- •Введение
- •Порядок проведения занятия
- •Техника безопасности
- •Тема 1 изучение влияния различных температур на рост и развитие популяции микроорганизмов Цели занятия:
- •Вопросы и задания для самоподготовки
- •Оборудование и материалы:
- •Общие сведения
- •Ход работы
- •Тема 2 общий микробиологический анализ почвы Цель занятия:
- •Вопросы и задания для самоподготовки
- •Оборудование и материалы:
- •Общие сведения
- •Ход работы
- •Тема 3 Учет ризосферной и корневой микрофлоры растений Цель занятия:
- •Вопросы и задания для самоподготовки
- •1. Метаногенное сообщество
- •7. Роль микробных сообществ в глобальных изменениях
- •Оборудование и материалы:
- •Общие сведения
- •Ход работы
- •Тема 4 получение почечной культуры клеток морской свинки методом теплой трипсинизации Цель занятия:
- •Вопросы и задания для самоподготовки
- •Оборудование и материалы
- •Общие сведения
- •Номенклатура культур тканей и клеток
- •Культивирование первичных однослойных культур
- •Питательны среды сбалансированные солевые растворы, используемые для культивирования клеток
- •Ход работы
- •Общие сведения
- •Ход работы
- •Ход работы
- •Перечень вопросов к зачету по курсу экология микроорганизмов
- •Библиографический список Обязательная
- •Дополнительная
Общие сведения
Вводные пояснения. Аммонификация — это минерализация азотсодержащих органических веществ, протекающая под воздействием аммонифицирующих микробов. Микроорганизмы, осуществляющие аммонификацию белковых веществ, выделяют в окружающую среду протеолитические ферменты (протеазы и пептидазы), под действием которых белки гидролизуются до аминокислот. В свою очередь, аминокислоты, поступая в клетку, дезаминируются с образованием аммиака (NH3), органических кислот и других продуктов. В белках С : N = 3,5 : 1. При разложении белков в анаэробных условиях выделяются также H2S, меркаптаны, скатол и индол, имеющие неприятный запах, кадаверин и путресцин (диамины). В аэробных условиях конечными продуктами являются NH3, CO2, Н2О, сульфаты.
Благодаря аммонификации представителей растительного и животного мира и их продуктов жизнедеятельности (мочевины, испражнений) почва обогащается азотом и другими соединениями. Одновременно с этим аммонифицирующие микробы выполняют огромную санитарную роль, очищая почву и гидросферу от разлагающегося органического субстрата. Основными представителями широко распространенных в природе аммонифицирующих микробов являются следующие микроорганизмы: Вас. probatus и Sporosarcina ureae.
Спорообразующие аэробы — это Вас. mesentericus (картофельная бактерия), Вас. megatherium (капустная бактерия), Вас. subtilis (сенная палочка), Вас. mycoides (грибовидная бацилла). Не образующие спор аэробные аммонификаторы — это Е. coli, Proteus vulgaris, Ps. fluorescens.
К анаэробным спорообразующим аммонификаторам относятся Cl. putrificum (газообразующая клостридия), Cl. sporogenes. Подсчитано, что весь животный мир земного шара за сутки выделяет 150 тыс. т мочевины. За год это составляет более 50 млн. т мочевины, или 20 млн. т азота.
Аммонификацию вызывают также актиномицеты, грибы, триходермы, живущие в почве.
Нитрификация — следующий за аммонификацией этап превращения азота микроорганизмами. Этот процесс представляет собой окисление аммиака, образующегося при разложении органических азотсодержащих соединений.
Денитрификация, протекающая под воздействием микробов, представляет собой восстановление нитратов с образованием в качестве конечного продукта — молекулярного азота, возвращающегося из почвы в атмосферу. Вызывается этот процесс денитрифицирующими бактериями. Наиболее распространенные из них в природе: Tiolacillus denitrificans — палочка, не образующая спор, факультативный анаэроб; Ps. fluorescens — подвижная палочка, выделяет зеленоватый пигмент, быстро разлагает нитраты; Ps. aeruginosa — бактерия сходна с предыдущей; Ps. Stutzeri — небольшая палочка, образующая цепочки, разлагает нитраты в анаэробных условиях.
Ход работы
Минерализация азотсодержащих органических соединений
Аммонификация белковых веществ
Постановка опыта. Для изучения аммонификации белковых веществ питательной средой может служить мясной бульон с добавлением 3% пептона.
По 10 мл среды разливают в 2 пробирки и добавляют по 1.0 -2.0 г почвы. Пробирки закрывают ватными пробками. Над средой подвешивают две бумажки — красную лакмусовую, или универсальную индикаторную бумагу, смоченную дистиллированной водой, для обнаружения выделяющегося аммиака и фильтровальную, смоченную щелочным раствором ацетата свинца, для выявления сероводорода и меркаптана. Закрепляют их между пробкой и стенками пробирки. Бумажки не должны касаться среды.
На 3—5-е сут инкубации при 28—30 °С опыт заканчивают и содержимое пробирок анализируют. Определяют возбудителей процесса аммонификации белка и продукты их жизнедеятельности.
Микроскопирование. Для обнаружения возбудителей гнилостного распада белковых веществ готовят фиксированный и окрашенный препарат.
Чаще других на препарате встречаются подвижные клетки Proteus vulgaris (от греч. Proteys — в древнегреческой мифологии морское божество, способное менять свой облик; от лат. vulgaris — обыкновенный, простой) преобладающие на первых стадиях распада белков.
Р
ис.1.
Proteus
vulgaris
Это неспорообразующие, неодинаковой длины палочки. Кроме того, на препарате можно наблюдать много спорообразующих клеток Bacillus mycoides и Clostridium putrificus. У последних споры расположены терминально и диаметр их превышает ширину клетки. Вас. mycoides вызывает аммонификацию белковых веществ в аэробных условиях, а С. putrificus — в анаэробных, но может также развиваться и в аэробных условиях, если в среде находятся аэробные микроорганизмы, поглощающие кислород.
Качественные реакции на продукты гнилостного распада белка. Выделяющийся в атмосферу NH3 окрашивает подвешенную полоску красной лакмусовой бумаги в синий цвет.
Накопление аммиака в культуральной жидкости устанавливают при помощи реактива Несслера. Реакция капельная. На фарфоровые пластинки с лунками или в чашки помещают каплю культуральной жидкости, затем — каплю реактива. При большом количестве аммиака образуется коричневый или буроватый осадок, при небольшом — появляется оранжевая или желтая окраска.
Сероводород обнаруживают с помощью подвешенной полоски фильтровальной бумаги, смоченной ацетатом свинца [РЬ(СН3СОО)2]. Бумага чернеет под действием сероводорода. Если она покрывается серебристым налетом, значит, наряду с H2S выделяются еще и меркаптаны (например, метилмеркаптан CH3SH).
Материалы, представляемые в отчет по лабораторной работе
1. Описать последовательность проведения работ
2. Результаты работы записать.
3. Изложить выводы по работе.
ТЕМА 6
ИЗУЧЕНИЕ УГЛЕВОДОРОДОКИСЛЯЮЩЕЙ МИКРОФЛОРЫ ПОЧВЫ
Цель занятия:
Выделение углеводородокисляющей микрофлоры почвы
Вопросы и задания для самоподготовки
1. Симбиозы прокариот и протистов
2. Симбиоз микроорганизмов и растительноядных животных
3. Симбиозы микроорганизмов и морских животных
4. Паразитизм – как стратегия жизни микроорганизмов
5. Факторы патогенности
6. Роль токсинов в экологии бактерий
7. Концепция и стратегии паразитизма
Оборудование и материалы
Микроскоп биологический МБР-3 или аналогичный
Спиртовка.
Термостат.
Пробирки с жидкой питательной средой..
Материалы (предметные стекла для микропрепаратов; пробирки стеклянные, вместимостью 15 мл; пипетки, вместимостью 1,0 и 5,0 мл с делениями).
Общие сведения
Широкая механизация сельского хозяйства приводит к загрязнению сельскохозяйственных земель значительным количеством углеводородов. Так, керосин и бензин, используемые в тракторных, автомобильных и других двигателях, мазут и дизельное топливо, применяемые на сельских электростанциях, попадая в почву, приводят к нарушению ее свойств, ухудшают экологическую ситуацию, а аварийные разливы нефти превращают почву в техногенную пустыню. Образцы почвы, загрязненные нефтепродуктами, продемонстрировали мутагенные эффекты на растениях. В городе источниками загрязнения являются сети АЗС, моек, станций технического обслуживания автомобилей содержание нефтепродуктов в почвах "значительно увеличилось". Доля участков, загрязненных нефтепродуктами свыше допустимого уровня, в среднем по Москве составила 26%, бензофенолом - 34% от общего числа обследованных участков.
Состав нефти и нефтепродуктов характеризуется высоким процентом парафиновых, нафтеновых и ароматических углеводородов, В почве эти продукты окисляют микроорганизмы. Углеводороды хорошо окисляют представители родов Pseudomonas (P. aeruginosa, P. putida), Mycobacterium, Arthrobacter и Nocardia. Загрязненные места должны быть рано или поздно подвергнуты очистке — ремедиации (лечению). Внесение в загрязненные почвы микроорганизмов, способных разлагать соответствующие специфические вещества используют в целях очистки загрязненных почв органическими веществами и нефтепродуктами. В настоящему времени выделено и описано большое количество бактерий, способных использовать нефтяные загрязнения, токсические соединения. Применение таких культур в качестве посевного материала может быть полезно в свежих загрязнениях, когда автохтонная микробная популяция еще не успела развиться или плотность ее очень низка. В любом случае необходимо обеспечить доступность загрязняющих веществ для использования их микроорганизмами. Здесь важную роль играют дисперсия и растворение загрязнителей, а также снабжение микроорганизмов источниками азота и фосфора. Их недостаток лимитирует микробный метаболизм и рост, а это, в свою очередь, ограничивает процесс биодеградации.
