
- •1. Взаимодействие фотонов оптического излучения с молекулами. Квантово-механические основы и последствия.
- •1.1. Основные характеристики оптического излучения
- •1.2. Основные квантово-механические механизмы взаимодействия оптического излучения с атомами и молекулами
- •1.3. Электронные переходы в атомах и молекулах при поглощении квантов оптического излучения.
- •2. Законы поглощения света веществом. Спектрофотометрический анализ. Особенности спектрофотометрии биологических объектов. Некоторые специальные методы спектрофотометрического анализа.
- •2.1. Количественное описание поглощения света растворами. Закон Бугера-Ламберта-Бера.
- •2.2. Условия выполнения закона Бугера-Ламберта-Бера.
- •2.3. Качественный и количественный спектрофотометрический анализ.
- •2.3.1. Качественный спектрофотометрический анализ.
- •2.3.2. Количественный спектрофотометрический анализ.
- •2.4. Некоторые специальные методы спектрофотометрии
- •2.5. Особенности спектрофотометрии биологических объектов
- •Оптические неоднородности
- •3. Вторичное излучение света молекулами объекта. Люминесцентный анализ и особенности его использования для исследования биологических объектов.
- •3.1. Явление фотолюминесценции
- •3.2. Электронные переходы в возбужденной молекуле. Законы люминесценции.
- •3.3. Зависимость интенсивности фотолюминесценции от концентрации люминесцирующих молекул. Люминесцентный анализ.
- •3.4. Методы регистрации фотолюминесценции. Спектрофлуориметры. Особенности флуориметрии биологических объектов.
- •3.5. Время жизни возбужденного состояния молекул. Связь между временем жизни возбужденных состояний и квантовым выходом фотолюминесценции.
- •3.6. Влияние окружения люминесцирующих молекул на параметры фотолюминесценции. Флуоресцентные зонды и метки.
- •3.7. Причины снижения интенсивности фотолюминесценции в биологических объектах. Тушение фотолюминесценции. Миграция энергии электронного возбуждения.
- •3.8. Поляризация фотолюминесценции.
- •3.9. Замедленная флуоресценция и фосфоресценция.
- •3.10. Хемилюминесценция биологических систем. Хемилюминесцентный анализ.
- •3.11. Проточная цитофлуориметрия.
- •3.12. Влияние размера люминесцирующей полупроводниковой частицы на ее свойства как люминофора. Квантовые точки.
- •В обычных полупроводниках радиус экситона Бора (ах) определяет размер областей электронного возбуждения.
- •Применение квантовых точек в качестве флуорофоров в медицине и биологии
- •Молекулярные сенсоры
- •Молекулярная диагностика
- •Гибридные молекулярные устройства
- •4.Биофизические основы некоторых фотобиологических процессов. Применение оптического излучения в медицине.
- •4.1. Общие закономерности фотохимических процессов в биомолекулах.
- •4.1.1. Кинетика однофотонных необратимых фотохимических реакций
- •4.1.2. Кинетика однофотонных обратимых фотохимических реакций
- •4.1.2. Кинетика многофотонных фотохимических реакций
- •4.2. Спектры действия фотопревращений молекул и фотобиологических процессов.
- •4.2.1 Спектры действия фотобиологических эффект при небольшой постоянной дозе облучения
- •4.2.2.Спектры действия при постоянной величине фотобиологического эффекта.
- •4.2.3.Спектры действия биологических ответов, зависящих от скорости фотопревращения активных молекул.
- •4.3. Фотомодификация олигомерных и однокомпонентных белков под действием ультрафиолетового излучения.
- •4.3.1. Естественное (солнечное) ультрафиолетовое излучение.
- •4.3.2. Кинетика фотоинактивации белковых молекул.
- •4.3.3. Природа первичных продуктов фотолиза аминокислот и их остатков в белках.
- •Значения для
- •4.4. Действие ультрафиолетового излучения на биологические мембраны.
- •4.5. Действие ультрафиолетового излучения на нуклеиновые кислоты.
2.2. Условия выполнения закона Бугера-Ламберта-Бера.
Как и все физические законы, закон Бугера-Ламберта-Бера выполняется при соблюдении во время измерений определенных условий. Рассмотрим эти условия.
Данный закон будет соблюдаться, если:
тестирующее излучение монохроматично, т.е. все его кванты имеют одинаковую энергию (длину волны, частоту и волновое число);
пучок тестирующего излучения параллелен и падает строго нормально на переднюю границу образца;
сам объект имеет плоскопараллельную форму, т.е. его передняя и задняя (по отношению к источнику излучения) границы представляют собой параллельные друг другу плоскости, и толщина объекта во всех его точках одинакова;
интенсивность тестирующего излучения и среднее время пребывания молекул-хромофоров в состоянии возбуждения после поглощения кванта, таковы, что примесью образующихся в образце молекул в возбужденном состоянии можно было пренебречь;
хромофорные молекулы распределены по объёму объекта равномерно, т.е. концентрация хромофора во всех точках объекта одинакова;
в образце за время измерения не наблюдаются значимые изменения его состава вследствие протекания фотохимических реакций;
все хромофорные молекулы пребывают в одном и том же агрегатном состоянии;
истинное поглощение есть единственная причина снижения числа квантов излучения, попадающих на фотодетектор измеряющего прибора.
Как видно из представленного, требования к тестирующему излучению и свойствам объекта, выполнение которых необходимо для того, чтобы закон Бугера-Ламберта-Бера соблюдался, довольно строги. Рассмотрим теперь, к чему приведет их несоблюдение.
Если тестирующее излучение немонохроматично, т.е. состоит из квантов с разными энергиями (длинами волн, частотами и волновыми числами), то, поскольку величина молярного коэффициента поглощения () для каждого типа квантов будет иметь собственное значение, при последующем расчёте концентрации хромофора в объекте по формуле D = cl будет сделана ошибка (в ней используется величина для вполне конкретной длине волны). Если же анализируется концентрационная зависимость D, то она в таких условиях может сильно отклоняться от линейной.
Если пучок тестирующего излучения, падающий на объект, не параллелен (т.е. является сходящимся или расходящимся), то те кванты света, которые попадут в объект не по нормали, будут иметь другой оптический путь, чем кванты в середине пучка (рис. 3). Из-за этого величина D также окажется измеренной неверно, а концентрация хромофора определена с ошибкой.
Рисунок 3. Схема, иллюстрирующая влияние непараллельности тестирующего пучка излучения на результаты измерения оптической плотности. Если пучок тестирующего излучения J0, как в приведенном примере, расходящийся, то для квантов, близких к его середине оптический путь будет равен толщине образца (l), тогда как кванты, попадающие в объект ненормально, будут иметь оптические пути l’ и l’’, которые значительно отличаются от l. Аналогичная ситуация будет наблюдаться и в случае, если пучок тестирующего излучения будет сходящимся.
Если объект не имеет плоскопараллельной формы (например, измерения проводятся в круглой кювете), его толщина в разных точках будет неодинакова. Следовательно, кванты тестирующего излучения пройдут разные оптические пути, и измеренная величина D будет ошибочна.
Если интенсивность J0 тестирующего излучения избыточно высока, а исследуемые молекулы долго пребывают в возбужденном состоянии после поглощения кванта (например, формируются триплетные возбуждения, см. выше), будет наблюдаться следующее. Во-первых, возбужденные молекулы являются новым типом хромофора с собственной величиной . Во-вторых, за счет формирования долгоживущих возбужденных молекул может заметно упасть концентрация невозбужденных. Наконец, в-третьих, длительно живущие возбужденные молекулы могут успеть поглотить второй квант излучения и перейти в еще более возбужденное состояние. Все указанные процессы приводят к тому, что зависимость D от концентрации хромофора перестает быть линейной, т.е. закон Бугера-Ламберта-Бера перестает соблюдаться.
Если хромофорные молекулы распределены по объему образца неоднородно и концентрация хромофора в разных частях объекта неодинакова, измеряемая оптическая плотность объекта будет занижена.
Попробуем доказать это математически.
Сопоставим однородный и неоднородный объекты при условии, что количество хромофора в обоих случаях одинаково. Для этого введем следующие обозначения:
S - площадь освещенной поверхности объектов, совпадающая с площадью тестирующего пучка монохроматического излучения;
J0 – световой поток, падающий на эту поверхность, выраженный в квантах/секунду;
m – количество хромофора в объектах, выраженное в молях;
dm/dS – поверхностная плотность хромафора
В случае однородного объекта
где С и l – концентрация вещества в объекте (количество вещества в единице объема) и толщина объекта. Согласно закону Бугера-Ламберта-Бера:
где К – поверхностный коэффициент поглощения, равный 10-3 моль-1см2; а J – выходящий из объекта световой поток.
Для неоднородного объекта
При этом вид зависимости dm/dS=f(S) неизвестен.
Разобъем неоднородный объект на такие маленькие фрагменты площадью dS каждый, чтобы неоднородностью распределения хромофора в пределах фрагмента можно было пренебречь. Закон Бугера-Ламберта-Бера в каждом из фрагментов будет выполняться и, соответственно, выходящий из каждого фрагмента световой поток dJ будет равен:
Полный световой поток J’, выходящий из неоднородного объекта площадью S, тогда будет составлять:
Отсюда
Трансформируем последнее уравнение в следующий вид:
Разложим подинтегральное выражение в ряд Тейлора и будет интегрировать его по частям:
Прологарифмировав последнее уравнение с учетом того, что lg(J0/J’)=D’ (оптическая плотность неоднородного объекта), а Km/S = D (оптическая плотность однородного объекта), получим:
Тот факт, что D’ меньше D можно будет считать доказанным, если различающий эти величины логарифм положителен. Логарифм будет положителен, если логарифмируемая величина больше 1. В нашем случае это так, поскольку к 1 под знаком логарифма добавлен квадратичный член разложения в ряд Тейлора, который всегда положителен. Остальные же члены этого ряда будут значительно меньше, и на результат не повлияют. Таким образом, оптическая плотность объекта с неоднородным распределением хромофора всегда меньше, чем оптическая плотность однородного объекта с тем же общим количеством хромофора.
Впрочем, понять, почему D’ меньше D можно и не прибегая к математическим выкладкам, на основании простых логических рассуждений. Действительно, предельный случай неоднородного распределения хромофора в объекте – это случай, когда все хромофорные молекулы сосредоточены в пределах безразмерной точки. Поток света через эту точку будет равен 0, поскольку у неё нулевая площадь поперечного сечения. Таким образом, и оптическая плотность такого, предельно неоднородного, объекта будет равна 0. Все остальные случаи неоднородного распределения хромофора по объекту являются промежуточными между этим, предельным, случаем, и идеально однородным раствором хромофора. Следовательно, и оптическая плотность промежуточных по неоднородности объектов должна быть больше 0, но меньше оптической плотности образца с идеально однородным раствором.
Частным случаем влияния неоднородности распределения хромофора в объекте на его оптическую плотность является так называемый эффект сита. Поскольку этот эффект весьма часто наблюдается в клеточных суспензиях, типичном биологическом объекте, мы рассмотрим его более подробно ниже.
Если во время измерения под влиянием тестирующего излучения в образце во время измерения оптической плотности протекают значимые фотохимические реакции, количество исходных молекул-хромофоров может значительно уменьшится. Вместе с тем, в образце будут появляться продукты фотохимической реакции, которые являются другим типом молекул с новой структурой электронных энергетических уровней (орбиталей). Если молекулы-продукты будут способны к поглощению квантов излучения при той длине волны, при которой проводится измерение, часть измеряемой оптической плотности окажется связана с их присутствием. Однако величина молярного коэффициента поглощения () у молекул-продуктов при длине волны измерения будет иной, чем у исходных молекул, из-за чего расчеты концентрации исходного соединения по формуле D = cl дадут неверный результат.
Если хромофорные молекулы в объекте представлены в нескольких агрегатных формах, например, в виде мономера и димера, то каждая из этих форм будет иметь при длине волны тестирующего излучения собственную величину (обозначим их м и д соответственно). В результате измеренное значение оптической плотности (Dизм) будет равно:
Соотношение же концентраций мономерной и димерной форм хромофора (см и сд) зависит от количества вещества в образце и его растворимости в применяемом растворителе в данных условиях. Чаще всего, это соотношение неизвестно. Нередко неизвестен и д (молярный коэффициент поглощения димерной формы хромофора). Естественно, в таких условиях применение закона Бугера-Ламберта-Бера невозможно, и определение концентрации соединения по величине Dизм даст неверный результат.
Молекулярные агрегаты (ди-, три- , тетрамеры и агрегаты большей величины) обычно начинают формироваться, если концентрация вещества в объекте близка к пределу его растворимости в используемом растворителе. Чтобы избежать их образования, при спектрофотометрии не следует применять растворители, в которых определяемое соединение растворяется плохо, и не следует подвергать исследованию растворы хромофоров очень высокой концентрации.
Если истинное поглощение излучения – не единственная причина снижения количества квантов, попадающих на фотодетектор фотометра (прибора для измерения поглощения света), измеряемая величина оптической плотности окажется завышенной. Соответственно, завышена окажется и рассчитанная величина концентрации хромофора в объекте.
Наиболее частой причиной такого эффекта является наличие в образце рассеивания света. Поскольку это явление чрезвычайно часто встречается в биологических объектах, ему будет посвящен специальный раздел ниже.