5. Группы

Объекты, рассматриваемые в филогенетике, на основании их признаков можно объединить в группы^⁷. Выделяются следующие их типы:

монофилетическая (клада, голофилетеческая) – группа включает всех потомков гипотетического общего предка. На рис. 7, а) группа Reptilia s.l. включает всех потомков общего предка рептилий (отмечен черной точкой)
парафилетическая^⁸ – группа включает не всех потомков такого гипотетического общего предка, т.е. получается из монофилетической путем изъятия одной или нескольких подгрупп. На рис. 7, б) группа Reptilia s.s. включает всех потомков общего предка рептилий, за исключением Aves.
полифилетическая – группа включает потомков различных гипотетических предков. Говоря точнее, это группа, в отношении которой доказано более близкое родство составляющих её подгрупп с другими группами, не входящими в данную. Выделение данных групп часто основано на ложных синапоморфиях. На рис 7, в) группа Теплокровные включает животных, имевших разных общих теплокровных предков: в линии Mammalia и Aves.

Часто объекты, расположенные рядом с основанием древа и сохранившие плезиоморфии, называют базальными группами. Например, относительно продвинутых Aves (см. рис. 7) базальными группами будут группы 1-3 из Reptilia s.s.

Базальная группа, противопоставленная всем остальным (т.е. отходящая в основании древа), и заведомо имеющая отдалённое родство с остальными на филогенетическом древе, называется внешней группой. Она служит для «калибровки» древа, т.к. при построении любого древа неплохо бы знать, как выглядит его основание. Важно, что правильно выбранная внешняя группа позволяет установить, какие состояния признаков являются плезиоморфными, а какие – апоморфными. Взаимоотношения между различными подгруппами (1-3) в составе Reptilia s.s. и группы Reptilia s.s. в целом и Aves не совсем понятны (см. рис. 7), но очевидно, что друг с другом они более родственны, чем с Mammalia. Поэтому, в данной ситуации именно млекопитающих удобно использовать в качестве внешней группы.

Группы, отходящие из одного узла, называются сестринскими группами. Например, на рис. 7 сестринскими группами являются группа 3 и Aves; группа 2 и группа «3+Aves»; Mammalia и Reptilia s.l. (т.е. 1+2+3+Aves).

Mammalia

Reptilia s.l.