходит изменение не только структуры |
молекулы |
|||||||
белка. П р и этом |
(что |
особенно ярко иллюстрируется |
результа |
|||||
тами расщепления |
при |
низких температурах) вода, первоначаль |
||||||
но структурированная |
около неполяриых участков |
белковой |
мо |
|||||
л е к у л ы и имеющая там плотность, близкую к плотности |
льда, |
так |
||||||
ж е меняет свою структуру, |
а именно, происходит плавление |
этой |
||||||
льдоподобиой воды, что должно |
сопровождаться |
уменьшением |
||||||
.объема (см. рис. 10). |
|
|
|
|
|
|
||
Т а к и м |
образом, следует |
вывод |
о том, что величину |
объемного |
||||
•эффекта, |
наблюдаемого |
при |
гидролизе белков, можно |
обосновать |
||||
с помощью двух явлений. Первое |
из них заключается |
в том, |
что |
в процессе расщепления пептидных связей в среде происходит образование новых з а р я ж е н н ы х аминных и карбоксильных групп. Взаимодействие этих групп с водой приводит к электрострикционному эффекту, равному около —20 см3 /моль. Кроме того, в про цессе гидролиза изменяется первоначальная структура белковой молекулы, образуются субъедииицы, обнажаются группы, ранее недоступные растворителю, и т. д. Поэтому вторым фактором, определяющим величину объемного эффекта при гидролизе бел ков, является изменение системы внутри- и межмолекулярных взаимодействий в растворе белка.
V
О Б Ъ Е М Н Ы Е Э Ф Ф Е К Т Ы , С О П Р О В О Ж Д А Ю Щ И Е К О Н Ф О Р М А Ц И О І Ш Ы Е
П Е Р Е Х О Д Ы В Б Е Л К А Х
НАБУХАНИЕ И РАСТВОРЕНИЕ
Прежде чем обратиться к рассмотрению конформационных пере
ходов в белках, нельзя не затронуть вопрос об измененпи |
объема |
||
белка |
при переводе его из твердой |
фазы в раствор. Е с л и |
п р и н я т ь |
точку |
зрения о том, что в растворе |
большинство полярных групп |
|
белка |
обращено к растворителю [44] то, по-видимому, растворе |
ние белка есть процесс наибольшего пасыщения межмолекуляр ными взаимодействиями его полярных групп с диполями воды. Сле довательно, дилатометрические исследования растворения белков могут привести к обнаружению значительных объемных эффек тов, вызванных электрострикцпей воды.
Ввиду необычайной простоты выполнения, эксперименты по исследованию изменения объема при намачивании различных ве ществ ведутся у ж е с начала X I X века [154—161]. И в первых ж е работах было замечено, что при этом наблюдается уменьшение объема системы и выделяется тепло.
Исследование процессов набухания и растворения сыграло большую роль при изучении гидратации белков. Д л я этой цели с помощью капиллярного дилатометра изучали кинетику погло
щения влаги при помещении в воду сухого материала. |
Т а к были |
|||
исследованы шерсть |
[162, |
163], коллаген |
[164—166], |
желатина |
[59, 60, 72,161, 167- |
171] и |
другие вещества |
[159, 161, |
172 - 174] . |
Е щ е в 1870 г. К в и и к [159] использовал дилатометрию д л я по лучения количественных сведений об изменении объема при на бухании в воде сваренного белка куриного яйца . Найденные им. величины уменьшения объема (—1,3—5,2 • 10~2 см3 /г) очень близ к и к значениям объемных эффектов, полученных позднее у ж е с помощью более совершенной экспериментальной техники.
Наибольшее число работ в области дилатометрии набухания было проведепо на желатине. С изучением свойств этого белка связано т а к ж е создание многочисленных разновидностей изме рителей объемных эффектов.
С |
помощью специально сконструированного |
дилатометра |
(рис. |
16) Сведберг [72] наблюдал изменение объема |
замкнутой |
системы при переносе сухих желатиновых пластинок из керосина в воду. Им был обнаружен отрицательный объемный эффект, составлявший — 5 , 4 - Ю - 2 см/г при 35° С. Б ы л о показано, что
56
величина объемного эффекта зависит от содержания воды в жела тине. П р и предварительном насыщении желатины водой до 0,4 г воды на 1 г белка объемный эффект уменьшается до—2,1 • 10~2 см3 /г. Добавление в систему сильных кислот и оснований тоже приводи л о к уменьшению величины объемного эффекта, однако слабые кислоты, нейтральные соли и неэлектролиты на величину объем
ного эффекта практически |
ппкакого в л и я н и я не |
оказывали . |
||||
К уменьшению эффекта |
приводило также увеличение температуры |
|||||
•среды |
в интервале |
от |
30 |
до 48° С. |
|
|
П р и |
дилатометрическом |
исследовании |
набухания |
желатины |
||
в зависимости от p H |
[60] было обнаружено, |
что величина предель |
ного объемного эффекта, характеризующего процесс, имеет макси
мальное значение в |
изоэлектрической |
зоне, |
т. е. при |
p H ~ |
5. |
|||||
Из рис. 29, где приведены |
экспериментальные |
точки, следует, |
что |
|||||||
к р и в а я помимо максимума |
в точке рЫ 5 имеет хорошо |
выражен |
||||||||
ный |
минимум вблизи |
p H |
2. |
|
|
|
|
|
|
|
Однако |
более поздние |
исследования |
того |
ж е процесса, прове |
||||||
денные Фридманом и |
Б р а у н о м [170], показали, |
что в описанных |
||||||||
выше экспериментах |
область |
p H 4—6 не была |
изучена |
достаточ |
||||||
но |
детально. |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Прежде |
всего Фридман |
и |
Б р а у н изучили |
кинетику |
процесса |
|||||
изменения |
объема в |
системе |
желатина |
— вода. К а к следует |
из |
|||||
рис. |
30, завершение процесса при 10° С |
наступает через 8 часов |
после введения желатины в контакт с водой. Все последующие измерения объемных эффектов проводили в течение этого времени. На рис. 30 приведена также зависимость от времени отношения величины объемного эффекта к количеству впитанной белком во ды. Х а р а к т е р этой зависимости указывает на то, что величина объемного эффекта пропорциональна количеству поглощенной
воды, что свидетельствует о наличии электрострикционного |
эф |
|
фекта. |
|
|
Исследование зависимости объемного эффекта от p H , |
как |
вид |
но из рис. 31, в области p H 4—6 привело к результату, |
противо |
положному тому, какой был известен ранее (рис. 29). Кривые на
рис. |
|
31 имеют |
явную |
тенденцию |
к минимуму в указанной зоне |
||
p H . |
Этот |
минимум расположен |
между двумя максимумами п р и |
||||
p H |
~ |
3,5 |
и в |
области |
p H |
6—7. |
Кроме того, помимо минимума |
в кислой |
зоне |
при p H |
~ 2 |
(рис. |
29) на рис. 31 имеется еще один |
||
минимум |
в щелочной зоне, где п р и p H 13 величина объемного эф |
||||||
фекта |
падает |
до н у л я . |
|
|
О степени гидратации белков и о величинах электрострикции можно судить т а к ж е по разнице в величинах удельного объема сухого белка и кажущегося объема белка, находящегося в - р а с творе.
Объемный эффект при полном растворении белка, по-видимо му, впервые достаточно корректно был исследован в 1913 г. Ч и - ком и Мартином [175]. Удельные объемы сухих препаратов казеи ногена, яичного альбумина, сывороточного альбумина и сыворо-
57
Р и с. 29. Зависимость отрицательного объемного аффекта при набухаіпш же латины от величины pH [во]
Максимум эффекта |
вблизи pH 5, т. е. |
в лзовлсктрпческой |
аонс |
Р и с . |
30. Изменение |
объема системы |
|
в процессе |
набухания |
желатины при |
|
І0°С |
[170] |
|
|
1 — изменение объема, отнесенное к і г Оухой желатины; 2 — изменение объе ма, отпесеиное к 1 г впитанной воды
Время, часы
Р и с . 31. Зависимость |
отрицательного |
|
объемного эффекта при |
набухании же |
|
латины от величины |
pH |
[170] |
В пэоэлектрической |
зоне вблизи pH Ь |
|
кривая характеризуется |
минимумом |
точного глобулина были рассчитаны ими из |
величин |
плотностей, |
||||||
измеренных |
в пикнометре, |
когда белок |
находился |
в |
бензоле. |
|||
К а ж у щ и е с я |
ж е объемы были получены из значений |
плотностей |
||||||
растворов белка. Разность этих величин достигала |
— 8 - Ю - 2 |
см3 /г. |
||||||
Т а к и е ж е измерения |
Гауровица [21], проведенные |
на |
яичном аль |
|||||
бумине, привели к |
величине |
объемного эффекта |
— 6 - Ю - 2 |
см 3 /г . |
||||
В случае миоглобина величина объемного |
эффекта при |
переводе |
58
белка из кристаллического состояния |
в раствор |
оказалась |
рав |
н о й — 3 , 9 - Ю - 2 см3 /г [176]. Эти и другие |
[177, 178] |
измерения |
поз |
воляют считать, что растворение различных белков приводит к уменьшению объема на величину того же порядка, что и при набу хании.
Уменьшение объема, наблюдающееся при набухании и раство рении белков, по-видимому, в с и л ь н о й степени зависит от взаимо действия групп боковых радикалов аминокислотных остатков с молекулами воды. Однако если провести оцеику величины объем
ного эффекта, исходя из электрострикции, обусловленной |
парой |
з а р я ж е н н ы х групп (см. разделы I I u I V ) , то оказывается, |
что ве |
личина объемного эффекта, обусловленного этой причиной, для многих белков приблизительно вдвое меньше, чем наблюдают при набухании и растворении [21], несмотря на то, что по этой оценке все полярные группы должны находиться на поверхности взаимо действия с водой. Этот результат свидетельствует о том, что объем ный эффект набухания и растворения может зависеть еще п от заполнения молекулами воды свободного пространства, имевше гося в сухом препарате. В случае белков, образующих в сухом состоянии кристаллы, часть объемного эффекта, наблюдаемого при набухании и растворении, может быть связана с характером упа ковки молекул белка, имевшей место в кристаллической решетке.
ПЕРЕХОД КЛУБОК-СПИРАЛЬ В ИСКУССТВЕННЫХ ПОЛИПЕПТИДАХ
Хорошо известно, что полипептидные цепи белков бывают в зна чительной степени спирализованы. При этом степень спирализации существенным образом зависит от условий, в которых находит ся белок [3, 21, 151]. Различные физнко-хнмические реакции могут приводить к повышению или понижению числа аминокислот ных остатков, включенных в спираль . П р и этом большинство бел ков не может быть спнрализованиыми полностью.
В то ж е время различные синтетические полипептиды, состоя щие из одного вида аминокислотных остатков, способны образовы вать стопроцентные спиральные структуры. Эти полиаминокис лоты представляют собой удобную модель для изучения спираль - ностн белков.
П р и переходе из |
одной конформации в другую в природном |
|
белке происходит перераспределение не только |
водородных свя |
|
зей, определяющих |
спиральную структуру . |
Конформационные |
переходы могут сопровождаться также перераспределением внутри молекулярных взаимодействий между боковыми радикалами амино кислотных остатков. Выявлению эффекта, обусловленного только изменением процента спиральиости в белке, может способствовать
изучение процессов, |
сопровождающих переход клубок - спираль |
у модельных систем, |
т. е. у искусственных полипептидов. |
59