Химические редакторы / Маркин В.И. Практическое руководство по использованию ChemWindow 6.0

On Its Left нужно набрать функциональную группу, которая имеет ответвление слева, а в поле Label Connected On Its Right – функциональную группу, которая имеет ответвление справа.

Чтобы подтвердить создание новой «горячей клавиши», надо нажать кнопку OK, чтобы отменить Cancel. Аналогичные действия следует провести и в диалоге Edit Hot Keys, для подтверждения сделанных изменений следует нажать кнопку OK, чтобы отменить Cancel.

Поясним все вышеизложенное на примерах.

Рис. 83. Диалог

«New Hot Keys»

Прежде всего остановимся на том, для чего используются Hot Keys («горячие» клавиши). «Горячие» клавиши необходимы для облегчения набора химических структур, в которых часто применяются одни и те же функциональные группы. Использование «горячих» клавиш возмож-

но при применении инструментов (Standard Bond) и (Lasso). Например, чтобы набрать формулу:

HOCH2 CH2OH ,

можно поступить следующим образом.

Сначала, используя инструмент Benzene, создать бензольное кольцо:

.

Затем с помощью инструмента (Standard Bond) в нужном месте нарисовать связь:

91

,

а затем клавишу «6». В результате структура превратится в

HOCH2 .

То же самое надо повторить со второй связью. В результате получится желаемая структура:

HOCH2 CH2OH .

Как видно из приведенной структуры, гидроксиметильную группу можно привести в двух вариантах: HOCH2– и –CH2OH. Один – со свободной валентностью справа, другой – со свободной валентностью слева. Поэтому при создании новых комбинаций «горячих» клавиш следует учитывать эту особенность (см. рис. 83).

Существует группа встроенных «горячих» клавиш, которые нельзя изменить (см. табл. 1). При этом регистр набираемой буквы (строчная или прописная), не имеет значения. Результат будет одинаков.

При выборе «горячей» клавиши в структуре устанавливается соответствующий атом (см. табл. 1) и все свободные валентности заполняются атомами водорода. Если Вы хотите оставить свободную валентность (или валентности) для другой(их) функциональной(ых) групп, то следует нажать на эту же клавишу еще раз, в этом случае количество атомов водорода будет уменьшено на один, и так будет происходить, пока их не останется, а затем все повторится по кругу. На рисунке 84 приведен пример использования «горячей» клавиши «С».

В таблице 2 приведен перечень «горячих» клавиш, которые запрограммированы в ChemWindow, но могут быть изменены в диалоге Edit Hot Keys. В этот перечень можно добавить новые комбинации с помощью диалога Edit Hot Keys.

92

Таблица 1. Встроенные «горячие» клавиши

Таблица 2. Перепрограммируемые «горячие» клавиши

93

C

Рис. 84. Пример использования «горячей» клавиши «С»

Clean Up

Действие. Выравнивание структур.

Описание. При помощи команды Clean Up (упорядочить) можно выровнять (упорядочить) химическую структуру, которая по каким-то причинам была набрана некорректно. На рисунке 85 приведен пример использования такой команды: исходная структура (рис. 85а) с помощью команды Clean Up выровнена (рис. 85б).

Рис. 85. Пример использования команды «Clean Up»: а – структура до использования команды Clean Up; б – структура после использования команды Clean Up

Check Spelling…

Действие. Проверяет правописание.

Описание. Данная команда предназначена для проверки правописания заголовков и подписей к созданным структурам. Встроенный словарь понимает много названий химических соединений. К сожале-

нию, команда работает только с английским языком!

94

Edit User Dictionary …

Действие. Редактирует пользовательский словарь.

Описание. Данная команда тесно связана с предыдущей командой Check Spelling и предназначена для редактирования пользовательского словаря, слова в который добавляются в результате использования команды Check Spelling. Команда Edit User Dictionary также работает

только с английским языком!

ChromKeeper

Действие. Запускает внешнюю программу ChromKeeper для обработки хроматограмм.

Описание. При выполнении этой команды выполняется одноименная внешняя программа для обработки хроматографических данных. Ее описание выходит за рамки данного руководства.

IRKeeper

Действие. Запускает внешнюю программу IRKeeper для обработки ИК-спектров.

Описание. При выполнении этой команды выполняется одноименная внешняя программа для обработки ИК-спектроскопических данных. Ее описание выходит за рамки данного руководства.

SymApps

Действие. Запускает внешнюю программу SymApps для работы с трехмерными моделями молекул.

Описание. При выполнении этой команды выполняется одноименная внешняя программа для преобразования двумерных структур, созданных в программе ChemWindow, в трехмерные и для их обработки. Ее описание выходит за рамки данного руководства.

95

Меню Window

В меню Window (окно) находятся команды для работы с окнами

(рис. 86).

Вход в меню осуществляется путем наведения указателя мыши на слово Window в строке меню или нажатием комбинации клавиш ALT+W на клавиатуре.

Рис. 86. Меню Window

New Window

Действие. Создает копию активного окна.

Описание. При выполнении команды New Window (новое окно) создается копия активного окна (рис. 87). Все изменения, которые осуществляются в одном окне, тут же появляются в другом. Использование копии активного окна полезно в том случае, когда Вы работаете с большим документом и Вам необходимо видеть, например, начало и конец документа.

Cascade

Действие. Располагает открытые окна каскадом.

Описание. При выполнении команды Cascade (каскад) все активные окна располагаются одно поверх другого, так чтобы было видно только последнее активное окно, а у остальных – только заголовки

(рис. 88).

96

Рис. 87. Новое окно, созданное при помощи команды «New Window»

Рис. 88. Результат выполнения команды «Cascade»

97

Tile

Действие. Располагает все открытые окна в окне программы

ChemWindow.

Описание. При выполнении команды Tile (секция) все открытые окна программы ChemWindow располагают так, чтобы были одинакового размера и равнодоступны для пользователя. Пример такого расположения показан на рисунке 87.

Arrange Icons

Действие. Выравнивает иконки свернутых окон по нижнему краю программы ChemWindow.

Описание. При выполнении команды Arrange Icons (выровнять иконки) все свернутые окна программы ChemWindow, расположенные хаотично (рис. 89а), упорядочиваются так, как показано на рисунке 89б.

а

б

Рис. 89. Окно программы ChemWindow: а – до выполнения команды Arrange Icons; б – после ее выполнения

98

1 «Имя файла»

Действие. Выбор активного окна.

Описание. На рисунке 86 (с. 96) показан типичный вид меню Window. Дан пример меню с одним открытым файлом Document1. Количество открытых окон зависит от доступной программе памяти. Каждому окну, соответствующему открытому файлу, присваивается порядковый номер (в порядке открытия окна). Чтобы с помощью клавиатуры переключиться с одного окна на другое, необходимо последовательно нажать следующие клавиши Alt+W, а затем цифру, соответствующую нужному окну, например, 1.

99

Меню Help

В меню Help (помощь) находятся команды для вызова помощи по работе с программой ChemWindow (рис. 90).

Вход в меню осуществляется путем наведения указателя мыши на слово Help в строке меню или нажатием комбинации клавиш ALT+H на клавиатуре.

Рис. 90. Меню «Help»

Help Topics …

Действие. Вызывает окно помощи.

Описание. При выполнении команды Help Topics (темы помощи) открывается новое окно, в котором приведены основные разделы справки по программе ChemWindow (рис. 91). Справка на английском языке и, к сожалению, весьма скудная.

Bio-Rad Laboratories on the Web

Действие. Осуществляется переход на Интернет-страницы компа-

нии Bio-Rad Laborartories.

Описание. При выборе этой команды осуществляется запуск встроенного Web-браузера (чаще всего это программа Internet Expoler) и переход на соответствующие Интернет-страницы компаниипроизводителя программы ChemWindow. При выборе раздела Bio-Rad

100