Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:
Підручник по молекулярній біофізиці .doc
Скачиваний:
115
Добавлен:
09.09.2014
Размер:
450.05 Кб
Скачать

2.9. Дисперсионное взаимодействие.

Дисперсионное или поляризационное взаимодействие наблюдается между молекулами, которые не обладают постоянным дипольным моментом. Они обусловлены внешними слабосвязанными электронами. Природа дисперсионных взаимодействий носит квантомеханический характер и является результатом появления линейных диполей, возникающих в результате движения электронов в молекулах, но обладающих постоянным дипольным моментом.

Энергия притяжения, обусловленная дисперсионными силами:

,

где  - частота колебаний (вращения) электрона; f - частотный фактор {сравним с моментом инерции}.

ТАБЛИЦА. Относительная роль разных видов сил ВВ для отдельных молекул.

Вещество

*1024 см3

Р [D]

Uор

Uинд*105 Дж

Uдисп

H

0.67

0.00

0.00

0.00

6.10

O2

1.51

0.00

0.00

0

39.80

H2O

1.48

1.84

190.00

10.00

47.00

NH3

2.24

1.50

84.00

10.00

70.00

HCl

2.63

2.63

19.00

5.40

111.00

Суммарное ВВ взаимодействие есть Uориент+Uинд+Uдисперс,и для полимеров составляет от 4 до 100 кДж/моль. Силы ВВ лежат в основе некоторых биоструктур и, в частности, биспиральных полинуклеотидов. Упаковка плоских молекул азотистых оснований в вертикальной пачке обеспечивается вертикальными взаимодействиями (стекинг), в которых сила ВВ вносит основной вклад.

2.10. Водородная связь и электростатические взаимодействия.

Наряду с силами Ван-дер-Ваальса, водородная связь и электростатические взаимодействия играют важнейшую роль в стабилизации макромолекулярных структур. В частности, водородная связь стабилизирует внутреннюю структуру полинуклеотидных цепей. Водородная связь осуществляется между атомом водорода одной молекулы и электроотрицательным атомом кислорода (О), азота (N), фтора (F), или хлора (Cl), принадлежащего другой молекуле (известны случаи образования и внутримолекулярных водородных связей). Природа водородной связи сложна и не сводится только к электростатическому притяжению, хотя оно и дает основной вклад в энергию водородной связи. Наряду с взаимодействиями Ван-дер-Ваальса и электростатическими силами, в энергию водородной связи (UH) вносит вклад энергия делокализации (Uделок.) 2электронов связи (А-Н) и неподеленной пары электронов другого атома. (А - какой-либо из 4электроотрицательных элементов). Энергия делокализации приводит к тому, что длина связи уменьшается. Например, для димера муравьиной кислоты:

Для большинства полимеров энергия водородной связи оценивается:

Uн=Uэл/стат+Uдисп+Uделок+Uотталк, =>

U=-25.2-12.6-33.6+35.3=-36.1 кДж/моль.

Как правило, для большинства биополимеров Uнсвязи лежит в пределах 1235 кДж/моль.

2.11. Физическая природа водородной связи.

Экспериментальные и квантомеханические исследования показывают, что потенциальная энергия водородной связи имеет вид асимметричной кривой с двумя минимумами, локализованными вблизи отрицательных атомов, между которыми протон совершает туннельные переходы.

Потенциальная энергия водородной связи, соответствующая локализации протона около 2-х различных атомов азота.

Проявление водородной связи в спектрах, приводя к расширению инфракрасных полос поглощения А - Н групп, частоты колеблющихся групп, содержащих водородную связь, снижаются по отношению к их свободному состоянию.