- •Сборник лекций
- •Курс: Третий
- •2. Горизонтальный транспорт генов у бактерий в природных экосистемах и его роль в эволюции и систематике прокариот
- •4. Механизмы, контролирующие генетическую изоляцию бактериального генома.
- •5. Эволюция бактериального генома.
- •1. Терминология и номенклатура, используемые в систематике прокариот
- •2. Фенотипическая систематика
- •4. Хемотаксономическая систематика
- •5. Геносистематика
- •1. Основные проблемы филогении прокариот.
- •2. Понятие о молекуле - хронометре
- •3. Концепция к. Вуза о трех линиях эволюции, трех формах жизни
- •4. Дистанционно-матричный метод построения филогенетических деревьев и их конструкции (веерообразная и сильно разветвленная дихотомическая). Гипотеза о. Кандлера о трех типах независимых проклеток
- •5. Методологические ловушки в филогенетической систематике микроорганизмов
- •1. Принципы построения идентификационных схем.
- •2. Общие правила при идентификации бактерий
- •3. Деление царства прокариот на высшие таксоны. Характеристика отделов
- •4. Группы прокариотных организмов и их основные представители
- •1. Сравнительная характеристика прокариот и эукариот
- •2. Основные принципы систематики эукариотных микроорганизмов
- •3. Группы низших эукариот
- •4. Фаготрофия и симбиоз – основные элементы существования протистов
- •5. Основы классификации вирусов
- •Лекция 2.1. Молекулярные и структурные аспекты организации архей. Общая характеристика. Систематика.
- •I. Положение архебактерий в системе царств органического мира
- •2. Характерные особенности отдельных групп архебактерий
- •3. Молекулярная биология архебактерий
- •4. Метаболизм архебактерий.
- •5. Структурная организация геномов архебактерий
- •1. Аэробные сероокислящие бактерии
- •2. Анаэробные серовосстанавливающие бактерии
- •3. Галофильные архебактерии.
- •4. Термоацидофильные микоплазмы
- •Раздел 1.
- •Раздел 2.
- •Раздел 3.
- •Раздел 4.
- •1. Классификация метанообразующих бактерий
- •2. Культурально-морфологические свойства метаногенов
- •3. Тип питания и метаболизм метанообразущих бактерий
- •4. Механизм энергетических процессов у метанообразущих бактерий
- •5. Местообитание и практическое применение метаногенов.
- •1. Пигменты фотосинтезирующих эубактерий
- •2. Строение фотосинтетического аппарата эубактерий
- •3. Группы фотосинтезирующих эубактерий
- •3. Цианобактерии
- •5. Прохлорофиты
- •1. Пурпурные бактерии
- •2. Зеленые эубактерии
- •3. Гелиобактерии
- •4. Распространение фототрофных эубактерий в природе
- •1. Явление автотрофии в микробиологии. Характеристика физиологических групп аэробных хемоавтотрофов
- •2. Нитрифицирующие бактерии
- •3. Бактерии, окисляющие серу
- •4. Железобактерии
- •5. Водородные бактерии
- •6. Метаболическая основа хемоавтотрофии
- •Явление облигатной автотрофии
- •Подавление роста органическими соединениями
- •1. Общая характеристика и систематика метаноокисляющих бактерий
- •2. Морфология вегетативных клеток
- •3. Ультратонкое строение клеток
- •4. Окисление углеродных соединений как основное свойство метанотрофов
- •5. Свойства метанотрофов в свете практического применения
- •2. Молочнокислое брожение и бактерии вызывающие данный процесс
- •3. Эубактерии осуществляющие спиртовое брожение
- •4. Пропионовокислое брожение
- •5. Клостридии и маслянокислый тип брожения
- •1. Системы классификации и таксономия дрожжей
- •2. Строение дрожжевой клетки
- •3. Питание и метаболизм дрожжей
- •4. Генетика дрожжей
- •5. Микробиологические аспекты практического использования дрожжей
- •1. Общая характеристика и систематика актиномицетов
- •Краткая характеристика групп родов Группа 22. Нокардиоформные актиномицеты
- •Группа 23. Роды с многогнездными спорангиями
- •Группа 25. Стрептомицеты и близкие роды
- •Группа 26. Мадуромицеты
- •Группа 29. Другие роды
- •2. Морфология актиномицетов.
- •3. Характеристика актиномицетов по химическому составу и строению клеточных стенок.
- •4. Питательные потребности и условия культивирования актиномицетов.
- •1.Общая характеристика скользящих организмов
- •2. Миксобактерии
- •3. Алгицидные миксобактерии, не образующие плодовых тел
- •4. Группа цитофаг
- •5. Нитчатые скользящие хемогетеротрофы
- •6. Нитчатые бактерии, окисляющие соединения серы
- •1. Общая характеристика бактерий, образующих эндоспоры
- •2. Аэробные спорообразующие бактерии (Род Bacillus)
- •3. Анаэробные спорообразующие бактерии: род clostridium
- •4. Другие спорообразующие бактерии
- •5. Спорообразование
3. Бактерии, окисляющие серу
При изучении хемоавтотрофии С. Виноградский исследовал свойства хемотрофных нитчатых скользящих бактерий группы Beggiatoa Thiothrix, присутствующих в ряде мест, богатых сульфидами и часто содержащих включения элементарной серы. Он показал, что эти организмы могут окислять H2S, превращая его сначала в элементарную серу, которая и накапливается в клетках.
Впоследствии отложенная в клетках сера окисляется до сульфата. Позднее было показано, что множество других аэробных бактерий окисляют H2S аналогичным образом, в результате чего внутри клеток временно откладывается сера. Бесцветные серобактерии составляют очень гетерогенную группу, в которую они объединены по способности окислять восстановленные или частично окисленные неорганические соединения серы. Использование этого свойства в качестве таксономического критерия привело к объединению в одной группе многих таксономически не взаимосвязанных родов. Положение еще более осложнили результаты проведенных за последние несколько лет исследований 5S- и 16S-PHK, показавшие, что виды, классифицированные в пределах некоторых больших родов (например, Thiobacillus), возможно лишь отдаленно родственны между собой, хотя сходны по (эко)физиологии.
Среди бесцветных серобактерий встречаются фактически все известные формы клеток и типы подвижности. Рост представителей этой группы можно обнаружить при значениях рН, покрывающих почти весь диапазон — от 1,0 до 10,5. Основные признаки, объединяющие роды «бесцветных серобактерий», — грамотрицателъные, аэробы (некоторые способны к денитрификации), хемолитотрофы. Бактериохлорофилл не содержат. Группа включает облигатных и факультативных хемолитоавтотрофов, а также хемолитогетеротрофов. Некоторые организмы, классифицированные как бесцветные серобактерии (например, виды Beggiatoa), возможно, не истинные хемолитогетеротрофы, поскольку не получают энергию при окислении соединений серы. Они, однако, получают в результате окисления выгоду иными способами. Бесцветные серобактерии могут быть обнаружены везде, где присутствуют восстановленные соединения серы (например, в осадках, в почве, на границах аэробных и анаэробных зон водоемов и в вулканических источниках, таких как выводные каналы гидротерм). На границе зон сульфид/кислород и там, где присутствуют и соединения серы и О2, можно обнаружить естественное накопление этих бактерий, иногда до 108 клеток на 1 мл и больше. Присутствие бесцветных серобактерий нередко видно невооруженным глазом — об их росте говорит появление обильных белых отложений серы, взвесей, тяжей, розеток или пленок. Пробы, отобранные в освещенных участках, могут также содержать (по крайней мере в местообитаниях с температурой ниже 55°С) фотолитотрофные (пурпурные) сероокисляющие бактерии, многие из которых способны расти и как хемолитотрофы. Необходимо обращать внимание на цвет (красный/ пурпурный, коричневый) осадков или концентрированных суспензий бактерий.
Итак, рассмотрим сероокисляющие бактерии, образующие внутриклеточные образования серы. К ним относятся (таблица 3).
ТАБЛИЦА 3.-Бактерии, окисляющие H2S с образованием внутриклеточных отложений серы, не выделенных в виде чистых культур
1. Нитчатые скользящие организмы: Beggiatoa, Thiothrix, Thioploca
2. Очень крупные одноклеточные скользящие организмы: Achromatium
3. Одноклеточные неподвижные или передвигающиеся с помощью жгутиков организмы с палочковидными или спиральными клетками:
Клетки палочковидные, неподвижные: Thiobacterium
Клетки палочковидные с полярно расположенными жгутиками: Масromonas.
Круглые или яйцевидные клетки с перитрихальными жгутиками: Thiovulum
Спиральные клетки с полярно расположенными жгутиками: Thiospira
Однако из-за технических трудностей, возникающих при выращивании этих бактерий в аэробных условиях за счет использования H2S, получить чистую культуру не удалось ни для одного из перечисленных в таблице 3 организмов.
Следующую группу серобактерий составляют организмы, у которых внутриклеточные включения серы не видны в световой микроскоп, но клетки могут содержать тонкодисперсную серу. Многие могут осаждать серу в колониях после продолжительной инкубации в присутствии сульфида, что делает колонии (желтовато-) белыми и непрозрачными. характеристика основных представителей данной группы серобактерия представлена в таблице 4.
ТАБЛИЦА 4.- Окисляющие серу хемоавтотрофы, выделенные в виде чистых культур
Признак
|
Thiobacillus
|
Thiomicrospira |
Sulfolobus
|
Форма клетки
Расположение жгутиков ГЦ-содержание ДНК, % Область значений рН, в которых возможен рост Автотрофность
|
(8 видов) Палочковидная Полярное
34—70
Варьирует
Варьирует
|
(1 вид) Спиральная Полярное
48
5,0—8,5
Облигатная
|
(1 вид) Сферическая, дольчатая Клетки неподвижны
60—68
0,5—6,0
Факультативная
|
Большинство этих бактерий представляют собой небольшие палочки с полярно расположенными жгутиками; они относятся к роду Thiobacillus и широко распространены как в морской среде, так и на суше. Бактерии с клетками спиральной или вибриоидной формы, Thiomicrospira, встречаются в морском иле, а бактерии с клетками сферической неправильной формы, Sulfolobus, обитают лишь в термальных источниках (таблица 4). Следует отметить, что диапазон значений ГЦ-содержания ДНК организмов этой группы довольно широк, особенно среди тиобацилл. Обширных мембранных разрастаний, которые характерны для многих нитрифицирующих бактерий, нет ни у одной из мелких окисляющих серу бактерий.
Эти организмы хорошо растут в автотрофных условиях, причем если рост происходит за счет тиосульфата, то время генерации составляет всего 2 ч. Общим примечательным свойством организмов этой группы является их толерантность к кислоте. Некоторые виды могут расти при крайне низких значениях рН вплоть до 1 или 2, и неспособны расти при рН выше 6. Эти организмы часто обнаруживаются в специфических местообитаниях, где низкое значение рН поддерживается в результате их собственной метаболической активности. Термофильная бактерия Sulfolobus встречается в кислых, богатых серой горячих источниках, где сульфид, имеющий геохимическое происхождение, при высокой температуре воды (70-85°С) - на воздухе немедленно превращается- в элементарную серу Sulfolobus растет на частицах серы, которая служит для нее окисляемым субстратом.
Тиобациллы изобилуют в особых условиях, которые возникают в результате деятельности человека. Это, например, откачиваемые из шахт кислые дренажные воды, содержащие минералы сульфидов металлов, в особенности пирит (FeS2). В таких местах преобладают крайне ацидофильные виды Thiobacillus thiooxidans, которые быстро окисляют элементарную серу, и Т. ferrooxidans, которые могут получать энергию как при окислении восстановленных соединений серы, так и при окислении Fe2+. Поскольку последний вид способен расти при рН от 2 до 4, когда закисное железо химически устойчиво, можно считать твердо установленным, что этот организм растет в хемоавтотрофных условиях, используя реакцию
Для классических «железобактерий», которые развиваются при более высоких рН (см. нижеследующий материал), этот факт пока нельзя считать доказанным.
Как и в случае нитрифицирующих бактерий, не все окисляющие серу бактерии являются облигатными хемоавтотрофами. Sulfolobus,и некоторые тиобациллы способны расти, используя органические источники углерода и энергии, однако субстратом для них могут быть лишь глюкоза и немногие из аминокислот.
Быстрый рост тиобацилл и способность их использовать довольно разнообразные питательные вещества делают эти организмы наиболее удобным объектом при экспериментальном исследовании проблем физиологии хемоавтотрофного способа жизни.
