- •2.Видатнi вченi бiохiмiки. Внесок українських вчених у розвиток світової біохімії.
- •Робоча (зручна для використання)
- •2. Будова ферментів. Активний та алостеричний центри ферментiв, їх значення.
- •3.Мультиферменти та iзоферменти. Клiнічне значення визначення ізоферментів
- •6. Способи регуляції ферментативної активності
- •1 Етап: перетворення полімерів на мономери. (1% енергії). 2 етап: перетворення мономерів до ацетил-КоА. (25-30% енергії) 3 етап: окиснення ацетил-КоА до со2 та н2о. (70-80% енергії).
- •Цикл трикарбонових кислот Кребса: локалізація в клітині, механізм, регуляція, поповнення метаболітів, енергетичний баланс
- •Пуриновi та пiримiдиновi азотисті основи нуклеїнових кислот, мононуклеозиди, мононуклеотиди - будова та значення
- •Днк: особливості будови та біологічна роль. Структура азотистих основ та вуглеводного компоненту. Правила Чаргаффа. Модель Уотсона-Кріка.
- •Вторинна структура днк
- •Склад, будова, види рнк та їх значення. Структура азотистих основ та вуглеводного компоненту
- •Проміжний обмін нуклеотидів. Бiосинтез та розпад пуринових нуклеотидiв в тканинах. Кiнцевi продукти обмiну. Патологiя пуринового обмiну
- •Біосинтез пуринових нуклеотидів de novo
- •Катаболізм пуринових нуклеотидів
- •Патологія обміну сечової кислоти
- •II. Ретенційна (зменшення виведення сечової кислоти), що спостерігається при хворобах нирок, цукровому діабеті (знижується канальцева секреція сечової кислоти).
- •Бiосинтез та розпад пiримiдинових нуклеотидiв. Оротатурія
- •Катаболізм піримідинових нуклеотидів
- •Молекулярна біологія. Реплікація днк: визначення, фактори та механізм
- •Ферменти і фактори реплікації дн к еукаріот і прокаріот
- •Транскрипція: визначення, етапи та фактори. Промотори та паліндроми. Інгібітори транскрипції. Процесiнг.
- •Механізм транскрипції у еукаріот
- •Посттранскрипційна модифікація рнк (процесію, дозрівання)
- •Молекулярнi основи генетичного коду. "Вироджений" код, "беззмiстовнi" триплети та їх значення. Молекулярнi механiзми точкових мутацiй та їх значення .
- •Регуляцiя матричного синтезу білка у прокаріотів за схемою Жакоб і Моно. Оперон
- •Загальна характеристика нейро-ендокринної регуляцiї обмiну речовин. Міжклітинна інтеграція функцій організму. Хімічна природа, класифiкацiя та характеристика гормонiв та гормоноподібних речовин.
- •Типи міжклітинної комунікації
- •Організація ендокринної системи.
- •Поняття про гормони
- •Цитозольний механізм дії гормонів ліпідної природи. Ліпідні месенджери.
- •Апоптоз: види, сигнальні системи
- •Представники, хiмiчна природа, механiзм дiї, бiологiчна роль гормонiв центральних ендокринних утворень: гiпоталамусу, гiпофiзу, епіфізу. Їх патологiя.
- •3. Гормони епіфіза - “третє око”.
- •Гормони як лiкарськi препарати
- •1.Вітаміни: визначення, класифікація..Основні поняття вітамінології: гіпо-, полігіпо-, гіпер-, авітаміноз, антивітаміни, провітаміни. Причини вітамінної недостатності. Вітаміноподібні речовини
- •6 . Сульфгемоглобін - це продукт незворотного окислення гемоглобіну, в якому розкривається
- •Синтез порфіринів. Порфірії
6. Способи регуляції ферментативної активності
Зміна активності існуючих молекул ферменту - швидка (сек, хв)
Ковалентна модифікація:
Фосфорилування / дефосфорилування
(глікогенфосфорилаза,глікогенсинтетаза)
Обмежений протеоліз:
(пепсиноген →пепсин)
Зміна кількості молекул ферменту – повільна (години, дні)
синтез ферменту –регуляція через геном(дія гормонів)
Клітинна організація ферментативної активності.
ядро: синтез ДНК та РНК
внутрішня мембрана мітохондрій: дихальний ланцюг
матрикс мітохондрій: ЦТК, окисне декарбоксилування α-кетокислот, β-окиснення жирних кислот
лізосоми: гідролази
цитоплазма: гліколіз, синтез жирних кислот
плазматична мембрана: транслокази (транспорт Nа+, К+, глюкози та ін.)
Коферменти, що приймають участь в окисно-відновних реакціях, механізми дії та
біологічне значення.
Коферменти І групи - переносники Н+, ē, Н : А. Вітамінні: аскорбінова кислота
НАД та НАДФ
ФАД та ФМН
5-дезоксиаденозилкобаламін
вітамін Е
Б. Вітаміноподібні: ліпоєва кислота
убіхінон (коензим Q)
тетрагідробіоптерин (ТГБП)
В. Невітамінні: гем
глутатіон (GSH)
Коферменти - переносники хiмiчних груп: хiмiчна природа, механiзм дiї, бiологiчне
значення.
А. Вітамінні: тіаміндифосфат (ТДФ)
коензим А (КоА)
піридоксальфосфат (ПАЛФ)
біоцитин
тетрагідрофолієвая кислота (ТГФК)
метилкобаламін
вітаміни К та А
Б. Вітаміноподібні: карнітин
В. Невітамінні: фосфати нуклеозидів
фосфати вуглеводів
Поняття про біоенергетику. Загальні шляхи катаболізму та етапи вивільнення енергії з
органічних речовин. Центральні метаболіти обміну речовин
Розділ біохімії, що займається питаннями перетворення і використання енергії ... Біоенергетика грунтується на процесах окиснення органічних речовин.
Основні етапи катаболізму
1 Етап: перетворення полімерів на мономери. (1% енергії). 2 етап: перетворення мономерів до ацетил-КоА. (25-30% енергії) 3 етап: окиснення ацетил-КоА до со2 та н2о. (70-80% енергії).
Окисне декарбоксилування пірувату та інших -кетокислот. Структура та значення
мультиферментного комплексу
Окисне декарбоксилювання пірувату здійснюється піруватдегідрогеназним мультиензимним комлпексом, до складу якого входять три різні ферменти та п'ять коферментів. Перетворення пірувату в ацетил-КоА включає 5 стадій (рис. 6-21).
Стадія I.На цій стадії піруват з'єднується з ТДФ в складі Е1 і піддається декарбоксилюванню.
В результаті цієї реакції утворюється похідне ТДФ з гідроксіетільной групою при тіазоловом кільці.
Стадія П.Дігідроліпоілтрансацетілаза (Е2) Каталізує перенесення атома водню і ацетильной групи від ТДФ на окислену форму ліпоіллізінових груп з утворенням ацетілтіоефіра ліпоєвоїкислоти (рис. 6-21).
Стадія III.На стадії III КоА взаємодіє з ацетильную похідним Е2, В результаті чого утворюються ацетил-КоА і повністю відновлений ліпоільний залишок, простетичної група Е2 (Рис. 6-23).
Стадія IV.На стадії IV дігідроліпоілде-гидрогеназу (Е3) Каталізує перенесення атомів водню від відновлених ліпоільних груп на FAD - простетичної групу ферменту Е3.
стадія V. На стадії V відновлений FADH2 передає водень на NAD+ з утворенням NADH.
Піруватдегідрогеназний комплекс характеризується великим негативним окислювально-відновним потенціалом, який забезпечує поряд з відновленням коферменту (NADH) освіту високоенергетичної тіоефірной зв'язку в ацетил-КоА.
Структурне об'єднання 3 видів ферментів створює можливості для координації окремих етапів складної ферментативної реакції. Всі проміжні продукти реакції окислювального декарбоксилювання пірувату міцно пов'язані з комплексом, що збільшує сумарну швидкість процесу і зводить до мінімуму побічні реакції.
Піруватдегідрогеназний комплекс, як і всі білки, що беруть участь в реакціях ЦТК, кодується ядерної ДНК. Транспорт субодиниць ГДК в мітохондрії відбувається складним шляхом за рахунок енергії АТФ або трансмембранного електрохімічного потенціалу за участю білків теплового шоку, або шаперонов (див. Розділ 1), що запобігають їх передчасний фолдінг до надходження в мітохон-дріальний матрикс або внутрішню мембрану мітохондрій.
У піруватдегідрогеназний комплекс (ГДК) входять 3 ферменту: піруватдекарбоксилази (Е1), Дігідроліпоілтрансацетілаза (Е2) І дігідроліпоілдегідрогеназа (Е3), А також 5 коферментів: тіаміндифосфат (ТДФ), ліпоєва кислота ,. FAD, NAD+ і КоА. Крім того, до складу комплексу входять регуляторні субодиниці: протеинкиназа і фосфопротеінфосфатаза.
Всі ці ферменти і коферменти об'єднані в Мультиферментний систему, яка містить різні кількості кожного з ферментів і має молекулярну масу більше 6 ? 106.
У центрі комплексу розташовується дігідроліпоілтрансацетілаза (Е2), Утворюючи його ядро. До дігідроліпоілтрансацетілазе приєднані молекули: піруватдекарбоксилази (Е1) І дігідроліпоілдегідрогенази (Е3).
Піруватдекарбоксилази містить міцно пов'язаний з білкової частиною ТДФ, а дігідролі-поілдегідрогеназа - FAD.
Ліпоіллізіновие групи центрального ферменту (Е2) Функціонують як поворотні "кронштейни", які переносять атоми водню і ацетильную групи від однієї ферментної молекули комплексу до іншого.
