- •Сборник лекций
- •Курс: Третий
- •2. Горизонтальный транспорт генов у бактерий в природных экосистемах и его роль в эволюции и систематике прокариот
- •4. Механизмы, контролирующие генетическую изоляцию бактериального генома.
- •5. Эволюция бактериального генома.
- •1. Терминология и номенклатура, используемые в систематике прокариот
- •2. Фенотипическая систематика
- •4. Хемотаксономическая систематика
- •5. Геносистематика
- •1. Основные проблемы филогении прокариот.
- •2. Понятие о молекуле - хронометре
- •3. Концепция к. Вуза о трех линиях эволюции, трех формах жизни
- •4. Дистанционно-матричный метод построения филогенетических деревьев и их конструкции (веерообразная и сильно разветвленная дихотомическая). Гипотеза о. Кандлера о трех типах независимых проклеток
- •5. Методологические ловушки в филогенетической систематике микроорганизмов
- •1. Принципы построения идентификационных схем.
- •2. Общие правила при идентификации бактерий
- •3. Деление царства прокариот на высшие таксоны. Характеристика отделов
- •4. Группы прокариотных организмов и их основные представители
- •1. Сравнительная характеристика прокариот и эукариот
- •2. Основные принципы систематики эукариотных микроорганизмов
- •3. Группы низших эукариот
- •4. Фаготрофия и симбиоз – основные элементы существования протистов
- •5. Основы классификации вирусов
- •Лекция 2.1. Молекулярные и структурные аспекты организации архей. Общая характеристика. Систематика.
- •I. Положение архебактерий в системе царств органического мира
- •2. Характерные особенности отдельных групп архебактерий
- •3. Молекулярная биология архебактерий
- •4. Метаболизм архебактерий.
- •5. Структурная организация геномов архебактерий
- •1. Аэробные сероокислящие бактерии
- •2. Анаэробные серовосстанавливающие бактерии
- •3. Галофильные архебактерии.
- •4. Термоацидофильные микоплазмы
- •Раздел 1.
- •Раздел 2.
- •Раздел 3.
- •Раздел 4.
- •1. Классификация метанообразующих бактерий
- •2. Культурально-морфологические свойства метаногенов
- •3. Тип питания и метаболизм метанообразущих бактерий
- •4. Механизм энергетических процессов у метанообразущих бактерий
- •5. Местообитание и практическое применение метаногенов.
- •1. Пигменты фотосинтезирующих эубактерий
- •2. Строение фотосинтетического аппарата эубактерий
- •3. Группы фотосинтезирующих эубактерий
- •3. Цианобактерии
- •5. Прохлорофиты
- •1. Пурпурные бактерии
- •2. Зеленые эубактерии
- •3. Гелиобактерии
- •4. Распространение фототрофных эубактерий в природе
- •1. Явление автотрофии в микробиологии. Характеристика физиологических групп аэробных хемоавтотрофов
- •2. Нитрифицирующие бактерии
- •3. Бактерии, окисляющие серу
- •4. Железобактерии
- •5. Водородные бактерии
- •6. Метаболическая основа хемоавтотрофии
- •Явление облигатной автотрофии
- •Подавление роста органическими соединениями
- •1. Общая характеристика и систематика метаноокисляющих бактерий
- •2. Морфология вегетативных клеток
- •3. Ультратонкое строение клеток
- •4. Окисление углеродных соединений как основное свойство метанотрофов
- •5. Свойства метанотрофов в свете практического применения
- •2. Молочнокислое брожение и бактерии вызывающие данный процесс
- •3. Эубактерии осуществляющие спиртовое брожение
- •4. Пропионовокислое брожение
- •5. Клостридии и маслянокислый тип брожения
- •1. Системы классификации и таксономия дрожжей
- •2. Строение дрожжевой клетки
- •3. Питание и метаболизм дрожжей
- •4. Генетика дрожжей
- •5. Микробиологические аспекты практического использования дрожжей
- •1. Общая характеристика и систематика актиномицетов
- •Краткая характеристика групп родов Группа 22. Нокардиоформные актиномицеты
- •Группа 23. Роды с многогнездными спорангиями
- •Группа 25. Стрептомицеты и близкие роды
- •Группа 26. Мадуромицеты
- •Группа 29. Другие роды
- •2. Морфология актиномицетов.
- •3. Характеристика актиномицетов по химическому составу и строению клеточных стенок.
- •4. Питательные потребности и условия культивирования актиномицетов.
- •1.Общая характеристика скользящих организмов
- •2. Миксобактерии
- •3. Алгицидные миксобактерии, не образующие плодовых тел
- •4. Группа цитофаг
- •5. Нитчатые скользящие хемогетеротрофы
- •6. Нитчатые бактерии, окисляющие соединения серы
- •1. Общая характеристика бактерий, образующих эндоспоры
- •2. Аэробные спорообразующие бактерии (Род Bacillus)
- •3. Анаэробные спорообразующие бактерии: род clostridium
- •4. Другие спорообразующие бактерии
- •5. Спорообразование
2. Анаэробные серовосстанавливающие бактерии
Впервые анаэробные серовосстанавливающие экстремально-термофильные архебактерии были выделены Штеттером и Циллигом в 1981 г. из серосодержащих грязей со дна океана и глубоководных гидротермальных источников, расположенных вблизи потухших вулканов в Италии и Исландии. Открытые бактерии были отнесены к порядку Thermoproteales и разделены на семейства - Thermoproteaceae, Desulfurococcaceae, Thermococcaceae. Четвертое семейство пока не получило официального наименования, но условно названо "Stiff filaments"- "упругие нити".
Таксономическое положение семейств порядка Thermoproteales было определено на основании данных по перекрестной гибридизации 16S рРНК и ДНК различных архебактерий. Дендрограмма, полученная на основании этих результатов (рисунок 1), в основном совпадает с дендрограммой, представленной Вузом. Согласно проведенным экспериментам представители порядка Thermoprotealee попадают в одну подгруппу с Sulfolobus и вместе с Sulfolobus образуют отдельную ветвь архебактерий.
Рисунок 1. Дендрограмма функциональной стабильности гибридомов между 16S РНК и ДНК архебактерий.
В настоящее время группа анаэробных серовосстанавливающих бактерий насчитывает 7 родов (таблица 3). В состав группы входят бактерии с разной морфологией (таблица 4). Среди них есть неподвижные и подвижные формы, передвигающиеся с помощью полярно расположенных жгутиков.
Размножение отдельных видов происходит почкованием (Thermoproteus tenax, Thermophilum pendens). Почка образуется главным образом терминально, но также может образовываться на различных частях клеточной поверхности.
Таблица 3.- Анаэробные серовосстанавливающие архебактерии
Микроорганизмы
|
Год открытия
|
Место обитания
|
Оптимальная температура
|
Оптимальный рН
|
Содержание ГЦ в ДНК, мол. %
|
Thermoproteus tenax
|
1981
|
морская донная грязь в Исландии
|
88
|
5,5
|
55,5
|
Desulfurococcus D.mobilis D.mucosus
|
1981
|
кислые горячие источники в Исландии
|
85
|
5,5-6,0
|
50,8 51,3
|
Thermophilum pendens
|
1983
|
серные горячие источники в Исландии
|
88-90
|
5,0-6,0
|
57,4
|
Thermococcus celer
|
1983
|
горячие источники вулканического происхождения в Италии
|
88
|
5,8
|
нд*
|
Thermodiscus maritimus
|
1983
|
горячие источники вулканического происхождения в Италии
|
85
|
6,5
|
нд *
|
Pyrodictium P.occultum P.brockli
|
1983
|
донные морские гидротермы в Италии
|
105 105
|
6,5 6,5
|
62 51,6-56,6
|
Pyrococcus furiosus
|
1986
|
геотермально обогреваемые морские осадки в Италии
|
100
|
7,0
|
нд*
|
*нд - нет данных
|
|||||
У некоторых представителей анаэробных серовосстанавливающих архебактерий обнаружены пили. У Pyrodictium найдена необычная сеть фибрилл, которая часто бывает представлена в виде связок. Высказывается мнение, что сеть фибрилл предохраняет клетки от сверхвысокой температуры и принимает участие в метаболизме.
В качестве запасного вещества продуцируют гликоген (Thermococcus Desulfurococcus, Thermoproteus).
Клеточная стенка серовосстанавливающих архебактерий построена из гликопротеиновых субъединиц гексагонального строения. Исключение составляет Pyrodictium brockii. Преобладающим компонентом клеточной стенки этого организма является белок с молекулярной массой 150000. Следует отметить, что субъединицы гексагонального строения у анаэробных бактерий встречаются редко и известны только у экстремально-термофильных бактерий. Предполагается, что гексагональное расположение субъединиц в поверхностном слое клетки обеспечивает более хорошее покрытие нижних слоев.
Различные виды анаэробных серовосстанавливающих архебактерий имеют температурный оптимум для роста в области 85-I05°C (таблица 3). Максимальная температура их роста находится в пределах 90-110°С. Среди них встречаются ацидофилы и нейтрофилы (таблица 3). Некоторые виды (Pyrodictium) устойчивы к высоким концентрациям NaCL (12 %).
В группе анаэробных серовосстанавливающих бактерий известны облигатные и факультативные автотрофы, гетеротрофы (таблица 4). Механизм фиксации СО2 у автотрофных Thermoproteales пока на расшифрован. Из органических соединений используют пептиды, аминокислоты (Desulfurococcus, Thermococcus), углеводы, например, крахмал, мальтозу (Pyrococcus), гликоген, глюкозу (Thermoproteus), а также простые соединения, такие, как формальдегид, формиат, малат, фумарат, метанол, этанол (Thermoproteus).
Распространенной формой энергетического метаболизма серовосстанавливающих архебактерий является "анаэробное дыхание". Конечным акцептором электронов служит молекулярная сера, которая восстанавливается до H2S. Из неорганических доноров электронов и энергии ряд представителей Thermoproteales (Thermoproteus, Thermodiscus, Pyrodictium) могут использовать Н2. Представители двух родов этого порядка – Desulfurococcus и Thermococcus – способны к брожению.
Таблица 4.- Характеристика некоторых свойств анаэробных серовосстанавливающих архебактерий
Микроорганизмы
|
Морфология
|
Подвижность
|
Способ питания
|
Thermoproteus tenax
|
Палочки, весьма вариабельны 0,5x1-80 мкм. Иногда дают разветвления без септ. Бывают V-образной формы
|
неподвижны
|
факультативные автотрофы
|
Desulfurococcus mobilis
|
Кокки, вариабельны 0,2-5 мкм
|
подвижны, жгутики монополярные политрихи
|
гетеротроф
|
Thermophilum pendens
|
Нитевидные палочки: 0,17-0,35х1-100 мкм. Иногда дают разветвления
|
неподвижны
|
гетеротроф
|
Thermococcus celer
|
Клетки сферические I мкм
|
подвижны, жгутики монополярные политрихи
|
гетеротроф
|
Thermodiscus maritimus
|
Клетки диcковидные
|
нд*
|
облигатный автотроф
|
Pyrodictium occultum
|
Клетки в форме плоских дисков 0,2x0,3-2,5 мкм
|
нд*
|
облигатный автотроф
|
Pyrococcus furiosus
|
Клетки сферические 0,8-2,5 мкм
|
подвижны, жгутики монополярные политрихи
|
гетеротроф
|
*нд - нет данных
|
|||
В природной обстановке серовосстанавливащие анаэробные архебактерии находятся в тесном сообществе друг с другом и некоторыми термофильными архебактериями. Предполагают, что распространенные в гидротермальных источниках хемолитотрофные бактерии Thermodiscus и Thermoproteus наряду с Sulfolobus и термофильными метаногенами являются продуцентами органического вещества, которое используется гетеротрофными организмами Thermophilum и Desulfurococcus.
