
- •Молекулярная биология
- •ТРАНСМЕМБРАННАЯ ТРАНСЛОКАЦИЯ РАСТУЩЕГО ПОЛИПЕПТИДА
- •СИГНАЛЬНЫЙ ПЕПТИД
- •СИГНАЛЬНЫЙ ПЕПТИД
- •ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ СОБЫТИЙ В ПРОЦЕССЕ КОТРАНСЛЯЦИОННОГО ПРИКРЕПЛЕНИЯ РАСТУЩЕГО ПОЛИПЕПТИДА К МЕМБРАНЕ ЭНДОПЛАЗМАТИЧЕСКОГО РЕТИКУЛУМА
- •Узнавание
- •Структура бактериальной SRP частицы в комплексе с рецептором (SR)
- •ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ СОБЫТИЙ ИНИЦИАЦИИ ТРАНСМЕМБРАННОЙ ТРАНСЛОКАЦИИ
- •Белок Sec61p/SecY – трансмембранный пептид-проводящий канал (РСС) (или транслокон, или ТС)
- •Трансмембранный пептид-проводящий канал (вид с торца, со стороны цитоплазмы)
- •Схема расположения трансмембранных спиралей пептид-проводящего канала (белка Sec61 ) –
- •Схема расположения трансмембранных спиралей пептид-проводящего канала (белка Sec61 ) –
- •Трансмембранный пептид-проводящий канал (вид с торца, со стороны цитоплазмы) –
- •«Пробка» трансмембранного пептид-проводящего канала (a) и ее открывание при прохождении растущего пептида (b)
- •Стадии котрансляционной трансмембранной транслокации секреторного белка
- •Котрансляционная и посттрансляционная трансмембранная транслокация новосинтезированного белка у грам-отрицательных бактерий
- •ГИПОТЕЗА НЕСТРОГОГО СООТВЕТСТВИЯ
- •РАБОЧИЙ (ЭЛОНГАЦИОННЫЙ) ЦИКЛ РИБОСОМЫ
- •Антипараллельное кодон-антикодоновое взаимодействие
- •ЧТО ВЫЯВИЛОСЬ В ЭКСПЕРИМЕНТАХ К 1966 ГОДУ?
- •Антипараллельное кодон-антикодоновое спаривание
- •Спаривание
- •ЧТО ВЫЯВИЛОСЬ В ЭКСПЕРИМЕНТАХ К 1966 ГОДУ?
- •Спаривание
- •Спаривание 1-го основания антикодона с 3-им основанием кодона
- •Гипотеза Крика о “шатании” положений азотистых оснований при спаривании положения 1 антикодона с
- •Спаривание 1-го основания антикодона с 3-им основанием кодона
- •WOBBLE RULES
- •WOBBLE RULES
- •Модифицированные нуклеозиды, типичные для первого положения антикодона:
- •ИНГИБИТОРЫ ТРАНСЛЯЦИИ
- •Антибиотики – ингибиторы корректного связывания аминоацил-тРНК
- •АНТИБИОТИКИ – ИНГИБИТОРЫ АМИНОАЦИЛ-тРНК-СВЯЗЫВАЮЩЕГО УЧАСТКА (А-УЧАСТКА) НА МАЛОЙ (30S) РИБОСОМНОЙ СУБЪЕДИНИЦЕ
- •Место связывания тетрациклинов в непосредственной близости от А участка связывания
- •ЭЛОНГАЦИОННЫЙ ЦИКЛ:
- •АНТИБИОТИКИ – ИНГИБИТОРЫ АМИНОАЦИЛ-тРНК-СВЯЗЫВАЮЩЕГО УЧАСТКА (А-УЧАСТКА) НА МАЛОЙ (30S) РИБОСОМНОЙ СУБЪЕДИНИЦЕ
- •Рибосомная 30S субъединица, контактирующая сторона: район связывания аминогликозидов и аминоциклитолов
- •Связывание паромомицина с основанием спирали 44 16S рибосомной РНК
- •Рибосомная 30S субъединица, контактирующая сторона: расположение антикодоновых шпилек тРНК в А и Р
- •Ингибиторы транспептидации и около …
- •АНТИБИОТИКИ – ИНГИБИТОРЫ ТРАНСПЕПТИДАЦИИ
- •ЭЛОНГАЦИОННЫЙ ЦИКЛ: ИНГИБИТОРЫ ТРАНСПЕПТИДАЦИИ
- •МАКРОЛИДЫ – ИНГИБИТОРЫ ПРОДВИЖЕНИЯ РАСТУЩЕГО ПОЛИПЕПТИДА?
- •Ингибиторы транслокации
- •АНТИБИОТИКИ – ИНГИБИТОРЫ ТРАНСЛОКАЦИИ
- •ЭЛОНГАЦИОННЫЙ ЦИКЛ: ИНГИБИТОРЫ ТРАНСЛОКАЦИИ
- •АМИНОГЛИКОЗИДЫ И АМИНОЦИКЛИТОЛЫ КАК ИНГИБИТОРЫ ТРАНСЛОКАЦИИ?
- •АНТИБИОТИКИ – ИНГИБИТОРЫ ТРАНСЛОКАЦИИ НА ЭУКАРИОТИЧЕСКИХ РИБОСОМАХ
- •АНТИБИОТИКИ – ИНГИБИТОРЫ ТРАНСЛОКАЦИИ НА ЭУКАРИОТИЧЕСКИХ РИБОСОМАХ
- •Ингибиторы факторов элонгации
- •Гуанозинтрифосфат и его негидролизуемые и медленно гидролизуемые аналоги
- •АНТИБИОТИК – ИНГИБИТОР ОСВОБОЖДЕНИЯ ФАКТОРА ЭЛОНГАЦИИ EF-Tu ИЗ РИБОСОМЫ
- •ЭЛОНГАЦИОННЫЙ ЦИКЛ:
- •АНТИБИОТИКИ – ИНГИБИТОРЫ ОСВОБОЖДЕНИЯ БЕЛКОВЫХ ФАКТОРОВ ЭЛОНГАЦИИ
- •АНТИБИОТИКИ – ИНГИБИТОРЫ СВЯЗЫВАНИЯ БЕЛКОВЫХ ФАКТОРОВ ЭЛОНГАЦИИ
- •ЭЛОНГАЦИОННЫЙ ЦИКЛ: ИНГИБИТОРЫ ФАКТОРОВ ЭЛОНГАЦИИ
- •Схема доменной структуры фактора элонгации EF-G
- •«Молекулярная мимикрия»:
- •ПУРОМИЦИН – АНАЛОГ АМИНОАЦИЛ-тРНК, ИНГИБИТОР ТРАНСЛЯЦИИ
- •Ошибки связывания аминоацил-тРНК: «ложное кодирование»
- •Трансляция poly(U) в бесклеточной системе:
- •Трансляция poly(U) в бесклеточной системе:
- •Ложное кодирование на poly(U)
- •Ложное кодирование: проскок терминирующих кодонов
- •ЛОЖНОЕ КОДИРОВАНИЕ:
- •КИНЕТИЧЕСКАЯ ОСНОВА ЛОЖНОГО КОДИРОВАНИЯ
- •КИНЕТИЧЕСКАЯ ОСНОВА ЛОЖНОГО КОДИРОВАНИЯ
- •КИНЕТИЧЕСКАЯ КОРРЕКЦИЯ («РЕДАКТИРОВАНИЕ») КОДИРОВАНИЯ
- •КОНЕЦ.

Антипараллельное кодон-антикодоновое спаривание

Спаривание
1-го основания антикодона с 3-им основанием кодона
anticodon, 1st codon, 3rd
ЧТО ВЫЯВИЛОСЬ В ЭКСПЕРИМЕНТАХ К 1966 ГОДУ?
(1)Если аминокислота кодируется более, чем одним кодоном, то кодоны, кодирующие эту аминокислоту, различаются, как правило, только по третьему основанию кодона (см. кодовую таблицу).
(2)Одна и та же тРНК может связываться более, чем с одним кодоном (в пределах семьи кодонов).
(3)Аденин никогда не присутствует в первом положении антикодона тРНК.

Спаривание
1-го основания антикодона с 3-им основанием кодона
anticodon, 1st codon, 3rd
A I
Спаривание 1-го основания антикодона с 3-им основанием кодона
I : C
tRNAIle I : U I : A
Гипотеза Крика о “шатании” положений азотистых оснований при спаривании положения 1 антикодона с положением 3 кодона (Wobble hypothesis, Crick 1966)

Спаривание 1-го основания антикодона с 3-им основанием кодона
I : C
tRNAIle I : U I : A
G : C
tRNATyr G : U
G : A ?

WOBBLE RULES
UNIVERSAL:
Anticodon, 5' A U 3', Codon
I |
C |
|
U |
|
A |
G |
C |
|
U |
C |
G |
U |
A |
|
G |
|
|

WOBBLE RULES
UNIVERSAL:
Anticodon, 5' A U 3', Codon
I |
C |
|
U |
|
A |
G |
C |
|
U |
U* A |
|
|
G |
C |
G |
|
|
MITOCHONDRIAL |
|
U |
A |
|
G |
|
C |
|
U |

Модифицированные нуклеозиды, типичные для первого положения антикодона:
Модификации С5 урацила