Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:
Потапов В.В. Решение задач биоинформатики при помощи веб - и интернет-сервисов.pdf
Скачиваний:
157
Добавлен:
14.09.2020
Размер:
2.93 Mб
Скачать

используются подсказки на основе ключевых фраз (мемов), выделенных в рефератах статей.

Интерфейс веб-сервисов доступен на русском и английском языках. Именно на основе сервисов данного сайта будет построена вторая часть нашего знакомства с биоинформатическими сервисами — учебная научная работа по моделированию пространственной структуры биологического объекта.

4.4Облачные вычисления — дорога в будущее

Что такое облако? Нет, мы не про те облака, что над головами, а про те, в которых производятся вычисления.

Облако — это интернет-сервис, в котором все ваши данные хранятся на удаленном сервере в Интернете и вы с ними работаете прямо там, используя мощность процессора, дисков и даже внешних устройств на серверной стороне. Облачные вычисления это перевод веб- и интернетсервисов на новый уровень, вы не только используете удаленные серверы для получения и обработки данных, но и результаты вашей работы тоже хранятся там. Самый простой пример облачного сервиса

— google docs, система работы с документами, где вы не загружаете, как обычно, текст или электронную таблицу со своего диска в программу и изменяете или создаете новый документ, а изменяете или создаете документы прямо на сервере в Интернете.

Чем это удобно для биоинформатика? Тем, что результат его работы — последовательности, аннотации, модели, статьи в конечном итоге все равно попадают в интернет-базы данных. Биоинформатик очень значительную часть данных для своей работы берет в Интернете и туда же они, обработанные и дополненные, возвращаются, потому совершенно логичным будет сразу работать в глобальной сети.

Это позволяет не заботиться о программном обеспечении на вашем компьютере, о его мощности, объеме памяти, защите. Нужен только браузер, и можно полноценно работать с маленького нетбука или смартфона, в командировках или даже экспедициях, ведь мест, где нет интернета, становится все меньше. Биоинформатика очень чувствительна к вычислительной мощности, например процессы молекулярной динамики считаются даже на современных быстрых рабочих станциях недели и месяцы. А ведь эти станции нужно купить, установить их сами и программы на них, научиться работать,

24

обеспечивать обслуживание и загрузку и. т. д. Облако же позволяет просто арендовать необходимые вычислительные мощности на нужное время, это получается гораздо дешевле и проще.

Несомненно, у облаков есть свои проблемы, например разграничение доступа и секретность, невозможность доступа к данным без интернета, но их плюсы несомненны и можно ожидать в ближайшем будущем появления виртуальных «лабораторий биоинформатика» которые можно будет арендовать для своих исследований.

Вопрос: Очень многие ученые - биоинформатики приходят в ходе своей работы к созданию новых алгоритмов, а на их основе - программ и сервисов. Обоснуйте, что более перспективно развивать в свете наступления «облачной эры» - интернетили веб-сервисы для биоинформатики?

4.5Контрольные вопросы

1.Что-такое веб- и интернет - сервисы?

2.Какие задачи решаются с помощью выравнивания?

3.В каких случаях применяется глобальное, а в каких — локальное выравнивания?

4.Какие сервисы для выравнивания вы знаете?

5.В чем преимущества облачных вычислений?

6.Что обозначает символ «*» в формате clustal?

7.Что такое множественное выравнивание?

25