Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:
Феранчук С.И. Биоинформатика. Обсуждение задач, подходов и методов.pdf
Скачиваний:
146
Добавлен:
16.09.2020
Размер:
60.84 Mб
Скачать

103

темах подобных перечисленным выше, дают основание соотнести современные традиции с традициями древней медицины у разных рас и народов. Обобщения, которые можно вывести при таком сравнении, приведены в следующем разделе и в заключительной части книги.

Традиции медицины и их эволюция

Лекарственные растения всегда использовались для лечения заболеваний. Многие из химических соединений, которые применяют в современной медицине, были подобраны при исследовании состава лекарственных растений. Также, для многих из современных лекарственных средств, сырьем служат продукты переработки растений. И потому исследования лекарственных растений продолжают развиваться, и в базе научных публикаций возможно провести автоматический анализ текстов, с целью обобщить представленные в публикациях результаты по многим из прикладных задач.

В результате проведенной обработки публикаций, используя подход описанный в 3.6, были отобраны записи, содержащие родовое название растения, название химического соединения, и термин относящийся к хроническим заболеваниям. Полученную базу записей возможно представить в виде матрицы соответствий между названиями растений и заболеваниями. Для построенной матрицы был проведен анализ главных компонент, так что в итоге по парам главных компонент возможно построить диаграмму отношений между лекарственными растениями и сопряженную диаграмму отношений между группами заболеваний, как это показано на рис. 3.28.

Рис. 3.28: Отношения между лекарственными растениями и между группами хрониче-

ских заболеваний

влевой части, размер кругов обозначает относительное количество публикаций с упоминанием лекарственного растения, а цветом обозначена группа, которой отнесено растение по его ботаническому описанию.

вправой части, размер кругов обозначает относительное количество публикаций, относящихся к заболеванию.

104

Часто в публикациях при описании лекарственного растения упоминают, в какой из традиций медицины принято было его использовать для лечения. И потому, в проведенной обработке текстов выделялись также географических термины, относящиеся к традициям медицины. Результаты, показанные на рис. 3.29, основаны на разложении матрицы, составленной из связей между лекарственными растениями и традициями медицины. При обработке также были использованы термины "modern" и "o cial", чтобы охарактеризовать мето современной медицины среди традиций, выработанных при развитии цивилизации.

Рис. 3.29: Отношения между традициями медицины

размер кругов обозначает относительное количество публикаций, относящихся к традиции медицины.

В показанном способе расчета, традиционные "школы" медицины, с долей условности, разделены на культуры Востока, культуры Европы, и культуры народов Африки, Австралии и Америки. Подходы современной медицины, в этом представлении, подобны, в большей степени, культурам Востока. Но, говоря прямо, "переоцененные" научные идеи и термины, приводящие к накоплению систематических ошибок в современной науке, как это обсуждалось в разделах 3.5, 3.6, 3.7, следует сравнить с языческими богами, подобными языческим богам древних культур Востока. И потому обнаруженное сходство современной медицины с традициями Востока не следует считать неожиданным.

Другой подход к автоматической обработке текстов, описанный в 3.6, где названию растения сопоставлялись названия генов, также был использован для оценки отношений между заболеваниями, по предполагаемому эффекту лекарственных растений. Для анализа были также использованы серии экспериментов RNA-Seq, где исследовалось различие в экспрессии генов в тканях,