Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

Химические редакторы / Маркин В.И. Практическое руководство по использованию ChemWindow 6.0

..pdf
Скачиваний:
170
Добавлен:
16.09.2020
Размер:
2.2 Mб
Скачать

Меню Table (таблица) содержит команды, позволяющие модифицировать и форматировать созданную таблицу (рис. 140). Вход в меню осуществляется путем наведения указателя мыши на слово Table.

Рис. 140. Меню Table

Рассмотрим основные команды данного меню. Чтобы проиллюстрировать действие этих команд, создадим с помощью инструмента

Table Tools таблицу (рис. 141).

Рис. 141. Пример таблицы, созданной с помощью команды Table Tools

Spilt Cell Horizontal (разделить ячейку по горизонтали) – с помощью этой команды можно разделить ячейку, в которой находится курсор, на две по горизонтали. Если поместить курсор в третью ячейку первой строки таблицы, показанной на рисунке 141, и применить эту команду, то получится таблица, показанная на рисунке 142.

Рис. 142. Пример использования команды Spilt Cell Horizontal

141

Spilt Cell Vertical (разделить ячейку по вертикали) – с помощью этой команды можно разделить ячейку в которой находится курсор, на две по вертикали. Если поместить курсор во вторую ячейку первой строки таблицы, показанной на рисунке 141, и применить эту команду, то получится таблица, показанная на рисунке 143.

Рис. 143. Пример использования команды Spilt Cell Vertical

Merge Two Cell Horizontal (объединить ячейки по горизонтали) – это команда, обратная по своему действию команде Spilt Cell Horizontal, позволяет объединить две ячейки в одну. Например, если поместить курсор во вторую ячейку второй строки таблицы, изображенной на рисунке 141, и применить эту команду, то в результате получится таблица представленная на рисунке 144, т.е. происходит объединение ячеек слева направо.

Рис. 144. Пример использования команды Merge Two Cell Horizontal

Merge Two Cell Vertical (объединить ячейки по вертикали) – это команда, обратная по своему действию команде Spilt Cell Vertical, позволяет объединить две ячейки в одну. Например, если поместить курсор в первую ячейку первой строки таблицы, изображенной на рисунке 141, и применить эту команду, то в результате получится таблица, представленная на рисунке 145, т.е. происходит объединение ячеек сверху вниз.

Insert Row (вставить строку) – это команда позволяет вставить строку ниже той, в которой находится курсор. Если поместить курсор в любую ячейку первой строки таблицы, изображенной на рисунке 141, и применить эту команду, то в результате получится таблица, представленная на рисунке 146.

142

Рис. 145. Пример использования команды Merge Two Cell Vertical

Рис. 146. Пример использования команды Merge Two Cell Vertical

Delete Row (удалить строку) – это команда по своему действию является обратной команде Insert Row. Она позволяет удалить ту строку, в которой находится курсор. Если поместить курсор в любую ячейку первой строки таблицы, изображенной на рисунке 146, и применить эту команду, то в результате получится таблица, представленная на рисунке 141.

Insert Column (вставить колонку) – это команда позволяет вставить колонку слева от той в которой находится курсор, причем размер этой колонки будет такой же, как и та, в которой находился курсор. Например, если поместить курсор в любую ячейку первой колонки таблицы, изображенной на рисунке 141, и применить эту команду, то в результате получится таблица, представленная на рисунке 147.

Рис. 147. Пример использования команды Insert Column

Delete Column (удалить колонку) – это команда по своему действию является обратной команде Insert Column. Она позволяет удалить ту колонку, в которой находится курсор. Если поместить курсор в любую ячейку первой колонки таблицы, изображенной на рисунке 147, и

143

применить эту команду, то в результате получится таблица, представленная на рисунке 141.

Format Table (форматировать таблицу). При использовании этой команды появляется диалоговое окно (рис. 148), в котором можно выбрать один из 19 стилей форматирования таблицы (границы, фон ячеек и т.д.). Диалоговое окно состоит из двух частей. Слева приведены возможные стили оформления таблицы, передвигаясь по которым с помощью мыши или клавиш навигации клавиатуры, можно выбрать нужный. Справа наглядный пример таблицы, оформленной выбранным стилем. На рисунке 149 приведен пример использования команды Format Table для форматирования таблицы.

Рис. 148. Диалоговое окно Format Table

abc

abc

abc

 

 

 

abc

abc

abc

abc

abc

abc

 

 

 

Рис. 149. Пример форматирования таблицы с помощью диалога

Format Table

144

Проекционные формулы Ньюмана

Для создания проекционных формул Ньюмана используют инстру-

мент Newman Projection из панели инструментов Other Tools

(см. с. 60). Для создания проекций необходимо активировать инструмент Newman Projection любым удобным Вам способом. Переместить указатель мыши в нужное место рабочего поля, нажать левую кнопку мыши. При этом появится проекция Ньюмана и, пока Вы держите левую кнопку мыши, можно вращать центральную часть проекции. Как только Вы отпустите кнопку мыши, проекция примет окончательный вид. Для того чтобы добавить функциональные группы, можно использовать ранее описанные инструменты Lasso (см. с. 106) или Label (см. с. 127) (рис. 150). Вращение осуществляется на угол, кратный 15º. Если при вращении нажать клавишу CTRL и удерживать ее, то вращение осуществляется на угол кратный 1°.

а)

CH3

б)

 

 

CH3

H3CCH3

Рис. 150. Пример использования инструмента Newman Projection: а) заторможенная конформация бутана; б) заслоненная конформация бутана

Инструмент Bracket

Инструмент Bracket размещается на панели инструментов

Other Tools (см. с. 60) и предназначен для создания квадратных скобок. Часто этот инструмент используется для рисования структур полимеров. Например, на рисунке 151 приведена структура полиорганосилоксана, в изображении которой использованы квадратные скобки. После того, как описанными ранее способами строим структуру остова полимера, активируем инструмент Bracket, перемещаем указатель мыши в нужное место, нажимаем левую кнопку мыши и, удерживая ее, перемещаем указатель мыши, пока рамка не станет необходимого

145

размера. После этого отпускаем кнопку мыши. В углах рамок появятся пунктирные прямоугольники, обозначающие местоположение коэффициентов. Щелкая в нужное место, можно набрать необходимый коэффициент. Если в дальнейшем нужно будет отредактировать эти коэффициенты, то следует вновь активировать инструмент Bracket и, щелкнув в нужном месте, отредактировать коэффициент.

R R R

HO Si O Si O Si OH

R R R n-2

Рис. 151. Структура полиорганосилоксана

Символы

Основные символы, доступные для пользователя, размещены на панели инструментов Symbol Tools (символы) (см. с. 62). Все символы на этих панелях условно можно разделить на две группы: символы, обозначающие свойства атома (заряды, радикалы, пары электронов и т.д.), и символы нумерации.

Рассмотрим использование данных инструментов.

Например, необходимо создать трет-бутил-катион. Для этого описанными ранее способами мы рисуем структуру, изображенную на рисунке 152а. Затем активируем удобным способом, например, инст-

рументом Positive Charge . Наводим указатель мыши на атом уг-

лерода, у которого должен стоять заряд. Этот атом должен быть помечен черным маркером. После щелкаем левой кнопкой мыши. Заряд примет нужное положение, которое программа выберет автоматически. Можно поступить по-другому. После того, как Вы навели указатель мыши на выбранный атом, нужно нажать левую кнопку мыши и не отпускать ее, пока перемещением мыши не добьемся нужного положения заряда. Только после этого можно отпустить кнопку мыши. Заряд займет нужное положение (рис.152б). Следует обратить внимание, что перемещение заряда осуществляется на угол, кратный 45º.

146

Если при вращении символа нажать клавишу CTRL и удерживать ее, то вращение осуществляется на угол, кратный 1°, и он может бытьперемещен на любое расстояние от исходного атома.

а)

 

 

 

CH3

б)

CH3

 

 

CH3

 

C

 

CH3 C

 

 

 

 

 

 

 

 

 

CH3

 

 

 

CH3

 

Рис. 152. Пример создания трет-бутил-катиона

Точно так же можно работать и со всеми другими символами. Рассмотрим, как можно проводить автоматическую нумерацию

атомов в молекуле. Любым описанным ранее способом создаем молекулу гексана (рис. 153а). Затем активируем инструмент Atom Tags (Numbers) , наводим указатель мыши на атом углерода, у которого должен стоять номер. Этот атом должен быть помечен черным маркером. После этого щелкаем левой кнопкой мыши. Номер будет поставлен автоматически. Затем перемещаем указатель мыши к другому атому, который должен иметь следующий номер, и вновь щелкаем левой кнопкой мыши и т.д. В результате получится структура, в которой будет проведена нумерация (рис. 153б). Как описано выше, используя удерживание левой кнопки мыши и клавишу CTRL, Вы можете произвольно выбрать местоположение номера.

Аналогично создается и другая нумерация, представленная на панели инструментов Symbol Tools. Примеры приведены на рисунке 154.

Формат (размер, начертание) номеров и символов можно изменить, используя команду Override Style (см. с. 43) во вкладке Tag.

 

 

1

3

 

5

а)

б)

2

4

6

 

 

 

Рис. 153. Пример нумерации гексана

147

а)

N1'

7'

6'

 

 

2' 3'

4'

5'

4

3

2

 

56 7

 

1N

 

3,3'-спироби(3Н-индол)

 

ε

δ

γ

β

α

1

 

6

5

4

3

2

б)

CH3

CH

CH2

CH

CH2

COOH

 

 

 

CH3

 

 

 

 

 

 

 

 

3-метил-5-(1-нафтил)гексановая кислота) или

β,δ−диметил-1-нафталенвалериановая кислота

Рис. 154. Пример нумерации в структурах различных соединений

Использование шаблонов

При написании химических реакций, создании структур различных химических соединений значительно облегчить работу может использование шаблонов (Template) – заранее подготовленных структур, объектов и т.д. Для использования шаблонов в программе ChemWindow предусмотрено несколько возможностей.

Template Tools

В программе ChemWindow имеется стандартная панель инструментов Template Tools (см. с. 62), на которой представлены некоторые наиболее часто используемые инструменты. Количество и ассортимент этих инструментов определяются содержанием файла templates.cwt, доступ к которому указывается в меню File – Preferences (см. с. 36). Этот файл можно модифицировать или вообще указать другой файл. Для того чтобы сделать какие-то изменения в этом файле, нужно его открыть, используя команды File – Open (см. с. 28). Размещение файла templates.cwt указано в меню File – Preferences, но обычно это

«C:\Program Files\Bio-Rad Laboratories\ChemWin\Templates\». В от-

крывшемся файле Вы увидите структуры, которые показаны на панели инструментов Template Tools. Вы можете изменить их, добавить новые, удалить ненужные и т.д. Разместить новую структуру можно в любом месте экрана. Программа автоматически определит ее, как

148

только Вы сохраните файл. Например, на рисунке 155 показано окно программы ChemWindow с открытым файлом templates.cwt. В этот файл была добавлена структура нафталина и после его сохранения она появилась на панели инструментов Template Tools. (Сравните с панелью Template Tools, показанной в одноименном разделе; с. 62!).

Рис. 155. Окно программы ChemWindow с открытым файлом templates.cwt

149

Инструмент Hierarchical Template

На панели инструментов Standard Tools (см. с. 53) находится ин-

струмент Hierarchical Template , который активирует набор

стандартных шаблонов. При первом нажатии на эту кнопку происходит загрузка стандартных структур из файлов, которые находятся в папке, путь к которой указан в File – Preferences (см. с. 36). В этой папке находится набор файлов, поставляемый производителями про-

граммы ChemWindow: Aromatics.cwt, Bicyclics.cwt, Conformers.cwt, Cycloalkanes.cwt, Polyhedra.cwt и Templates.cwt. После того как файлы шаблонов загружены, структуры, которые в них представлены, можно использовать. Для этого нужно навести указатель мыши на инструмент

Hierarchical Template , нажать левую кнопку мыши и удержи-

вать ее. Появится иерархическое меню, элементами которого будут имена вышеприведенных файлов (рис. 156а). Передвигаясь по нему, можно выбрать нужную структуру. Как только Вы выбрали необходимую структуру, нужно отпустить левую кнопку мыши – меню исчезнет. Переместить указатель мыши в нужное место рабочего поля программы ChemWindow и щелкнуть левой кнопкой мыши. Появится желаемая структура (рис. 156б). Если нажать левую кнопку мыши и, не отпуская ее, переместить указатель мыши в нужном направлении, то можно повернуть структуру так, чтобы она заняла нужное положение. Так же, как и в случае, описанным для файла Templates.cwt, любой из файлов, входящих в структуру иерархическое меню, можно редактировать, дополнять нужными структурами, которых нет в стандартной поставке.

Обратите внимание, что элемент меню Templates такой же, как и состав панели инструментов Template Tools. Это связано с тем, что файл Templates.cwt находится в той же папке, что и остальные файлы шаблонов. В таблице 9 приведены структуры, которые находятся в файлах иерархического меню.

150