- •Сборник лекций
- •Курс: Третий
- •2. Горизонтальный транспорт генов у бактерий в природных экосистемах и его роль в эволюции и систематике прокариот
- •4. Механизмы, контролирующие генетическую изоляцию бактериального генома.
- •5. Эволюция бактериального генома.
- •1. Терминология и номенклатура, используемые в систематике прокариот
- •2. Фенотипическая систематика
- •4. Хемотаксономическая систематика
- •5. Геносистематика
- •1. Основные проблемы филогении прокариот.
- •2. Понятие о молекуле - хронометре
- •3. Концепция к. Вуза о трех линиях эволюции, трех формах жизни
- •4. Дистанционно-матричный метод построения филогенетических деревьев и их конструкции (веерообразная и сильно разветвленная дихотомическая). Гипотеза о. Кандлера о трех типах независимых проклеток
- •5. Методологические ловушки в филогенетической систематике микроорганизмов
- •1. Принципы построения идентификационных схем.
- •2. Общие правила при идентификации бактерий
- •3. Деление царства прокариот на высшие таксоны. Характеристика отделов
- •4. Группы прокариотных организмов и их основные представители
- •1. Сравнительная характеристика прокариот и эукариот
- •2. Основные принципы систематики эукариотных микроорганизмов
- •3. Группы низших эукариот
- •4. Фаготрофия и симбиоз – основные элементы существования протистов
- •5. Основы классификации вирусов
- •Лекция 2.1. Молекулярные и структурные аспекты организации архей. Общая характеристика. Систематика.
- •I. Положение архебактерий в системе царств органического мира
- •2. Характерные особенности отдельных групп архебактерий
- •3. Молекулярная биология архебактерий
- •4. Метаболизм архебактерий.
- •5. Структурная организация геномов архебактерий
- •1. Аэробные сероокислящие бактерии
- •2. Анаэробные серовосстанавливающие бактерии
- •3. Галофильные архебактерии.
- •4. Термоацидофильные микоплазмы
- •Раздел 1.
- •Раздел 2.
- •Раздел 3.
- •Раздел 4.
- •1. Классификация метанообразующих бактерий
- •2. Культурально-морфологические свойства метаногенов
- •3. Тип питания и метаболизм метанообразущих бактерий
- •4. Механизм энергетических процессов у метанообразущих бактерий
- •5. Местообитание и практическое применение метаногенов.
- •1. Пигменты фотосинтезирующих эубактерий
- •2. Строение фотосинтетического аппарата эубактерий
- •3. Группы фотосинтезирующих эубактерий
- •3. Цианобактерии
- •5. Прохлорофиты
- •1. Пурпурные бактерии
- •2. Зеленые эубактерии
- •3. Гелиобактерии
- •4. Распространение фототрофных эубактерий в природе
- •1. Явление автотрофии в микробиологии. Характеристика физиологических групп аэробных хемоавтотрофов
- •2. Нитрифицирующие бактерии
- •3. Бактерии, окисляющие серу
- •4. Железобактерии
- •5. Водородные бактерии
- •6. Метаболическая основа хемоавтотрофии
- •Явление облигатной автотрофии
- •Подавление роста органическими соединениями
- •1. Общая характеристика и систематика метаноокисляющих бактерий
- •2. Морфология вегетативных клеток
- •3. Ультратонкое строение клеток
- •4. Окисление углеродных соединений как основное свойство метанотрофов
- •5. Свойства метанотрофов в свете практического применения
- •2. Молочнокислое брожение и бактерии вызывающие данный процесс
- •3. Эубактерии осуществляющие спиртовое брожение
- •4. Пропионовокислое брожение
- •5. Клостридии и маслянокислый тип брожения
- •1. Системы классификации и таксономия дрожжей
- •2. Строение дрожжевой клетки
- •3. Питание и метаболизм дрожжей
- •4. Генетика дрожжей
- •5. Микробиологические аспекты практического использования дрожжей
- •1. Общая характеристика и систематика актиномицетов
- •Краткая характеристика групп родов Группа 22. Нокардиоформные актиномицеты
- •Группа 23. Роды с многогнездными спорангиями
- •Группа 25. Стрептомицеты и близкие роды
- •Группа 26. Мадуромицеты
- •Группа 29. Другие роды
- •2. Морфология актиномицетов.
- •3. Характеристика актиномицетов по химическому составу и строению клеточных стенок.
- •4. Питательные потребности и условия культивирования актиномицетов.
- •1.Общая характеристика скользящих организмов
- •2. Миксобактерии
- •3. Алгицидные миксобактерии, не образующие плодовых тел
- •4. Группа цитофаг
- •5. Нитчатые скользящие хемогетеротрофы
- •6. Нитчатые бактерии, окисляющие соединения серы
- •1. Общая характеристика бактерий, образующих эндоспоры
- •2. Аэробные спорообразующие бактерии (Род Bacillus)
- •3. Анаэробные спорообразующие бактерии: род clostridium
- •4. Другие спорообразующие бактерии
- •5. Спорообразование
2. Нитрифицирующие бактерии
B середине XIX в. появились косвенные указания на то, что в природе окисление аммония в нитрат осуществляют микробы. Однако многочисленные попытки выделить эти агенты, пользуясь обычными культуральными средами, оказались безуспешными. Это удалось сделать лишь в 1890 г. С. Виноградскому. Использовав строго неорганические среды, он смог выделить чистые культуры нитрифицирующих бактерий. Было доказано, что за этот процесс отвечают небольшие грамотрицательные палочковидные бактерии — окисляющие аммоний Nitrosomonas и окисляющие нитрит Nitrobacter. Для их роста наиболее благоприятны нейтральные или щелочные условия. Поскольку при окислении аммония до нитрита образуется в значительных количествах кислота, среда для выращивания Nitrosomonas должна обладать достаточной буферной емкостью (например, в нее должны быть добавлены нерастворимые карбонаты). Оба типа бактерий растут медленно, и минимальное время их удвоения составляет около 24 ч. Невысок также и выход биомассы в расчете на количество окисленного неорганического субстрата. Виноградский показал, что эти бактерии являются облигатными автотрофами, неспособными развиваться в отсутствие специфичного для них неорганического источника энергии.
Число открытых в последние годы неизвестных ранее бактерий, окисляющих аммоний и нитрит, весьма невелико. По своей физиологии все они похожи на два упомянутых выше классических прототипа, но удивительно разнородны по структуре (таблица.2). Группа нитрифицирующих бактерий невелика и включает всего восемь видов, отнесенных к семи родам, которые различаются по структуре, а также по типу окисляемых субстратов. Вариации в нуклеотидном составе ДНК как среди бактерий, окисляющих аммоний, так и среди бактерий, окисляющих нитрит, невелики, причем у последних ГЦ-содержание существенно выше, чем у первых.
Разнообразию форм клеток нитрифицирующих бактерий соответствует удивительное разнообразие их тонкой структуры. У некоторых родов этих бактерий цитоплазматическая мембрана образует обширные, проникающие далеко в глубь клетки везикулярные, ламеллярные или трубчатые разрастания, тогда как у других такие разрастания отсутствуют.
Как правило, нитрифицирующие бактерии являются облигатными автотрофами. Исключение составляют некоторые штаммы Nitrobacter, использующие в качестве источника углерода и энергии уксусную кислоту. Однако эти штаммы растут на ацетате гораздо медленнее, чем на нитрате.
ТАБЛИЦА 2.- Нитрофицирующие бактерии
Реакция, поставляющая анергию
|
Форма клеток
|
Характер жгутико-вания
|
Мембранные разрастания
|
ГЦ-содержание ДНК, %
|
Обли-гатная авто-троф-ность
|
Род
|
NH3→NO2-
|
Палочковидные
Туго закрученные спиральные Сферические
Неправильной формы, дольчатые
|
Субполярный2 Перитри-хальный2 Перитри-хальный2 Перитри-хальный2
|
Ламеллярные Отсутствуют Ламеллярные Везикулярные
|
50—51
54
50—51
54—55
|
+
+
+
+
|
Nitrosomo- nas Nitrosospira
Nitrosococcus
Nitrosolobus
|
NO2-→NO3-
|
Палочковидные, часто грушевидные
|
-
|
Ламеллярные
|
60-62
|
+ или-
|
Nitrobacter
|
Длинные, тонкие палочки Сферические
|
-
Полярный
|
Отсутствуют Трубчатые
|
58
61
|
+
+
|
Nitrospina
Nitrococcus
|
1. Размножаются почкованием; все остальные нитрифицирующие бактерии размножаются бинарным делением.
2. Некоторые штаммы неподвижны.
