- •Сборник лекций
- •Курс: Третий
- •2. Горизонтальный транспорт генов у бактерий в природных экосистемах и его роль в эволюции и систематике прокариот
- •4. Механизмы, контролирующие генетическую изоляцию бактериального генома.
- •5. Эволюция бактериального генома.
- •1. Терминология и номенклатура, используемые в систематике прокариот
- •2. Фенотипическая систематика
- •4. Хемотаксономическая систематика
- •5. Геносистематика
- •1. Основные проблемы филогении прокариот.
- •2. Понятие о молекуле - хронометре
- •3. Концепция к. Вуза о трех линиях эволюции, трех формах жизни
- •4. Дистанционно-матричный метод построения филогенетических деревьев и их конструкции (веерообразная и сильно разветвленная дихотомическая). Гипотеза о. Кандлера о трех типах независимых проклеток
- •5. Методологические ловушки в филогенетической систематике микроорганизмов
- •1. Принципы построения идентификационных схем.
- •2. Общие правила при идентификации бактерий
- •3. Деление царства прокариот на высшие таксоны. Характеристика отделов
- •4. Группы прокариотных организмов и их основные представители
- •1. Сравнительная характеристика прокариот и эукариот
- •2. Основные принципы систематики эукариотных микроорганизмов
- •3. Группы низших эукариот
- •4. Фаготрофия и симбиоз – основные элементы существования протистов
- •5. Основы классификации вирусов
- •Лекция 2.1. Молекулярные и структурные аспекты организации архей. Общая характеристика. Систематика.
- •I. Положение архебактерий в системе царств органического мира
- •2. Характерные особенности отдельных групп архебактерий
- •3. Молекулярная биология архебактерий
- •4. Метаболизм архебактерий.
- •5. Структурная организация геномов архебактерий
- •1. Аэробные сероокислящие бактерии
- •2. Анаэробные серовосстанавливающие бактерии
- •3. Галофильные архебактерии.
- •4. Термоацидофильные микоплазмы
- •Раздел 1.
- •Раздел 2.
- •Раздел 3.
- •Раздел 4.
- •1. Классификация метанообразующих бактерий
- •2. Культурально-морфологические свойства метаногенов
- •3. Тип питания и метаболизм метанообразущих бактерий
- •4. Механизм энергетических процессов у метанообразущих бактерий
- •5. Местообитание и практическое применение метаногенов.
- •1. Пигменты фотосинтезирующих эубактерий
- •2. Строение фотосинтетического аппарата эубактерий
- •3. Группы фотосинтезирующих эубактерий
- •3. Цианобактерии
- •5. Прохлорофиты
- •1. Пурпурные бактерии
- •2. Зеленые эубактерии
- •3. Гелиобактерии
- •4. Распространение фототрофных эубактерий в природе
- •1. Явление автотрофии в микробиологии. Характеристика физиологических групп аэробных хемоавтотрофов
- •2. Нитрифицирующие бактерии
- •3. Бактерии, окисляющие серу
- •4. Железобактерии
- •5. Водородные бактерии
- •6. Метаболическая основа хемоавтотрофии
- •Явление облигатной автотрофии
- •Подавление роста органическими соединениями
- •1. Общая характеристика и систематика метаноокисляющих бактерий
- •2. Морфология вегетативных клеток
- •3. Ультратонкое строение клеток
- •4. Окисление углеродных соединений как основное свойство метанотрофов
- •5. Свойства метанотрофов в свете практического применения
- •2. Молочнокислое брожение и бактерии вызывающие данный процесс
- •3. Эубактерии осуществляющие спиртовое брожение
- •4. Пропионовокислое брожение
- •5. Клостридии и маслянокислый тип брожения
- •1. Системы классификации и таксономия дрожжей
- •2. Строение дрожжевой клетки
- •3. Питание и метаболизм дрожжей
- •4. Генетика дрожжей
- •5. Микробиологические аспекты практического использования дрожжей
- •1. Общая характеристика и систематика актиномицетов
- •Краткая характеристика групп родов Группа 22. Нокардиоформные актиномицеты
- •Группа 23. Роды с многогнездными спорангиями
- •Группа 25. Стрептомицеты и близкие роды
- •Группа 26. Мадуромицеты
- •Группа 29. Другие роды
- •2. Морфология актиномицетов.
- •3. Характеристика актиномицетов по химическому составу и строению клеточных стенок.
- •4. Питательные потребности и условия культивирования актиномицетов.
- •1.Общая характеристика скользящих организмов
- •2. Миксобактерии
- •3. Алгицидные миксобактерии, не образующие плодовых тел
- •4. Группа цитофаг
- •5. Нитчатые скользящие хемогетеротрофы
- •6. Нитчатые бактерии, окисляющие соединения серы
- •1. Общая характеристика бактерий, образующих эндоспоры
- •2. Аэробные спорообразующие бактерии (Род Bacillus)
- •3. Анаэробные спорообразующие бактерии: род clostridium
- •4. Другие спорообразующие бактерии
- •5. Спорообразование
2. Характерные особенности отдельных групп архебактерий
В настоящее время царство архебактерий объединяет 7 порядков и 5 физиологических групп микроорганизмов. Рассмотрим данные группы (таблица 3).
Таблица 3.- Группы архебактерий (Дуда и др., 1985)
Группа
|
Некоторые характерные особенности
|
Метанообразущие
Аэробные се-роокислящие
Анаэробные серо восстанавливающие
Галофилы
Термоацидофильные "микоплазмы"
|
Образуют метан из Н2 + С02, С0, ацетата, формиата, метанола, метиламинов. Строгие анаэробы. Облигатные и факультативные автотрофы и гетеротрофы Мезо- и термофилы. Нейтрофилы, оптимум рН 6,0-7,0. Имеются галофильные виды
Окисляют элементарную серу, используя ее в качестве источника энергии. Факультативные автотрофы. Аэробы. Термофилы, оптимум температуры 70-75 °С. Ацидофилы, оптимум рН 3,0 Восстанавливают элементарную серу до Н2S. Строгие анаэробы. Облигатные и факультативные автотрофы, гетеротрофы. Экстремальные термофилы, оптимум температуры от 85 до 105° С. Ацидофилы и нейтрофилы. Экстремальные галофилы, оптимум концентрации NaCL в среде - 20-25 %. Факультативные фототрофы. Аэробы и факультативные анаэробы Гетеротрофы. Термофилы, оптимум температуры 60° С. Ацидофилы, оптимум рН 1-2. Аэробы |
Стоимт отметить, что филогенетические отношения между архебактериями указываают нам на то, что данное царство делится на две (или три) подгруппы. Одну образуют метаногены и галофилы, другую - термоацидофилы. Вопрос относительно положения Thermoplasma среди архебактерий до сих пор остается открытым. Состав оснований ДНК - стандартная мера филогенетического различия - внутри подгруппы архебактерий по молярной доле содержания (Г + Ц) варьирует от 28 до 68 %. Это дает основания предполагать, что группа архебактерий может содержать гораздо больше представителей, чем известно в настоящее время.
Далее рассмотрим цитологию архебактерий.
По общей морфологии, размерам клеток и их ассоциаций, а также по ультраструктурной организации архебактерии принципиально не отличаются от эубактерий.
Все это справедливо за исключением Thermoplasma, клетки всех архебактерий отграничены от окружающей среды клеточной стенкой. У некоторых метаногенов клетки объединены под внешним чехлом. Многие виды архебактерий обладают жгутиками бактериального типа и фимбриями. У ряда форм обнаружены цитоплазматические включения - газовые вакуоли. В качестве запасных веществ накапливают гликоген, поли-3-гидрооксибутират и полифосфаты.
3. Молекулярная биология архебактерий
Исследование клеточных стенок архебактерий показало, что они по химическому составу и строению более вариабельны, чем клеточные стенки эубактерий. В настоящее время у архебактерий обнаружено 4 типа клеточных стенок, построенных из различных полимеров. Однако ни один из них не содержит мурамовой кислоты и Д-аминокислот, обязательных компонентов клеточной стенки эубактерий (табллица 4).
Вместе с тем среди метанообразующих бактерий имеются виды, в клеточной стенке которых содержится пептидогликан, получивший название псевдомуреин (псевдомуреиновый тип). Он относится к гликопептидам, но отличается от муреина по составу полисахаридов. В пептидных мостиках присутствуют только L-аминокислоты.
В связи с тем, что в клеточных стенках архебактерий отсутствует муреин, они устойчивы к β-лактамным антибиотикам и другим ингибиторам синтеза пептидогликана. Мебраны ахебактерий включают липиды особого типа и этим резко отличаются от других организмов.
Таблица 4.- Клеточные стенки архебактерий (Воробьева, 1987)
Группа
|
Род
|
Регидный мешок
|
Белковая оболочка
|
Полимер
|
Метанообразуюцие
|
Methanobacterium Methanosarcina Methanococcus
|
+ + -
|
- - +
|
псевдомуреин гетерополисахарид белковые субъединицы
|
Аэробные сероокислящие
|
Sulfolobus
|
-
|
+
|
гликопротеиновые субъединицы
|
Анаэробные серовосстанавливающие
|
Thermoproteus
Desulfurоcoccus |
-
-
|
+
+ |
гликопротеиновые субъединицы то же
|
Галофилы
|
Halobacterium
Halococcus
|
-
+ |
+
- |
гликопротеиновые или белковые субъ-единицы сульфатированный гетерополисахарид |
Термоацидо-фильные ми-коплазмы"
|
Thermoplaema
|
+
|
-
|
не имеет клеточной стенки
|
Диэфиры архебактерий способны образовывать обычные билипидные мембраны. В молекулах тетраэфира гидрофобные части в мембране частично связаны. Поэтому мембраны тех архебактерий, в которых большинство глицеролипидов представлены тетраэфирами, являются монослойными (рисунок) . Таким образом, у архебактерий нарушается принцип расположения липидов в виде бимолекулярного слоя, характерный для остальных организмов.
В мембранах архебактерий присутствуют полярные фосфолипиды и гликолипиды, образованные на основе ди- и тетраэфиров. В состав нейтральных липидов входят изопреноидные и гидроизопреноидные углеводороды.
У архебактерий обнаружена необычная структура субъединиц ДНК-зависимых РНК-полимераз. В их состав входит от 9 до 12 отдельных субъединиц (у эубактерий от 4 до 8). При этом различают два типа РНК-полимераз архебактерий: один с 4 большими компонентами найден у метаногенов и галофилов; второй - с 3 большими компонентами обнаружен у термоацидофилов.
Главной особенностью рибосом архебактерий является наличие у них черт, характерных для эубактериальных и эукариотических рибосом. Например, рибосомы архебактерий, как и эубактерий, осаждаются при 70S и состоят из 2 частей: большой – 50S и малой – 30S субчастиц. По строению 30S субъединица архебактерий имеет сходство с аналогичной субъединицей эукариот. Рибосомный белок А архебактерий по последовательности аминокислот сходен с соответствующим белком эукариот и т.д. Отличительным свойством рибосом архебактерий является их нечувствительность ко многим ингибиторам эубактериальных и эукариотических рибосом. Имеются отличия и в количестве рибосомальных белков в 30S субъединице - их больше, чем у эубактерий, и меньше, чем у эукариот. Рибосомные белки архебактерий характеризуются большей кислотностью по сравнению с белками рибосом эубактерий.
Рибосомы архебактерий внутри царства Archaebacteriа могут быть разделены по размеру на 2 класса, которые различаются только по относительному содержанию в них белка. Рибосомы первого класса характерны для экстремальных галофилов и всех метаногенов, кроме Methanoсоссасеае. Они сходны по размеру с рибосомами эубактерий, имеют общую массу 2, 3 МД, состоят из большой и малой субъединиц соответственно по 1,5 и 0,8 МД и, как рибосомы эубактерий, содержат 1/3 белка и 2,3 РНК. Рибосомы второго класса характерны для Мethanocoсceaceae и серозависимых термофилов. Они тяжелее эубактериальных (общая масса 3 МД, субъединицы по 1,8 и 1,2 МД) и характеризуются тем же соотношением - белок: РНК, что и рибосомы эукариот (55 и 50 % белка соответственно в малой и большой субъединицах).
